Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.07 0.04 0.01 0.02 0.03 0.07 0.01 1.0 0.14 0.06 0.02 0.05 0.04 0.06 0.04 0.05 0.06 0.01 0.09
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.06 0.02 0.08 0.06 0.1 0.07 0.06 0.01 0.04 0.02 0.19
0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.12 0.02 1.0 0.08 0.03 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.05
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.07
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.09 0.03 0.0 0.05 0.03 0.12 0.07 0.05 0.04 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0
0.46 0.12 0.07 0.46 0.23 0.15 0.17 0.27 1.0 0.56 0.26 0.07 0.13 0.14 0.18 0.11 0.16 0.13 0.15 0.09
0.05 0.05 0.04 0.06 0.04 0.04 0.05 0.05 1.0 0.12 0.07 0.09 0.13 0.1 0.09 0.09 0.13 0.07 0.09 0.21
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0
0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 1.0 0.15 0.05 0.03 0.05 0.04 0.06 0.01 0.04 0.04 0.03 0.04
0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.09
0.14 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 1.0 0.01 0.02 0.08 0.01 0.04 0.09 0.02 0.03 0.04 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.18 0.05 0.04 0.08 0.08 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.02 0.01 0.06
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.72
0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.05 0.01 0.07 0.1 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 1.0 0.07 0.02 0.0 0.03 0.01 0.1 0.04 0.02 0.03 0.04 0.03
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.06 0.02 0.08 0.06 0.1 0.07 0.06 0.01 0.04 0.02 0.19
0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.05 0.01 0.09 1.0 0.03 0.02 0.02 0.05 0.05 0.02 0.04 0.03 0.03 0.04 0.05
0.06 0.02 0.04 0.02 0.09 0.02 0.02 0.01 1.0 0.07 0.05 0.02 0.06 0.03 0.05 0.01 0.03 0.03 0.03 0.12
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.0 1.0 0.2 0.07 0.0 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.16
0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 1.0 0.16 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.0
0.11 0.06 0.06 0.06 0.06 0.04 0.0 0.04 1.0 0.38 0.14 0.02 0.08 0.18 0.0 0.0 0.04 0.09 0.05 0.19
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.04 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0
0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.17 0.04 0.02 0.1 0.11 0.06 0.04 0.05 0.05 0.03 0.05
0.01 0.07 0.11 0.01 0.01 0.01 0.07 0.0 1.0 0.25 0.08 0.11 0.09 0.1 0.11 0.05 0.04 0.05 0.05 0.21
0.04 0.07 0.1 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 1.0 0.04 0.04 0.02 0.07 0.11 0.09 0.04 0.06 0.03 0.05 0.19
0.06 0.12 0.07 0.18 0.28 0.1 0.03 0.1 1.0 0.18 0.22 0.09 0.08 0.11 0.11 0.04 0.15 0.06 0.06 0.48
0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.05 0.01 0.04 0.06 0.05 0.06 0.03 0.05 0.02 0.03 0.02
0.08 0.08 0.09 0.13 0.07 0.04 0.16 0.05 1.0 0.22 0.1 0.05 0.11 0.12 0.08 0.04 0.08 0.07 0.04 0.09
0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.13 0.04 0.03 0.11 0.08 0.06 0.02 0.04 0.02 0.02 0.1
0.03 0.06 0.07 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 1.0 0.05 0.09 0.05 0.05 0.06 0.07 0.04 0.05 0.03 0.03 0.14
0.02 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.21 0.06 0.03 0.08 0.04 0.07 0.03 0.05 0.03 0.02 0.06
0.05 0.22 0.04 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.12 0.04 0.02 0.04 0.1 0.07 0.07 0.1 0.06 0.06 0.13
0.02 0.17 0.17 0.02 0.03 0.01 0.07 0.01 1.0 0.15 0.07 0.02 0.02 0.03 0.07 0.03 0.12 0.02 0.03 0.07
0.0 0.08 0.03 0.0 0.01 0.01 0.05 0.0 1.0 0.25 0.07 0.0 0.03 0.04 0.06 0.03 0.12 0.07 0.11 0.0
0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.14 0.05 0.16 0.07 0.06 0.08 0.1 0.01 0.05 0.03 0.27
0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.16 0.05 0.06 0.2 0.11 0.07 0.06 0.05 0.06 0.03 0.06
0.0 0.1 0.06 0.02 0.02 0.06 0.11 0.03 1.0 0.13 0.09 0.12 0.18 0.16 0.12 0.05 0.14 0.08 0.03 0.08
0.07 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 1.0 0.31 0.08 0.06 0.08 0.04 0.06 0.04 0.04 0.04 0.02 0.05
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.13 0.06 0.04 0.1 0.09 0.05 0.06 0.03 0.05 0.04 0.05
0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 1.0 0.27 0.07 0.01 0.07 0.1 0.09 0.02 0.05 0.05 0.04 0.01
0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.1 0.03 0.06 0.02 0.06 0.12 0.08 0.03 0.05 0.03 0.01
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 1.0 0.12 0.05 0.05 0.06 0.05 0.11 0.04 0.03 0.05 0.04 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.12 0.06 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04
0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08
0.0 0.05 0.06 0.09 0.06 0.02 0.19 0.05 1.0 0.07 0.07 0.09 0.15 0.13 0.24 0.09 0.08 0.09 0.04 0.04
0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.01 0.0 0.07 0.06 0.03 0.03 0.01 0.04 0.03 0.0
0.03 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0 0.08 0.01 1.0 0.09 0.04 0.01 0.02 0.03 0.05 0.07 0.05 0.06 0.05 0.11
0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.06 0.02 0.06 0.0 0.08 0.02 0.0 0.01 0.05 0.03 0.0
0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.06 0.02 0.02 0.07 0.17 0.0 0.0 0.05 0.06 0.01 0.0
0.0 0.03 0.01 0.18 0.23 0.1 0.01 0.16 1.0 0.11 0.12 0.06 0.08 0.07 0.02 0.08 0.04 0.06 0.04 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07
0.07 0.03 0.02 0.15 0.03 0.02 0.08 0.01 1.0 0.1 0.1 0.05 0.11 0.11 0.1 0.02 0.04 0.06 0.04 0.05
0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 1.0 0.1 0.03 0.07 0.16 0.11 0.29 0.05 0.04 0.1 0.07 0.28
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.07 0.07 0.08 0.01 0.01 0.01 0.09 0.01 1.0 0.16 0.06 0.09 0.17 0.11 0.17 0.09 0.11 0.08 0.04 0.15
0.03 0.05 0.04 0.06 0.12 0.17 0.03 0.27 1.0 0.09 0.12 0.04 0.09 0.1 0.08 0.08 0.07 0.05 0.07 0.06
0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.3 0.08 0.04 0.05 0.08 0.07 0.04 0.06 0.06 0.05 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.01 0.02 0.01 0.0
0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.01 0.01 0.05 0.01 0.08
0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.16 0.04 0.01 0.05 0.08 0.04 0.01 0.02 0.03 0.01 0.04
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.12 0.03 0.01 0.03 0.04 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06
0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 1.0 0.17 0.05 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0
0.1 0.1 0.08 0.11 0.09 0.08 0.03 0.08 1.0 0.28 0.14 0.17 0.12 0.14 0.12 0.12 0.12 0.12 0.11 0.11
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.17 0.04 0.03 0.02 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.01 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.11 0.03 0.0 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.15 0.1 0.14 0.24 0.26 0.16 0.07 0.28 1.0 0.27 0.27 0.17 0.13 0.14 0.15 0.13 0.1 0.13 0.09 0.26
0.04 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.19 0.05 0.03 0.02 0.04 0.05 0.02 0.01 0.02 0.02 0.06
0.0 0.11 0.08 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 1.0 0.54 0.13 0.04 0.07 0.1 0.02 0.04 0.06 0.08 0.08 0.18
0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.27 0.08 0.03 0.02 0.02 0.06 0.06 0.02 0.03 0.03 0.0
0.04 0.01 0.02 0.41 0.21 0.23 0.04 0.14 1.0 0.25 0.13 0.05 0.04 0.03 0.05 0.02 0.03 0.05 0.07 0.12
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.33 0.08 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.03 0.04 0.02 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)