Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
0.55 0.6 -0.41 -1.47 0.76 -0.1 0.0 -1.64 0.12 0.26 0.32 1.0 -0.05 0.12 0.12 -0.53 -1.37 0.18 -1.39 -0.06 -0.39 0.82 -0.07 -0.29 0.71 -0.54 -0.77 -0.26 -0.21 -1.0 -1.05 0.85 -0.34 -0.14 -0.76 -0.75 0.58 -0.89 1.65 0.57 0.78 -0.77 -0.53 -0.53 -0.3 -0.24 -1.66 0.1 0.27 -0.55 -0.17
0.24 0.13 0.13 -0.66 -1.37 0.15 1.1 -0.24 0.04 -1.32 0.07 -0.27 -0.19 -0.58 -0.6 -0.08 0.72 -0.55 0.13 0.04 -0.92 -1.63 -1.41 -0.62 -1.39 -1.39 0.1 -0.04 -1.02 -0.2 0.16 1.11 -0.27 0.53 -0.12 0.89 -0.15 0.48 0.76 0.85 0.74 0.69 0.1 -0.81 -0.47 -0.66 0.04 1.09 -0.25 -0.82 -0.76
0.44 2.26 1.91 -1.23 -2.09 -0.34 1.36 -0.52 -1.19 -4.22 -1.06 -0.85 -1.12 -0.18 -0.32 -1.2 -0.59 -0.04 -0.31 -0.65 -0.32 -0.14 -0.8 -1.69 0.08 -1.65 -0.94 -1.76 -1.22 -0.26 -0.46 1.24 -1.09 -0.84 0.22 0.27 -1.44 -1.95 1.31 1.86 1.58 0.11 -1.01 -4.23 -3.12 -3.26 -0.88 1.31 -1.0 -0.57 -0.11
-1.05 2.27 0.99 -2.89 -1.37 -0.77 0.94 -0.9 0.14 -2.78 -0.16 -2.7 -0.35 -1.14 -1.34 -0.52 -0.9 -1.16 0.09 -1.72 -1.48 0.42 -1.71 -1.17 0.84 -1.73 -0.49 -2.07 -0.44 -0.7 -0.62 1.64 -0.5 -1.04 -1.29 0.88 -1.07 -0.39 2.25 1.93 1.6 -0.04 -0.66 -3.29 -2.46 -2.93 0.6 0.87 -1.68 -1.91 -1.67
2.43 0.55 2.42 0.35 -1.93 -1.39 1.3 -1.2 -1.9 -2.47 -2.73 -1.83 -1.08 -2.43 -2.23 -1.57 -0.1 -2.2 -0.93 -1.41 -2.22 -2.4 -3.48 -2.53 -2.65 -3.04 -2.66 -2.0 -3.37 0.08 0.01 1.7 -1.05 0.27 1.43 0.97 -1.26 -1.15 1.97 1.86 1.88 -0.99 -0.38 -2.86 -3.06 -2.98 -0.96 1.12 -3.3 -3.89 -3.58
- 0.05 -4.55 -3.66 -4.7 -5.36 0.37 -5.71 -2.96 -0.93 -3.28 -2.52 -2.54 -2.99 -3.52 -4.42 -4.13 -3.05 -1.1 -1.58 -4.42 -2.02 0.1 -2.55 -2.35 -1.7 -2.16 -2.62 -2.66 -0.79 -0.26 2.27 -1.81 -1.1 -2.79 -1.95 -0.81 -1.27 3.7 3.26 2.87 0.9 -2.27 -1.36 -1.06 -1.44 -6.22 0.57 -2.8 -2.0 -3.17
0.42 0.18 0.03 -1.12 0.77 0.76 1.14 -0.58 -0.0 -0.6 -0.14 -0.31 0.05 -0.61 -0.59 0.28 0.96 -0.49 -0.33 -0.17 -1.01 -1.32 -1.25 -0.87 -1.36 -1.4 -0.54 -0.46 -1.07 -0.88 -0.67 1.09 0.01 0.55 0.4 0.75 -0.26 0.65 0.88 0.87 0.78 0.25 0.34 -0.98 -0.97 -1.0 -0.09 0.97 -0.71 -1.23 -1.0
-0.15 0.65 0.01 -1.91 1.65 0.42 0.95 -0.35 0.19 -0.98 0.22 -0.59 0.02 -0.66 -0.75 -0.11 0.73 -0.52 -0.3 0.22 -0.72 -0.4 -0.92 -0.66 -0.45 -0.98 -0.04 -0.41 -0.62 -0.48 -0.17 0.71 -0.01 0.78 0.39 0.43 0.29 -0.08 0.62 0.46 0.38 -0.13 0.15 -0.81 -0.57 -0.82 -0.57 0.7 -0.23 -1.07 -0.99
0.29 -0.38 -0.06 -0.77 -0.79 0.55 1.3 -0.79 -0.09 -2.1 -0.18 -0.21 0.04 0.02 0.08 0.28 0.54 0.19 -0.36 -0.26 -1.1 -1.63 -1.72 -0.14 -1.04 -1.95 0.2 0.31 -0.32 -0.53 -0.32 1.03 -0.16 0.92 0.44 0.78 -0.99 0.83 0.77 1.03 0.88 0.47 0.14 -2.11 -1.8 -1.84 -0.59 1.11 -0.78 -1.08 -0.74
0.82 0.8 1.11 -0.46 -0.14 0.7 0.18 -0.97 0.48 -1.73 0.3 -0.05 0.22 -1.06 -1.01 0.05 0.2 -0.82 -0.13 -0.26 -0.46 -0.0 -0.82 -0.06 -0.11 -0.87 0.23 0.6 -0.35 -0.26 -0.08 -0.58 -0.07 0.76 0.4 0.42 -0.09 1.27 -0.05 0.52 0.18 -0.49 0.4 -1.32 -0.95 -0.98 -0.67 0.13 -0.51 -0.94 -0.54
0.54 0.64 0.74 -1.2 -1.5 -0.91 1.14 0.3 -1.13 -0.17 -0.72 -0.13 -0.69 -0.94 -0.7 -0.52 -0.77 -0.77 -0.22 -0.26 -0.65 -0.65 -0.59 -1.25 -0.57 -0.98 -0.98 -1.26 -1.67 0.27 0.73 1.39 -0.18 -0.27 -0.49 0.48 -0.83 -0.99 1.56 1.86 1.6 0.33 0.03 -0.06 -0.27 -0.19 -0.31 0.91 -1.64 -1.55 -1.57
0.27 -0.26 -0.07 0.0 0.27 -0.07 0.62 -0.21 0.04 -0.12 -0.22 -0.47 0.35 -0.43 -0.34 0.24 0.16 -0.29 0.27 0.35 -0.62 -0.6 -0.55 -0.34 -0.27 -0.73 0.13 0.08 -0.43 -0.47 -0.35 0.76 0.26 0.1 0.08 0.69 0.29 0.26 0.48 0.59 0.47 0.27 0.31 -1.06 -0.87 -0.95 -0.15 0.58 -0.29 -0.67 -0.45
- -3.82 -3.33 -1.36 -3.38 -4.04 -0.85 -5.39 -1.95 0.41 -1.74 -0.31 -2.04 -2.68 -1.93 -3.5 -3.81 -2.09 -2.69 0.05 -4.91 -4.56 0.62 -2.71 -4.03 -3.14 -2.88 -2.62 -2.05 -3.17 -2.86 -0.24 -1.75 -0.05 1.4 - 2.64 -2.23 1.47 0.24 0.11 -2.35 0.35 3.12 2.94 2.23 - -1.28 -0.49 -0.06 0.36
0.11 0.23 0.18 0.31 -1.98 -0.49 0.85 -0.65 -0.24 -1.3 -0.11 0.29 0.18 -0.55 -0.46 0.17 0.6 -0.43 -0.02 0.34 -0.93 -0.81 -0.59 -0.5 -0.74 -0.97 -0.27 0.36 -0.69 -0.92 -0.79 1.04 0.06 -0.11 0.88 0.24 0.62 0.27 1.02 1.09 1.2 0.63 0.05 -1.37 -0.95 -0.98 -0.33 0.79 -0.89 -1.72 -1.42
-2.19 -0.53 -0.29 0.19 -2.35 0.84 0.74 -1.34 0.61 -4.03 0.32 -1.44 0.25 0.46 0.2 0.03 -0.13 0.22 -0.98 -0.06 -1.21 -2.66 -2.11 -0.69 -1.81 -2.61 -0.43 0.3 -0.59 -0.59 -0.35 1.68 0.21 -0.04 0.47 0.19 -1.64 1.01 1.56 1.87 2.0 0.72 0.32 -4.22 -3.8 -3.85 -1.79 0.88 -1.55 -2.93 -2.9
0.45 -0.17 0.2 -0.49 -3.1 0.12 1.11 -0.3 0.09 -1.67 -0.09 -0.76 0.32 -0.32 -0.46 0.46 0.96 -0.35 0.33 0.13 -0.53 -2.95 -2.53 -0.49 -1.97 -2.27 0.12 0.01 -1.25 -0.44 -0.21 1.16 0.38 0.42 0.05 1.01 -0.11 0.37 0.77 0.76 0.64 0.72 0.51 -2.46 -1.48 -1.63 0.16 1.05 -0.29 -0.74 -0.63
0.12 -0.29 0.44 -0.04 -1.73 -0.09 0.84 -0.3 -0.2 -2.08 -0.14 -0.06 0.34 -0.25 -0.11 0.41 0.29 -0.06 0.28 0.73 -0.4 -1.4 -0.82 -0.5 -0.87 -1.4 0.2 0.41 -0.76 -0.44 -0.14 0.83 0.47 0.45 0.36 0.8 -0.01 0.39 0.62 0.78 0.89 0.48 0.45 -2.5 -2.14 -1.98 -0.21 0.82 -0.98 -1.08 -1.05
-0.42 -0.36 -1.61 -1.01 -0.94 -1.09 1.26 -3.78 -1.09 0.78 -0.16 0.83 -1.46 -0.51 -0.98 -1.18 -1.86 -0.97 -0.51 -0.16 -1.24 -0.76 - -0.88 -1.08 -0.09 -1.4 -2.66 -0.83 0.09 -0.04 1.68 -0.8 0.33 -1.45 0.05 1.01 -1.01 2.64 2.09 1.44 -0.99 -0.81 0.05 0.37 -0.09 -5.18 0.75 -0.41 -1.37 -0.99
-1.21 -0.6 -1.28 -1.36 -1.62 0.96 0.36 -0.52 0.68 -2.09 0.29 -1.08 0.69 0.48 0.57 1.12 0.57 0.74 -1.12 1.27 -0.99 -0.6 -1.94 -0.18 -0.55 -0.92 -0.04 0.4 0.29 -1.02 -0.62 0.88 0.37 -0.22 0.88 0.07 -0.08 0.77 0.77 0.78 0.88 -0.03 0.21 -2.08 -0.95 -2.09 -0.42 -0.14 -2.58 -2.46 -0.91
-0.49 -0.02 -0.01 -1.83 2.62 0.15 0.6 -2.6 -0.63 -0.72 -0.17 -0.23 0.73 -0.48 -0.41 1.08 -0.67 -0.54 -0.57 -0.19 0.46 -0.37 -0.41 -0.9 -0.67 -1.07 -0.79 -1.23 -0.8 -1.05 -1.34 0.6 1.23 -1.12 -1.27 -0.94 0.25 -0.63 0.81 -0.11 -0.01 -0.54 -0.24 -1.56 -0.63 0.18 0.02 0.42 -0.06 0.18 1.08
0.95 1.55 0.8 0.35 -0.55 -0.72 0.69 -1.54 -0.12 -0.69 -0.23 0.54 0.05 -1.13 -0.95 -0.44 -0.03 -0.99 -0.9 -0.26 -0.54 -0.05 -1.0 -1.14 -0.37 -0.81 -1.11 -0.36 -1.44 -0.12 0.08 1.23 -0.11 0.38 0.45 0.05 -0.11 -0.66 1.41 1.14 1.29 -0.34 0.3 -0.96 -0.5 -1.02 -1.22 0.55 -1.14 -1.34 -0.84
0.73 1.05 0.01 -0.08 1.01 -1.15 0.35 -3.53 -0.47 0.04 -0.37 -0.1 -1.33 -0.8 -0.96 -1.42 0.16 -0.9 -1.45 -0.55 0.13 0.87 0.23 -0.93 0.48 0.95 -1.33 -0.41 -0.92 -1.03 -1.66 1.01 -1.65 -0.19 0.83 -1.03 0.72 0.97 1.03 0.77 0.81 -0.72 -1.19 -0.59 -0.45 -0.08 -3.27 0.0 -0.02 0.37 0.76
0.26 1.05 1.21 -0.38 0.17 0.63 0.43 -1.81 -0.03 -0.33 -0.08 -0.06 0.05 -0.32 -0.29 -0.1 -0.2 -0.04 -1.15 0.07 -0.55 0.76 0.01 -0.45 0.67 -0.84 -0.09 -0.74 -0.1 -0.75 -0.31 0.25 -0.23 -0.05 0.28 -0.14 0.2 -0.05 0.39 0.51 0.38 -0.68 -0.01 -0.67 -0.45 -0.54 -1.8 0.38 0.01 -0.17 0.22
-1.92 -1.18 -0.69 -3.09 -5.87 -0.52 1.58 -1.16 -0.8 -7.51 -1.02 0.06 -0.22 -0.07 -0.09 0.1 1.82 0.02 0.93 1.2 -2.36 -5.5 -3.23 -1.46 -3.65 -3.48 -1.22 -1.3 -1.43 -0.49 -0.05 1.55 0.08 1.32 0.99 1.02 -1.81 0.55 1.73 1.16 1.44 0.19 -0.21 -6.07 -7.37 -7.06 1.04 1.23 -6.27 -6.75 -5.2
-2.38 -3.13 -3.28 0.16 -1.64 -1.8 -2.27 -4.2 -0.01 -0.08 -0.62 0.99 -0.15 -1.72 -2.53 0.37 -2.84 -2.38 -4.72 -0.3 3.3 0.65 -0.15 0.02 0.35 0.3 0.95 0.12 0.88 -1.62 -2.02 -0.82 0.12 0.11 -2.23 -3.47 2.21 -2.46 0.39 -0.15 -0.69 -3.23 1.11 -0.17 0.45 0.43 - -2.33 0.51 -0.94 -2.32
-3.14 -3.54 -2.22 -1.79 -3.48 1.14 0.24 -1.47 0.37 -3.13 0.26 -2.13 0.64 0.75 0.81 1.37 1.02 0.9 -1.14 1.66 -1.18 -4.37 -3.18 -0.25 -3.55 -3.0 0.34 1.04 0.37 -1.05 -0.2 0.27 0.68 1.13 1.59 1.01 -1.53 0.4 0.2 0.65 0.98 0.25 0.11 -3.2 -2.51 -3.27 -0.41 -0.09 -3.21 -4.72 -3.86
-0.45 -0.75 -0.25 0.22 -2.14 -0.36 0.63 -0.46 0.0 -1.84 -0.01 -0.86 0.45 0.26 0.2 0.54 0.39 0.19 -0.4 0.8 -0.44 -1.63 -0.26 -0.01 -0.98 -1.37 0.18 0.29 -0.3 -0.3 -0.33 0.75 0.27 0.29 0.11 0.64 0.14 0.71 0.75 0.96 0.35 0.49 0.36 -2.66 -2.15 -1.96 -0.0 0.52 0.16 -0.56 -0.1
2.26 1.05 1.55 -0.6 -0.87 -0.61 -0.16 0.76 -0.56 -1.2 -0.88 -0.96 -0.01 -0.98 -0.69 0.24 -0.34 -0.75 0.09 0.37 -0.07 1.34 0.4 -0.92 1.56 0.47 -1.26 -0.98 -1.23 0.08 0.26 -0.32 0.18 -0.44 -0.42 0.34 -0.21 -0.37 -0.67 -0.66 -0.73 -0.07 -0.09 -1.73 -1.81 -1.17 0.14 -0.31 -1.5 -1.39 -1.01
-0.14 0.1 0.36 -0.92 -1.86 0.01 1.11 0.04 -0.18 -2.6 0.17 0.06 0.51 -0.16 0.02 0.38 0.3 0.21 -0.57 0.16 -0.98 -0.25 -1.31 -0.43 -0.11 -1.78 -0.49 -0.46 -0.27 0.03 0.37 0.86 0.57 0.53 0.36 0.97 -0.84 -0.32 0.74 0.81 0.84 0.13 0.1 -2.85 -2.29 -2.13 -0.16 0.73 -0.42 -0.53 0.18
-0.92 1.17 0.77 -0.52 -3.97 -0.91 1.04 -0.99 -0.34 -3.38 -0.25 -1.04 0.51 -0.38 -0.5 0.53 -0.11 -0.22 -0.87 1.23 -1.67 -1.06 -0.79 0.09 -1.31 -1.25 0.04 0.26 0.31 -0.61 -0.09 1.15 0.55 0.26 0.74 0.53 0.85 0.49 0.81 1.2 1.22 0.23 0.06 -2.7 -2.69 -2.85 -0.67 0.9 -2.16 -4.29 -3.9
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-0.15 1.5 1.09 -2.73 -0.77 -1.01 1.26 -0.82 0.4 -1.03 1.08 -0.76 -0.14 -0.21 -0.14 -0.76 -1.55 -0.18 -0.46 -1.67 -0.8 -0.29 -0.13 -0.18 -0.09 0.27 -1.11 -1.67 -0.64 -0.4 -0.4 1.03 -0.51 0.22 -0.39 0.03 -1.73 0.37 1.12 1.54 1.45 0.13 -0.34 -1.64 -1.54 -1.52 -0.55 1.18 -2.26 -0.62 -0.29
2.0 0.24 1.46 -2.8 -1.25 -0.64 1.23 -2.06 -2.61 -0.5 -3.89 -0.2 -1.68 -2.56 -1.33 -1.73 -3.63 -2.39 -0.62 -1.12 -1.59 -2.83 -2.59 -2.76 -2.61 -2.37 -3.95 -6.64 -3.85 1.67 1.28 1.73 -1.23 -0.64 -3.83 0.91 -0.53 -1.52 2.48 2.24 2.11 -0.74 0.03 -1.98 -2.06 -1.58 -0.9 1.16 -2.22 -1.51 -2.18
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.