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Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1%O,SRE1 KO
1%O,UPC2 KO
1%O,WT
1M Salt,YNB
1n,Log,Mat A,Alkane,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat A,Oleic Acids,YNB,28C,WT
1n,Log,Mat B,YPD,28C,Ku70 KO
21%O,WT
25C
28C
32C
Alkane
Citrate,YNB
Glucose
Glucose,Glycerol
Glucose,YNB
Glucose,YPD,28C
Glycerol
H2O2
Log
Log,-O,Glucose
Log,Arabinose
Log,Arabinose,Cellulose,Xylose
Log,Arabinose,Xylose
Log,Cellulose
Log,Cellulose,Xylose
Log,Glucose
Log,Glucose,Xylose
Log,Xylose
Log,YPD,28C,TER KO
Log,YPD,28C,WT
MAGO KO
Malate,YNB
Oleic Acids
Oleic Acids,YPD,28C
PH4
Stationary, -N
Tributyrin,YPD,28C
UPF1 KO
UPF2 KO
WT
Y14 KO
YNB
YNB,28C,SPT15L KO
YNB,28C,SPT15L OE
YNB,28C,WT
YPD,18C
YPD,28C
pH2
pH4
pH6
0.08 0.54 0.56 -1.05 -2.31 0.4 0.5 0.33 0.33 -2.15 0.45 -0.01 0.45 0.42 0.59 0.54 0.27 0.64 -0.06 0.21 -0.36 -0.86 -0.48 -0.32 -0.66 -0.69 0.12 0.62 -0.19 0.08 0.24 0.27 0.47 -0.11 0.38 0.56 -0.88 -0.31 -0.05 0.36 0.35 0.19 0.6 -2.37 -2.3 -2.09 0.11 0.26 -1.15 -1.42 -0.8
1.19 0.75 0.67 -0.64 -0.09 0.72 0.26 0.72 0.48 -0.14 0.62 -0.18 0.27 0.33 0.28 0.4 0.12 0.2 -0.61 -0.03 -0.57 -0.7 -0.97 -0.79 -0.58 -0.42 -0.54 -0.43 -0.82 -0.25 0.05 0.06 0.22 -0.71 -0.3 0.09 0.07 -0.04 -0.15 0.08 0.01 0.13 0.19 -0.71 -0.57 -0.5 0.21 -0.15 -0.26 -0.7 -0.5
0.82 1.27 0.35 -1.29 -1.41 -0.16 0.48 0.42 -0.14 -1.44 -0.12 -0.08 0.47 -0.49 -0.31 0.23 -0.42 -0.25 -0.32 -0.32 -0.04 1.11 -0.11 0.15 1.14 -0.49 0.03 0.16 0.27 -0.2 0.18 0.07 0.6 0.2 -0.32 0.74 -0.57 -0.82 -0.15 -0.2 -0.22 -0.01 0.24 -1.41 -1.18 -1.22 0.18 0.39 -0.76 -1.4 -1.29
1.25 0.63 0.59 -0.35 -1.77 -0.58 -0.01 0.48 0.3 -0.82 0.24 -0.28 0.31 -0.11 -0.04 0.27 -0.08 -0.09 0.55 -0.03 -0.34 -0.12 0.18 -0.07 0.18 -0.55 -0.15 0.11 -0.52 0.18 0.53 -0.16 0.52 -0.22 -0.51 0.73 -0.51 -0.55 -0.37 -0.34 -0.34 0.51 0.47 -0.78 -0.83 -0.85 0.82 0.18 -0.65 -1.31 -1.4
-0.32 0.06 0.43 -1.25 -1.81 0.27 0.59 0.69 0.43 -1.12 0.55 0.25 0.56 0.2 0.33 0.67 0.15 0.36 -0.29 0.42 -0.47 -0.9 -0.82 0.2 -0.53 -0.7 0.08 0.61 -0.07 0.05 0.34 -0.29 0.6 0.21 0.05 0.64 -0.59 -0.29 -0.37 -0.2 -0.14 -0.38 0.44 -1.3 -1.13 -0.89 0.21 0.15 -0.65 -0.54 -0.06
0.47 0.64 0.43 -0.87 -1.61 -0.75 0.4 0.34 0.4 -0.27 0.58 -0.57 0.74 0.56 0.49 0.63 -1.09 0.47 -0.4 -0.0 -0.05 0.49 0.68 0.04 0.58 -0.58 0.06 -0.79 0.26 0.02 0.31 -0.07 0.81 -0.42 -1.24 0.37 -0.55 -1.09 -0.45 -0.11 -0.08 -0.21 0.36 -0.9 -0.7 -0.78 0.01 0.25 -0.54 -1.84 -1.17
0.7 -0.1 0.39 -1.29 -0.95 0.15 0.72 0.19 -0.17 -2.27 0.05 -0.15 0.32 -0.09 0.06 0.46 0.2 0.0 0.04 0.15 -0.26 0.5 -0.08 -0.12 0.49 -0.46 0.28 -0.03 -0.08 -0.24 0.02 0.37 0.57 0.41 0.43 0.78 -0.77 -0.49 -0.07 0.24 0.42 0.22 0.27 -2.46 -1.9 -1.86 0.02 0.84 -0.94 -1.44 -1.27
-1.26 -0.77 -1.11 -0.21 0.02 -0.38 -0.96 1.2 1.01 -1.4 0.98 -1.33 0.67 0.79 0.65 0.69 -1.42 0.67 0.41 0.23 -0.51 -0.76 -0.64 -0.45 -0.43 -1.61 0.04 -0.23 -0.76 1.77 2.28 -1.38 0.77 -0.45 -2.11 0.81 0.15 -0.8 -1.44 -1.52 -2.34 0.49 -0.18 -1.88 -1.65 -1.42 0.54 -0.56 -0.45 -1.95 -3.33
0.09 -0.04 0.3 -0.77 -2.22 0.18 0.54 0.44 0.27 -0.89 0.56 -0.2 0.53 0.14 0.33 0.57 0.28 0.34 -0.28 0.96 -0.85 -1.18 -0.06 -0.26 -1.02 -0.89 -0.27 0.46 -0.5 -0.1 0.22 0.17 0.65 0.19 0.13 0.58 -0.28 0.15 0.0 0.29 0.36 0.5 0.55 -1.37 -1.18 -1.14 0.19 0.17 -1.22 -1.64 -1.07
1.09 0.46 0.67 -0.24 -1.98 -1.07 -0.02 0.72 0.4 -0.97 0.44 -0.42 0.81 -0.23 -0.2 0.65 -1.31 -0.22 0.27 0.18 -0.31 0.18 -0.28 0.34 0.33 -0.57 0.21 0.41 0.37 0.28 0.46 -0.08 1.03 -0.57 -1.16 0.65 0.04 -0.88 -0.61 -0.53 -0.77 0.6 0.42 -1.41 -1.07 -1.24 0.19 -0.01 -0.69 -1.61 -1.3
0.15 -0.09 0.13 -1.18 -1.41 0.22 0.36 0.78 0.36 -0.09 0.38 -1.26 0.31 0.09 0.15 0.54 -0.06 0.13 -0.14 0.29 -0.26 0.06 -0.47 -0.17 0.14 -0.67 0.12 0.28 -0.33 0.12 0.48 -0.17 0.78 -0.15 -0.57 0.52 -0.94 -0.39 -0.36 0.05 -0.07 0.51 0.39 -0.06 -0.14 0.02 0.49 0.17 -0.83 -1.64 -1.33
1.0 0.42 0.37 -0.9 -1.52 -0.28 0.14 -0.03 0.3 -0.99 0.24 -0.57 0.58 -0.24 -0.0 0.45 0.38 0.07 0.64 -0.09 -0.41 0.15 0.4 -0.37 0.42 -0.6 0.25 0.08 -0.32 -0.22 -0.25 -0.23 0.52 0.21 0.0 0.4 0.09 0.35 -0.18 -0.4 -0.49 0.17 0.34 -1.11 -0.8 -0.8 0.4 0.08 -0.52 -0.84 -0.63
0.31 -0.08 -0.01 -0.42 -1.54 -0.25 0.02 0.63 0.33 0.24 0.63 -0.62 0.49 0.23 0.35 0.51 -0.63 0.31 -0.11 0.7 0.18 -0.55 -0.13 0.37 -0.55 -0.68 -0.01 0.38 0.11 0.26 0.33 -0.18 0.64 0.06 -0.76 0.37 0.04 -0.77 -0.53 -0.4 -0.32 0.38 0.31 -0.2 -0.21 -0.13 0.29 -0.14 -0.83 -1.74 -1.33
1.38 0.99 0.48 -0.83 -0.78 -0.02 0.2 0.42 0.15 -1.51 0.05 -0.41 0.56 -0.02 -0.01 0.49 0.07 0.12 -0.07 0.41 -0.61 -0.04 0.29 0.28 0.03 -0.6 0.17 0.52 0.27 0.2 0.28 -0.36 0.69 0.28 0.17 0.38 -0.07 0.32 -0.79 -0.6 -0.69 -0.45 0.21 -1.85 -1.66 -1.57 0.02 -0.04 -0.65 -2.04 -2.16
0.48 0.69 0.37 -0.38 -0.56 -0.11 0.4 0.36 0.34 -0.77 0.42 0.37 0.47 0.37 0.38 0.34 -0.15 0.42 -0.31 0.08 0.25 0.1 -0.14 -0.3 0.2 -0.32 -0.08 0.2 -0.28 -0.25 -0.18 -0.29 0.48 0.45 -0.52 0.35 -0.28 -0.51 -0.45 -0.45 -0.64 -0.13 0.32 -0.92 -0.89 -0.8 -0.0 0.06 -0.27 -0.64 -0.25
0.01 0.69 0.72 -1.93 -1.33 0.46 0.65 0.59 0.27 -1.5 0.52 -0.68 0.33 0.14 0.35 0.46 0.38 0.36 -0.73 0.28 -0.64 -0.26 -1.02 0.13 -0.4 -0.28 -0.19 0.77 0.32 -0.42 0.01 0.14 0.38 -0.03 0.71 0.62 -0.62 -0.0 0.09 0.26 0.39 -0.3 0.21 -1.55 -1.78 -1.47 0.24 0.2 -1.67 -1.66 -0.63
0.3 0.32 0.31 -1.49 -0.57 0.11 0.74 0.83 0.51 -0.56 0.67 -0.68 0.64 0.21 0.25 0.71 -0.13 0.35 -0.46 0.29 -0.52 -0.36 -0.71 0.12 -0.33 -1.03 0.07 0.33 0.24 0.08 0.32 -0.29 0.69 0.2 -0.57 0.63 -0.64 -0.57 -0.6 -0.22 -0.35 -0.2 0.39 -0.65 -0.67 -0.62 0.46 0.26 -0.91 -1.48 -1.0
1.28 0.56 0.59 0.11 -1.84 -0.28 0.2 0.54 0.25 -2.4 0.28 -1.11 0.03 0.04 0.22 -0.04 -0.58 0.21 0.23 -0.02 -0.42 0.77 0.29 -0.63 1.05 -0.56 -0.32 0.1 -0.44 1.12 1.07 -0.17 0.23 -0.08 -0.69 0.74 -0.52 -0.91 -0.65 -0.38 -0.71 0.47 0.15 -2.1 -1.78 -1.7 0.24 0.13 -0.62 -1.21 -1.42
-0.29 -0.43 -0.01 -0.84 -1.09 -0.26 0.1 0.05 0.69 -1.06 0.98 -0.24 0.49 0.03 0.19 0.59 -0.02 0.22 0.22 0.47 -0.3 -0.61 0.23 -0.04 -0.4 -0.75 0.25 0.66 -0.1 -0.14 0.08 -0.02 0.44 -0.42 -0.25 0.22 0.92 0.32 -0.21 -0.11 -0.28 -0.14 0.38 -1.31 -0.75 -0.99 0.53 0.16 -0.28 -0.77 -0.66
1.13 0.17 0.37 -1.63 -1.69 -0.12 0.87 0.28 -0.09 -1.56 0.3 -1.32 0.34 -0.11 0.18 0.61 0.24 0.13 -0.12 0.72 -0.79 -0.61 -0.13 -0.33 -0.73 -1.43 -0.04 0.32 -0.38 0.21 0.44 0.26 0.49 0.09 0.49 0.78 -0.03 0.17 -0.28 0.11 0.29 0.26 0.55 -1.68 -1.39 -1.36 0.31 0.63 -1.2 -1.6 -1.09
0.71 0.18 0.66 -1.37 -2.58 0.23 -0.95 0.45 0.47 -0.91 0.21 -0.45 0.58 0.01 -0.16 0.63 -0.06 0.06 0.62 1.79 -1.02 -0.17 0.11 -0.17 -0.12 -0.27 0.58 -0.85 0.19 0.11 0.25 -0.7 0.66 -0.33 -0.57 0.4 -0.04 -0.51 -1.06 -0.67 -1.02 0.55 -0.01 -0.92 -0.12 -0.21 1.24 -0.46 -2.0 -2.54 -2.5
0.63 0.15 0.45 -0.82 -1.73 -0.41 0.35 0.9 0.55 -0.78 0.51 -1.59 0.84 0.03 0.19 0.72 -0.14 0.3 0.8 1.07 -1.03 -1.36 -0.52 -0.43 -0.9 -1.13 -0.04 -0.34 -0.81 0.4 0.87 -0.13 1.04 0.01 -0.6 1.14 -0.1 -0.25 -0.87 -0.62 -0.87 0.69 0.32 -1.34 -1.51 -0.97 0.79 0.33 -1.71 -3.07 -2.67
0.88 0.17 0.46 -0.88 -1.54 -1.0 0.26 0.31 0.56 -0.16 0.41 -0.7 0.67 -0.64 -0.24 0.77 -0.87 -0.46 0.77 1.26 -0.77 -2.5 -0.07 -0.43 -1.6 -1.18 -0.12 -0.21 -0.94 -0.18 0.01 0.41 0.79 -0.5 -0.82 0.76 0.81 0.33 -0.04 0.13 0.06 0.67 0.48 -1.05 -0.84 -0.46 0.96 0.05 -1.32 -1.92 -1.27
0.88 0.37 0.29 -0.61 -1.58 -0.16 -0.4 0.72 0.56 -0.26 0.63 -0.53 0.14 0.04 0.16 0.21 -0.37 0.08 -0.3 -0.05 0.61 0.18 0.48 -0.17 0.42 -0.08 -0.05 0.03 -0.42 0.49 0.88 -0.58 0.37 -0.81 -0.6 0.1 -1.1 -0.7 -1.06 -0.89 -0.84 0.35 0.08 -0.42 -0.27 -0.13 0.1 -0.61 0.2 -0.05 -0.02
0.57 0.41 0.33 -0.16 -0.9 -0.45 -0.23 0.6 0.32 -1.17 0.41 -0.21 0.24 -0.13 -0.21 0.11 -0.2 -0.14 0.07 0.2 0.48 -0.06 0.6 0.31 0.14 0.1 0.77 0.61 0.03 0.55 0.78 -0.76 0.46 0.12 -0.51 0.06 -0.31 0.27 -1.08 -0.91 -1.06 -0.11 0.37 -1.33 -1.2 -1.28 0.26 -0.26 -0.32 -0.55 -0.99
0.52 0.07 0.7 -1.33 -1.84 -0.52 -0.25 1.12 0.55 -1.6 0.6 -2.23 0.82 0.01 0.25 0.7 -0.68 0.36 0.44 0.05 -0.19 -0.01 0.29 0.23 0.5 0.12 0.08 0.18 -0.03 0.67 1.05 -0.65 1.14 -0.53 -0.93 1.01 -0.78 -0.95 -1.32 -1.03 -1.18 0.87 0.42 -1.73 -1.64 -1.42 0.44 -0.46 -1.79 -2.27 -1.97
0.22 0.35 0.26 -1.17 -1.32 0.1 0.25 0.54 0.26 -1.81 0.44 -0.4 0.85 0.31 0.24 0.58 -0.43 0.37 -0.66 0.29 -0.46 0.76 0.12 0.29 0.8 -0.39 -0.12 0.26 0.66 0.26 0.43 -0.16 0.88 0.23 -0.13 0.36 -0.34 -0.03 -0.26 -0.23 -0.31 0.04 0.24 -1.75 -1.56 -1.58 -0.27 -0.15 -1.47 -2.52 -1.81
0.2 0.04 0.38 -0.84 -1.34 0.04 0.54 0.4 0.31 -0.84 0.65 -0.42 0.57 0.48 0.36 0.65 -0.0 0.52 -0.34 -0.21 -0.76 -0.11 0.02 -0.15 -0.12 -0.67 -0.22 0.11 0.0 -0.56 -0.31 0.56 0.7 -0.16 -0.18 0.36 -1.05 -0.01 0.59 0.44 0.66 0.28 0.11 -0.81 -0.89 -0.68 0.17 0.26 -1.19 -1.95 -1.86
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0.19 1.13 0.26 -1.55 -0.79 0.71 0.62 0.62 0.39 -1.17 0.6 0.04 0.41 0.31 0.36 0.48 0.24 0.33 -0.09 -0.36 -0.5 -0.81 -0.35 -0.59 -0.77 -1.02 -0.43 0.03 -0.78 -0.49 -0.14 0.3 0.43 0.22 0.08 0.66 -0.96 -0.37 0.18 0.36 0.45 0.17 0.32 -1.4 -1.25 -1.1 0.16 0.49 -0.8 -1.03 -0.58
0.0 1.36 0.49 -1.19 -1.7 -0.12 0.68 0.62 0.17 -1.48 0.19 -0.53 0.74 -0.13 0.08 0.85 -0.28 0.11 -0.83 0.28 -0.24 -0.52 -0.89 0.23 -0.47 -0.41 0.06 0.51 0.3 -0.01 0.32 0.18 0.8 0.04 -0.21 0.57 -0.79 -0.84 0.05 0.33 0.39 -0.19 0.63 -1.67 -1.72 -1.39 -0.03 0.17 -1.11 -1.34 -0.45
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0.56 1.1 0.27 -1.83 -0.86 0.56 0.48 1.12 0.3 -0.13 0.41 -1.38 0.56 0.33 0.41 0.86 0.54 0.44 -0.26 0.39 -0.06 -1.33 -0.9 -0.3 -0.78 -0.91 0.19 -0.44 -0.83 -0.04 0.18 -0.65 0.64 -0.13 -0.8 0.74 -0.86 0.06 -0.83 -0.54 -0.74 0.2 0.49 -0.41 -0.51 -0.31 0.59 0.07 -0.96 -1.65 -1.93
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1.61 0.86 0.9 0.07 -1.13 -0.3 -0.5 0.6 0.47 -2.14 0.44 -0.29 0.23 -0.16 -0.03 0.09 -1.04 -0.09 -0.0 0.01 0.11 0.13 0.04 0.12 0.38 -0.47 0.3 0.53 0.24 0.59 0.52 -0.19 0.39 -0.48 -0.81 -0.23 -0.08 -0.05 -0.51 -0.57 -0.84 0.15 0.21 -2.26 -1.42 -1.58 -0.65 -0.41 0.1 -0.32 -0.56
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.