Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
1.63 0.97 1.4 -2.81 -0.2 0.81 0.62 0.66 0.28 -1.21 0.26 -0.36 0.63 0.3 0.26 0.69 -0.5 0.25 0.38 -0.97 -0.97 -0.99 -0.38 -1.42 -0.5 -0.91 -1.04 -2.86 -1.07 -0.47 -0.32 0.29 0.78 -1.15 -1.64 0.7 -1.56 -0.29 -0.02 0.22 0.15 0.09 0.37 -1.5 -1.29 -1.24 0.22 0.4 -0.24 -0.35 0.07
-5.0 -2.42 -1.0 0.52 0.93 -1.87 2.74 - -2.6 -1.47 -0.87 0.18 -2.82 -0.28 -0.1 -3.43 -1.64 0.05 -0.31 0.51 -3.59 -2.84 -2.13 -0.88 -3.32 -3.71 -0.89 0.74 -3.78 -1.26 -2.07 -0.78 -3.37 0.14 -0.09 1.84 0.39 1.48 -1.86 1.18 1.78 -0.54 0.31 -2.41 -0.82 -0.97 -2.31 2.12 0.84 -0.13 0.38
-1.93 -1.97 -1.86 -1.35 -0.55 0.32 0.8 0.04 -0.06 -0.63 0.32 0.8 1.75 0.08 -0.02 -0.07 1.16 0.13 0.36 -1.59 -0.07 -1.84 -0.97 1.14 -0.62 -1.31 1.19 0.93 0.95 -1.01 -1.58 -0.56 -0.7 0.73 -0.07 0.65 -2.93 1.38 -0.83 -1.29 -1.91 0.05 -0.94 -1.77 -0.79 -1.26 1.22 0.64 -1.29 -1.51 -1.56
0.89 0.27 1.01 -1.15 -2.62 0.79 0.66 0.62 -0.06 -2.9 -0.1 -0.6 0.22 -0.15 0.02 0.1 0.88 0.13 0.12 -0.52 -0.77 -2.51 -0.95 -0.26 -1.62 -1.4 0.12 0.04 -0.3 -0.21 -0.03 -0.04 0.33 1.31 1.17 0.95 -2.15 1.36 -0.27 -0.02 -0.14 -0.24 0.05 -3.01 -2.79 -2.51 0.68 0.65 -1.13 -1.26 -0.92
0.38 -0.57 0.39 -0.67 -2.44 -0.61 0.58 0.09 0.02 -2.69 -0.02 -0.83 -0.08 -0.54 -0.58 -0.02 1.26 -0.62 0.79 -1.04 -0.25 -2.15 -1.04 -0.16 -1.32 -1.05 0.2 0.33 -0.14 -0.5 -0.47 0.7 -0.02 0.74 1.49 0.51 -1.6 2.0 0.52 0.61 0.48 0.25 -0.03 -1.69 -1.53 -1.5 0.14 0.38 -0.64 -0.97 -1.26
0.79 0.25 0.66 -0.8 -2.0 0.01 0.57 -0.46 -0.61 -2.99 -0.61 -0.72 0.2 -0.68 -0.52 0.38 0.43 -0.67 0.46 -0.25 -0.63 -1.66 -1.04 -0.21 -1.06 -1.88 0.35 0.19 -0.42 -0.51 -0.43 -0.06 0.37 0.59 0.77 0.95 -0.85 3.02 -0.26 -0.03 -0.32 0.02 0.45 -2.54 -2.12 -2.24 -0.44 0.55 -1.98 -1.88 -1.56
1.68 0.94 1.15 -2.71 -0.25 0.43 0.65 0.29 0.18 -0.55 0.17 -0.41 0.67 -0.24 -0.06 0.62 -0.14 0.03 0.57 0.08 -0.86 -0.87 -0.56 -1.44 -0.34 -0.76 -1.09 -3.58 -1.1 -0.57 -0.23 0.32 0.7 -1.64 -1.37 0.8 0.06 -0.14 0.06 0.17 0.08 0.09 0.17 -0.98 -0.77 -0.76 0.26 0.64 -0.22 -0.5 -0.6
-0.37 -1.04 -0.21 0.4 -0.79 -0.47 0.62 -1.83 -0.15 -1.9 0.34 0.15 0.08 -0.05 0.19 -0.04 -0.8 0.16 -0.14 -0.75 0.21 0.7 0.36 -0.19 0.85 -0.03 0.3 -0.49 -0.69 -0.42 -0.78 0.32 -0.31 0.26 -0.94 0.2 -0.93 0.99 0.38 0.44 0.68 0.59 0.46 -1.49 -0.93 -1.06 -0.57 0.87 0.56 0.01 0.05
1.19 0.53 0.22 -1.35 -0.17 0.98 0.34 -1.21 -0.16 -2.12 -0.21 0.92 0.58 -0.31 -0.15 0.84 0.75 -0.02 -0.77 1.16 -0.43 -1.61 -1.35 -0.86 -1.21 -1.65 -0.13 -0.07 -0.77 -0.74 -0.73 -0.32 0.48 1.87 1.12 0.31 -0.06 0.73 -0.49 -0.33 -0.25 -0.68 0.39 -3.44 -2.28 -2.3 -0.43 0.18 -1.04 -0.9 -0.37
0.08 -0.23 0.77 -0.09 -3.26 1.1 0.45 -1.28 -0.15 -3.29 0.14 -0.87 0.0 0.66 0.71 0.09 0.68 0.94 0.02 0.94 -1.35 -2.62 -1.4 -1.26 -1.75 -2.08 -0.87 0.35 -1.22 -0.13 -0.07 0.42 -0.2 0.67 1.53 -0.25 -0.13 0.98 0.53 0.7 1.0 -0.17 0.16 -3.75 -2.14 -2.74 -1.11 0.31 -0.41 -0.46 -0.14
0.88 1.5 0.45 0.07 -1.03 -0.07 0.36 0.37 -0.2 -0.59 0.17 -1.75 -0.14 -0.51 -0.46 0.45 0.03 -0.39 0.03 -0.19 -1.15 -0.78 -0.34 -0.11 -0.51 -0.87 0.21 0.35 -0.05 -0.17 -0.05 0.39 0.04 -0.48 0.23 0.51 0.01 0.87 0.03 0.38 0.27 0.79 -0.15 -0.87 -0.32 -0.62 -0.07 0.33 -0.36 -1.57 -1.65
0.13 1.92 -0.4 0.74 -3.92 -3.54 1.37 -1.73 -4.15 0.25 -3.35 -5.07 -5.23 -4.9 -4.17 -3.83 -0.94 -4.32 0.09 -1.31 -3.67 -4.46 -2.73 -2.05 -3.05 -3.33 -2.19 -1.43 -2.85 0.72 0.33 1.14 -4.16 1.11 0.34 0.52 -1.93 2.74 0.81 1.77 1.66 1.08 -1.61 0.59 0.97 0.53 -1.83 1.16 -2.35 -2.32 -3.34
0.51 1.87 0.07 0.06 0.84 0.35 -0.72 -0.02 0.46 -1.4 0.47 -0.4 0.53 0.36 0.19 0.2 -0.36 0.31 -0.18 -0.45 -0.36 0.44 0.13 -0.32 0.8 0.22 -0.28 -0.33 -0.3 -0.35 -0.2 -0.81 0.32 -0.37 -0.38 0.02 -0.3 -0.02 -0.92 -0.93 -1.12 -0.0 -0.12 -1.83 -1.49 -1.21 -0.14 -0.65 0.01 0.24 0.25
1.67 0.67 1.42 -1.18 -1.44 1.2 0.46 0.25 -0.32 -2.11 -0.35 -0.28 0.61 -0.12 -0.1 0.17 0.38 -0.11 0.57 -0.43 -1.39 -2.98 -1.03 -0.92 -1.84 -1.49 -0.59 -0.97 -1.14 -0.16 0.07 -0.51 0.88 1.13 0.55 0.86 -0.43 1.09 -0.97 -0.66 -0.74 -0.31 0.2 -2.5 -2.13 -1.97 0.38 0.49 -0.18 -0.34 -0.1
-1.2 0.32 0.18 -0.65 -2.18 0.95 1.09 -1.58 0.08 -2.51 -0.07 -1.13 0.11 -0.31 -0.45 0.09 1.09 -0.16 -0.38 0.98 -1.99 -3.83 -2.57 -1.29 -2.95 -3.27 -1.03 -0.25 -1.72 -1.22 -0.59 0.9 -0.18 0.41 1.11 0.81 -0.28 2.74 0.75 0.84 1.28 0.22 -0.4 -2.37 -1.44 -1.58 -1.53 0.61 -1.96 -2.35 -1.06
-9.35 -7.62 -9.04 -2.49 -8.63 -9.88 -3.25 -8.94 -8.01 -5.68 -7.33 1.88 -6.29 -5.7 -7.06 -2.42 3.73 -5.8 -5.49 -6.6 2.11 -6.11 -7.23 -3.67 -5.75 -5.06 -3.99 -0.91 -1.68 -4.08 -5.69 -1.04 -4.75 2.93 4.09 -4.38 -5.55 -2.12 0.07 -3.44 -2.81 -1.02 -8.92 -7.08 -7.4 -7.93 -9.1 -2.99 -7.43 -5.42 -0.67
1.34 0.19 0.8 -0.53 0.65 -0.52 0.84 -1.08 -1.01 -1.96 -0.88 0.91 0.5 0.08 0.29 0.33 0.58 0.21 -0.26 0.23 -0.87 -1.13 -1.5 -0.91 -1.06 -1.58 -0.78 -0.17 -1.31 -0.09 -0.32 -0.34 -0.03 1.12 0.81 0.41 -0.03 1.41 -0.46 -0.17 -0.04 -0.31 0.15 -3.47 -2.28 -2.21 0.1 0.58 -0.18 -0.1 0.26
1.51 1.26 1.33 -2.8 0.2 1.02 0.79 0.41 0.21 0.11 0.21 -0.81 0.65 0.21 0.12 0.52 -0.83 0.14 0.24 0.07 -1.37 -1.01 -0.48 -1.44 -0.57 -0.94 -1.29 -3.43 -1.06 -0.32 0.01 -0.13 0.71 -1.62 -1.95 0.79 -0.06 -0.85 -0.46 -0.26 -0.4 -0.29 0.12 -0.47 -0.3 -0.19 0.15 0.47 -0.4 -0.5 -0.22
1.65 0.44 0.4 -1.17 -1.34 -0.27 0.74 -0.43 -0.18 -1.95 -0.0 -0.04 0.75 0.37 0.06 0.24 1.17 0.3 0.41 0.44 -1.04 -0.42 -1.0 -0.86 -0.38 -1.16 -0.35 -0.8 -0.7 -0.4 -0.21 0.25 0.55 -0.06 0.35 0.64 0.72 1.24 0.06 0.07 -0.03 -0.2 -0.18 -2.95 -2.35 -2.32 -0.1 0.55 -1.5 -1.4 -0.84
-0.07 -0.1 -0.41 -2.28 1.2 -0.45 1.09 -1.72 -1.1 0.59 -0.66 0.57 -1.37 -1.69 -1.8 -1.27 -0.97 -1.51 -0.18 -0.66 -0.39 -1.64 -1.7 0.22 -1.17 -1.81 -0.17 -1.01 -0.37 -1.26 -1.09 0.67 -1.24 1.23 -0.39 1.09 0.17 1.68 0.93 0.75 0.55 -0.15 -0.88 0.84 0.76 0.78 0.45 0.67 -0.88 -0.33 -0.17
-2.47 -4.9 -1.37 0.06 -2.87 1.33 -0.29 -6.51 -1.26 -5.4 -2.03 -6.83 -2.28 0.05 -0.37 0.54 -0.63 -0.19 0.21 0.8 -4.28 -5.74 -2.81 -1.18 -2.53 -3.49 0.39 1.2 -1.77 -1.75 -1.45 -2.36 -3.25 -2.44 -0.32 2.99 -3.23 3.85 -2.61 0.57 1.08 0.07 0.59 -3.57 -5.19 -3.7 -0.93 -0.42 -4.95 -3.52 -3.3
-0.1 0.77 -0.01 -0.96 0.28 -0.43 0.14 -3.1 -1.07 -0.55 -0.98 0.77 0.17 -1.93 -2.25 -0.85 -0.38 -2.16 0.56 0.65 -1.88 -2.62 -2.94 -0.44 -2.23 -2.74 0.29 0.57 0.22 -0.37 -1.05 -0.07 0.7 2.04 0.89 0.34 0.91 2.35 0.46 0.07 -0.32 -0.69 -0.44 -1.21 -0.37 -0.45 -1.96 -0.07 0.25 -0.37 -0.25
1.39 0.7 0.67 -1.22 -1.78 -0.87 -0.39 0.08 0.22 0.46 0.36 -0.79 0.55 0.23 0.11 0.55 -1.44 0.11 0.85 -0.15 -0.53 0.14 0.86 -0.24 0.63 0.29 -0.69 -1.43 -0.05 -0.04 -0.11 -0.17 0.55 -1.59 -1.73 0.56 0.16 -0.28 -0.6 -0.38 -0.57 0.38 0.05 -0.55 -0.09 -0.16 0.24 0.01 -0.04 -1.54 -1.4
-2.42 -0.86 -2.63 -0.87 -3.46 -3.71 -3.64 -6.13 -1.82 -0.07 -1.59 1.44 0.71 -3.5 -4.5 -0.09 - -5.03 -2.72 2.57 -3.28 -3.22 - -2.88 -2.27 -4.88 -2.37 -5.28 -2.29 -1.2 -2.17 0.97 1.49 3.57 2.02 -5.37 2.71 -2.89 1.4 -3.04 -1.89 -3.24 0.43 -0.96 -0.06 -0.55 -5.58 -4.16 -1.84 -3.98 -
-1.85 -0.89 -0.61 -0.4 -1.26 1.54 0.83 -2.47 0.38 -1.47 -0.49 -0.45 0.17 -0.2 -0.34 0.16 1.03 -0.01 -1.04 0.86 -0.99 -0.58 -1.04 -0.6 -0.79 -1.12 -0.22 0.49 -0.6 -1.49 -1.1 0.88 -0.45 -0.41 0.58 -0.09 0.56 2.04 0.95 1.1 1.53 -0.22 -0.18 -1.97 -1.27 -1.64 -1.86 0.48 -1.69 -1.56 -0.61
-1.12 0.43 0.03 -3.7 -0.63 -0.55 0.14 -0.69 -0.18 -3.21 0.3 -0.83 -0.04 -0.77 -0.87 0.01 -0.55 -0.69 1.76 -1.72 -1.47 -0.72 -0.43 0.48 -0.72 -1.28 0.76 -0.99 0.51 -1.11 -1.48 -0.09 -0.13 -0.37 -0.9 0.17 -1.93 3.34 0.24 -0.42 -0.68 -0.22 0.99 -3.92 -2.96 -3.3 1.89 0.01 -2.47 -2.69 -2.56
-1.4 -2.46 -1.91 -1.23 2.48 -0.08 0.05 -3.16 0.3 -0.75 0.15 -0.82 0.16 -1.0 -0.91 -0.24 -0.22 -0.8 -1.06 -1.03 -0.45 -0.97 -0.93 0.24 -0.41 -1.51 0.77 0.11 -0.25 -1.48 -1.07 0.16 0.2 1.2 0.19 0.3 -0.47 1.14 -0.21 -0.36 -0.56 -1.11 0.39 -0.78 -0.9 -0.74 -1.39 -0.14 1.57 1.66 0.66
-3.52 0.67 -0.22 -0.27 -0.47 1.46 0.74 -3.32 -0.39 -5.43 0.28 -1.1 -1.61 -1.04 -1.42 -2.18 -1.74 -1.09 -2.72 -0.81 -2.21 0.4 -1.66 -0.36 -0.24 -2.41 -1.03 -2.08 -0.83 -0.92 -0.16 0.74 -2.2 3.24 2.68 -0.84 -0.58 -2.4 1.31 1.33 1.22 -0.99 -2.25 -4.91 -3.82 -4.53 -6.37 0.47 -0.5 -0.68 -0.71
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0.2 -1.76 -0.12 -2.52 -2.23 -1.36 -0.98 -2.42 -1.91 -1.61 0.14 -0.48 -1.25 -3.24 -3.21 -0.43 -2.23 -3.1 -0.9 -1.3 -2.94 0.78 2.99 1.95 1.21 1.96 -0.58 -1.14 2.08 -0.72 -1.92 -0.97 -1.63 -0.76 -0.65 -0.22 0.64 2.47 1.2 -0.19 -1.71 -1.93 -1.24 -1.13 -2.6 -2.68 -2.5 -1.22 -1.63 -3.66 -4.63
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1.28 1.04 0.75 -4.09 -0.98 -4.65 0.26 0.8 -5.22 -0.34 -5.64 -3.69 -5.02 -7.99 -6.38 -1.4 -7.0 -7.9 -0.03 -2.02 -3.18 -3.21 -1.23 0.82 -2.14 -1.17 0.46 -0.97 0.76 0.22 0.18 0.53 -2.1 0.87 -0.27 0.63 1.19 3.22 0.58 -0.22 -0.36 -0.01 -1.47 -1.01 -0.04 -0.75 1.58 0.09 0.08 -1.63 -1.71
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.