Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.07 0.73 0.59 0.21 0.09 0.12 1.0 0.07 0.23 0.17 0.19 0.63 0.49 0.41 0.68 0.12 0.66 0.49 0.42 0.68
0.69 0.29 0.38 0.36 0.26 0.34 1.0 0.45 0.31 0.3 0.3 0.58 0.29 0.21 0.43 0.26 0.46 0.45 0.37 0.52
0.46 0.39 0.31 0.2 0.21 0.14 1.0 0.13 0.15 0.13 0.27 0.59 0.3 0.22 0.62 0.23 0.57 0.42 0.36 0.4
0.65 0.62 0.82 0.72 0.32 0.58 1.0 0.59 0.36 0.4 0.52 0.73 0.52 0.32 0.8 0.31 0.94 0.65 0.56 0.4
0.25 0.83 0.62 0.53 0.33 0.21 1.0 0.12 0.27 0.28 0.38 0.46 0.26 0.38 0.62 0.39 0.63 0.45 0.5 0.52
0.68 1.0 0.91 0.71 0.48 0.48 0.51 0.44 0.41 0.33 0.54 0.7 0.69 0.61 0.83 0.52 0.77 0.61 0.55 1.0
0.54 0.77 0.74 0.41 0.35 0.27 1.0 0.2 0.39 0.35 0.49 0.93 0.81 0.78 0.77 0.8 0.7 0.66 0.45 1.0
0.49 0.75 0.73 0.19 0.17 0.17 1.0 0.01 0.36 0.38 0.38 0.55 0.28 0.33 0.52 0.27 0.64 0.4 0.45 0.75
0.45 0.62 0.68 0.22 0.16 0.2 1.0 0.23 0.43 0.31 0.36 0.48 0.27 0.31 0.35 0.3 0.54 0.42 0.53 0.51
0.33 0.78 0.83 0.43 0.44 0.31 1.0 0.36 0.2 0.42 0.49 0.33 0.1 0.16 0.21 0.34 0.56 0.42 0.49 0.28
0.48 0.32 0.35 0.17 0.0 0.06 1.0 0.06 0.25 0.27 0.18 0.52 0.26 0.1 0.56 0.5 0.33 0.3 0.41 0.3
0.82 0.63 0.44 0.55 0.49 0.42 1.0 0.4 0.38 0.18 0.52 0.55 0.81 0.82 0.64 0.6 0.73 0.6 0.53 0.66
0.31 0.69 0.66 0.53 0.15 0.18 1.0 0.12 0.18 0.19 0.33 0.67 0.32 0.46 0.67 0.51 0.68 0.48 0.55 0.65
0.93 0.75 0.74 0.31 0.29 0.26 1.0 0.2 0.58 0.41 0.51 0.7 0.66 0.6 0.76 0.57 0.76 0.61 0.48 0.79
0.48 0.81 0.69 0.28 0.33 0.27 1.0 0.22 0.32 0.22 0.41 0.64 0.4 0.44 0.45 0.41 0.79 0.51 0.49 0.6
0.6 0.69 0.87 0.24 0.15 0.2 1.0 0.13 0.22 0.37 0.35 0.79 0.32 0.4 0.37 0.4 0.64 0.58 0.57 0.6
0.12 0.37 0.23 0.18 0.16 0.15 0.45 0.13 0.22 0.08 0.17 0.59 0.5 0.4 0.38 0.36 0.31 0.28 0.19 1.0
0.12 0.26 0.21 0.15 0.18 0.07 1.0 0.24 0.17 0.31 0.21 0.31 0.07 0.07 0.38 0.18 0.31 0.27 0.27 0.33
1.0 0.66 0.65 0.21 0.26 0.22 0.67 0.2 0.24 0.17 0.45 0.56 0.35 0.34 0.39 0.37 0.69 0.48 0.37 0.53
0.51 0.97 0.64 0.46 0.44 0.33 1.0 0.24 0.07 0.15 0.33 0.23 0.16 0.21 0.53 0.26 0.69 0.43 0.44 0.45
0.32 0.48 0.44 0.08 0.07 0.08 1.0 0.1 0.5 0.38 0.24 0.85 0.22 0.16 0.76 0.22 0.72 0.36 0.36 0.77
1.0 0.65 0.71 0.16 0.04 0.17 0.8 0.12 0.09 0.06 0.22 0.38 0.2 0.23 0.39 0.34 0.63 0.41 0.46 0.94
0.49 0.9 0.63 0.68 0.07 0.15 1.0 0.09 0.19 0.3 0.41 0.33 0.1 0.21 0.63 0.34 0.83 0.49 0.54 0.74
0.33 0.76 0.49 0.65 0.54 0.45 0.59 0.46 0.55 0.32 0.5 1.0 0.82 0.8 0.83 0.62 0.76 0.66 0.51 0.87
0.3 1.0 0.78 0.4 0.34 0.28 0.99 0.27 0.31 0.14 0.36 0.74 0.64 0.58 0.76 0.51 0.82 0.58 0.48 0.97
0.0 1.0 0.23 0.01 0.0 0.1 0.55 0.01 0.05 0.01 0.06 0.57 0.53 0.5 0.59 0.27 0.72 0.43 0.41 0.75
0.99 0.78 0.91 0.34 0.25 0.3 1.0 0.24 0.35 0.26 0.48 0.91 0.44 0.49 0.6 0.58 0.81 0.66 0.72 0.66
0.16 1.0 0.86 0.34 0.05 0.23 0.92 0.04 0.14 0.39 0.22 0.63 0.55 0.5 0.65 0.46 0.58 0.51 0.55 0.68
0.37 0.7 0.58 0.33 0.3 0.31 0.9 0.33 0.18 0.28 0.44 0.55 0.27 0.36 0.6 0.4 0.71 0.5 0.57 1.0
0.32 1.0 0.61 0.71 0.56 0.57 0.74 0.49 0.68 0.48 0.56 0.84 0.99 0.95 0.81 0.8 0.92 0.74 0.69 0.98
0.36 0.71 0.66 0.01 0.01 0.1 1.0 0.06 0.06 0.06 0.21 0.46 0.13 0.16 0.31 0.17 0.65 0.36 0.41 0.56
0.18 1.0 0.74 0.62 0.09 0.33 0.92 0.17 0.08 0.09 0.25 0.94 0.87 0.87 0.86 0.65 0.84 0.71 0.53 0.83
0.26 0.74 0.56 0.42 0.27 0.2 1.0 0.07 0.05 0.07 0.33 0.46 0.4 0.45 0.88 0.44 0.59 0.43 0.38 0.81
0.71 0.61 0.84 0.18 0.17 0.18 1.0 0.18 0.34 0.51 0.42 0.4 0.23 0.32 0.33 0.28 0.5 0.39 0.39 0.64
0.28 0.61 0.42 0.25 0.31 0.24 1.0 0.19 0.07 0.08 0.42 0.8 0.42 0.33 0.5 0.33 0.75 0.43 0.44 1.0
0.38 0.96 0.74 0.26 0.19 0.27 1.0 0.24 0.16 0.18 0.33 0.8 0.76 0.75 0.75 0.78 0.88 0.71 0.63 0.9
0.27 0.57 0.47 0.22 0.28 0.15 1.0 0.14 0.1 0.13 0.28 0.41 0.15 0.18 0.49 0.28 0.53 0.33 0.39 0.59
0.34 0.89 0.76 0.36 0.15 0.18 0.95 0.09 0.41 0.68 0.42 0.84 0.79 0.8 1.0 0.61 0.92 0.78 0.64 0.47
0.47 0.86 0.85 0.4 0.22 0.34 1.0 0.23 0.25 0.25 0.34 0.74 0.51 0.53 0.59 0.52 0.7 0.55 0.55 0.86
0.22 0.96 0.57 0.41 0.38 0.26 0.72 0.16 0.26 0.21 0.35 0.65 0.76 0.86 0.71 0.55 0.72 0.59 0.57 1.0
0.66 0.69 0.8 0.27 0.2 0.25 0.98 0.16 0.88 1.0 0.57 0.56 0.56 0.48 0.78 0.49 0.61 0.59 0.53 0.66
0.52 0.8 0.69 0.5 0.44 0.39 0.9 0.29 0.47 0.37 0.48 0.9 0.73 0.72 0.56 0.84 0.69 0.6 0.45 1.0
0.55 0.82 0.81 0.2 0.07 0.13 1.0 0.08 0.18 0.08 0.18 0.68 0.44 0.41 0.47 0.71 0.65 0.39 0.34 0.92
0.4 0.31 0.41 0.02 0.03 0.12 1.0 0.11 0.0 0.05 0.17 0.24 0.13 0.08 0.28 0.13 0.34 0.25 0.39 0.3
0.59 0.5 0.52 0.2 0.11 0.1 1.0 0.08 0.59 0.16 0.17 0.32 0.18 0.2 0.37 0.55 0.41 0.34 0.4 0.56
0.2 0.98 0.48 0.92 0.58 0.31 0.76 0.14 0.52 0.72 0.53 0.85 0.61 0.97 1.0 0.62 0.75 0.78 0.71 0.54
0.77 0.72 0.83 0.3 0.25 0.28 1.0 0.22 0.65 0.81 0.54 0.61 0.42 0.44 0.57 0.51 0.6 0.54 0.49 0.89
0.47 0.54 0.45 0.27 0.23 0.25 1.0 0.2 0.43 0.4 0.4 0.7 0.42 0.42 0.45 0.47 0.53 0.42 0.46 0.88
0.48 0.82 0.89 0.24 0.1 0.2 1.0 0.09 0.4 0.5 0.46 0.51 0.25 0.31 0.55 0.38 0.7 0.5 0.54 0.87
0.37 0.68 0.54 0.04 0.01 0.09 0.68 0.03 0.04 0.05 0.08 0.85 0.69 0.63 1.0 0.48 0.84 0.59 0.54 0.84
0.53 0.64 0.67 0.29 0.23 0.27 1.0 0.2 0.12 0.23 0.34 0.45 0.31 0.32 0.51 0.31 0.53 0.42 0.48 0.66
0.03 0.39 0.24 0.27 0.2 0.19 1.0 0.15 0.04 0.04 0.13 0.34 0.22 0.19 0.53 0.14 0.43 0.29 0.34 0.36
0.12 0.37 0.4 0.25 0.08 0.12 1.0 0.1 0.03 0.18 0.21 0.29 0.09 0.11 0.23 0.15 0.28 0.33 0.32 0.11
0.24 0.86 0.55 0.29 0.18 0.15 1.0 0.12 0.2 0.14 0.28 0.51 0.42 0.53 0.5 0.47 0.68 0.5 0.42 0.65
0.29 0.39 0.45 0.11 0.11 0.23 1.0 0.32 0.31 0.37 0.33 0.31 0.23 0.24 0.39 0.31 0.37 0.35 0.36 0.64
0.17 0.49 0.51 0.01 0.02 0.08 1.0 0.02 0.06 0.04 0.14 0.3 0.16 0.22 0.38 0.15 0.46 0.29 0.32 0.55
0.33 0.94 0.74 0.56 0.48 0.37 0.98 0.28 0.46 0.26 0.48 0.83 0.85 0.83 0.8 0.72 0.77 0.73 0.55 1.0
0.81 0.71 0.77 0.31 0.29 0.27 0.95 0.31 0.81 1.0 0.67 0.59 0.34 0.42 0.59 0.42 0.75 0.53 0.51 0.95

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)