Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
-1.11 -0.83 -0.12 -1.59 -3.97 0.29 0.9 0.52 0.77 -2.05 0.83 -0.51 0.53 0.5 0.12 0.43 0.83 0.34 -0.07 0.88 0.03 -1.78 -1.46 0.2 -1.88 -2.21 0.59 1.4 -0.34 0.17 0.65 -0.33 0.37 0.75 0.08 0.65 -0.01 -0.19 -0.57 -0.19 -0.07 0.13 0.39 -2.01 -1.7 -2.12 -0.07 0.66 -1.51 -1.62 -1.11
0.73 0.86 0.6 -1.35 -0.13 0.04 -0.19 0.06 0.9 -0.71 0.88 0.38 0.25 0.39 0.19 0.23 -0.69 0.19 -0.27 1.49 -0.5 -1.25 -3.24 -0.23 -1.1 -1.18 -0.5 0.29 -0.68 0.05 -0.07 -0.25 0.06 -0.72 -0.35 -0.32 1.27 0.41 -0.14 0.28 0.02 0.11 0.66 -0.81 -0.77 -0.67 -0.67 -0.52 -0.59 -0.88 -1.09
1.03 0.83 -0.05 -2.07 -2.24 -0.59 0.67 0.02 0.54 -1.18 0.84 1.16 -0.18 0.36 -0.03 -0.26 -0.5 0.11 0.32 1.41 -0.85 -0.21 -1.23 -0.06 -0.66 -0.89 -0.26 0.4 -0.28 0.34 0.01 -0.02 -0.25 0.08 -0.74 0.14 1.43 -0.61 0.1 0.22 0.25 0.17 -0.06 -0.95 -0.7 -0.83 -0.41 0.3 -2.08 -2.87 -2.43
0.13 0.22 0.12 -1.96 -1.39 0.41 0.55 0.15 1.0 -0.24 1.22 0.07 0.41 0.53 0.22 0.21 -0.2 0.29 -0.4 1.19 -0.29 -0.86 -0.16 -0.09 -0.72 -1.04 0.06 0.54 -0.65 0.02 0.14 -0.36 0.21 0.01 -0.5 0.17 0.54 -0.06 -0.33 -0.06 -0.01 -0.28 0.15 -0.29 -0.11 -0.26 -0.79 0.12 -1.19 -1.94 -1.71
-1.11 -0.38 -1.48 -1.62 -2.5 1.05 0.68 -0.28 1.23 -2.95 1.11 -1.66 0.97 1.11 1.16 1.12 -0.27 1.14 -0.75 0.45 -0.7 -1.13 -1.22 0.01 -1.5 -1.74 0.06 0.68 0.76 -0.92 -0.61 0.44 0.67 -0.18 0.51 0.49 -1.28 -0.18 0.22 0.63 0.5 -0.06 -0.05 -3.12 -2.78 -2.8 -0.15 0.36 -2.21 -2.99 -1.58
-0.23 -0.2 -0.5 -1.53 -2.03 0.33 0.05 -0.49 1.1 -1.33 0.95 0.96 0.66 0.78 0.46 0.35 0.22 0.53 -0.16 0.77 0.05 -0.99 -0.64 -0.1 -0.89 -1.58 0.45 1.6 -0.32 -0.77 -0.62 -0.2 0.47 0.74 0.25 -0.36 1.18 0.36 -0.17 -0.36 -0.16 -0.61 0.17 -1.59 -1.18 -1.21 -1.25 0.03 -1.82 -2.94 -3.2
-1.14 -0.53 0.09 -1.41 -4.03 0.58 1.12 0.17 0.93 -3.78 0.93 -0.93 0.54 0.41 0.11 0.71 0.56 0.23 -0.36 0.27 -0.05 -2.72 -2.59 -0.02 -2.4 -2.07 0.45 1.28 -0.85 -0.23 0.37 0.61 0.53 0.22 0.02 0.61 -0.91 0.27 0.39 0.78 0.99 0.63 0.85 -3.22 -3.13 -3.22 -0.76 0.82 -3.1 -3.41 -2.84
-0.42 0.49 0.67 -2.37 -1.94 0.96 0.85 0.11 0.91 -1.33 1.14 0.16 0.19 0.55 0.29 0.17 0.61 0.46 -0.7 0.68 -0.78 -1.67 -1.53 -0.43 -1.67 -1.58 -0.45 0.7 -0.66 -0.4 -0.16 0.18 0.04 -0.12 0.49 0.07 0.02 0.28 0.11 0.53 0.78 -0.06 0.14 -1.05 -1.06 -1.03 -0.35 0.42 -1.6 -1.42 -0.49
1.14 1.49 0.46 -2.62 -1.25 0.56 0.41 0.12 0.85 0.46 1.07 -0.31 0.12 0.32 -0.0 0.16 0.49 0.09 -0.49 0.84 -0.58 -1.17 -0.39 -0.11 -1.09 -0.7 -0.25 0.46 -0.39 -0.41 -0.36 -0.66 0.23 -0.2 0.07 -0.1 0.26 0.01 -0.83 -0.57 -0.5 -0.58 0.09 0.2 0.03 0.02 -0.59 0.03 -1.88 -2.08 -1.53
-1.12 -0.43 -1.16 -1.72 -2.92 0.94 0.89 -0.4 0.89 -1.11 0.85 -1.18 0.35 0.78 0.76 0.52 0.32 0.95 -0.42 1.07 -0.62 -2.17 -1.53 0.11 -1.89 -2.32 0.36 0.49 0.55 -0.57 -0.27 0.48 -0.03 0.43 0.53 0.69 0.04 0.19 0.44 0.6 0.6 -0.1 -0.41 -1.85 -1.2 -1.84 -0.01 0.5 -2.03 -2.6 -1.31
-0.1 0.58 -0.13 -1.86 -0.54 1.56 0.34 -0.22 1.2 -1.59 1.09 -1.14 -0.11 1.22 0.93 -0.29 0.7 0.99 -0.9 0.47 -0.53 -1.28 -1.77 -0.54 -1.45 -1.0 -0.39 0.57 -0.49 -0.57 -0.09 0.28 -0.54 -0.13 0.45 -0.22 0.51 0.07 0.17 0.48 0.78 0.02 -0.23 -1.83 -1.37 -1.69 -0.67 0.19 -1.6 -1.84 -1.32
-1.53 -0.94 -1.75 -1.54 -3.03 0.79 0.4 -0.19 1.4 -1.71 1.52 -0.84 0.92 1.4 1.51 0.89 -0.05 1.57 -0.89 0.27 -1.32 -2.95 -3.3 -0.21 -2.3 -2.93 -0.15 0.72 0.64 -0.82 -0.37 0.29 0.41 0.18 0.2 0.5 -0.92 -0.41 0.42 0.54 0.46 -0.17 -0.25 -1.85 -1.37 -1.48 -0.41 -0.02 -2.0 -2.46 -1.81
0.2 -0.4 0.03 -0.76 -1.5 0.01 0.57 0.62 0.37 -1.95 0.64 -0.31 0.68 0.01 -0.06 0.47 -0.09 -0.2 0.69 0.34 -0.08 -1.15 -0.89 -0.01 -0.86 -1.82 0.45 0.67 -0.73 0.1 0.43 0.32 0.57 0.73 -0.74 0.62 -0.32 -0.06 0.06 0.28 0.37 0.7 0.73 -1.54 -1.28 -1.36 0.1 0.67 -0.93 -2.38 -2.71
0.04 0.39 -0.46 -1.19 -1.53 1.34 0.43 -0.32 0.97 -1.95 0.66 -1.05 0.66 0.93 0.77 0.49 0.51 0.75 -0.64 0.83 -0.94 -0.73 -1.14 -0.21 -0.59 -1.48 -0.02 0.37 0.33 -0.76 -0.35 0.47 0.44 0.45 0.53 0.18 -0.18 0.23 0.42 0.32 0.35 -0.14 -0.3 -1.66 -1.43 -1.65 -0.59 0.34 -1.96 -3.51 -3.32
-0.57 0.8 -1.52 -1.7 -1.68 1.09 0.01 -0.43 1.35 0.34 1.36 -0.99 0.57 1.3 1.21 0.55 -0.25 1.24 -1.28 0.37 -0.86 -1.94 -2.02 -0.16 -1.81 -1.9 -0.31 0.43 0.44 -1.43 -0.94 0.08 0.17 -0.18 -0.07 0.0 -0.09 -0.58 0.02 0.14 0.07 -0.76 -0.45 -0.27 0.16 -0.12 -0.59 -0.27 -0.79 -0.94 -0.42
-0.62 -0.28 -0.74 -0.72 -3.28 0.34 0.09 -0.18 0.97 -1.8 0.81 -1.09 0.67 1.16 1.12 0.75 -0.77 1.14 -1.07 1.01 -0.61 -0.57 -1.93 0.52 -0.74 -1.32 0.33 0.44 1.07 -0.17 0.22 0.39 0.5 0.02 -0.11 0.22 0.26 -0.21 0.14 0.38 0.14 -0.35 -0.36 -1.83 -1.61 -1.67 -0.72 -0.03 -0.49 -2.09 -1.46
-0.19 0.19 -0.49 -1.62 -1.55 -0.1 0.15 0.46 1.45 -0.98 1.48 -1.05 0.93 0.84 0.86 0.71 -1.12 0.89 -1.39 0.96 -0.49 -0.59 -0.68 -0.39 -0.72 -1.12 -0.13 0.34 -0.04 0.04 0.43 0.22 0.54 -0.8 -0.66 0.01 0.28 -0.59 -0.21 0.18 0.04 0.11 0.15 -0.8 -0.94 -0.85 0.07 -0.17 -1.64 -1.91 -1.33
-1.4 -0.94 0.02 0.13 -3.14 0.17 0.27 0.01 1.29 -1.62 0.92 -2.07 0.42 0.27 0.14 0.46 -0.0 0.44 -1.26 1.38 0.07 -2.63 -0.63 0.46 -1.48 -0.89 0.46 1.33 -0.55 0.27 0.77 0.27 0.02 -0.22 -0.65 0.13 -0.3 0.18 0.39 0.84 0.55 0.17 0.62 -2.19 -1.9 -1.96 -0.53 0.13 -1.1 -1.77 -1.55
0.26 -0.12 -0.25 -2.07 0.06 1.33 0.89 -0.18 0.71 -0.4 0.91 0.19 0.24 0.51 0.5 0.2 0.8 0.65 -0.68 0.25 -1.14 -1.46 -1.51 -0.9 -1.46 -1.82 -0.74 -0.15 -0.85 -0.83 -0.37 0.29 -0.04 0.58 0.46 0.59 -0.04 -0.16 0.22 0.2 0.21 -0.12 -0.18 -0.67 -0.24 -0.55 0.21 0.6 -0.87 -1.49 -0.73
-0.87 -0.58 -0.14 -0.89 -2.62 1.06 0.84 -0.03 1.21 -1.51 0.76 -0.93 0.68 0.17 -0.13 0.82 0.33 -0.01 -0.74 0.73 -0.44 -2.46 -1.81 0.32 -2.22 -2.0 0.63 1.25 -0.58 -0.35 0.19 0.09 0.48 0.39 0.53 0.42 -0.22 0.94 0.11 0.3 0.44 -0.3 0.63 -1.26 -0.73 -1.31 -0.65 0.3 -2.74 -3.41 -2.28
-0.59 -0.24 -0.36 -1.67 -3.33 0.53 0.5 -0.45 1.25 -1.89 0.98 -1.08 0.78 0.68 0.44 0.35 -0.03 0.52 -0.78 0.37 0.44 -1.49 -1.92 0.42 -1.09 -2.11 0.84 1.15 0.7 -0.29 0.28 0.39 0.54 0.24 0.2 0.15 -0.54 0.66 0.41 0.47 0.47 -0.13 0.16 -2.3 -1.24 -1.88 -2.24 0.58 -1.44 -3.86 -3.65
-0.34 0.11 -0.56 -1.67 -1.53 0.51 0.55 -0.53 1.08 -1.05 0.83 -1.17 0.62 0.81 0.65 0.53 0.08 0.78 -0.49 1.13 -0.27 -1.25 -1.54 -0.37 -0.78 -1.35 -0.19 0.58 -0.41 -0.48 -0.23 0.54 0.39 -0.04 -0.08 0.33 0.89 0.12 0.2 0.21 0.33 0.19 0.35 -1.21 -0.82 -1.03 -0.55 0.29 -0.64 -2.15 -1.9
-0.48 -0.07 -0.62 -1.89 -1.81 0.43 0.65 0.22 1.46 -1.56 1.41 -0.52 0.66 0.79 0.72 0.54 0.13 0.83 -0.91 0.66 -0.33 -0.91 -1.36 -0.26 -1.02 -1.24 -0.12 0.96 -0.46 -0.26 0.29 0.14 0.28 0.18 -0.44 0.32 0.13 -0.6 0.08 0.28 0.43 -0.07 0.3 -1.68 -1.58 -1.58 -0.09 0.3 -1.5 -2.14 -1.53
-0.79 -1.09 -0.49 -0.42 -2.0 -1.12 -0.22 0.34 0.46 -0.2 0.58 0.25 0.05 0.03 -0.26 0.37 0.28 -0.4 1.43 0.7 1.3 -1.28 -1.28 -0.39 -1.07 -1.12 0.4 0.23 -1.26 0.88 0.69 0.06 0.17 0.11 -0.23 0.11 -0.5 1.04 0.01 0.09 0.07 0.72 0.43 -0.56 0.04 -0.18 -0.04 0.01 -2.67 -3.62 -4.64
0.75 -0.08 0.29 -0.87 -3.26 -0.12 -0.25 1.1 0.96 -2.23 0.98 -1.04 0.37 0.86 0.59 0.29 -0.03 0.33 -0.05 0.54 -0.01 -1.48 0.15 0.47 -1.21 -1.2 0.65 1.06 -0.49 1.09 1.38 -0.51 0.32 -0.24 -0.78 -0.2 -0.83 -0.4 -0.97 -0.56 -0.62 0.07 0.73 -2.24 -2.08 -2.42 0.18 -0.3 -0.94 -2.02 -2.26
-1.04 0.45 -0.04 -0.53 -2.85 0.42 0.16 0.03 1.23 -2.6 1.12 -0.91 0.26 1.38 0.85 0.16 0.05 0.94 -0.34 0.85 -0.1 -1.08 -1.24 0.42 -1.12 -0.89 0.52 1.31 -0.07 0.23 0.49 -0.24 0.06 0.41 -0.47 0.18 0.15 -0.19 -0.32 -0.2 -0.07 -0.25 0.29 -2.47 -2.88 -2.82 -0.63 0.31 -1.38 -2.87 -2.34
-0.71 -1.04 -0.88 -1.32 -1.59 0.45 0.72 0.29 1.21 -1.94 1.3 0.23 0.33 0.94 0.72 0.26 -0.06 0.89 -0.35 0.76 -0.5 -1.24 -0.51 -0.29 -1.31 -2.1 0.01 0.94 -0.52 0.48 0.76 0.04 0.13 0.53 -0.39 0.26 0.14 -0.63 -0.27 0.09 0.27 0.0 0.26 -1.96 -1.22 -2.21 -0.08 0.71 -1.28 -2.32 -2.16
-1.11 0.1 0.34 -1.2 -2.3 0.66 0.38 0.48 1.39 -2.64 1.48 -0.42 0.8 0.8 0.51 0.78 0.38 0.7 -0.36 0.73 -0.02 -1.18 -1.13 0.02 -1.36 -0.55 0.12 0.95 -0.38 -0.13 0.1 -0.44 0.77 -0.28 -0.29 0.21 -0.0 -0.83 -0.46 -0.4 -0.45 -0.5 0.69 -2.24 -2.37 -2.15 -0.39 -0.07 -0.88 -1.19 -0.83
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0.16 -0.03 -0.1 -2.16 -1.18 0.52 0.73 -0.19 1.05 0.15 0.97 0.29 0.31 -0.16 -0.3 0.23 0.3 -0.1 -1.03 0.57 -0.36 -0.93 -1.69 -0.17 -1.01 -1.06 0.01 0.79 -0.64 -0.53 -0.14 0.48 0.07 0.0 -0.05 0.12 0.42 0.2 0.24 0.29 0.46 -0.31 0.2 -0.05 0.04 -0.01 -0.73 0.28 -0.5 -1.14 -0.75
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-0.85 -0.96 0.39 -2.33 -1.33 1.57 0.85 1.01 1.0 -1.89 1.2 -0.8 -0.14 0.87 0.65 0.01 1.0 0.54 0.4 -0.03 -0.97 -2.75 -1.92 -1.08 -2.24 -1.37 -0.52 0.41 -1.58 -0.44 -0.16 0.7 -0.23 -0.24 0.38 0.32 -0.44 0.08 0.24 0.58 0.81 0.17 0.04 -1.37 -1.45 -1.45 -0.25 0.73 -1.1 -1.69 -1.24
0.82 0.34 -0.35 -1.68 -2.18 0.36 1.0 -0.9 0.59 -0.94 0.88 -0.07 0.03 -0.1 -0.07 0.04 0.29 0.09 -0.39 0.77 -0.77 -1.72 -1.32 -0.02 -1.29 -1.67 -0.05 0.59 -0.13 -0.46 -0.43 1.16 -0.14 0.84 0.54 0.52 -0.13 0.33 0.67 0.66 0.5 -0.04 -0.23 -1.15 -0.81 -0.81 -0.76 0.65 -0.89 -1.71 -1.09
0.83 -1.39 -1.95 1.43 -3.65 0.71 0.18 -2.7 1.53 -1.73 1.54 -0.58 0.27 1.84 1.11 0.11 -0.08 1.27 -2.06 1.06 -0.34 -1.76 -1.98 0.05 -1.84 -2.15 0.18 1.34 -0.21 -1.11 -1.82 0.25 -0.42 0.4 -0.66 -0.4 0.39 -0.1 0.11 0.29 0.04 -0.15 -0.21 -2.21 -1.45 -1.23 -1.63 -0.68 -3.45 -3.43 -2.7
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-1.84 -1.16 -0.87 -1.28 -0.26 0.25 -0.1 -0.24 1.31 -3.11 0.85 -1.02 0.47 0.65 0.19 0.41 -0.62 0.42 -0.83 1.15 0.63 -0.68 -1.48 0.96 -0.54 -1.36 0.82 1.64 0.62 -0.05 0.28 -0.18 -0.04 -0.51 -1.19 -0.15 0.14 -1.32 -0.47 0.05 -0.05 -0.44 0.58 -2.43 -2.02 -2.16 -0.22 0.03 0.6 -0.08 -0.11
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0.42 0.01 0.13 0.28 -0.29 0.07 0.51 -0.86 0.51 -1.98 0.58 0.11 -0.05 0.28 0.22 -0.2 0.01 0.32 -0.08 0.0 -0.39 0.08 -0.75 -0.29 0.18 -0.93 0.14 0.74 -0.45 -0.15 -0.03 0.53 -0.53 0.1 -0.21 0.27 -0.31 0.12 0.06 0.45 0.41 0.06 -0.14 -1.72 -1.07 -1.28 -0.32 0.66 0.07 -0.04 0.14
-0.04 -0.17 0.07 -2.64 -2.07 0.12 1.01 0.76 0.37 -1.36 0.44 -1.02 0.13 0.7 0.46 0.14 0.49 0.44 0.18 0.63 -0.8 -2.23 -1.29 -0.39 -1.86 -1.8 -0.15 0.67 -1.12 0.16 0.32 0.41 0.29 0.61 0.48 0.81 0.02 0.84 -0.42 0.16 -0.16 -0.01 0.2 -1.13 -0.91 -0.95 -0.36 0.8 -0.32 -0.81 -0.85
-0.63 -0.28 -0.19 0.3 -1.89 -0.01 -0.51 0.33 0.88 -2.15 0.87 -1.62 0.39 0.09 -0.09 0.39 0.28 -0.3 0.07 0.28 0.67 -1.17 -0.53 0.55 -0.83 -0.63 0.71 1.36 0.02 0.31 0.63 0.52 0.31 -0.64 -0.53 -0.44 -0.24 0.65 -0.06 0.11 0.21 0.5 0.85 -1.3 -1.34 -1.35 -0.98 -0.1 -0.45 -1.11 -1.93
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-0.2 0.65 0.01 -1.89 -2.21 0.64 0.33 0.71 0.95 -0.13 0.95 -0.22 0.84 0.57 0.47 0.67 0.27 0.65 -1.19 0.14 -0.55 -1.58 -1.01 -0.01 -1.34 -1.2 0.21 1.0 -0.35 -0.2 -0.18 0.01 0.65 0.19 -0.1 0.19 -0.68 0.61 -0.27 -0.73 -0.41 -0.2 0.28 -0.6 -0.28 0.08 -0.89 -0.47 -0.83 -1.68 -1.0
0.05 -0.18 0.37 -1.84 -2.08 0.44 0.72 0.73 0.48 -1.23 0.81 -0.03 0.54 0.36 0.57 0.51 0.32 0.61 -0.32 0.16 -0.93 -1.37 -1.32 -0.41 -1.0 -1.74 -0.44 0.07 -0.66 -0.05 0.23 0.36 0.53 0.51 -0.04 0.85 -0.79 -0.27 0.81 0.11 0.08 0.35 0.35 -1.53 -1.43 -1.32 0.47 0.52 -0.87 -1.24 -0.72
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-2.27 -1.05 -0.39 -2.9 - -0.19 0.14 -0.07 1.9 -2.86 2.04 -0.8 0.88 0.88 0.37 0.61 -0.41 0.72 -0.32 0.26 -0.1 -1.67 -1.04 -0.33 -1.54 -1.29 -0.03 1.08 -0.83 -0.5 -0.21 0.29 0.42 -0.35 -0.71 -0.56 0.27 -0.62 2.02 1.22 0.08 -0.49 -0.16 -2.63 -2.95 -2.01 0.09 -0.01 -4.05 -3.29 -2.14
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.