Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.28 0.77 0.98 0.28 0.22 0.27 0.0 0.22 0.51 0.86 0.53 0.16 0.08 0.27 0.0 0.37 0.25 1.0 0.42 0.24
0.15 0.52 0.39 1.0 0.43 0.54 0.0 0.13 0.45 0.32 0.38 0.17 0.17 0.3 0.0 0.2 0.29 0.42 0.19 0.46
0.69 0.91 0.94 0.58 0.42 0.27 0.25 0.25 0.6 0.34 0.49 0.36 0.36 0.68 0.16 0.41 0.52 0.59 0.28 1.0
0.55 1.0 0.77 0.34 0.17 0.36 0.01 0.0 0.48 0.21 0.47 0.0 0.12 0.53 0.0 0.34 0.42 0.58 0.19 0.0
0.36 0.6 0.28 1.0 0.69 0.67 0.0 0.72 0.09 0.2 0.54 0.11 0.18 0.39 0.0 0.49 0.33 0.61 0.36 0.0
0.77 0.24 0.22 0.46 0.21 0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.4 0.07 0.13 0.22 0.0 0.14 0.13 0.59 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.02 0.0
0.53 0.97 1.0 0.44 0.34 0.36 0.17 0.05 0.8 0.47 0.57 0.29 0.3 0.51 0.15 0.66 0.57 0.68 0.5 0.99
0.49 0.55 0.53 0.27 0.26 0.19 0.0 0.19 1.0 0.44 0.39 0.21 0.34 0.6 0.0 0.69 0.27 0.66 0.36 0.43
0.07 1.0 0.59 0.6 0.45 0.24 0.21 0.12 0.23 0.11 0.4 0.15 0.34 0.56 0.07 0.49 0.45 0.52 0.09 0.7
0.78 0.69 0.89 0.15 0.17 0.36 0.09 0.34 0.52 0.53 0.49 0.12 0.11 0.22 0.02 0.29 0.3 0.56 0.28 1.0
0.49 0.77 0.53 0.56 0.41 0.25 1.0 0.11 0.82 0.7 0.51 0.19 0.36 0.62 0.03 0.37 0.37 0.67 0.31 0.52
0.44 0.65 0.45 0.91 0.65 0.58 0.24 0.65 0.58 0.25 0.46 0.22 0.38 0.68 0.09 0.22 0.33 0.43 0.21 1.0
0.8 0.96 0.79 0.81 0.7 0.74 0.11 0.57 0.97 0.39 0.68 0.22 0.31 0.6 0.12 0.74 0.52 1.0 0.4 0.74
0.46 0.92 0.8 0.25 0.21 0.22 0.29 0.23 0.27 0.25 0.4 0.3 0.31 0.41 0.29 0.42 0.57 0.62 0.29 1.0
0.25 0.66 0.44 1.0 0.63 0.32 0.18 0.37 0.46 0.42 0.49 0.23 0.65 0.75 0.26 0.35 0.34 0.58 0.23 0.76
0.55 0.68 0.62 0.6 0.5 0.5 0.0 0.49 0.65 0.21 0.61 0.11 0.14 0.4 0.01 0.31 0.35 0.42 0.21 1.0
0.36 0.84 0.74 0.35 0.34 0.23 0.0 0.0 0.84 1.0 0.72 0.14 0.22 0.53 0.0 0.3 0.38 0.7 0.34 0.73
0.38 0.59 0.73 0.41 0.43 0.55 0.39 0.44 0.08 0.12 0.45 0.14 0.12 0.18 0.07 0.29 0.36 0.37 0.2 1.0
0.4 0.46 0.53 0.21 0.16 0.15 0.0 0.09 0.4 0.39 0.3 0.09 0.1 0.22 0.0 0.24 0.2 0.37 0.19 1.0
0.2 0.92 1.0 0.92 0.58 0.59 0.08 0.0 0.78 0.79 0.66 0.21 0.35 0.81 0.05 0.45 0.45 0.75 0.44 0.0
0.24 0.69 0.49 0.38 0.35 0.38 0.53 0.36 1.0 0.57 0.55 0.36 0.47 0.62 0.31 0.54 0.49 0.76 0.42 0.44
0.34 1.0 0.83 0.21 0.06 0.17 0.0 0.0 0.1 0.51 0.34 0.12 0.09 0.22 0.0 0.37 0.48 0.97 0.5 0.45
0.6 0.86 0.86 0.11 0.1 0.17 0.0 0.07 0.99 0.77 0.43 0.26 0.15 0.22 0.12 0.31 0.54 0.45 0.24 1.0
0.77 0.84 1.0 0.57 0.37 0.52 0.0 0.09 0.14 0.17 0.45 0.1 0.2 0.44 0.0 0.45 0.46 0.72 0.39 0.4
0.38 0.57 0.6 1.0 0.54 0.45 0.0 0.61 0.74 0.25 0.41 0.1 0.31 0.53 0.0 0.34 0.25 0.46 0.24 0.28
0.0 0.38 0.11 0.41 0.38 0.18 0.22 0.1 1.0 0.48 0.29 0.11 0.23 0.34 0.09 0.24 0.25 0.39 0.17 0.0
0.14 0.35 0.24 0.55 0.4 0.32 0.02 0.43 1.0 0.61 0.42 0.06 0.29 0.43 0.0 0.36 0.19 0.44 0.18 0.11
0.19 0.43 0.33 1.0 0.44 0.26 0.0 0.27 0.16 0.15 0.34 0.07 0.18 0.3 0.0 0.29 0.23 0.37 0.12 0.38
0.61 0.46 0.7 1.0 0.34 0.59 0.03 0.56 0.3 0.31 0.41 0.11 0.23 0.35 0.02 0.38 0.24 0.43 0.26 0.66
0.45 1.0 1.0 0.37 0.29 0.31 0.0 0.13 0.64 0.33 0.45 0.13 0.18 0.41 0.0 0.46 0.39 0.68 0.22 0.9
0.59 0.79 0.69 0.36 0.23 0.25 0.0 0.03 0.55 0.29 0.34 0.1 0.19 0.4 0.0 0.39 0.32 0.63 0.22 1.0
0.24 0.54 0.49 0.26 0.18 0.23 0.02 0.12 0.31 0.28 0.28 0.15 0.16 0.32 0.04 0.09 0.24 0.49 0.1 1.0
0.33 0.63 0.62 0.52 0.31 0.23 0.06 0.07 1.0 0.7 0.46 0.11 0.2 0.4 0.04 0.1 0.31 0.63 0.23 0.32
0.29 0.86 0.38 0.56 0.56 0.51 0.03 0.55 0.5 0.34 0.59 0.23 0.4 0.57 0.15 0.32 0.67 0.65 0.29 1.0
0.6 0.55 0.51 0.55 0.43 0.36 0.16 0.06 0.35 0.13 0.44 0.17 0.34 0.47 0.12 0.43 0.39 0.73 0.27 1.0
0.53 0.45 0.58 0.39 0.24 0.21 0.24 0.2 0.48 1.0 0.51 0.35 0.24 0.29 0.34 0.37 0.35 0.47 0.28 0.57
0.34 0.32 0.34 0.74 0.59 0.32 0.02 0.31 0.75 0.95 0.63 0.22 0.3 0.54 0.15 0.68 0.3 1.0 0.63 0.21
0.2 0.47 0.35 1.0 0.37 0.42 0.0 0.42 0.61 0.44 0.44 0.12 0.25 0.47 0.01 0.31 0.22 0.61 0.22 0.35
0.73 0.5 0.32 0.2 0.14 0.17 0.0 0.24 1.0 0.68 0.39 0.22 0.19 0.39 0.02 0.46 0.23 0.52 0.27 0.78
0.38 0.69 0.69 0.36 0.17 0.3 0.13 0.03 1.0 0.55 0.48 0.19 0.34 0.62 0.04 0.44 0.36 0.74 0.31 0.43
0.15 0.2 0.13 0.13 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.13 0.07 0.04 0.13 0.0 0.1 0.07 0.24 0.07 0.0
0.11 1.0 1.0 0.23 0.19 0.26 0.09 0.0 0.36 0.53 0.51 0.24 0.21 0.41 0.35 0.46 0.47 0.79 0.38 0.03
0.46 0.76 0.95 0.44 0.32 0.33 0.23 0.05 0.51 0.52 0.65 0.13 0.1 0.27 0.05 0.27 0.41 0.62 0.42 1.0
0.29 0.68 0.41 0.67 0.46 0.34 0.0 0.0 0.28 0.21 0.4 0.08 0.23 0.45 0.02 0.37 0.34 0.57 0.43 1.0
0.72 0.92 0.58 0.35 0.38 0.31 0.4 0.44 0.36 0.19 0.48 0.11 0.19 0.3 0.04 0.32 0.41 0.55 0.28 1.0
0.26 0.86 0.58 0.03 0.01 0.09 0.0 0.03 0.38 0.56 0.3 0.09 0.11 0.23 0.0 0.24 0.27 0.34 0.27 1.0
0.14 0.71 0.95 0.81 0.54 0.59 0.05 0.5 0.28 0.72 0.58 0.19 0.2 0.41 0.02 0.36 0.38 1.0 0.06 0.5
0.53 0.78 0.74 0.47 0.5 0.46 0.0 0.19 1.0 0.81 0.72 0.12 0.22 0.43 0.0 0.46 0.37 0.71 0.34 0.6
0.54 0.88 1.0 0.21 0.18 0.26 0.55 0.22 0.4 0.39 0.43 0.4 0.2 0.24 0.22 0.29 0.7 0.4 0.22 0.37
1.0 0.87 0.73 0.67 0.43 0.37 0.0 0.26 0.75 0.48 0.63 0.21 0.24 0.64 0.01 0.56 0.54 0.77 0.31 0.87
0.7 1.0 0.98 0.94 0.68 0.48 0.0 0.25 0.33 0.59 0.69 0.09 0.33 0.8 0.0 0.51 0.41 0.81 0.42 0.8
0.69 0.65 1.0 0.61 0.28 0.49 0.31 0.43 0.36 0.64 0.57 0.24 0.24 0.34 0.24 0.39 0.51 0.6 0.34 0.7
0.36 0.85 0.75 0.34 0.09 0.16 0.25 0.04 0.37 1.0 0.43 0.39 0.32 0.37 0.19 0.25 0.55 0.68 0.32 0.9
0.41 0.57 0.33 0.89 0.47 0.31 0.13 0.01 1.0 0.25 0.42 0.15 0.31 0.46 0.08 0.55 0.3 0.56 0.16 0.26
0.47 0.72 0.58 0.12 0.17 0.22 0.0 0.0 0.39 0.83 0.58 0.06 0.16 0.29 0.06 0.53 0.41 0.61 0.61 1.0
0.58 0.52 0.49 0.56 0.31 0.19 0.08 0.2 0.44 0.36 0.39 0.1 0.2 0.36 0.05 0.24 0.25 0.37 0.17 1.0
0.26 0.56 0.59 0.15 0.13 0.16 0.03 0.1 0.72 1.0 0.45 0.18 0.15 0.25 0.12 0.27 0.36 0.39 0.23 0.4
0.64 0.91 0.82 1.0 0.64 0.68 0.35 0.6 0.71 0.34 0.62 0.36 0.35 0.55 0.16 0.25 0.63 0.57 0.18 0.73
0.6 1.0 0.96 0.35 0.33 0.26 0.83 0.23 0.89 1.0 0.68 0.7 0.34 0.42 0.57 0.51 0.96 0.7 0.48 0.66
0.54 0.65 0.65 0.3 0.15 0.19 0.0 0.26 0.5 1.0 0.48 0.11 0.27 0.46 0.0 0.35 0.31 0.54 0.34 0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)