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Heatmap: Cluster_24 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
0.97 0.79 0.78 -1.84 -1.07 0.44 0.63 0.68 -0.09 0.01 -0.02 -0.64 -0.04 0.38 0.4 0.23 0.58 0.4 0.15 0.37 -0.75 -0.68 -1.18 -0.79 -0.45 -0.81 -0.68 -0.76 -1.1 0.0 0.13 0.01 0.16 -0.14 -0.33 0.8 -0.77 0.28 -0.27 -0.02 -0.16 0.5 0.19 -0.29 -0.38 -0.19 0.8 0.32 -0.95 -1.22 -1.25
0.14 -0.16 0.05 -1.74 0.4 0.56 0.85 0.53 -0.72 0.83 -0.46 1.66 -0.57 -0.31 -0.2 -0.79 0.25 -0.37 0.28 -0.78 -0.84 -2.21 -1.5 -0.7 -1.88 -1.51 -1.24 -1.02 -2.61 0.55 0.35 -0.38 -0.52 1.07 -1.46 0.65 -0.36 0.04 -0.25 -0.47 -0.6 0.24 0.27 0.75 0.76 0.7 0.81 0.72 -0.32 -0.78 -0.37
0.9 1.37 1.04 -1.93 0.33 0.41 1.19 -0.48 -0.02 0.48 0.36 0.46 -0.56 -1.06 -1.05 -0.59 -0.27 -0.84 -0.45 -0.4 -1.44 -0.97 -1.59 -0.77 -1.29 -0.86 -1.49 -1.48 -1.19 0.01 -0.09 0.42 -0.54 1.02 0.6 0.52 -0.23 -0.13 0.61 0.81 0.68 -0.38 0.53 0.04 0.0 0.04 -0.01 0.76 -2.25 -2.12 -0.95
1.25 1.16 1.06 -1.8 -0.02 -0.62 0.44 0.18 -0.49 0.55 -0.24 -1.23 -1.38 0.2 0.0 -1.28 0.47 0.28 0.24 0.77 -0.98 -0.43 -1.07 -1.13 -0.35 -0.98 -0.65 -0.87 -0.92 -0.54 -0.51 0.2 -1.23 -1.34 0.42 0.31 1.23 0.42 0.0 0.36 0.13 1.09 -1.01 -0.31 -0.28 -0.13 -0.25 0.39 -0.23 -0.38 -0.19
1.81 0.49 0.05 -1.14 -0.96 0.48 0.36 -0.75 -0.59 0.03 -0.43 1.11 -0.14 -0.54 -0.66 -0.18 0.56 -0.44 -0.3 0.54 -0.49 -0.47 -1.1 -0.71 -0.32 -1.23 -0.4 -1.03 -0.84 -0.4 0.05 0.03 0.05 1.06 0.69 0.43 0.41 0.43 -0.02 -0.29 -0.47 -0.06 -0.61 -0.06 0.31 -0.12 -0.04 0.37 -0.03 -0.96 -0.97
1.42 1.02 0.11 -2.03 0.89 0.52 0.4 -0.37 0.07 0.36 0.26 0.51 -0.23 -0.38 -0.4 -0.25 0.61 -0.21 -0.45 -0.15 -1.17 0.39 -0.74 -0.53 0.31 -1.03 -0.64 -1.0 -0.09 -0.19 -0.39 -0.28 -0.21 0.18 0.46 0.18 0.29 0.86 -0.15 -0.31 -0.51 -0.58 -0.56 -0.29 -0.33 -0.06 -0.56 0.1 -0.04 -0.6 -0.32
0.69 0.17 -0.0 -2.5 -0.84 1.1 0.99 0.12 0.35 -0.19 0.54 0.04 -0.29 0.34 0.42 -0.15 1.14 0.54 -0.58 0.32 -1.03 -1.42 -1.57 -0.93 -1.26 -1.84 -0.73 -0.49 -0.86 -0.41 -0.01 0.26 -0.37 0.33 0.34 0.75 -0.15 0.12 0.23 0.29 0.2 0.26 -0.52 -0.53 -0.33 -0.4 0.44 0.7 -0.51 -0.9 -0.57
-0.56 0.2 -0.28 -2.06 -0.26 -0.37 1.16 -2.13 -0.4 -0.29 0.1 1.21 -1.06 0.26 0.48 -0.55 0.04 0.78 -0.94 0.92 -0.72 -0.87 -1.36 -0.52 -0.74 -0.26 -0.6 -0.6 -0.36 -0.88 -0.32 0.73 -0.99 0.77 0.92 0.75 0.28 1.11 0.83 0.69 0.83 -0.86 0.26 -0.52 -0.41 -0.28 -0.39 0.74 -1.36 -4.05 -2.5
-0.06 -0.54 0.48 0.83 -1.61 -0.87 -0.56 1.39 0.0 0.79 -0.22 -0.41 0.14 -0.91 -0.68 0.52 0.71 -0.8 1.4 -1.49 -0.48 -4.48 -1.78 -1.43 -2.59 -0.57 -1.08 -1.46 -2.6 0.11 -0.03 -0.94 0.48 -0.6 -1.21 0.9 -1.92 -0.28 -1.11 -0.73 -0.91 0.33 0.86 1.1 0.74 1.0 1.71 0.01 -0.18 -0.01 -0.25
0.4 0.01 -0.3 -0.21 -0.43 -0.36 -1.43 0.03 0.45 0.83 0.8 0.25 -0.27 0.29 0.26 -0.47 -1.59 0.28 -0.18 0.58 0.02 -0.31 1.22 0.3 -0.08 0.52 -0.2 0.02 0.14 0.69 0.24 -0.93 -0.36 -0.75 -2.11 -0.49 0.99 -0.42 -1.16 -1.11 -1.51 -0.26 -0.21 0.41 0.5 0.43 0.03 -0.99 -0.35 -0.28 -0.33
1.3 1.83 1.52 -3.08 -0.9 1.15 1.2 0.02 -0.7 -0.42 -0.77 -0.59 -0.43 -0.22 -0.2 -0.28 0.83 -0.04 0.33 -0.37 -1.74 -2.73 -1.94 -2.17 -1.89 -1.9 -1.75 -2.95 -2.03 -0.04 0.31 0.57 -0.13 0.07 0.74 1.03 -0.76 0.95 0.48 0.65 0.67 -0.06 -0.45 -1.46 -1.41 -1.34 0.01 0.81 -1.44 -1.73 -1.35
-1.21 0.66 -0.14 -0.11 -0.56 -0.36 1.36 0.35 -1.69 -0.61 -1.3 1.54 -1.5 -1.5 -1.38 -1.72 -0.3 -1.45 0.74 -1.73 0.23 -0.77 -1.7 0.41 -0.74 -1.54 -0.09 -0.93 -1.91 1.2 0.73 -0.13 -1.42 1.99 -1.29 0.73 -1.1 -0.57 0.16 0.24 -0.1 1.0 0.38 -1.48 -1.21 -1.68 0.35 1.47 0.02 -0.04 -0.2
0.93 0.25 0.74 -1.84 0.04 0.6 1.56 -2.19 -2.01 -0.56 -1.22 1.27 -1.91 -0.11 -0.22 -2.41 0.43 0.07 -0.79 -1.48 -1.07 -0.91 -1.37 -0.72 -0.54 -1.82 -1.54 -0.72 -1.68 1.05 0.05 -0.09 -2.73 1.37 1.13 -0.11 -0.23 1.54 -0.02 0.52 0.27 0.19 0.12 -2.17 -1.21 -2.03 -1.37 1.14 -0.11 0.08 0.74
1.07 0.79 0.74 -1.31 -0.3 0.06 1.1 0.13 -1.08 0.83 -0.7 0.81 -1.1 -0.61 -0.59 -1.17 0.08 -0.55 0.73 -0.14 -1.29 -1.93 -2.0 -0.86 -1.52 -1.83 -1.08 -1.78 -2.16 0.85 0.68 -0.47 -0.91 0.75 -0.59 0.76 -0.13 0.79 -0.63 -0.35 -0.69 1.02 -0.36 0.31 0.53 0.37 0.28 0.8 -0.1 -0.32 -0.16
1.44 0.81 1.37 -1.59 -1.65 -0.46 -0.19 0.53 -0.2 0.66 -0.35 -0.26 -0.3 -0.15 0.37 -0.16 0.94 0.05 1.46 0.2 -0.94 -2.79 -1.07 -1.55 -1.68 -0.3 -1.38 -1.58 -2.08 0.11 0.31 -0.76 0.02 -0.36 -0.19 0.92 -0.68 0.35 -1.5 -1.24 -1.44 0.4 0.25 -0.01 -0.28 0.02 1.41 -0.12 -0.61 -0.2 -0.14
0.98 0.41 0.31 -1.41 0.06 0.08 -0.31 -0.05 0.25 0.44 0.5 0.84 -0.22 0.02 0.05 -0.26 -0.43 0.07 0.09 -0.46 -0.05 -0.15 1.07 0.02 -0.0 0.05 0.08 -0.57 -0.18 0.21 0.31 -0.67 -0.18 -0.55 -1.12 0.05 -0.03 -0.66 -0.91 -0.85 -0.83 -0.28 -0.47 0.38 0.51 0.38 -0.06 -0.29 -0.18 -0.03 -0.06
0.77 0.22 0.75 0.02 -1.8 -1.51 -0.81 0.76 0.19 0.27 -0.11 -0.49 0.22 -0.31 -0.41 0.06 0.81 -0.46 0.92 -0.41 -0.26 -0.8 -0.63 -1.02 -0.12 -0.03 -1.01 -0.96 -1.66 0.47 0.72 -0.54 0.44 -0.96 0.04 0.19 -0.77 0.05 -0.97 -1.11 -1.21 0.67 0.5 0.94 0.77 0.92 0.61 -1.0 -0.26 -0.23 -0.22
0.92 0.68 0.6 -2.89 -0.78 0.45 1.7 -0.47 -0.47 0.33 -0.45 -0.05 0.06 -0.42 -0.27 0.24 0.14 -0.34 0.74 -0.06 -1.16 -1.98 -1.37 -1.34 -1.38 -1.6 -1.88 -2.41 -2.27 1.11 0.42 -0.67 0.19 1.48 -1.35 0.85 -0.63 -0.38 -0.46 -0.72 -0.81 0.82 0.98 -0.26 -0.48 -0.35 0.05 1.48 -0.94 -0.92 -0.85
-0.68 0.2 0.46 -0.38 -1.39 -0.54 0.71 0.92 -0.54 -0.35 -0.27 0.5 -0.48 -0.39 -0.05 -0.48 -0.92 -0.47 0.16 -0.04 -0.34 -0.76 -0.47 -0.08 -0.64 -0.43 -1.06 -0.18 -1.49 1.87 1.14 -0.66 -0.08 0.49 -1.45 0.29 -0.08 -1.04 -0.4 -0.14 -0.34 0.71 0.9 -0.94 -0.88 -0.79 0.58 0.71 -0.28 0.28 0.57
-0.18 -0.39 -0.47 0.98 -1.64 0.2 -0.18 -1.19 0.67 -0.52 0.75 0.7 0.05 0.83 0.59 -0.16 0.79 0.71 -0.41 0.56 0.22 -1.0 -1.14 -0.39 -0.83 -0.91 -0.44 0.5 -0.17 -0.16 0.39 0.19 -0.19 0.14 0.68 0.17 0.29 -0.36 0.15 0.13 0.06 -0.06 -0.33 -0.71 -0.98 -0.85 -0.33 -0.02 -0.37 -0.7 -0.83
-0.09 -0.32 0.02 -1.27 -0.12 0.16 0.79 0.46 -0.1 -0.07 -0.02 0.04 0.06 -0.41 -0.44 -0.05 -0.06 -0.43 -0.07 0.33 -0.05 -0.12 -0.35 0.36 -0.05 -1.13 0.19 0.04 -0.38 0.62 0.7 0.06 0.14 0.65 -1.04 0.7 -0.6 -0.81 -0.06 -0.14 -0.21 0.34 0.41 -0.28 -0.06 -0.13 0.62 0.7 -0.7 -0.97 -0.91
-0.66 -0.25 -0.18 -0.5 -0.55 -0.19 -0.18 -0.2 0.05 -0.23 0.4 1.01 -0.1 0.66 0.39 -0.18 -0.19 0.43 -0.7 0.07 1.06 0.56 0.22 0.12 0.71 -0.52 0.04 -0.15 -0.49 0.62 0.5 -0.59 0.03 -0.12 -1.41 -0.1 0.25 -0.3 -0.2 -0.37 -0.94 0.06 0.24 -1.25 -0.7 -1.02 -0.03 -0.07 0.33 0.07 0.03
0.33 -0.49 0.66 -2.17 0.32 -0.05 1.31 -0.38 -0.44 0.38 -0.28 2.03 -0.55 -0.49 -0.07 -0.7 -0.1 -0.24 0.54 0.27 -0.72 -2.34 -1.62 -0.36 -1.85 -2.31 -0.95 -0.51 -2.41 0.84 0.18 -0.39 -1.15 1.06 -1.77 1.02 0.07 0.32 -0.08 0.03 0.01 0.26 0.22 -0.5 -0.64 -0.75 1.05 1.05 -0.59 -1.6 -1.55
-3.17 -2.78 -2.01 -3.28 -3.92 -1.88 1.33 -3.91 -4.79 2.39 -3.18 2.21 -4.56 -6.11 -5.9 -5.29 -2.26 -5.82 1.5 -0.56 -0.59 -1.69 -0.92 -0.26 -1.51 -0.37 -2.19 -3.88 -2.16 0.81 -0.19 0.48 -4.7 -1.38 -8.36 1.4 -0.69 -1.13 0.16 0.75 0.43 1.63 0.41 1.28 0.8 0.65 1.18 2.24 -2.78 -6.37 -6.16
-2.02 -1.11 -1.0 0.09 0.76 -0.55 1.31 -1.81 -1.14 -0.9 -0.29 0.31 -1.88 0.33 0.17 -2.42 -1.17 0.37 0.13 -0.79 0.17 1.05 -0.55 0.23 0.98 -1.12 -0.31 -0.24 -0.51 0.58 0.13 0.31 -2.33 1.07 -0.97 0.43 -0.08 -1.88 0.53 0.69 0.68 0.9 -0.81 -1.82 -1.32 -1.87 -0.31 1.55 0.18 0.02 0.39
0.21 0.14 0.34 0.62 1.7 -0.93 -0.45 0.35 -0.61 0.47 0.5 -1.06 -1.23 -0.76 -0.73 -0.87 -1.64 -1.03 0.06 0.21 -0.62 -0.01 0.53 0.53 0.2 -0.26 0.24 0.27 -0.12 0.82 0.8 -0.45 -0.7 -0.58 -0.25 -0.37 0.56 0.52 0.07 0.5 -0.21 -0.88 0.48 -0.28 0.03 -0.38 0.2 -0.2 -0.75 -1.43 -1.75
1.48 0.45 -0.2 -1.63 0.99 0.37 0.86 -0.79 -0.58 0.55 -0.3 1.04 -0.35 -0.49 -0.65 -0.58 0.67 -0.53 0.25 0.28 -0.97 -0.55 -1.09 -0.63 -0.6 -1.48 -0.74 -0.94 -1.04 -0.08 -0.4 -0.05 -0.61 0.8 -0.19 0.47 0.43 0.39 0.01 -0.12 -0.39 0.46 -0.47 -0.14 0.19 -0.04 0.19 0.71 -0.52 -0.83 -0.49
0.63 0.71 -0.5 -0.71 0.43 -1.15 0.75 -0.56 -0.68 0.7 -0.42 2.27 -1.06 -1.13 -1.22 -1.23 -1.94 -1.32 0.78 -0.61 -1.1 -0.22 -1.15 -0.19 -0.63 -0.95 -1.01 -0.83 -0.99 0.7 -0.3 -0.48 -0.99 1.38 -2.1 -0.23 0.89 -1.3 -0.31 -0.55 -0.75 0.26 -0.25 0.81 0.57 0.39 0.32 0.95 -0.11 -0.13 0.03
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-0.15 -0.53 0.34 0.66 -2.32 -0.93 -0.2 1.28 -0.29 0.09 -0.49 -0.81 0.01 -0.25 -0.21 0.39 0.59 -0.62 1.06 -0.52 -0.3 -4.07 -2.11 -1.27 -2.63 -0.59 -1.11 -1.67 -2.43 0.66 0.51 -0.45 0.39 -0.73 -1.59 0.18 -1.66 -0.65 -0.82 -0.43 -0.56 0.86 0.77 1.49 1.2 1.44 1.33 -0.4 -0.52 -0.05 -0.4
-0.86 -2.97 -3.43 -3.54 -0.58 -0.36 2.04 -2.49 -2.6 1.24 -2.86 2.85 -4.62 -3.39 -2.88 -5.55 -0.72 -3.6 0.52 -1.48 -2.74 -3.31 -3.28 -0.25 -3.14 -3.08 -2.33 -4.63 -3.79 1.62 0.11 -0.45 -4.24 2.54 -5.35 0.58 1.05 0.24 -0.23 -0.82 -1.46 1.25 0.66 0.29 0.17 -0.51 0.48 1.66 -0.68 -2.27 -1.61
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1.01 0.71 0.73 -2.89 -0.18 0.56 0.7 -0.09 0.51 0.52 0.69 -0.35 0.82 0.03 0.14 0.37 -0.03 0.3 0.89 -0.06 -2.39 -2.07 -1.24 -2.77 -1.79 -1.78 -2.68 -4.14 -2.31 -0.4 -0.09 0.47 0.91 -2.0 -0.84 0.63 0.59 -0.05 0.82 0.0 -0.06 0.17 -0.09 -0.3 -0.09 -0.15 -0.0 0.38 -0.03 -0.31 -0.19
-1.16 -0.99 -0.47 -0.02 -2.79 -0.69 0.29 0.04 -0.02 -3.08 -0.91 -1.18 -0.69 -0.46 -0.49 0.45 -0.4 -0.37 -0.91 -0.53 0.6 -1.17 1.15 0.89 -0.09 0.33 1.52 0.86 0.84 -0.4 -0.38 0.53 -0.59 -0.6 -0.68 -0.12 -0.31 0.22 0.94 0.42 -0.12 -0.14 0.06 -3.19 -3.06 -2.9 -0.6 0.26 0.67 0.92 1.44
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-0.06 -0.14 0.42 -2.06 -1.37 -0.22 -0.22 0.89 -0.18 1.16 -0.26 -0.23 0.07 0.56 0.62 0.28 1.22 0.52 0.69 0.87 -0.83 -4.41 -2.21 -1.58 -2.65 -0.92 -1.59 -1.93 -2.67 0.01 0.21 -0.87 0.4 -0.33 -0.99 0.82 -0.33 -0.42 -0.4 -1.07 -1.15 0.22 0.53 0.3 0.23 0.42 1.56 -0.17 -0.25 0.15 0.3
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.