Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.01 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.61 1.0 0.24 0.01 0.02 0.02 0.04 0.01 0.03 0.02 0.01 0.05
0.03 0.13 0.16 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 1.0 0.96 0.26 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.13 0.02 0.03 0.03
0.04 0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.43 1.0 0.24 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.07
0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.71 1.0 0.24 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.09
0.04 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.82 1.0 0.27 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.11
0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.13 0.0 0.1 1.0 0.26 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0
0.04 0.07 0.08 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.85 1.0 0.25 0.04 0.02 0.02 0.07 0.01 0.03 0.03 0.02 0.2
0.05 0.04 0.08 0.01 0.02 0.02 0.07 0.01 0.91 1.0 0.27 0.04 0.04 0.04 0.09 0.02 0.07 0.04 0.03 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.21 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0
0.04 0.04 0.08 0.0 0.0 0.02 0.18 0.0 0.58 1.0 0.25 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.02 0.03 0.04
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.01 0.03 1.0 0.26 0.04 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01
0.03 0.03 0.1 0.0 0.0 0.01 0.15 0.0 0.93 1.0 0.26 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 0.02 0.04
0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.68 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.0
0.05 0.07 0.1 0.0 0.0 0.02 0.12 0.01 0.57 1.0 0.26 0.03 0.05 0.05 0.07 0.03 0.05 0.03 0.04 0.07
0.03 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.56 1.0 0.25 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02
0.05 0.08 0.1 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 1.0 0.86 0.21 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.09 0.01 0.03 0.09
0.06 0.11 0.12 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 1.0 0.7 0.16 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.09 0.01 0.04 0.11
0.02 0.05 0.1 0.0 0.0 0.01 0.12 0.02 0.6 1.0 0.28 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.84 1.0 0.24 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03
0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.52 1.0 0.25 0.02 0.08 0.12 0.02 0.01 0.05 0.05 0.02 0.06
0.03 0.05 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.87 0.21 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07
0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.53 1.0 0.24 0.03 0.03 0.05 0.03 0.06 0.07 0.04 0.05 0.03
0.03 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.99 1.0 0.24 0.03 0.01 0.02 0.05 0.01 0.04 0.03 0.02 0.03
0.0 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 1.0 0.26 0.02 0.05 0.06 0.07 0.03 0.09 0.04 0.05 0.05
0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.56 1.0 0.24 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.47 1.0 0.24 0.04 0.03 0.05 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02
0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.16 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.5 1.0 0.24 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02
0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.81 1.0 0.24 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.08
0.05 0.03 0.11 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 1.0 0.92 0.22 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.03 0.01 0.02 0.03
0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.85 0.21 0.03 0.03 0.04 0.04 0.01 0.02 0.02 0.02 0.05
0.02 0.04 0.06 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.16 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.06
0.04 0.04 0.19 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.72 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04
0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.73 1.0 0.24 0.01 0.05 0.05 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02
0.01 0.1 0.14 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.84 1.0 0.26 0.07 0.06 0.08 0.08 0.05 0.05 0.05 0.07 0.13
0.01 0.05 0.07 0.0 0.0 0.01 0.12 0.0 0.37 1.0 0.25 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.04 0.02 0.03 0.03
0.04 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.35 1.0 0.24 0.01 0.01 0.02 0.04 0.01 0.05 0.02 0.02 0.05
0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.95 1.0 0.29 0.04 0.03 0.04 0.05 0.02 0.03 0.03 0.03 0.06
0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.93 1.0 0.26 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.03 0.02 0.02 0.19
0.01 0.06 0.06 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.54 1.0 0.24 0.04 0.04 0.05 0.07 0.03 0.06 0.04 0.04 0.03
0.01 0.07 0.1 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.95 1.0 0.24 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.05 0.02 0.03 0.03
0.02 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 1.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.15 1.0 0.23 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.04 0.09 0.0 0.0 0.01 0.25 0.01 0.89 1.0 0.3 0.04 0.01 0.01 0.06 0.01 0.03 0.02 0.02 0.07
0.02 0.04 0.17 0.0 0.0 0.02 0.21 0.0 0.82 1.0 0.25 0.02 0.0 0.01 0.06 0.01 0.02 0.02 0.02 0.15
0.06 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.56 1.0 0.28 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04
0.0 0.22 0.13 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.83 0.21 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 0.05 0.02 0.04 0.08
0.02 0.09 0.12 0.02 0.01 0.02 0.09 0.02 0.9 1.0 0.27 0.03 0.04 0.05 0.06 0.03 0.06 0.04 0.04 0.04
0.01 0.16 0.06 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.25 1.0 0.24 0.01 0.01 0.02 0.08 0.03 0.07 0.03 0.04 0.04
0.02 0.19 0.11 0.01 0.02 0.02 0.12 0.03 0.75 1.0 0.26 0.0 0.03 0.06 0.13 0.06 0.12 0.06 0.06 0.1
0.03 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 1.0 0.86 0.21 0.03 0.05 0.05 0.06 0.02 0.02 0.02 0.03 0.06
0.01 0.04 0.05 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.87 1.0 0.24 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.06
0.05 0.06 0.16 0.01 0.02 0.03 0.15 0.03 0.79 1.0 0.29 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04
0.0 0.03 0.1 0.01 0.01 0.02 0.23 0.01 0.51 1.0 0.27 0.04 0.01 0.01 0.04 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0
0.01 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 1.0 0.24 0.03 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03
0.01 0.04 0.11 0.0 0.0 0.02 0.26 0.01 0.62 1.0 0.24 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0
0.01 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.61 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03
0.03 0.05 0.06 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 1.0 1.0 0.25 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.04
0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 1.0 1.0 0.23 0.02 0.05 0.07 0.05 0.01 0.04 0.04 0.05 0.04
0.04 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.65 1.0 0.24 0.01 0.06 0.05 0.06 0.03 0.05 0.03 0.03 0.03
0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.33 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04
0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.72 1.0 0.24 0.02 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 0.02 0.02 0.08
0.24 0.04 0.1 0.0 0.0 0.02 0.08 0.02 0.67 1.0 0.25 0.1 0.02 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.04 0.07
0.04 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.48 1.0 0.26 0.01 0.02 0.03 0.04 0.02 0.06 0.02 0.03 0.02
0.03 0.09 0.21 0.0 0.0 0.02 0.14 0.0 0.65 1.0 0.25 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.19
0.04 0.05 0.05 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.75 1.0 0.25 0.05 0.03 0.05 0.08 0.03 0.05 0.04 0.06 0.05
0.04 0.07 0.07 0.01 0.0 0.01 0.05 0.01 1.0 0.92 0.22 0.02 0.08 0.08 0.06 0.03 0.04 0.04 0.03 0.09
0.03 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.73 1.0 0.24 0.01 0.02 0.04 0.06 0.02 0.06 0.03 0.04 0.03
0.02 0.02 0.06 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.54 1.0 0.24 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01
0.04 0.05 0.05 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.74 1.0 0.25 0.06 0.04 0.07 0.06 0.03 0.04 0.04 0.04 0.13
0.01 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.26 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.82 1.0 0.24 0.04 0.04 0.05 0.07 0.02 0.04 0.04 0.02 0.03
0.02 0.03 0.06 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.64 1.0 0.24 0.03 0.02 0.03 0.05 0.01 0.03 0.02 0.03 0.03
0.03 0.03 0.09 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.8 1.0 0.28 0.04 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.03 0.06
0.04 0.02 0.06 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.65 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01
0.02 0.06 0.09 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.64 1.0 0.24 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03
0.01 0.04 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.85 1.0 0.25 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01
0.05 0.07 0.15 0.0 0.0 0.03 0.25 0.01 0.95 1.0 0.26 0.03 0.04 0.04 0.05 0.04 0.04 0.03 0.05 0.11
0.07 0.01 0.08 0.0 0.0 0.01 0.18 0.0 0.74 1.0 0.23 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06
0.08 0.06 0.04 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.86 1.0 0.24 0.02 0.01 0.02 0.06 0.02 0.03 0.02 0.03 0.05
0.02 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.59 1.0 0.24 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01
0.03 0.07 0.1 0.0 0.0 0.01 0.17 0.0 0.76 1.0 0.25 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.05 0.02 0.02 0.05
0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.68 1.0 0.25 0.02 0.01 0.03 0.03 0.02 0.05 0.04 0.04 0.1
0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.93 1.0 0.24 0.02 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01 0.04
0.07 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.3 1.0 0.26 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01
0.02 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.94 1.0 0.24 0.03 0.05 0.06 0.04 0.02 0.04 0.03 0.03 0.04
0.04 0.08 0.12 0.0 0.0 0.02 0.14 0.01 1.0 0.94 0.26 0.02 0.02 0.02 0.05 0.02 0.06 0.03 0.04 0.07
0.03 0.07 0.1 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.88 1.0 0.26 0.02 0.03 0.04 0.08 0.02 0.06 0.03 0.04 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)