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Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
0.98 0.83 0.31 -3.19 1.15 1.58 0.65 -0.65 -0.37 0.41 -0.1 0.68 -0.37 -0.37 -0.11 -0.36 1.02 0.1 -2.86 0.01 -0.82 0.0 -3.05 -0.41 -0.19 -0.28 -0.85 -0.6 -0.21 -0.92 -0.87 -0.54 -0.52 0.31 1.1 -0.26 -0.2 0.96 -0.55 -0.41 -0.51 -0.88 -0.56 0.12 0.48 0.28 -0.76 -0.5 -0.81 -0.76 0.16
1.09 0.81 0.27 -2.16 0.68 0.94 0.71 -0.79 0.23 -0.25 0.48 1.04 -0.43 -0.35 -0.47 -0.44 0.65 -0.39 -0.33 -0.48 -0.35 -0.13 -0.44 -0.35 -0.24 -0.25 -0.23 -0.17 -0.19 -0.61 -0.49 -0.37 -0.59 0.54 0.47 0.25 0.04 0.67 -0.43 -0.46 -0.53 -0.81 -0.51 -0.48 0.04 -0.34 -0.21 0.37 -0.55 -0.59 0.23
1.03 2.3 1.12 -2.39 0.93 1.16 0.8 -0.66 -0.83 0.34 -0.82 0.3 -0.83 -1.19 -0.87 -0.79 1.34 -0.81 -1.07 0.41 -1.22 -1.94 -2.88 -1.65 -2.07 -1.4 -1.72 -1.45 -1.97 -0.97 -0.53 0.25 -0.76 0.04 1.24 0.31 0.64 0.77 0.08 0.23 0.46 -0.62 -0.57 -0.29 0.19 -0.19 -0.47 0.18 -1.44 -1.72 -0.65
-0.01 0.41 -0.07 -1.46 -0.05 0.48 0.55 -1.41 -0.11 0.19 0.25 1.44 0.08 -0.08 -0.03 0.27 -0.53 0.18 -1.33 -0.63 0.58 0.17 -0.47 0.11 0.15 -1.25 -0.09 0.31 0.49 -1.1 -1.01 -0.05 0.09 0.53 0.26 -0.21 -0.21 0.21 0.29 0.2 0.04 -1.1 -0.4 -0.54 0.09 -0.47 -1.55 0.24 -0.2 -0.12 0.74
0.44 0.92 0.52 -3.23 0.87 0.65 0.82 -1.56 -0.45 0.42 -0.12 0.05 -0.64 -0.55 -0.39 -0.97 0.3 -0.16 -1.34 -0.09 -1.31 -1.02 -1.7 -0.98 -1.25 -1.09 -1.29 -1.32 -0.68 -1.65 -1.19 0.65 -0.76 0.28 1.01 -0.01 1.08 1.04 0.84 0.51 0.58 -0.73 -1.42 0.46 0.49 0.67 -1.04 0.32 -0.66 -0.17 0.97
1.23 0.88 0.5 -0.91 0.99 0.66 0.69 -1.16 -0.42 -0.84 -0.29 0.58 -0.47 -0.64 -0.52 -0.37 0.66 -0.29 -1.32 -0.52 -0.13 -0.09 -1.07 -0.33 -0.19 -0.68 0.45 0.98 0.22 -0.75 -0.68 0.38 -0.78 0.03 0.52 -0.2 0.18 0.16 0.63 0.3 0.14 -0.37 -0.35 -1.55 -0.73 -1.45 -0.55 0.22 -0.1 -0.27 0.18
0.28 0.05 0.53 -0.54 0.81 0.69 -0.18 -3.83 -0.06 0.91 -0.07 -0.8 -1.37 -0.51 -0.13 -1.1 -1.01 -0.09 -1.98 0.12 -1.32 -0.39 0.13 0.23 -0.11 -0.14 0.34 1.45 0.18 -1.33 -1.87 -1.24 -1.95 1.66 2.12 -0.64 0.46 0.58 -1.18 -0.06 -0.4 -1.9 -0.58 -0.43 -0.45 0.04 -2.53 -0.46 0.34 0.11 0.12
0.73 0.61 0.12 -1.99 0.71 0.66 1.0 -0.74 -0.2 0.17 -0.06 0.36 -0.35 -0.34 -0.28 -0.43 0.98 -0.15 -0.3 -0.13 -1.34 -0.37 -1.16 -1.13 -0.36 -0.84 -1.0 -1.06 -0.71 -0.83 -0.57 0.46 -0.27 0.27 0.66 0.65 -0.06 0.57 0.5 0.22 0.24 -0.42 -0.56 0.2 0.21 0.3 0.02 0.54 -0.43 -0.61 -0.2
1.39 1.73 0.06 -1.25 0.26 -0.41 0.5 -1.44 -0.63 0.08 -0.67 0.23 -0.21 -0.53 -0.41 -0.37 -0.87 -0.17 -1.34 -0.71 -0.48 0.53 -0.15 -0.08 0.55 -1.21 -0.43 -0.4 0.06 -0.6 -1.04 0.42 -0.61 -0.1 -0.74 -0.47 0.21 -0.24 0.91 1.06 0.31 -0.29 -0.34 0.16 0.45 0.35 -0.65 0.26 -0.06 -0.49 -0.19
1.05 1.01 0.66 -1.47 0.98 0.42 0.89 -1.39 -0.57 0.27 -0.33 0.95 -0.38 -0.66 -0.59 -0.39 0.14 -0.43 -0.95 0.07 -0.84 -0.31 -1.03 -0.19 -0.48 -0.9 -0.54 -0.32 -0.16 -1.12 -0.97 0.31 -0.58 0.21 0.54 0.21 0.41 0.3 0.26 0.2 0.22 -0.86 -0.68 -0.13 0.05 0.16 -1.1 0.36 -0.06 -0.13 0.72
-0.18 0.23 0.18 -2.04 1.62 0.66 1.15 -2.0 -0.47 0.3 -0.09 0.67 -0.75 -0.29 -0.21 -0.73 0.38 -0.04 -1.0 -0.14 -0.79 -0.11 -0.45 -0.11 -0.17 -0.88 -0.05 0.34 0.11 -1.46 -1.12 -0.23 -1.17 0.35 1.13 0.53 -0.26 0.89 -0.42 0.12 0.35 -0.89 -0.93 0.15 0.18 0.03 -0.86 0.55 -0.65 -0.62 0.02
0.6 0.44 0.21 -1.41 0.74 0.22 0.8 -0.79 -0.08 0.12 0.16 0.62 -0.24 -0.23 -0.13 -0.3 -0.18 0.01 -0.79 -0.11 -0.13 0.07 0.14 0.08 0.07 -0.68 -0.07 -0.07 0.23 -0.72 -0.69 0.04 -0.45 0.08 0.21 0.3 0.74 0.59 0.38 0.36 -0.11 -0.61 -0.45 -0.23 0.03 -0.1 -0.64 0.3 -0.4 -1.14 -0.59
0.65 1.55 0.6 -0.92 0.26 -0.01 0.71 -1.59 -0.31 -0.03 -0.08 0.28 0.07 -0.56 -0.36 -0.13 -0.11 -0.18 -1.07 -0.05 -0.56 0.36 0.03 -0.12 0.16 -0.7 -0.24 0.29 0.14 -1.02 -0.91 0.56 -0.11 -0.08 0.45 -0.2 0.33 0.3 0.57 0.5 0.48 -0.5 -0.32 -0.33 -0.15 -0.29 -0.89 0.27 -0.61 -1.32 -0.59
0.48 1.68 1.35 -0.55 1.61 0.45 0.72 -1.69 -1.28 -0.62 -0.86 0.07 -0.56 -1.1 -1.28 -1.77 -1.11 -0.82 -1.11 0.25 -1.57 -0.51 -2.05 -1.64 -0.86 -2.03 -1.59 -1.67 -1.7 -0.57 -0.18 0.96 -0.59 0.66 0.8 -0.15 0.88 1.14 1.13 1.16 0.98 -0.12 -1.77 -1.03 -0.88 -1.5 -2.26 0.54 -0.42 0.25 0.25
0.41 0.56 0.0 -1.37 0.28 0.75 0.27 -0.83 0.19 0.11 0.59 0.76 0.22 -0.3 -0.17 -0.0 0.24 0.02 -1.45 -0.27 -0.79 0.33 -1.19 -0.27 0.18 -0.85 -0.59 0.01 0.11 -0.74 -0.53 0.27 0.08 0.04 0.27 -0.29 -0.03 -0.51 0.68 0.34 0.28 -0.48 -0.54 -0.25 0.1 -0.04 -0.85 -0.04 0.27 0.06 0.59
0.44 -0.43 -1.43 -1.64 1.01 0.83 0.17 -3.78 0.52 0.17 0.27 0.15 -0.15 0.08 0.22 -0.09 1.37 0.5 -0.45 0.21 -0.62 0.99 0.08 -0.58 0.62 0.78 -0.1 -0.4 0.41 -1.44 -1.94 0.22 -0.63 -0.24 0.59 -0.28 0.63 0.53 -0.09 -0.1 -0.3 -0.69 -0.69 -0.48 -0.14 -0.33 -1.93 -0.11 -0.9 -1.16 -0.72
-3.17 2.01 1.15 0.3 -1.46 -0.82 0.73 -2.46 -1.45 0.29 -0.05 0.32 -1.9 -0.02 -0.0 -1.62 -1.99 0.17 -1.03 -0.1 0.14 -0.36 -1.37 -1.51 -0.56 -0.18 -0.5 -1.14 -0.65 -1.3 -1.1 1.39 -1.92 0.6 0.7 -1.49 1.19 -0.37 2.03 1.58 1.21 -1.09 -1.71 -0.5 0.09 -0.08 -3.41 0.68 -1.89 -2.46 -3.02
0.5 0.61 0.12 -1.07 0.34 0.66 1.16 -1.63 -0.58 0.31 -0.26 1.01 -0.54 -0.3 -0.13 -0.32 0.13 0.02 -0.75 -0.15 -1.32 -1.17 -1.21 -0.35 -0.91 -0.95 -0.66 -0.09 -0.37 -1.43 -1.28 0.22 -0.78 0.96 0.81 0.75 0.43 0.43 0.16 0.26 0.27 -0.74 -0.56 0.13 0.48 0.1 -0.64 0.7 -0.08 -0.42 0.19
0.99 0.51 -0.08 -0.99 0.4 0.41 0.21 -1.97 -0.18 0.72 -0.1 1.9 -0.05 -0.07 -0.12 -0.43 0.77 0.03 -0.86 -0.12 -0.64 -1.05 -0.99 -0.15 -1.05 -0.4 -0.17 0.7 -0.26 -1.5 -1.89 -0.27 -0.38 1.5 0.88 -0.17 0.69 0.2 -0.34 -0.49 -0.64 -1.04 -0.54 -1.3 -0.23 -0.23 -1.2 0.1 -0.2 -0.62 -0.01
0.61 -0.23 -0.86 -1.45 1.28 0.37 0.61 -2.43 -0.28 -0.47 -0.21 1.02 -0.22 -0.14 -0.18 -0.53 -0.37 -0.02 -0.8 0.29 -0.65 -0.53 -0.86 0.1 -0.37 -1.19 -0.04 0.3 0.2 -1.43 -1.55 0.14 -0.66 1.01 0.36 0.13 0.54 0.48 0.37 0.3 0.05 -0.03 -0.62 -0.1 0.27 0.02 -0.64 0.35 0.2 0.14 0.29
0.62 -0.2 0.31 -0.85 -0.15 1.14 0.77 -3.33 -0.08 -0.66 -0.18 0.68 -0.15 -0.2 -0.22 -0.03 1.05 -0.09 -0.69 -0.97 -0.57 -0.22 -1.33 -0.45 -0.18 -1.1 -0.33 -0.14 -0.43 -0.98 -1.29 0.12 -0.58 0.55 0.87 0.34 -0.63 1.38 0.12 0.09 0.31 -0.37 -0.33 -0.53 -0.13 -0.18 -0.79 0.7 0.19 0.12 0.37
-2.54 0.21 0.2 -2.12 2.01 0.52 0.78 -6.02 -1.35 0.21 -0.4 0.65 -1.91 0.22 0.61 -1.4 0.24 0.9 -1.86 0.31 -1.23 -0.86 -1.45 -0.11 -0.96 -0.91 -0.65 1.54 0.3 -2.82 -1.86 -0.25 -4.86 -0.18 1.72 0.21 0.24 1.28 -0.15 0.51 0.52 -0.74 -0.88 -0.49 -0.19 -0.64 -1.57 0.18 -1.18 -0.53 0.33
0.88 0.88 -0.19 -1.61 0.79 0.46 0.26 -0.7 0.36 0.32 0.56 0.52 -0.23 0.22 0.18 -0.36 -0.16 0.23 -1.1 -0.11 -0.61 0.32 -1.13 -0.22 0.12 -0.51 -0.71 0.06 -0.0 -0.76 -0.67 -0.09 -0.49 -0.18 -0.2 -0.08 0.13 -0.1 0.15 0.0 -0.16 -0.57 -0.42 -0.08 0.26 0.12 -0.41 0.11 0.29 0.22 0.32
0.49 1.04 1.32 -1.4 -0.88 1.03 0.79 -0.82 -0.01 -0.58 0.59 0.3 -1.08 -0.21 -0.09 -0.94 0.17 0.05 -0.39 0.24 -1.22 -0.06 -1.16 -1.32 -0.06 -0.04 -1.04 -1.05 -0.87 -0.52 -0.24 0.71 -1.12 -0.12 0.3 0.51 -0.39 0.99 0.29 0.65 0.55 -0.4 -0.52 -0.29 -0.06 -0.16 -0.52 0.41 -0.36 -0.91 0.17
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1.59 1.99 1.45 -2.16 0.79 0.05 1.14 -0.79 -1.06 -0.88 -0.84 0.23 -1.35 -0.97 -0.85 -1.29 0.33 -0.59 -0.34 -0.59 -1.52 -0.43 -1.51 -1.6 -0.49 -1.19 -1.85 -1.89 -1.53 0.02 0.13 0.71 -1.52 -0.55 0.96 0.05 0.12 0.32 0.64 0.57 0.64 -0.05 -0.84 -1.47 -0.87 -1.19 -0.61 0.75 -0.31 0.16 0.9
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1.44 0.4 0.27 -2.0 1.17 0.61 0.71 -2.55 -0.78 -0.08 -0.63 0.76 -1.42 -0.43 -0.39 -1.01 0.46 -0.12 0.32 1.07 -1.87 -1.27 -1.43 -0.78 -1.06 -1.42 -0.69 -0.48 -0.47 -1.24 -1.41 -0.13 -1.71 0.06 1.23 0.55 0.78 1.86 0.51 0.04 -0.12 -0.85 -1.6 -0.59 -0.09 -0.13 -1.04 0.2 -0.4 -0.31 0.38
1.15 0.53 -0.25 -1.48 0.01 0.53 1.01 -1.05 0.19 -0.39 0.31 0.94 -0.4 -0.41 -0.34 -0.5 0.77 -0.18 -0.44 -0.36 -0.48 -0.63 -0.43 -0.36 -0.79 -0.97 -0.13 -0.09 -0.16 -0.77 -0.81 0.93 -0.65 0.71 0.45 0.26 -0.18 0.1 1.29 0.2 0.1 -0.14 -0.73 -0.35 -0.09 -0.22 -0.67 0.73 -0.46 -1.62 -1.57

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.