1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.65 1.0 0.81 0.79 0.66 0.55 0.15 0.34 0.56 0.46 0.73 0.53 0.39 0.48 0.59 0.71 0.74 0.57 0.65 0.6
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.56 0.83 1.0 0.0 0.89 0.68 0.32 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.13 0.06 0.0 0.82 0.48 0.7 1.0 0.03 0.61 0.69 0.56 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.83 0.85 0.73 0.01 0.56 0.62 0.38 0.0
0.0 0.48 0.08 0.0 0.07 0.05 0.22 0.12 0.66 0.41 0.15 0.33 1.0 0.68 0.63 0.49 0.77 0.37 0.39 0.42
0.12 0.33 0.17 0.25 0.26 0.24 0.11 0.22 1.0 0.45 0.34 0.34 0.36 0.36 0.32 0.27 0.36 0.32 0.45 0.14
0.03 0.26 0.22 0.01 0.01 0.08 0.24 0.05 1.0 0.41 0.17 0.13 0.2 0.23 0.22 0.21 0.21 0.19 0.29 0.42
0.04 0.4 0.07 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 1.0 0.39 0.16 0.15 0.32 0.33 0.34 0.24 0.26 0.22 0.28 0.3
0.0 0.55 0.37 0.0 0.0 0.08 0.22 0.0 0.43 0.05 0.06 0.44 0.47 0.63 0.4 0.32 1.0 0.63 0.98 0.0
0.05 0.4 0.11 0.0 0.01 0.02 0.21 0.02 1.0 0.67 0.18 0.19 0.33 0.54 0.61 0.31 0.42 0.37 0.43 0.31
0.06 0.49 0.25 0.02 0.01 0.04 0.12 0.01 1.0 0.58 0.19 0.38 0.37 0.53 0.59 0.46 0.36 0.29 0.4 0.56
0.01 1.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.21 0.01 0.06 0.03 0.05 0.34 0.28 0.53 0.61 0.38 0.76 0.49 0.63 0.4
0.02 0.3 0.12 0.01 0.01 0.03 0.08 0.03 1.0 0.69 0.18 0.13 0.08 0.12 0.24 0.13 0.29 0.16 0.25 0.19
0.01 1.0 0.29 0.0 0.0 0.05 0.26 0.0 0.0 0.04 0.07 0.38 0.5 0.57 0.8 0.37 0.66 0.5 0.47 0.91
0.0 0.71 0.05 0.08 0.05 0.07 0.03 0.0 0.35 0.16 0.09 0.32 0.29 0.75 0.57 0.41 1.0 0.79 0.69 0.5
0.0 0.77 0.06 0.01 0.01 0.07 0.12 0.01 0.01 0.02 0.02 0.38 0.31 0.63 1.0 0.68 0.62 0.42 0.61 0.58
0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.23 0.56 0.68 0.51 0.48 0.7 0.39 0.54 0.19
0.0 1.0 0.12 0.21 0.17 0.18 0.24 0.21 0.01 0.03 0.12 0.31 0.21 0.42 1.0 0.33 0.74 0.52 0.48 0.51
0.0 0.72 0.07 0.0 0.01 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.26 0.82 0.83 1.0 0.72 0.61 0.4 0.48 0.61
0.0 0.44 0.0 0.06 0.02 0.0 0.01 0.0 0.06 0.01 0.02 0.19 0.65 0.71 1.0 0.41 0.62 0.41 0.34 0.1
0.08 0.15 0.07 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 1.0 0.33 0.11 0.32 0.22 0.28 0.37 0.22 0.21 0.22 0.32 0.29
0.16 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 1.0 0.06 0.01 0.32 0.16 0.28 0.64 0.12 0.12 0.19 0.22 0.16
0.0 1.0 0.05 0.0 0.01 0.07 0.09 0.05 0.0 0.0 0.05 0.71 0.67 0.51 0.68 0.66 0.76 0.51 0.86 0.23
0.13 0.5 0.23 0.48 0.49 0.6 0.27 0.62 0.49 0.3 0.45 0.7 0.38 0.61 0.4 0.53 0.74 0.73 1.0 0.13
0.06 1.0 0.2 0.02 0.01 0.04 0.28 0.01 0.34 0.18 0.09 0.4 0.76 0.78 0.86 0.49 0.69 0.45 0.49 0.88
0.0 1.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.05 0.01 0.02 0.28 0.62 0.65 0.74 0.5 0.8 0.57 0.78 0.52
0.23 1.0 0.14 0.19 0.07 0.09 0.38 0.06 0.59 0.36 0.17 0.74 0.47 0.56 0.94 0.77 0.94 0.76 0.77 0.34
0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.19 0.0 0.0 0.01 0.02 0.21 0.48 0.67 0.82 0.44 0.84 0.44 0.44 0.23
0.05 0.26 0.1 0.03 0.01 0.03 0.09 0.01 1.0 0.55 0.15 0.17 0.13 0.18 0.29 0.13 0.25 0.16 0.19 0.12
0.06 0.19 0.03 0.09 0.07 0.01 0.05 0.05 1.0 0.36 0.18 0.06 0.09 0.18 0.28 0.13 0.24 0.15 0.23 0.09
0.0 0.8 0.05 0.01 0.0 0.01 0.09 0.0 0.04 0.17 0.05 0.48 0.28 0.62 1.0 0.66 0.7 0.59 0.45 0.13
0.13 1.0 0.54 0.44 0.17 0.29 0.63 0.23 0.33 0.13 0.3 0.51 0.53 0.75 0.63 0.46 0.89 0.54 0.62 0.74
0.0 0.56 0.0 0.19 0.14 0.09 0.08 0.05 0.0 0.0 0.14 0.43 0.23 0.31 0.83 0.34 1.0 0.51 0.61 0.0
0.01 1.0 0.08 0.0 0.02 0.06 0.12 0.03 0.45 0.1 0.09 0.3 0.39 0.53 0.61 0.49 0.95 0.72 0.67 0.12
0.14 0.86 0.09 1.0 0.61 0.41 0.23 0.3 0.21 0.1 0.45 0.61 0.36 0.48 0.71 0.66 0.94 0.66 0.69 0.21
0.0 0.53 0.1 0.0 0.02 0.06 0.03 0.01 0.68 1.0 0.38 0.26 0.17 0.37 0.37 0.34 0.29 0.25 0.39 0.35
0.02 0.08 0.03 0.01 0.0 0.02 0.08 0.01 1.0 0.34 0.09 0.13 0.15 0.2 0.25 0.04 0.1 0.1 0.15 0.1
0.01 1.0 0.11 0.13 0.03 0.09 0.24 0.04 0.03 0.01 0.06 0.29 0.8 1.0 0.93 0.63 0.93 0.53 0.42 0.45
0.06 0.26 0.11 0.0 0.0 0.01 0.29 0.0 1.0 0.2 0.17 0.36 0.24 0.27 0.8 0.27 0.38 0.33 0.43 0.03
0.0 1.0 0.24 0.42 0.22 0.24 0.33 0.14 0.11 0.04 0.14 0.45 0.59 0.5 0.69 0.46 0.8 0.46 0.42 0.44
0.01 0.85 0.1 0.05 0.03 0.04 0.09 0.02 0.0 0.03 0.04 0.32 0.28 0.36 0.52 0.38 1.0 0.61 0.61 0.25
0.05 0.18 0.12 0.15 0.12 0.08 0.06 0.07 1.0 0.35 0.21 0.17 0.29 0.24 0.31 0.19 0.18 0.14 0.22 0.46
0.0 0.73 0.28 0.0 0.0 0.06 0.22 0.0 0.07 0.05 0.05 0.38 0.54 0.78 0.31 0.42 0.36 0.41 0.36 1.0
0.01 0.33 0.01 0.11 0.01 0.27 0.02 0.47 0.05 0.04 0.11 0.4 0.3 0.23 0.93 0.4 0.72 0.75 1.0 0.04
0.0 0.56 0.18 0.0 0.0 0.07 0.16 0.0 0.0 0.01 0.03 0.34 0.19 0.33 1.0 0.25 0.82 0.48 0.64 0.1
0.08 0.34 0.0 0.01 0.04 0.1 0.12 0.05 1.0 0.74 0.2 0.21 0.43 0.59 0.77 0.34 0.47 0.35 0.53 0.67
0.0 0.93 0.07 0.01 0.0 0.05 0.1 0.0 0.04 0.01 0.02 0.26 0.8 1.0 0.81 0.39 0.64 0.47 0.56 0.49
0.2 0.88 0.29 0.51 0.35 0.3 0.36 0.26 0.23 0.26 0.33 0.68 0.73 0.68 1.0 0.55 0.9 0.72 0.67 0.45
0.01 1.0 0.29 0.1 0.14 0.22 0.56 0.2 0.12 0.04 0.15 0.76 0.63 0.8 0.77 0.4 0.65 0.53 0.45 0.71
0.0 0.75 0.14 0.09 0.34 0.1 0.1 0.13 0.44 0.04 0.11 0.25 1.0 0.83 0.69 0.41 0.73 0.56 0.53 0.12
0.0 1.0 0.14 0.0 0.0 0.09 0.19 0.02 0.52 0.43 0.12 0.39 0.21 0.52 0.77 0.19 0.77 0.46 0.5 0.19
0.33 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.87 0.06 0.04 0.48 0.2 1.0 0.7 0.2 0.29 0.44 0.37 0.0
0.03 0.66 0.19 0.0 0.0 0.01 0.44 0.0 0.03 0.02 0.05 0.47 0.29 0.56 1.0 0.39 0.63 0.52 0.7 0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)