Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.31 0.0 0.37
0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.01 0.05 0.04 0.01 0.07 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.11 0.06 0.07 0.04 0.07 0.07 0.03 0.03 0.27 0.03 0.0
0.31 0.0 0.09 0.05 0.03 0.0 0.0 0.04 1.0 0.21 0.09 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.13 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.19 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.03 1.0 0.24 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0
0.21 0.04 0.02 0.04 0.04 0.04 0.03 0.11 1.0 0.17 0.06 0.02 0.09 0.11 0.04 0.04 0.05 0.2 0.06 0.16
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.93 0.01 0.0
0.0 0.02 0.08 0.02 0.04 0.0 0.05 0.0 1.0 0.13 0.05 0.07 0.02 0.06 0.04 0.04 0.05 0.06 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.28 0.01 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.13 0.02 0.25
0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.01 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0
0.0 0.11 0.08 0.02 0.0 0.08 0.04 0.0 1.0 0.03 0.02 0.07 0.04 0.02 0.07 0.01 0.08 0.1 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.41 1.0 0.23 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.41 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.09 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0
0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.05 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.1 0.04 0.02 0.05 0.02 0.02 0.01 0.11 0.25 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19
0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.08 0.0 0.02 0.0 0.11 0.0 0.22
0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.01 0.12 0.01 1.0 0.04 0.02 0.11 0.03 0.07 0.06 0.04 0.11 0.1 0.08 0.05
0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.04 0.04 0.09 0.02 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.37 0.08 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.6 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.07 0.0 0.03 0.04 0.23 0.04 0.0
0.0 0.06 0.11 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.4 0.1 0.0 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.15 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.81 0.16 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.04 0.24 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.55 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.18 0.01 0.0
0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 1.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.43 0.01 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.13 0.04 0.02 0.0 0.04 0.05 0.02 0.01 0.06 0.03 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.23 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.82 0.2 0.0 0.03 0.07 0.0 0.08 0.04 0.56 0.09 0.0
0.0 0.67 1.0 0.1 0.01 0.23 0.0 0.09 0.42 0.76 0.53 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.16 0.22 0.14 0.5
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.09 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0
0.12 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.04 0.0 0.02 0.12 0.03 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 1.0 0.19 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.14 0.01 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.4 0.1 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.06 0.17 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.09 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0
0.0 0.26 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.3 0.0 0.11 0.17 0.0 0.05 0.07 0.22 0.09 0.88
0.0 0.12 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.46 0.11 0.02 0.06 0.07 0.01 0.01 0.02 0.1 0.01 0.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.09 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0
0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.23 0.06 0.08 0.01 0.02 0.06 0.01 0.01 0.15 0.03 0.08
0.0 0.08 0.13 0.02 0.0 0.0 0.19 0.0 0.67 1.0 0.36 0.1 0.0 0.12 0.04 0.0 0.03 0.44 0.04 0.53
0.0 0.05 0.18 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 1.0 0.36 0.1 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.04
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.07 0.02 0.0
0.0 0.06 0.02 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.41 0.1 0.03 0.03 0.06 0.11 0.02 0.04 0.1 0.04 0.0
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 1.0 0.44 0.12 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.24 0.02 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.09 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.27 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.12 0.02 0.0
0.14 0.36 0.85 0.02 0.01 0.02 0.03 0.0 1.0 0.58 0.24 0.13 0.05 0.06 0.03 0.02 0.13 0.18 0.09 0.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.05 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.07 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.02 0.03 0.33 0.03 0.15
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.58 0.14 0.0 0.05 0.05 0.06 0.03 0.03 0.17 0.04 0.0
0.05 0.02 0.02 0.04 0.06 0.0 0.04 0.04 1.0 0.14 0.09 0.01 0.08 0.06 0.07 0.05 0.04 0.07 0.03 0.07
0.0 0.03 0.1 0.01 0.09 0.0 0.1 0.0 1.0 0.12 0.09 0.0 0.09 0.02 0.12 0.0 0.02 0.23 0.02 0.08
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 1.0 0.74 0.19 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.06 0.26 0.05 0.0
0.11 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 1.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.04 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.23 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.13 0.06 0.0 0.0 0.05 0.07 0.03 0.01 0.2 0.01 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)