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Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
-1.07 0.71 0.54 0.61 -0.72 -0.62 0.12 -1.08 -0.81 0.08 -0.37 0.33 -0.48 -0.09 0.25 -0.02 0.69 -0.05 0.14 -0.11
-0.75 -0.01 0.14 -1.43 -1.73 -0.37 -1.01 -0.44 -0.59 1.24 -0.04 0.84 -0.48 0.05 0.1 -0.96 0.9 0.56 1.11 -
-1.87 0.91 0.81 0.01 -0.63 -0.38 -0.03 -0.81 -0.31 -0.0 -0.28 0.46 -0.49 -0.02 -0.47 -0.03 0.6 0.45 0.5 -1.22
0.8 0.61 0.78 -0.6 -1.31 -0.44 0.12 -0.92 -1.57 0.0 -0.29 -0.43 -1.05 -0.54 0.13 -0.31 0.51 0.04 0.06 1.09
0.51 0.93 1.47 -0.18 -0.41 -0.22 0.1 -0.78 -2.4 -1.8 0.03 -0.45 -0.99 -0.55 -0.59 -1.0 0.33 -0.26 -0.18 1.13
0.5 0.45 0.27 -0.27 -0.43 -0.48 0.47 -0.73 -0.04 0.69 0.07 0.07 -0.6 -0.34 -0.35 -0.39 0.33 0.29 0.15 -1.11
0.1 0.24 0.52 -1.01 -1.01 -0.74 0.55 -0.65 0.36 0.54 -0.05 -0.23 -0.61 -0.34 0.15 -0.74 0.27 -0.1 -0.23 0.94
0.08 -0.08 -0.18 -1.24 -1.28 -2.06 -0.14 -2.29 0.49 1.34 -0.01 0.52 0.27 0.26 0.36 0.2 -0.14 0.21 -0.3 -0.24
-0.73 0.49 0.34 -0.33 -0.97 -0.63 0.77 -1.38 -1.64 -1.23 -0.74 0.58 0.31 0.5 0.11 -0.05 0.21 0.4 0.13 0.66
-0.02 0.74 0.76 -0.34 -1.15 -0.96 0.24 -1.31 -2.06 -0.95 -0.29 0.31 -0.38 -0.19 0.37 0.19 0.7 0.33 0.45 0.23
-0.39 0.77 0.68 0.14 -1.19 -0.68 0.61 -0.88 -0.79 -0.47 -0.32 -0.19 -0.04 0.28 0.34 -0.22 0.71 0.31 0.17 -1.3
0.24 0.56 0.68 -1.34 -0.79 -0.78 0.89 -1.09 -0.99 0.36 0.24 0.28 -1.01 -0.65 0.03 -0.27 0.48 0.15 -0.12 0.36
-0.48 0.25 0.15 -0.84 -1.11 -1.36 -0.27 -2.18 1.31 0.78 -0.13 0.45 -0.55 -0.43 0.18 -0.23 -0.09 -0.16 -0.49 1.05
0.81 -0.07 0.4 -0.34 -0.65 0.08 0.23 0.17 -0.85 -0.04 0.17 -0.04 -0.74 -0.83 0.18 -0.85 0.3 0.02 0.27 0.34
-0.38 0.33 0.08 -0.66 -0.57 -1.06 -0.06 -1.09 1.22 0.88 0.01 0.06 -0.65 -0.39 0.16 -0.23 0.37 0.05 -0.08 -0.24
0.71 0.48 0.79 -0.86 -1.1 -0.68 0.45 -0.54 -0.59 -0.11 0.07 -0.03 -0.65 -0.38 -0.01 -0.39 0.36 0.09 0.04 0.47
0.02 0.8 1.03 -0.65 -0.88 -0.94 -0.08 -0.91 0.32 0.3 0.05 -0.02 -0.82 -0.53 0.16 -0.14 0.82 -0.11 0.36 -1.92
0.2 0.45 0.55 0.6 0.16 -0.0 0.29 0.04 -1.94 -1.18 0.17 -0.36 -0.51 -0.31 -0.01 -0.52 0.29 -0.04 -0.27 0.39
0.23 0.65 0.67 -0.93 -1.49 -0.95 0.5 -1.21 -0.54 0.15 -0.17 -0.03 -0.48 -0.08 -0.03 -0.04 0.57 0.19 0.37 0.3
-0.01 0.33 0.7 0.19 -0.19 -0.3 0.69 -0.32 -0.48 -0.68 0.27 -0.09 -0.9 -0.41 -0.16 -0.26 0.4 0.21 0.01 -0.19
0.63 0.93 0.79 -3.93 -3.85 -1.18 -0.21 -0.78 -1.37 0.02 -0.69 0.02 -0.17 0.02 0.38 -0.07 0.67 0.41 0.36 0.5
1.52 0.06 0.71 -0.54 -0.97 -1.16 0.8 -1.29 -1.98 -0.58 -0.35 0.53 -0.84 -0.55 -0.05 -0.55 0.46 0.27 0.16 -0.12
0.1 1.06 1.21 -0.59 -0.79 -0.59 0.19 -1.23 -0.22 0.5 0.11 -0.23 -1.06 -0.44 -0.61 -0.56 0.57 0.01 -0.21 -0.1
0.43 0.7 0.75 0.78 -0.1 -0.16 0.31 -1.02 -0.96 0.37 -0.04 -0.59 -0.67 -0.51 -0.3 -0.61 0.39 -0.05 -0.38 -0.36
-0.86 0.79 0.64 -0.28 -1.62 -1.62 0.54 -1.16 -1.47 -0.34 -0.08 0.29 -0.19 -0.17 0.64 -0.15 0.42 0.31 0.55 0.25
-0.82 0.44 0.49 0.11 -0.45 -0.39 0.74 -1.09 -0.48 0.59 -0.01 0.09 -0.24 -0.23 0.05 -0.32 0.17 -0.01 -0.08 0.1
0.46 0.54 0.61 0.36 -1.27 -1.79 0.39 -1.83 -0.61 0.98 0.14 0.04 -1.08 -0.73 -0.02 -0.45 0.44 0.04 0.07 0.1
-0.45 0.85 1.07 -0.19 -0.64 -0.5 0.69 -1.06 -1.47 -1.69 -0.21 0.29 0.07 0.15 -0.14 -0.19 0.56 0.15 0.19 -0.72
-0.08 0.25 -0.4 0.32 -0.4 0.63 0.06 0.58 -1.36 -1.81 -0.13 -0.69 0.08 -0.01 0.12 -0.21 0.64 0.2 -0.18 0.29
-0.31 0.94 0.86 -1.04 -1.46 -1.09 0.53 -1.29 -0.89 0.25 -0.24 0.26 -0.47 -0.31 0.28 -0.23 0.63 0.04 0.31 0.14
-0.89 0.6 0.37 -1.26 -0.89 -0.13 0.24 -0.39 0.59 1.24 0.33 -0.18 -0.69 -0.17 -0.28 -1.14 0.51 0.29 -0.25 -0.84
0.93 0.52 0.71 -0.8 -0.92 -1.06 1.07 -1.35 -0.95 -0.18 -0.18 0.08 -0.94 -0.51 -0.3 -0.65 0.39 0.25 0.02 0.5
-0.38 0.34 -0.43 0.82 0.38 -0.77 0.39 -0.62 -0.72 0.63 0.24 -0.05 -0.26 -0.19 0.12 -0.62 0.1 -0.1 -0.4 0.13
0.06 0.26 0.28 1.14 0.04 -0.44 0.19 -0.48 -1.01 -0.93 -0.02 -0.1 -0.53 -0.36 -0.3 -0.74 0.17 0.03 -0.3 0.96
0.39 0.6 0.82 -0.79 -0.89 -1.03 0.21 -1.82 -0.13 0.69 -0.06 0.53 -0.75 -0.47 0.14 -0.07 0.58 -0.05 -0.27 -0.36
-1.37 0.73 0.59 1.23 0.29 0.29 0.3 0.0 -1.77 -2.86 -0.01 -0.23 -0.59 -0.23 -0.58 -0.69 0.44 0.17 -0.06 -0.16
0.55 0.58 0.82 -1.09 -1.48 -1.47 0.92 -2.05 -0.85 -0.02 -0.18 0.64 -0.47 -0.4 0.08 -0.41 0.24 0.12 -0.26 0.66
0.06 0.39 -0.02 0.65 -0.13 -0.13 0.55 -0.25 -1.33 -0.95 0.09 -0.03 -0.42 0.03 -0.13 -0.28 0.49 0.26 0.2 -0.41
0.71 0.48 0.79 -0.86 -1.1 -0.68 0.45 -0.54 -0.59 -0.11 0.07 -0.03 -0.65 -0.38 -0.01 -0.39 0.36 0.09 0.04 0.47
-0.24 0.42 0.62 -0.2 -1.02 -0.88 0.6 -1.19 -0.15 0.21 -0.4 -0.28 0.29 0.3 0.24 -0.14 0.01 0.14 0.01 0.17
0.26 0.58 0.54 -0.14 -0.26 -0.62 0.84 -0.77 -1.0 -0.11 0.05 0.06 -0.44 -0.34 0.21 -0.37 0.21 0.1 -0.02 -0.14
0.09 0.32 0.39 0.06 -0.54 -0.49 0.26 -0.52 -0.19 -0.18 -0.05 0.23 -0.01 -0.02 0.31 -0.36 0.12 0.24 0.17 -0.43
0.16 0.44 0.47 -0.91 -1.45 -1.44 0.34 -1.64 -0.3 0.52 -0.12 0.24 -0.18 -0.07 0.49 -0.14 0.14 -0.04 -0.23 0.91
-2.49 1.07 -0.38 -2.23 -3.01 -2.25 -0.5 -2.65 1.06 0.77 -0.41 0.68 -1.15 -0.08 0.66 0.03 0.77 -0.05 0.22 0.65
0.15 0.85 1.02 -1.01 -1.32 -1.41 0.78 -2.1 -0.5 -0.27 -0.35 0.14 -0.84 -0.79 -0.16 -0.37 0.64 0.14 -0.19 1.05
0.12 0.95 0.97 -0.94 -1.68 -0.32 0.25 -0.58 -2.81 -0.09 -0.35 0.64 -0.49 0.02 -0.48 -0.29 0.78 0.24 0.44 -0.83
-0.78 0.6 0.73 -0.68 -0.91 0.28 -0.51 0.01 0.38 0.81 -0.03 0.06 -0.62 -0.28 -0.23 -0.24 0.55 -0.2 0.12 -1.04
-0.24 0.58 0.5 -0.54 -0.89 -0.71 0.42 -1.17 -1.17 -0.14 -0.2 0.59 -0.19 0.16 -0.43 0.07 0.52 0.45 0.47 -0.13
-0.41 0.56 0.6 -1.39 -1.49 -0.51 0.46 -0.69 0.24 0.91 0.29 0.09 -0.92 -0.53 -0.34 -0.35 0.58 0.1 -0.11 0.24
-0.14 0.32 0.32 0.15 -0.32 -0.58 0.21 -0.62 0.32 0.12 -0.01 0.1 -0.11 0.0 -0.06 0.01 -0.01 -0.06 -0.18 0.1
-1.08 0.46 0.11 1.4 -0.15 -0.68 0.34 -0.9 -1.0 -1.06 -0.12 -0.06 -0.28 -0.04 -0.12 -0.4 0.38 0.16 -0.11 0.52
1.37 0.22 0.75 0.34 -0.12 -0.38 0.42 -0.3 -3.27 -2.78 0.46 -0.14 -1.12 -0.72 -0.47 -0.57 0.37 0.15 0.02 0.07
-1.87 0.91 0.81 0.01 -0.63 -0.38 -0.03 -0.81 -0.31 -0.0 -0.28 0.46 -0.49 -0.02 -0.47 -0.03 0.6 0.45 0.5 -1.22
2.08 0.45 2.12 -1.62 -2.11 -0.83 0.06 -0.63 -2.35 -3.35 -0.01 0.27 -1.33 -2.03 -1.33 -0.54 0.2 -0.01 -0.69 -1.78
0.87 0.13 0.05 -1.44 -1.44 -0.66 -0.66 -0.89 0.78 1.32 0.22 -0.06 -0.88 -0.71 0.38 -0.77 0.13 0.11 0.21 -0.31
-1.03 1.43 -0.82 0.3 -1.24 -0.34 -0.88 -1.14 -4.71 -4.0 -1.19 -0.09 -0.93 -0.03 0.69 0.06 1.51 0.52 1.03 -0.26
-0.3 1.01 1.02 0.25 -0.42 0.46 0.6 -0.52 -1.41 -0.9 -0.32 -0.43 -0.47 -0.38 -0.13 -0.68 0.65 0.08 -0.03 -0.92
0.03 0.49 0.57 0.13 -0.04 -1.13 0.86 -1.12 -0.6 -0.51 -0.13 -0.05 -0.08 -0.05 0.0 -0.07 0.27 0.1 -0.34 0.15
0.69 0.46 0.81 -1.05 -0.73 -0.99 0.36 -1.32 -0.35 -0.27 0.07 0.2 -0.37 -0.32 -0.01 -0.03 0.51 0.18 0.17 -0.09
-0.44 0.02 2.81 - - -1.65 -0.21 -3.4 0.88 1.52 0.42 -0.98 -4.46 -1.65 -5.24 -5.38 -1.98 -0.9 -2.43 1.01
0.29 0.85 0.89 -0.66 -1.07 -1.23 -0.5 -1.91 0.21 0.66 0.01 0.43 -0.92 -0.47 0.14 -0.59 0.53 0.06 0.09 -0.09
-0.43 0.27 0.43 -0.45 -0.77 -0.06 -0.1 -0.65 0.31 1.0 0.12 0.14 -0.73 -0.38 -0.18 -0.31 0.35 0.16 0.49 -0.84
-0.32 0.58 0.48 -0.83 -1.15 -1.06 -0.28 -1.2 0.85 0.71 0.1 0.38 -0.35 -0.23 -0.14 -0.24 0.37 0.12 -0.33 0.25
0.81 0.09 0.92 0.75 0.06 0.3 -0.01 0.22 -3.85 -2.46 0.08 -0.53 -0.46 -0.38 -0.13 -0.65 0.35 -0.12 -0.2 0.08
0.05 0.63 0.52 -0.2 -1.29 -0.97 0.9 -1.62 -1.09 0.14 -0.14 -0.48 -0.44 -0.22 0.7 -0.43 0.53 0.33 0.0 0.18
0.29 -0.1 -0.32 -1.16 -1.68 -1.53 0.46 -2.41 -0.38 0.95 -0.19 0.35 -0.4 -0.57 0.55 -0.43 0.02 -0.04 -0.06 1.55

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.