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Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
-0.21 0.3 0.41 -0.35 -0.39 -0.02 -0.41 0.86 0.4 -0.69 0.47 -0.08 0.28 0.41 0.53 0.25 -0.41 0.53 -0.62 0.35 -0.25 -0.2 -0.66 -0.09 0.03 -0.34 -0.41 0.45 -0.48 0.54 0.77 -0.32 0.32 -0.84 -1.09 -0.02 -0.49 -0.88 -0.39 0.01 -0.25 0.1 0.56 -0.56 -0.65 -0.38 0.13 -0.6 0.21 0.26 0.2
0.32 -0.06 1.0 0.18 -1.51 -0.52 -0.7 1.2 -0.35 -1.07 -0.23 -1.25 0.16 -0.04 0.2 0.4 -0.38 0.04 0.29 0.04 0.19 -0.35 -0.28 0.31 0.09 -0.13 0.08 0.48 -0.46 0.73 0.95 -0.88 0.59 -1.1 -1.5 0.22 -1.17 0.05 -1.34 -0.32 -0.35 0.25 1.01 -1.48 -1.38 -1.63 0.48 -0.61 0.43 0.56 0.26
0.33 0.15 0.37 1.0 -0.57 -0.61 -0.71 0.46 0.63 0.54 0.71 -0.22 0.21 0.22 0.22 0.23 -0.2 0.26 0.44 -0.38 -0.04 -0.72 0.14 -0.47 -0.25 0.43 -0.38 -0.11 -0.74 -0.1 0.28 -0.64 0.32 -0.89 -0.97 0.14 -0.41 -0.57 -1.14 -0.91 -1.24 0.15 0.41 0.13 0.2 0.25 0.15 -0.76 -0.34 0.36 0.19
-1.2 -1.14 0.06 0.57 -1.02 -0.28 -1.03 1.69 0.34 -1.2 0.3 -0.92 0.18 0.99 0.84 0.33 -0.59 0.54 0.32 0.57 0.54 -2.77 -1.05 -0.11 -1.62 -0.06 -0.23 -0.67 -1.62 1.03 1.17 -0.68 0.45 -0.84 -2.35 0.2 -0.29 -1.59 -0.98 -0.58 -0.77 0.85 0.71 -1.29 -1.46 -1.19 1.04 -0.65 0.21 0.47 -0.02
-0.96 -1.11 0.33 0.99 -2.41 -1.33 -0.85 1.78 0.14 -0.15 0.09 -0.72 0.35 -0.57 -0.55 0.59 -0.42 -0.63 1.09 -0.81 0.47 -3.25 -1.02 -0.27 -1.73 -0.35 -0.36 -0.86 -1.57 1.07 1.21 -1.05 0.67 -0.6 -2.39 0.66 -2.07 -1.5 -0.96 -0.63 -0.84 0.49 1.02 0.18 -0.12 0.19 1.5 0.01 -0.16 0.27 -0.11
0.36 0.1 0.85 1.28 -2.03 -1.71 -1.27 1.27 0.64 -1.48 0.46 -0.75 0.6 -0.44 -0.23 0.42 -1.14 -0.43 0.68 0.1 0.11 -1.91 -0.2 -0.03 -0.78 0.22 -0.48 -0.19 -1.12 1.34 1.78 -0.57 0.86 -1.03 -2.21 0.22 -1.15 -1.35 -1.12 -1.1 -1.28 0.92 0.85 -1.9 -2.03 -1.75 0.78 -1.22 -0.21 -0.04 -0.23
0.45 0.52 0.64 -1.29 -1.86 -0.26 -0.29 1.11 -0.18 -0.44 -0.17 0.66 0.35 -0.23 -0.03 0.3 0.05 -0.22 0.17 0.98 -0.65 -0.22 -0.76 -0.31 -0.02 -1.01 -0.56 -0.12 -0.57 0.87 0.63 -0.67 0.59 -0.38 -0.71 0.42 1.03 -0.5 -0.68 -0.52 -0.63 0.25 0.63 -0.67 -0.7 -0.53 0.24 -0.54 -0.26 -0.38 0.0
-0.52 0.46 0.12 1.11 -1.45 -1.25 -0.78 1.66 -0.06 0.45 -0.11 -0.75 0.05 0.16 0.06 0.15 -0.59 -0.11 0.37 0.62 0.02 -2.78 -1.08 -0.3 -1.79 -0.4 -0.31 -0.57 -1.3 0.74 0.73 -0.41 0.3 -0.88 -2.28 0.2 0.08 -1.42 -0.81 -0.41 -0.51 0.98 0.56 -0.07 -0.22 -0.09 1.07 -0.54 0.07 0.5 0.12
0.57 0.97 0.87 0.62 -2.77 -0.32 0.15 1.21 -0.08 -1.28 -0.26 -0.76 0.19 0.51 0.31 0.26 0.44 0.22 0.86 0.02 -0.2 -3.48 -1.21 -0.48 -2.0 -1.2 0.14 0.02 -1.0 -0.12 -0.17 0.45 0.32 0.27 -0.83 0.44 -0.72 0.26 -0.07 0.12 0.04 0.65 0.48 -1.74 -1.65 -1.45 0.84 0.29 -0.73 -0.48 -0.81
-0.77 0.21 0.29 -0.42 -1.64 -0.98 -0.77 1.47 0.46 -0.82 0.5 -0.26 -0.11 0.69 0.87 0.12 -0.37 0.39 0.41 0.17 0.35 -1.37 -0.54 -0.04 -0.66 0.24 -0.0 0.33 -1.2 0.48 0.56 -0.15 0.07 -0.79 -1.07 0.06 -1.0 -0.58 -0.66 -0.24 -0.3 0.75 0.59 -0.75 -0.76 -0.34 0.79 -0.33 -0.13 0.08 0.09
0.49 1.17 0.89 1.73 -2.37 -1.71 -1.05 0.86 0.46 -0.4 0.31 -1.32 0.28 0.04 -0.12 0.1 -0.83 -0.46 -0.03 -0.38 0.05 -1.37 -0.56 -0.18 -0.54 -0.04 -0.73 -0.12 -1.52 0.68 1.01 -0.03 0.48 -1.88 -1.11 -0.98 -0.42 -0.93 -0.55 -0.58 -0.65 0.67 0.6 0.26 0.19 0.41 -0.08 -1.67 0.07 0.35 -0.04
0.3 1.0 0.41 0.97 -0.98 -0.85 -0.99 1.22 -0.18 0.21 -0.14 -0.02 -0.1 -0.55 -0.42 -0.1 -0.68 -0.57 0.63 -0.74 0.23 -0.62 -0.38 0.16 -0.45 -0.13 -0.01 -0.09 -0.31 -0.01 -0.02 -0.46 0.14 -0.45 -1.58 0.14 -0.51 -0.54 -0.48 -0.38 -0.45 0.58 0.34 -0.05 -0.19 -0.09 0.83 -0.33 0.45 0.66 0.22
-0.85 -0.8 0.11 0.5 -1.22 -0.53 -0.74 1.42 0.23 -0.1 0.06 -1.17 0.22 0.57 0.6 0.28 -0.08 0.41 0.53 1.07 0.21 -3.2 -0.95 -0.18 -1.89 -0.48 -0.27 -0.64 -1.59 0.43 0.45 -0.24 0.41 -0.71 -1.97 0.24 -0.15 -1.35 -0.45 -0.11 -0.29 1.27 0.62 -0.72 -1.02 -0.71 1.15 -0.53 0.14 0.42 -0.01
0.77 0.47 0.78 1.46 -2.15 -1.45 -0.79 0.19 -0.09 -0.75 -0.19 -0.77 0.65 -0.78 -0.66 0.46 -0.68 -0.76 0.93 0.47 0.19 -1.27 0.36 0.12 -0.38 0.05 -0.13 0.14 -0.7 0.66 0.9 0.1 0.84 -0.66 -1.21 0.14 -0.77 -0.35 -0.54 -0.38 -0.49 1.07 0.84 -0.52 -0.72 -0.54 0.5 -0.32 -1.76 -1.18 -1.82
0.8 0.43 0.79 0.18 -0.52 -0.34 0.31 0.93 0.09 -1.28 0.21 0.58 0.28 -0.3 -0.29 0.08 -0.05 -0.32 -0.02 -0.45 -0.19 -0.75 -0.87 -0.61 -0.68 -1.38 -0.45 -0.18 -1.18 0.33 0.34 -0.25 0.31 0.24 -0.53 0.47 -0.29 -0.05 -0.33 -0.26 -0.32 0.11 0.51 -1.56 -1.08 -1.2 0.65 0.27 0.22 0.62 0.91
-0.72 -0.69 0.17 0.87 -1.28 -0.42 -0.77 1.2 -0.13 -0.31 -0.28 -0.88 0.48 0.27 0.4 0.6 -0.12 0.19 0.34 1.16 0.68 -3.06 -1.18 0.26 -1.69 -0.46 -0.07 -0.41 -1.36 0.71 0.78 -0.56 0.76 -0.89 -1.99 0.02 -0.21 -1.65 -0.82 -0.41 -0.58 1.01 1.05 -0.98 -1.17 -0.89 1.05 -0.85 -0.07 0.41 0.0
-0.88 -0.72 0.08 0.29 -1.56 -0.84 -0.84 1.06 -0.27 -0.14 -0.24 -0.5 0.01 0.13 -0.07 0.06 -0.93 -0.41 0.13 -0.19 0.69 -0.76 -0.57 0.3 -0.5 0.32 -0.06 0.19 -1.05 0.9 1.14 -0.36 0.34 -0.68 -1.75 -0.14 -0.91 -1.11 -0.41 -0.33 -0.53 0.7 0.38 0.48 0.29 0.49 0.73 -0.45 0.22 0.76 0.44
-0.35 -0.37 0.25 0.38 -1.65 -0.16 -1.02 0.81 0.42 -1.47 0.49 -0.82 0.41 0.15 0.18 0.53 -0.46 0.07 0.08 -0.37 0.13 -0.85 -0.52 -0.15 -0.47 -0.15 0.27 0.44 -0.36 0.59 0.86 -0.68 0.45 -0.79 -1.1 0.02 -0.94 -0.99 -0.77 -0.69 -0.87 0.28 0.77 -1.49 -1.36 -1.24 -0.06 -0.72 1.01 1.53 1.18
0.88 -0.53 0.71 1.27 -2.63 -1.25 -0.89 1.07 0.75 -2.39 0.63 -1.45 -0.02 -0.3 -0.32 -0.12 -0.69 -0.41 0.56 -0.19 0.31 0.43 0.2 0.27 0.88 -0.06 0.12 0.25 -0.4 1.0 1.15 -0.11 0.13 -1.06 -1.37 -0.05 -0.82 -0.35 -0.82 -0.68 -0.7 1.13 0.06 -1.65 -1.42 -1.35 0.29 -0.93 -0.26 -0.44 -0.92
1.55 0.74 1.35 0.98 -1.44 -0.85 -0.72 0.98 0.41 0.04 0.29 -0.74 0.29 -0.24 -0.09 0.18 -0.49 -0.22 0.66 0.03 -0.35 -1.49 -0.38 -1.02 -0.85 -0.29 -0.95 -0.6 -1.6 0.61 0.94 -0.17 0.52 -1.07 -1.67 0.34 -0.95 -1.11 -0.84 -0.8 -1.02 1.18 0.61 -0.44 -0.45 -0.45 0.67 -0.69 -1.15 -0.45 -0.33
1.0 0.24 1.04 1.63 -2.51 -0.84 -0.8 1.02 -0.04 -1.07 -0.07 -1.41 0.24 -0.29 -0.07 0.31 -0.2 -0.4 0.72 0.24 0.09 -1.4 -0.38 -0.11 -0.46 -0.24 -0.25 -0.37 -1.04 1.24 1.62 -0.15 0.48 -0.76 -0.88 0.28 -1.07 -0.29 -0.8 -0.65 -0.82 0.9 0.64 -1.26 -1.4 -1.14 0.44 -0.58 -1.18 -1.15 -1.6
0.02 -0.85 0.5 1.19 -0.84 -0.23 -0.38 0.06 0.5 -3.52 0.37 -0.22 0.95 0.25 0.11 0.54 -0.3 -0.06 -0.23 0.02 -0.1 -0.51 -0.11 -0.12 -0.13 -0.63 0.31 0.75 -0.34 0.18 0.37 0.25 0.74 0.04 -0.28 0.08 -0.36 -0.66 -0.05 -0.02 0.03 -0.56 0.82 -3.29 -2.55 -2.7 -0.79 -0.19 0.27 0.48 0.4
0.7 -0.13 0.53 0.85 -0.62 -0.37 -0.71 1.18 0.29 -1.03 0.43 0.11 0.74 -0.44 -0.44 0.49 -0.12 -0.5 0.33 -0.32 -0.74 -0.27 -0.46 -0.2 -0.06 -0.56 -0.26 0.13 -0.54 0.72 0.9 -0.76 0.99 0.1 -0.53 0.46 -0.85 0.04 -1.45 -1.3 -1.57 0.14 0.67 -1.18 -1.03 -1.0 0.6 -0.49 0.53 -0.22 -0.56
-0.45 -0.25 0.88 -0.31 -1.23 -0.88 -0.99 1.62 0.4 -1.35 0.11 -1.57 0.35 0.38 0.78 0.42 -0.69 0.31 -0.21 0.24 0.36 -2.01 -1.06 0.23 -1.05 -0.36 0.09 1.2 -1.26 1.41 1.75 -0.74 0.63 -0.73 -1.96 0.42 -1.49 -1.5 -0.86 -0.44 -0.53 0.53 1.02 -1.26 -1.53 -1.31 0.12 -1.13 -0.82 -0.42 -0.3
0.58 0.23 0.94 1.14 -1.12 -0.45 -0.55 1.17 0.35 0.1 0.31 -0.04 0.54 -0.3 0.12 0.45 -0.75 -0.1 0.55 0.36 -1.29 -2.11 -1.18 -1.68 -1.72 -1.04 -1.53 -1.09 -2.1 0.68 1.06 -0.33 0.75 -0.21 -0.9 0.34 -0.02 -0.54 -0.77 -0.59 -0.7 0.68 0.74 0.03 -0.2 -0.02 0.77 -0.62 -0.49 -0.25 -0.17
-0.45 -0.4 0.68 0.37 -0.82 -0.89 -1.16 0.94 -0.11 0.82 -0.18 -0.28 0.29 0.75 0.95 0.44 -0.63 0.27 0.43 -0.21 0.01 -3.85 -1.28 -0.44 -2.37 -0.07 -0.66 -0.87 -1.87 0.61 0.55 -0.72 0.63 -0.99 -2.25 0.02 -0.96 -1.32 -1.04 -0.55 -0.87 0.81 0.68 0.56 0.23 0.57 0.82 -0.93 0.28 0.65 0.68
-0.16 0.08 -0.07 -0.37 1.15 0.11 -1.73 0.06 0.16 0.06 0.48 1.68 -0.15 -0.25 0.04 -0.38 -1.08 -0.15 -0.94 -0.05 0.06 0.26 -0.5 0.06 0.53 0.58 -0.87 0.01 -0.82 0.21 0.41 -1.36 -0.08 -1.32 -1.24 -1.33 0.32 -0.57 -1.43 -1.24 -1.26 -1.46 0.54 -0.31 -0.34 -0.34 -1.4 -1.73 1.11 1.44 1.33
0.5 0.48 0.48 1.5 -1.13 -1.38 -0.45 -0.18 -0.28 1.15 -0.32 -0.24 0.1 -0.45 -0.52 -0.1 -0.13 -0.46 0.31 -0.64 -0.2 0.15 0.04 -0.56 0.35 0.11 -0.48 -0.42 -0.78 0.06 0.32 -0.04 0.18 -0.73 0.0 -0.09 -0.31 -0.01 -0.25 -0.32 -0.42 0.24 0.15 0.77 0.78 0.51 -0.27 -0.61 -0.5 -0.54 -0.66
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-0.33 -0.17 0.25 0.1 -1.14 -0.97 -1.84 0.88 0.88 -0.82 0.87 -0.57 0.71 0.19 0.25 0.77 -0.91 0.2 -0.06 0.02 -0.36 -1.14 -0.91 -0.34 -0.75 0.01 -0.79 -0.31 -1.06 0.73 0.98 -0.86 0.83 -1.47 -1.99 -0.19 -0.49 -0.66 -1.11 -0.86 -1.14 0.36 1.08 -0.32 -0.22 -0.2 0.21 -1.35 1.09 1.19 0.64
0.48 0.61 0.23 -0.73 -1.1 -1.07 -0.7 0.87 0.1 -0.15 0.2 -0.97 0.75 -0.87 -0.56 0.72 -1.49 -0.81 0.02 1.18 -0.44 -1.49 0.02 0.48 -0.73 -0.3 0.28 -0.03 -0.34 0.45 0.85 -0.43 1.26 -0.23 -1.74 0.15 1.24 0.35 -0.87 -0.84 -0.88 0.28 1.13 -0.6 -0.6 -0.5 0.32 -0.64 -0.61 -1.18 -1.52
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0.37 0.87 0.93 1.07 -0.56 -0.11 -1.52 1.05 -0.18 -0.31 -0.08 0.16 0.58 -0.28 0.23 0.46 -0.17 -0.21 0.49 0.29 -0.55 -1.16 -0.7 -0.37 -0.77 -0.13 -0.6 -0.16 -1.41 0.21 0.4 -0.98 0.88 -1.38 -0.74 0.01 0.07 -0.25 -0.92 -0.76 -0.75 0.04 1.02 -0.35 -0.59 -0.25 -0.02 -1.63 0.05 0.51 0.44
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0.76 -0.38 -0.15 0.98 -1.74 -1.11 0.15 0.25 -0.18 -1.53 -0.06 -0.71 0.1 -0.05 -0.18 0.1 -0.48 -0.18 0.44 0.26 0.11 0.01 0.52 0.42 0.45 0.33 0.3 0.29 0.21 0.28 0.13 0.72 0.43 -0.11 -0.62 0.35 0.15 -0.14 -0.16 0.02 -0.3 0.84 0.31 -1.61 -1.26 -1.53 -0.39 -0.15 -0.49 -0.77 -0.86
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1.24 0.38 1.3 1.62 -1.74 -1.05 -0.78 1.05 0.41 -0.95 0.07 -1.26 0.18 0.14 0.27 0.24 -0.34 0.11 0.81 -0.37 -0.0 -1.7 -0.34 -0.36 -0.71 -0.1 -0.71 -0.45 -0.98 0.81 1.07 -0.24 0.43 -1.44 -1.61 0.2 -1.33 -0.17 -1.23 -1.18 -1.4 1.05 0.67 -1.03 -1.12 -1.04 0.38 -0.73 -0.24 -0.18 -0.73
1.04 0.32 1.43 0.88 -1.5 -0.73 -0.44 1.34 0.04 -1.1 -0.11 -1.47 0.54 -0.58 -0.54 0.5 0.07 -0.68 0.88 0.06 -0.13 -2.08 -0.79 -0.69 -0.99 -0.61 -0.71 -0.83 -1.5 0.52 0.95 0.52 0.89 -0.88 -1.36 0.59 -1.44 -0.23 -0.47 -0.45 -0.61 1.6 0.87 -1.36 -1.76 -1.41 0.66 -0.51 -0.92 -0.6 -0.85
0.05 -0.06 0.72 -0.3 -1.57 -0.75 -0.2 1.07 0.07 -0.56 0.29 -0.19 0.23 -0.11 -0.14 0.31 -0.41 -0.39 0.6 -0.37 -0.67 -1.62 -0.39 -0.97 -0.85 -0.98 -0.8 -1.18 -1.65 0.66 0.86 1.23 0.72 -0.35 -1.42 0.46 -0.48 -0.76 1.23 0.01 0.09 0.68 0.65 -0.28 -0.55 -0.34 0.69 0.03 -0.53 -0.22 -0.27
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0.7 0.91 1.16 -0.31 -6.3 -0.84 -0.18 1.7 -0.2 -2.58 0.2 -1.49 0.86 -0.66 -0.53 0.06 -0.22 -0.64 0.69 -0.69 -0.77 -2.79 -0.48 -0.19 -1.56 -0.52 -0.54 -1.38 -0.79 1.04 1.4 0.78 1.31 0.67 -0.1 0.35 -3.74 0.56 1.09 -0.37 -0.46 0.53 0.38 -3.36 -3.31 -3.64 1.31 -0.19 -4.77 -6.31 -7.46
-0.28 0.31 0.16 0.09 -0.5 -0.16 -0.85 0.79 0.27 -0.49 0.43 -0.19 -0.35 0.24 0.32 -0.12 -1.0 -0.1 0.17 0.29 0.09 -0.05 -0.63 0.29 0.06 0.31 -0.2 0.34 -0.39 1.11 1.44 -0.15 -0.01 -1.09 -1.17 -0.5 -0.15 -0.95 0.3 -0.26 -0.14 0.22 0.67 -0.68 -0.7 -0.65 0.07 -0.91 0.08 -0.19 -0.31
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.