Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.29 0.6 0.45 0.43 0.45 0.28 0.73 0.26 0.24 0.04 0.33 0.37 0.68 0.47 0.84 0.42 0.51 0.29 0.38 1.0
0.99 0.97 1.0 0.2 0.12 0.26 0.65 0.1 0.53 0.76 0.41 0.6 0.34 0.41 0.83 0.44 0.84 0.55 0.68 0.61
0.56 0.52 0.62 0.06 0.06 0.11 1.0 0.1 0.14 0.06 0.22 0.63 0.34 0.4 0.62 0.35 0.59 0.42 0.48 0.77
0.17 0.72 1.0 0.0 0.0 0.15 0.74 0.02 0.04 0.14 0.13 0.3 0.17 0.21 0.49 0.11 0.56 0.25 0.27 0.53
0.83 0.51 0.58 0.09 0.11 0.19 1.0 0.26 0.08 0.17 0.29 0.71 0.28 0.3 0.66 0.36 0.53 0.42 0.7 0.56
0.97 0.84 1.0 0.04 0.02 0.13 0.7 0.06 0.1 0.21 0.27 0.63 0.37 0.43 0.3 0.52 0.66 0.48 0.7 0.28
0.76 0.68 0.74 0.01 0.01 0.1 0.7 0.07 0.46 0.44 0.34 0.47 0.2 0.41 0.48 0.32 0.68 0.44 0.64 1.0
0.7 0.59 0.64 0.35 0.35 0.27 1.0 0.15 0.33 0.25 0.36 0.72 0.42 0.45 0.68 0.43 0.66 0.52 0.66 0.66
0.16 0.63 0.46 0.19 0.18 0.14 0.82 0.05 0.02 0.05 0.17 0.39 0.39 0.51 0.43 0.15 0.36 0.38 0.4 1.0
0.64 0.96 0.74 1.0 0.61 0.49 0.56 0.62 0.22 0.43 0.76 0.58 0.37 0.45 0.91 0.49 1.0 0.7 0.87 0.72
0.43 0.62 0.56 0.19 0.11 0.13 0.84 0.14 0.35 0.31 0.27 0.61 0.59 0.49 0.47 0.59 0.46 0.39 0.5 1.0
0.33 0.7 0.64 0.35 0.09 0.19 1.0 0.14 0.7 0.46 0.32 0.58 0.53 0.64 0.58 0.53 0.66 0.57 0.67 0.76
0.83 0.87 0.84 0.66 0.42 0.53 0.66 0.55 0.23 0.39 0.55 0.39 0.31 0.41 0.49 0.43 0.71 0.49 0.6 1.0
0.43 0.62 0.67 0.0 0.0 0.05 1.0 0.04 0.24 0.18 0.21 0.75 0.43 0.49 0.66 0.62 0.54 0.43 0.5 0.59
0.07 0.62 0.54 0.09 0.01 0.12 0.74 0.01 0.93 0.35 0.19 0.97 0.82 0.73 0.78 0.52 0.43 0.42 0.42 1.0
0.67 0.71 0.71 0.26 0.24 0.27 1.0 0.22 0.37 0.51 0.44 0.76 0.59 0.58 0.69 0.66 0.65 0.54 0.62 0.6
0.49 0.57 0.59 0.26 0.2 0.22 0.55 0.21 0.16 0.31 0.35 0.53 0.33 0.35 0.59 0.34 0.57 0.36 0.44 1.0
0.38 0.85 0.71 0.11 0.13 0.09 0.6 0.09 0.21 0.32 0.26 0.37 0.32 0.39 0.6 0.31 0.58 0.35 0.34 1.0
0.07 0.52 0.36 0.11 0.09 0.14 0.63 0.08 0.1 0.03 0.12 0.44 0.41 0.43 0.35 0.31 0.35 0.26 0.23 1.0
0.65 0.56 0.71 0.22 0.19 0.19 0.92 0.08 0.1 0.25 0.34 0.65 0.42 0.38 0.48 0.42 0.51 0.43 0.59 1.0
0.06 0.44 0.36 0.0 0.0 0.06 0.67 0.0 0.03 0.0 0.1 0.38 0.64 0.32 0.67 0.2 0.38 0.23 0.28 1.0
0.38 0.57 0.45 0.22 0.16 0.26 0.67 0.24 1.0 0.31 0.36 0.73 0.61 0.52 0.67 0.63 0.55 0.39 0.49 0.56
0.54 0.43 0.39 0.23 0.19 0.2 0.58 0.16 0.37 0.13 0.31 0.48 0.31 0.37 0.45 0.33 0.45 0.32 0.4 1.0
0.3 0.46 0.55 0.0 0.0 0.1 1.0 0.06 0.04 0.12 0.2 0.54 0.27 0.26 0.72 0.22 0.46 0.35 0.46 0.52
0.6 0.47 0.62 0.01 0.0 0.03 0.41 0.02 0.13 0.07 0.2 0.37 0.23 0.26 0.29 0.17 0.32 0.19 0.26 1.0
0.34 1.0 0.64 0.28 0.17 0.24 0.95 0.16 0.38 0.39 0.4 0.45 0.36 0.45 0.68 0.46 0.88 0.55 0.84 0.09
0.41 0.86 0.82 0.56 0.08 0.35 1.0 0.16 0.33 0.73 0.43 0.68 0.46 0.58 0.44 0.48 0.66 0.55 0.74 0.67
0.46 0.7 0.52 0.24 0.21 0.26 1.0 0.23 0.11 0.26 0.31 0.69 0.22 0.38 0.96 0.49 0.92 0.54 0.83 0.23
0.3 0.98 0.63 0.64 0.35 0.26 1.0 0.27 0.42 0.35 0.37 0.87 0.83 0.79 0.73 0.69 0.88 0.6 0.61 0.43
0.82 0.62 0.77 0.41 0.12 0.28 1.0 0.07 0.25 0.18 0.37 0.71 0.68 0.56 0.69 0.48 0.62 0.43 0.49 0.97
1.0 0.27 0.44 0.2 0.07 0.13 0.51 0.11 0.38 0.02 0.24 0.2 0.22 0.25 0.25 0.22 0.32 0.23 0.29 0.71
0.05 0.44 0.27 0.0 0.0 0.05 0.48 0.0 0.04 0.01 0.06 0.51 0.31 0.32 0.37 0.18 0.22 0.18 0.18 1.0
0.11 0.53 0.48 0.26 0.16 0.19 1.0 0.12 0.19 0.13 0.18 0.59 0.62 0.58 0.5 0.38 0.35 0.38 0.39 0.71
0.4 0.96 0.85 0.39 0.2 0.18 1.0 0.1 0.46 0.45 0.4 0.76 0.6 0.72 0.91 0.66 0.86 0.62 0.57 0.7
0.62 0.43 0.42 0.01 0.01 0.07 1.0 0.03 0.37 0.22 0.22 0.58 0.23 0.32 0.38 0.33 0.29 0.32 0.4 0.39
0.56 0.66 0.98 0.25 0.08 0.17 0.68 0.08 0.35 0.12 0.25 0.47 0.27 0.3 0.46 0.26 0.6 0.37 0.44 1.0
0.29 0.87 0.76 0.3 0.39 0.26 1.0 0.25 0.27 0.35 0.52 0.44 0.3 0.32 0.84 0.65 0.79 0.54 0.8 0.79
0.06 1.0 0.43 0.13 0.08 0.13 0.43 0.08 0.06 0.08 0.14 0.52 0.22 0.28 0.42 0.33 0.76 0.39 0.6 0.53
0.35 1.0 0.7 0.39 0.09 0.22 0.78 0.07 0.43 0.3 0.27 0.64 0.58 0.6 0.58 0.39 0.78 0.48 0.51 0.69
0.49 0.72 0.71 0.37 0.39 0.24 0.8 0.24 0.21 0.04 0.37 0.65 0.65 0.6 0.72 0.43 0.64 0.42 0.49 1.0
0.31 0.55 0.56 0.3 0.25 0.29 1.0 0.29 0.35 0.35 0.38 0.63 0.42 0.43 0.37 0.45 0.44 0.4 0.47 0.5
0.27 1.0 0.63 0.56 0.36 0.36 0.66 0.2 0.42 0.42 0.43 0.72 0.51 0.61 0.76 0.64 0.86 0.6 0.76 0.45
0.16 0.81 0.55 0.37 0.1 0.16 0.9 0.12 0.06 0.06 0.15 1.0 0.74 0.77 0.91 0.51 0.61 0.58 0.59 0.63
0.02 0.59 0.5 0.0 0.0 0.09 1.0 0.0 0.05 0.01 0.06 0.81 0.45 0.42 0.66 0.26 0.7 0.38 0.39 0.58
0.06 0.87 0.81 0.3 0.29 0.26 1.0 0.2 0.11 0.11 0.39 0.55 0.35 0.49 0.54 0.29 0.61 0.43 0.46 1.0
0.04 0.66 0.75 0.34 0.19 0.25 1.0 0.13 0.47 0.12 0.22 0.94 0.45 0.52 0.96 0.32 0.57 0.5 0.5 0.94
0.19 0.9 0.72 0.41 0.3 0.37 1.0 0.23 0.46 0.53 0.53 0.63 0.39 0.47 0.41 0.36 0.64 0.53 0.51 0.57
0.12 0.65 0.47 0.02 0.02 0.19 0.95 0.07 0.62 0.16 0.13 0.93 0.73 0.54 1.0 0.59 0.54 0.4 0.57 0.84
0.07 0.51 0.35 0.0 0.0 0.02 0.54 0.0 0.57 0.11 0.1 0.54 0.48 0.44 0.47 0.23 0.36 0.28 0.29 1.0
0.69 1.0 0.94 0.37 0.27 0.41 0.91 0.26 0.43 0.48 0.49 0.6 0.43 0.48 0.83 0.49 0.91 0.57 0.74 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)