Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.29 0.51 0.48 0.27 0.24 0.04 0.13 0.16 0.12 0.01 0.3 0.03 0.26 0.11 0.12 0.36 0.22 0.12 0.1 1.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.09 0.21 0.02
1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.64 0.09 0.0 0.33 0.12 0.15 0.16 0.37 0.0
0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.0 0.05 0.23 0.0
0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.17 0.0
0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.06 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 1.0 0.01 0.11 0.32 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.2 0.0
0.11 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.44 0.06 0.01 0.01 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 0.01 0.15 1.0 0.02
0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.5 0.0
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 1.0 0.0 0.08 0.28 0.0
0.51 0.38 0.15 0.71 0.19 0.23 0.01 0.0 0.11 0.17 0.25 0.14 0.31 0.56 0.04 0.27 0.23 0.23 0.18 1.0
0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.28 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02 0.05 0.0
0.06 0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.14 0.01 0.05 0.04 0.08 1.0 0.13 0.14 0.23 0.11
0.63 0.38 0.09 1.0 0.33 0.37 0.22 0.2 0.15 0.39 0.51 0.6 0.59 0.65 0.34 0.16 0.66 0.4 0.32 0.86
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.7 1.0 0.25 0.14 0.08 0.2 0.02 0.28 0.02 0.45 0.63 0.0
0.0 0.23 0.06 0.25 0.19 0.22 0.43 0.66 0.42 0.07 0.13 0.18 0.3 0.24 0.2 0.1 0.27 0.31 1.0 0.88
0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.11 0.19 0.0
0.2 0.75 0.12 0.0 0.01 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.49 0.32 0.81 0.29 0.25 0.32 1.0
0.3 0.94 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.02 0.07 0.08 0.5 0.4 1.0 0.33 0.34 0.29 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.07 0.0
0.1 0.16 0.07 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.32 0.14 0.06 0.01 0.04 0.1 0.0 1.0 0.05 0.11 0.21 0.13
0.0 0.38 0.1 0.01 0.01 0.0 0.29 0.0 0.06 0.13 0.12 0.32 0.36 0.3 1.0 0.49 0.51 0.46 0.5 0.42
0.24 0.44 0.35 0.18 0.1 0.2 0.0 0.07 0.23 0.45 0.41 0.0 0.02 0.02 0.0 0.11 0.09 0.06 0.05 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.11 0.13 0.0
0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.07 0.23 0.0
1.0 0.4 0.36 0.61 0.53 0.36 0.03 0.52 0.59 0.1 0.36 0.26 0.53 0.48 0.51 0.65 0.46 0.29 0.43 0.69
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.11 0.42 0.0
0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.05 0.18 0.0 0.06 0.01 0.01 0.04 0.13 0.34 0.27 0.57 0.21 0.23 0.21 1.0
1.0 0.37 0.39 0.23 0.2 0.17 0.36 0.2 0.08 0.15 0.28 0.28 0.17 0.2 0.28 0.52 0.34 0.3 0.39 0.32
0.0 0.17 0.56 0.5 0.06 0.25 0.04 0.32 0.11 0.05 0.11 0.0 0.08 0.14 0.0 1.0 0.15 0.15 0.23 0.0
0.0 0.61 0.59 0.69 0.09 0.45 0.01 0.41 0.08 0.02 0.25 0.0 0.14 0.2 0.03 1.0 0.17 0.1 0.26 0.3
0.0 0.53 0.57 0.15 0.08 0.19 0.0 0.0 0.03 0.02 0.14 0.01 0.02 0.06 0.0 0.16 0.1 0.07 0.18 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.1 0.17 0.0
0.05 0.02 0.0 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.05 0.04 0.06 0.01 1.0 0.02 0.06 0.14 0.0
1.0 0.09 0.05 0.02 0.03 0.04 0.37 0.0 0.01 0.02 0.07 0.04 0.08 0.07 0.11 0.64 0.15 0.12 0.42 0.0
0.14 0.36 0.12 0.07 0.06 0.08 0.0 0.05 0.13 0.03 0.08 0.04 0.14 0.19 0.01 0.32 0.11 0.09 0.14 1.0
0.33 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.27 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 1.0 0.04 0.17 0.31 0.0
0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.01 0.08 0.23 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.22 0.0
0.1 0.75 0.33 0.53 0.43 0.35 0.17 0.4 0.77 0.57 0.56 0.24 0.31 0.3 0.32 1.0 0.57 0.37 0.52 0.46
0.28 0.36 0.27 0.19 0.01 0.08 0.07 0.04 0.24 0.09 0.07 0.09 0.18 0.09 0.15 1.0 0.19 0.24 0.34 0.5
0.0 0.34 0.06 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.05 0.31 0.35 0.09 0.29 0.21 0.18 0.17 1.0
0.72 0.64 0.52 0.73 0.2 0.27 0.42 0.03 0.23 0.22 0.52 0.29 0.43 0.67 0.51 0.41 0.55 0.42 0.37 1.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.21 0.0 0.54 0.26 0.2 0.17 0.71
0.11 0.5 0.15 0.07 0.06 0.09 0.0 0.04 0.13 0.01 0.09 0.06 0.18 0.3 0.0 0.41 0.15 0.13 0.15 1.0
0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.09 0.0
0.84 0.12 0.03 0.01 0.04 0.01 0.15 0.0 0.18 0.27 0.08 0.3 0.36 0.51 0.45 1.0 0.24 0.48 0.79 0.18
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.17 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09 0.11 0.19 0.02 1.0 0.91 0.0
1.0 0.26 0.05 0.25 0.23 0.13 0.7 0.36 0.19 0.11 0.26 0.24 0.29 0.26 0.41 0.77 0.3 0.32 0.67 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.06 0.06 0.0
0.27 0.2 0.24 0.27 0.27 0.49 1.0 0.85 0.0 0.17 0.33 0.32 0.27 0.18 0.05 0.28 0.34 0.34 0.81 0.07
0.36 0.05 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.39 0.02 0.01 0.02 0.14 0.16 0.03 1.0 0.04 0.09 0.21 0.03
0.0 0.7 0.45 0.63 0.06 0.75 0.02 0.36 0.52 0.0 0.18 0.0 0.31 0.14 0.0 1.0 0.19 0.27 0.35 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)