Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.27 0.27 0.62 0.0 0.0 0.09 1.0 0.0 0.01 0.09 0.1 0.18 0.03 0.05 0.05 0.05 0.02 0.09 0.19 0.98
0.0 0.48 0.49 0.21 0.15 0.31 1.0 0.04 0.05 0.17 0.19 0.11 0.06 0.1 0.24 0.03 0.29 0.16 0.2 0.64
0.05 1.0 0.55 0.0 0.0 0.08 0.62 0.0 0.0 0.04 0.08 0.17 0.09 0.46 0.59 0.33 0.49 0.37 0.37 0.79
0.0 0.82 0.1 0.0 0.0 0.01 0.16 0.0 0.01 0.02 0.03 0.61 0.32 0.76 1.0 0.59 0.93 0.82 0.55 0.06
0.0 0.28 0.22 0.0 0.0 0.05 0.32 0.0 1.0 0.09 0.06 0.23 0.1 0.18 0.23 0.05 0.21 0.12 0.11 0.4
0.0 1.0 0.26 0.37 0.07 0.18 0.58 0.07 0.14 0.12 0.16 0.53 0.54 0.88 0.67 0.55 0.74 0.63 0.5 0.85
0.09 0.73 0.58 0.08 0.03 0.12 0.81 0.03 0.21 0.12 0.24 0.31 0.31 0.39 0.59 0.21 0.59 0.39 0.36 1.0
0.23 0.18 0.48 0.0 0.0 0.1 1.0 0.0 0.02 0.13 0.13 0.13 0.03 0.05 0.05 0.05 0.02 0.08 0.18 0.76
0.24 0.36 0.9 0.02 0.02 0.06 1.0 0.01 0.11 0.04 0.14 0.64 0.25 0.25 0.25 0.22 0.12 0.21 0.17 0.53
0.06 0.71 0.53 0.01 0.0 0.09 0.83 0.0 0.1 0.04 0.11 0.41 0.18 0.21 0.34 0.14 0.39 0.23 0.22 1.0
0.23 0.62 0.36 0.26 0.19 0.2 1.0 0.33 0.03 0.09 0.26 0.68 0.22 0.14 1.0 0.44 0.84 0.53 0.55 0.8
0.39 0.49 0.21 0.31 0.19 0.19 0.52 0.03 0.35 0.11 0.23 0.98 0.85 0.68 0.62 0.62 0.41 1.0 0.43 1.0
0.0 0.92 0.19 0.0 0.0 0.07 0.68 0.0 0.02 0.07 0.09 0.71 0.19 0.26 0.29 0.12 0.52 0.25 0.25 1.0
0.09 0.48 0.9 0.0 0.0 0.08 0.7 0.0 0.23 0.2 0.15 0.13 0.06 0.14 0.16 0.18 0.16 0.15 0.16 1.0
0.05 0.15 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.12 0.08 0.23 1.0 0.71 0.24 0.31 0.33 0.14
0.0 0.2 0.09 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.29 0.29 0.35 1.0 0.55 0.29 0.41 0.25 0.0
0.1 1.0 0.09 0.0 0.0 0.09 0.55 0.0 0.05 0.04 0.09 0.8 0.22 0.21 0.23 0.09 0.59 0.29 0.31 0.5
0.0 0.42 0.22 0.09 0.08 0.09 0.51 0.03 0.05 0.01 0.07 0.13 0.16 0.22 0.17 0.07 0.25 0.13 0.12 1.0
0.11 0.58 0.22 0.0 0.0 0.04 0.28 0.01 1.0 0.32 0.26 0.17 0.18 0.39 0.62 0.21 0.24 0.29 0.22 0.64
0.05 0.34 0.52 0.02 0.0 0.06 0.76 0.0 0.05 0.01 0.15 0.2 0.12 0.11 0.15 0.08 0.19 0.15 0.13 1.0
0.0 1.0 0.44 0.0 0.0 0.05 0.37 0.01 0.01 0.04 0.09 0.13 0.1 0.4 0.48 0.29 0.47 0.27 0.25 0.48
0.05 0.29 0.54 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.15 0.09 0.12 0.29 0.36 0.29 0.24 0.11 0.12 0.21 0.13 0.55
0.06 0.31 0.92 0.0 0.0 0.18 1.0 0.03 0.05 0.02 0.13 0.23 0.15 0.18 0.1 0.05 0.14 0.12 0.09 0.62
0.58 0.23 0.47 0.32 0.16 0.17 1.0 0.12 0.29 0.09 0.15 0.45 0.19 0.19 0.24 0.13 0.2 0.22 0.12 0.61
0.05 0.92 0.71 0.35 0.24 0.23 1.0 0.18 0.04 0.05 0.26 0.4 0.58 0.48 0.68 0.29 0.59 0.38 0.42 0.77
0.31 0.27 0.54 0.01 0.02 0.07 1.0 0.04 0.16 0.05 0.13 0.56 0.11 0.13 0.09 0.05 0.11 0.14 0.05 0.59
0.06 0.4 0.09 0.13 0.05 0.11 0.19 0.03 0.66 0.16 0.07 1.0 0.27 0.38 0.46 0.28 0.34 0.44 0.33 0.69
0.01 0.86 0.24 0.0 0.0 0.08 0.48 0.0 0.03 0.01 0.05 0.45 0.26 0.35 0.52 0.32 0.46 0.34 0.31 1.0
0.02 0.55 0.21 0.01 0.0 0.1 0.6 0.0 0.64 0.4 0.17 0.1 0.09 0.09 0.09 0.03 0.3 0.09 0.11 1.0
0.33 0.82 0.26 0.23 0.12 0.09 0.99 0.11 0.08 0.05 0.14 0.86 0.65 0.51 1.0 0.66 0.72 0.64 0.74 0.5
0.01 0.81 0.26 0.06 0.03 0.12 0.5 0.04 0.04 0.04 0.07 0.42 0.48 0.42 1.0 0.35 0.72 0.48 0.49 0.6
0.03 0.59 0.73 0.0 0.0 0.1 1.0 0.0 0.02 0.02 0.13 0.1 0.02 0.1 0.27 0.18 0.31 0.2 0.26 0.6
0.15 0.36 0.49 0.04 0.05 0.21 1.0 0.07 0.69 0.32 0.25 0.24 0.28 0.35 0.41 0.18 0.31 0.22 0.25 0.43
0.14 0.44 0.68 0.15 0.1 0.09 1.0 0.02 0.31 0.28 0.23 0.28 0.15 0.21 0.24 0.2 0.28 0.19 0.26 0.51
0.13 1.0 0.46 0.21 0.15 0.12 0.44 0.09 0.14 0.32 0.22 0.25 0.46 0.84 0.35 0.38 0.59 0.54 0.4 0.81
0.01 0.43 1.0 0.0 0.0 0.08 0.95 0.0 0.05 0.05 0.1 0.52 0.03 0.06 0.17 0.05 0.14 0.15 0.18 0.48
0.1 0.41 0.18 0.1 0.02 0.06 0.5 0.03 1.0 0.35 0.12 0.39 0.29 0.31 0.39 0.31 0.39 0.34 0.31 0.2
0.35 0.17 1.0 0.0 0.0 0.13 0.98 0.01 0.01 0.11 0.14 0.04 0.0 0.01 0.04 0.04 0.01 0.04 0.09 0.53
0.0 0.41 0.06 0.0 0.0 0.08 0.37 0.0 0.05 0.0 0.03 0.17 0.18 0.14 0.15 0.05 0.28 0.1 0.1 1.0
0.0 0.47 0.18 0.05 0.02 0.14 1.0 0.04 0.03 0.07 0.07 0.23 0.15 0.26 0.17 0.14 0.26 0.19 0.22 0.08
0.04 1.0 0.41 0.11 0.11 0.07 0.64 0.02 0.71 0.29 0.19 0.32 0.21 0.48 0.57 0.23 0.44 0.33 0.21 0.95
0.09 0.23 0.7 0.04 0.05 0.11 1.0 0.08 0.09 0.05 0.16 0.39 0.12 0.15 0.39 0.08 0.21 0.22 0.19 0.58
0.03 0.67 0.5 0.05 0.03 0.17 0.81 0.04 0.03 0.21 0.21 0.38 0.26 0.19 0.49 0.16 0.51 0.34 0.36 1.0
0.0 0.42 0.04 0.0 0.0 0.05 0.35 0.01 0.01 0.0 0.02 0.13 0.14 0.15 0.19 0.05 0.23 0.09 0.05 1.0
0.3 0.26 0.29 0.11 0.08 0.16 1.0 0.13 0.13 0.02 0.16 0.22 0.09 0.14 0.23 0.08 0.23 0.19 0.25 0.19
0.46 0.41 0.53 0.17 0.35 0.2 0.66 0.13 0.53 0.07 0.29 0.17 0.13 0.13 0.16 0.15 0.28 0.19 0.2 1.0
0.04 0.51 1.0 0.04 0.03 0.12 0.76 0.02 0.03 0.06 0.15 0.21 0.04 0.05 0.13 0.04 0.15 0.1 0.13 0.68
0.01 0.3 0.62 0.0 0.0 0.04 0.56 0.0 0.03 0.03 0.08 0.18 0.09 0.08 0.18 0.08 0.19 0.13 0.15 1.0
0.24 0.58 0.66 0.03 0.01 0.09 1.0 0.02 0.18 0.05 0.12 0.72 0.28 0.34 0.36 0.23 0.36 0.26 0.14 0.72
0.02 0.29 0.46 0.0 0.0 0.09 1.0 0.01 0.02 0.02 0.07 0.18 0.06 0.09 0.13 0.08 0.14 0.15 0.1 0.34
0.0 0.39 0.04 0.0 0.0 0.07 0.48 0.0 0.03 0.0 0.03 0.16 0.21 0.11 0.11 0.04 0.17 0.08 0.1 1.0
0.08 0.84 0.64 0.07 0.07 0.12 0.61 0.04 0.51 0.4 0.19 1.0 0.64 0.99 0.83 0.59 0.7 0.77 0.56 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)