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Heatmap: Cluster_1 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
0.44 0.42 0.55 -1.52 -0.79 0.24 1.07 -0.17 -0.16 -1.15 0.23 -0.09 0.06 -0.32 -0.22 0.16 -0.03 -0.05 -0.55 -0.02 -0.07 0.16 -0.15 0.11 0.1 -0.99 0.32 0.29 0.48 -0.64 -0.43 0.32 0.04 0.34 0.24 0.51 -0.59 -0.16 0.3 0.36 0.31 -0.23 -0.32 -1.41 -1.02 -1.11 -0.21 0.6 -0.32 -0.11 0.52
0.18 -0.15 0.02 -1.71 -0.21 0.5 1.55 -0.69 0.09 -1.61 0.08 -0.1 -0.08 -0.02 -0.12 -0.05 0.91 0.09 -0.4 -0.6 -0.64 -0.58 -0.56 -0.11 -0.35 -1.33 0.3 -0.26 0.11 -0.78 -0.4 0.74 -0.08 0.92 0.72 0.99 -0.44 0.03 0.33 0.33 0.52 -0.56 -0.44 -2.45 -1.57 -1.87 -0.59 1.16 0.05 -0.6 0.07
0.96 0.45 0.38 -0.73 -0.62 0.48 1.17 -1.23 -0.14 -1.44 0.07 0.27 0.07 -0.08 -0.07 0.0 0.59 0.09 -0.49 -0.08 -1.01 -0.41 -0.21 -0.07 -0.23 -1.45 0.16 0.32 0.12 -0.65 -0.78 0.41 -0.08 0.78 0.3 0.75 0.0 0.23 0.15 0.13 -0.01 -0.41 -0.3 -1.85 -1.01 -1.34 -0.87 0.86 0.12 -0.31 0.2
0.49 1.02 0.29 -0.95 -0.01 0.33 1.54 -1.37 -0.45 -1.03 -0.15 0.05 -0.26 -0.29 -0.34 -0.41 0.4 -0.1 0.35 0.25 -1.26 -0.93 -1.67 -1.08 -0.95 -0.58 -1.08 -0.6 -0.7 -0.93 -0.73 1.04 -0.51 0.86 0.01 0.98 0.53 0.06 0.79 0.58 0.6 0.6 -0.76 -1.1 -0.45 -0.61 0.17 1.06 -1.0 -1.65 -0.6
0.52 -0.13 -0.23 -0.03 -0.18 0.27 0.91 -0.91 -0.07 -0.96 0.06 0.86 0.02 0.01 0.05 -0.02 0.35 0.1 -0.15 -0.4 -0.48 -0.5 -0.36 -0.2 -0.38 -0.81 0.05 0.21 -0.19 -0.77 -0.57 0.57 -0.13 0.48 0.19 0.57 -0.02 0.1 0.56 0.54 0.41 0.13 -0.05 -1.06 -0.52 -0.54 -0.07 0.76 -0.33 -0.98 -0.7
-0.36 -0.62 -0.47 -1.05 -2.46 -0.47 1.36 -1.03 -0.11 -2.23 -0.19 -0.36 0.13 0.09 0.04 0.31 0.82 0.3 -0.19 1.29 -0.5 -2.23 -1.01 -0.09 -1.79 -2.01 0.64 0.08 -0.33 -0.99 -0.72 1.18 0.08 0.55 -0.26 1.12 0.72 -1.15 0.7 0.83 0.66 0.82 -0.28 -2.73 -1.75 -2.11 -0.19 1.28 -0.48 -0.97 -0.42
0.02 0.16 -0.12 -1.58 -2.06 0.32 1.75 0.09 0.3 -1.55 0.48 0.24 0.4 -0.06 -0.11 0.35 0.01 -0.01 -0.72 -0.3 0.54 -0.87 -0.92 0.1 -0.67 -1.25 0.42 0.13 -0.03 -0.05 0.32 0.47 0.45 1.02 -0.29 1.08 -0.52 -1.02 0.16 0.2 0.12 -0.11 -0.1 -1.59 -1.24 -1.35 -0.22 1.11 -1.26 -2.11 -1.18
0.64 0.79 0.29 -0.24 -0.93 0.44 0.82 -0.92 0.27 -1.45 0.17 0.37 0.42 -0.23 -0.07 0.37 0.19 0.11 -0.89 0.15 -0.58 -0.03 -0.74 0.01 0.16 -1.12 0.07 0.28 0.39 -0.72 -0.84 0.41 0.37 0.26 0.46 0.11 -0.2 0.25 0.38 0.49 0.23 -0.15 0.23 -1.45 -0.86 -1.09 -0.84 0.4 -0.48 -0.89 -0.35
0.26 0.03 0.21 -1.5 -1.83 0.71 1.14 -0.08 0.58 -0.57 0.99 -0.4 0.4 0.15 0.28 0.34 -0.11 0.3 -0.44 0.28 -1.2 -0.8 -0.33 -0.17 -0.75 -1.46 0.2 0.16 0.27 -0.67 -0.14 0.79 0.32 0.77 -0.06 0.8 -0.26 -0.63 0.37 0.4 0.24 -0.1 -0.18 -1.14 -0.97 -0.89 -0.24 0.69 -0.62 -2.07 -1.79
-0.91 -0.68 -0.37 -0.88 -3.2 0.47 0.76 -0.66 0.77 -1.73 0.75 -1.51 0.18 0.2 0.34 0.37 0.1 0.39 -0.75 0.85 -1.1 -1.09 -0.24 0.29 -0.82 -1.8 0.57 0.66 0.7 0.02 0.51 1.1 0.25 0.47 -0.07 0.6 -0.69 0.11 1.1 0.71 0.65 0.22 0.13 -2.04 -1.69 -1.64 -1.05 0.67 -1.53 -3.27 -3.05
0.18 -0.16 0.02 -1.12 0.36 0.48 1.03 -0.52 0.2 -0.57 0.28 0.25 0.34 -0.43 -0.25 0.33 0.29 -0.12 -0.82 0.24 -0.71 -0.47 -0.51 0.1 -0.42 -1.32 0.21 0.44 0.07 -0.75 -0.47 0.35 0.17 0.61 0.15 0.71 0.37 0.34 0.26 0.36 0.21 -0.27 0.07 -0.87 -0.62 -0.71 -0.21 0.74 -0.79 -1.18 -0.69
-0.37 -0.55 -0.31 -0.72 -1.08 0.23 0.67 -0.33 0.39 -2.16 0.68 -0.09 0.25 0.14 0.14 0.28 -0.02 0.29 -0.78 -0.2 -0.22 0.15 0.08 0.34 0.28 -0.67 0.67 0.8 0.71 -0.18 0.14 0.43 0.37 0.57 -0.29 0.33 -0.63 -0.49 0.4 0.31 0.3 -0.1 -0.07 -2.01 -1.52 -1.58 -0.14 0.64 -0.14 -0.87 -0.79
0.78 0.55 0.31 -0.35 -1.95 -0.0 1.1 -0.73 0.22 -1.99 0.31 -0.12 0.43 0.03 -0.04 0.36 0.44 0.06 -0.05 0.8 -0.74 -2.83 -1.29 -0.38 -2.02 -2.3 0.18 0.51 -0.76 -0.19 -0.03 0.51 0.4 0.81 -0.27 0.84 0.54 -0.08 -0.01 0.07 -0.1 0.16 0.19 -2.43 -1.33 -1.55 -0.71 0.78 0.44 -0.39 0.01
0.57 -0.26 -0.17 -0.03 -1.06 -0.11 0.66 -1.01 0.62 -1.55 0.71 0.5 0.32 0.32 0.28 0.13 0.24 0.27 0.07 -0.49 -0.48 -0.72 -0.56 0.07 -0.44 -1.0 0.41 0.81 0.01 -0.86 -0.76 0.4 0.08 0.61 0.34 0.36 -0.39 0.21 0.26 0.24 -0.02 -0.41 0.19 -0.92 -0.51 -0.73 -0.6 0.57 -0.0 -0.73 -0.46
-0.32 -0.44 -0.66 -0.08 -2.42 -0.77 1.36 -0.11 -0.11 -2.32 0.1 1.24 0.06 0.04 -0.06 0.04 -0.42 0.06 -0.25 0.31 -0.3 -0.24 -0.21 -0.01 -0.19 -1.31 0.09 0.18 0.13 -0.07 0.28 0.99 0.11 0.84 -0.53 0.78 -0.52 -1.02 0.88 0.68 0.5 0.63 -0.25 -2.48 -2.07 -2.03 0.08 1.22 -0.53 -2.2 -2.13
-0.31 -0.45 -0.19 -0.65 -1.46 0.39 0.74 -0.43 0.27 -2.45 0.45 -0.12 0.34 0.43 0.38 0.14 -0.13 0.51 -0.46 0.51 -0.35 -0.29 -1.11 0.15 -0.15 -1.62 0.14 0.67 0.33 -0.04 0.17 0.48 0.19 0.63 -0.21 0.47 -0.26 -1.06 0.42 0.47 0.35 0.23 -0.21 -2.43 -1.94 -2.11 -0.32 0.57 0.16 0.23 0.36
0.41 -0.04 -0.07 -0.66 -2.18 0.06 1.02 0.18 0.43 -0.85 0.57 -0.54 0.27 0.21 0.12 0.27 0.05 0.23 -0.35 0.08 -0.21 -0.44 -0.11 0.13 -0.38 -1.1 0.28 0.18 0.08 -0.08 0.29 0.67 0.35 0.5 -0.29 0.79 -0.61 -0.41 0.4 0.46 0.41 0.21 -0.06 -1.29 -0.93 -1.09 -0.05 0.94 -1.32 -2.56 -2.05
0.21 -0.11 -0.46 -0.72 0.08 -0.3 1.19 -0.43 0.26 -1.63 0.23 -0.57 0.61 -0.03 -0.07 0.59 -0.14 0.08 -0.42 0.03 -0.29 -0.66 -0.45 0.23 -0.65 -1.32 0.47 0.7 0.27 -0.13 0.1 0.41 0.62 0.94 -0.29 0.83 -0.28 0.08 -0.05 0.01 -0.06 -0.48 0.18 -1.78 -1.2 -1.49 -0.49 0.89 -0.14 -1.0 -0.09
1.47 0.79 0.33 -0.72 0.13 0.4 0.43 -0.08 0.35 -1.33 0.62 0.16 0.32 0.27 0.41 0.26 0.12 0.53 -0.69 0.34 -0.72 -0.82 -1.3 -0.12 -0.72 -1.7 -0.11 0.22 0.09 -0.53 -0.18 0.11 0.3 0.02 0.25 0.43 -0.21 0.52 -0.14 0.05 0.03 -0.4 -0.16 -1.86 -1.29 -1.4 -0.15 0.09 -0.29 -0.84 -0.19
1.0 0.39 0.55 -1.36 -1.16 0.53 1.22 0.05 0.17 -2.15 0.21 -0.47 0.27 0.07 0.14 0.17 0.64 0.23 -0.35 -0.02 -0.41 -1.31 -0.83 -0.23 -0.95 -1.69 0.24 0.05 -0.44 -0.34 -0.0 0.45 0.06 0.77 0.1 0.97 -0.47 -0.39 0.18 0.15 0.04 0.01 -0.13 -2.5 -1.83 -1.92 -0.04 0.86 0.06 -0.35 0.08
0.3 -0.02 -0.18 -0.72 -1.54 0.08 1.04 -0.98 0.07 -2.18 0.12 0.02 0.15 0.02 0.0 0.15 0.8 0.2 0.19 0.42 -0.9 0.02 -0.32 -0.27 -0.01 -0.71 -0.05 0.43 -0.07 -0.41 -0.4 0.72 0.18 0.85 0.65 0.6 -0.06 0.56 0.5 0.46 0.39 -0.01 -0.17 -2.29 -1.97 -1.89 -0.15 0.76 -0.55 -1.67 -1.19
-0.01 -0.44 -0.85 -0.5 -1.6 -0.45 1.25 -0.27 0.6 -2.05 0.35 -0.77 0.71 0.29 0.2 0.41 0.03 0.24 -0.43 0.46 -0.82 -1.16 -0.53 -0.16 -0.78 -1.82 0.16 0.18 -0.05 -0.34 -0.04 0.93 0.89 0.75 -0.37 0.88 -0.09 -0.61 0.68 0.44 0.37 0.35 0.41 -1.91 -1.37 -1.49 0.05 0.9 -0.33 -1.37 -1.22
-0.12 -0.12 -0.11 -1.34 0.04 0.5 1.21 -0.83 0.21 -1.68 0.43 -0.13 0.27 0.15 0.19 0.2 0.17 0.38 -1.06 0.08 -0.54 -0.7 -0.62 0.34 -0.61 -1.58 0.4 0.78 0.6 -0.73 -0.51 0.53 0.03 0.85 0.32 0.6 -0.27 0.22 0.38 0.48 0.39 -0.27 -0.19 -1.52 -1.15 -1.2 -0.56 0.6 -0.53 -1.06 -0.28
0.6 0.15 -0.06 -0.95 -0.84 0.21 1.19 -0.36 0.11 -0.52 0.35 0.52 0.32 -0.25 -0.2 0.26 0.46 -0.08 -0.37 0.28 -0.82 -1.27 -1.01 -0.31 -0.95 -1.58 -0.13 -0.03 -0.61 -0.34 -0.05 0.67 0.26 0.71 0.22 0.76 0.33 0.05 0.42 0.38 0.28 0.03 0.13 -1.44 -0.79 -1.03 -0.29 0.78 -0.19 -0.75 -0.43
1.02 0.77 0.9 -1.6 0.16 0.13 0.92 -0.28 0.01 -0.46 0.29 0.52 0.26 -0.31 -0.24 0.12 0.39 -0.07 -0.39 -0.22 -0.25 -0.4 -0.81 -0.08 -0.48 -0.99 -0.07 0.29 -0.31 -0.52 -0.42 -0.27 0.18 0.33 -0.32 0.83 0.1 -0.35 -0.29 -0.23 -0.41 -0.53 -0.09 -1.05 -0.68 -0.71 0.21 0.54 -0.08 -0.25 0.43
-0.15 -0.69 -0.43 -0.3 -1.77 0.11 0.52 -0.23 0.5 -1.7 0.53 0.08 0.45 0.16 0.19 0.44 -0.18 0.14 -0.19 -0.32 0.35 0.07 -0.05 0.04 0.15 -1.05 0.43 1.02 -0.01 -0.17 0.01 0.43 0.38 0.3 -0.53 0.46 -0.98 -0.61 0.44 0.47 0.34 0.15 0.32 -1.85 -1.47 -1.45 -0.61 0.56 -0.07 -0.3 -0.28
-0.02 -0.64 -0.9 -0.14 -1.94 -0.09 0.96 0.02 0.22 -1.89 0.18 -0.18 0.5 0.29 0.22 0.37 -0.56 0.23 -0.2 0.08 -0.41 -0.7 -0.51 0.06 -0.39 -1.31 0.26 0.52 -0.01 0.07 0.37 0.63 0.6 0.97 -0.93 0.83 -0.36 -1.4 0.39 0.31 0.16 0.01 0.28 -2.24 -1.71 -1.71 -0.0 0.84 0.43 -0.09 -0.1
0.83 0.04 -0.14 -0.68 -0.13 0.42 0.6 -0.45 0.14 -1.23 0.41 -0.09 0.19 0.18 0.22 0.07 0.32 0.29 -0.51 -0.31 -0.66 -0.65 -0.97 -0.48 -0.53 -1.19 -0.03 0.44 -0.72 -0.27 -0.31 0.45 -0.06 0.24 -0.07 0.49 -0.39 -0.49 0.14 0.14 0.08 0.04 -0.11 -1.47 -0.85 -1.13 -0.84 0.62 0.75 0.78 1.17
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-0.05 -0.28 -0.46 -0.45 -1.74 0.18 0.74 -0.34 0.79 -1.67 0.77 -0.34 0.54 0.42 0.33 0.47 -0.11 0.43 -0.34 0.42 -0.37 -1.33 -1.02 -0.02 -0.75 -1.75 0.34 0.8 -0.02 -0.21 0.13 0.82 0.42 0.53 -0.14 0.43 -0.11 -0.13 1.13 0.08 0.16 -0.15 0.09 -1.66 -1.32 -1.54 -0.45 0.55 -0.52 -1.18 -0.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.