Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.18 0.0 0.0 0.27 0.0 0.02 0.0 0.23 0.59 0.0 0.0 0.07 0.67 0.28 0.0
0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.12 0.57 0.0 2.5 1.55 0.43 0.23 0.19 0.68 0.53 0.21 0.33 1.02 0.55 0.0
1.52 0.31 0.11 0.05 0.02 0.25 1.35 0.0 4.25 0.89 0.3 0.73 3.0 1.96 2.34 1.14 1.02 1.83 1.34 1.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.04 0.36 0.0 0.0 0.0 0.25 0.1 0.0
0.0 0.23 0.53 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.93 0.0 0.11 0.0 0.26 0.69 0.3 0.0 0.18 0.9 0.76 0.0
0.0 0.05 0.23 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.42 0.29 0.0
0.0 1.5 0.0 0.97 1.42 1.01 0.13 0.0 2.01 0.79 1.08 3.68 1.81 2.63 0.89 1.55 2.6 2.68 2.11 0.0
0.0 0.17 0.24 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.7 0.06 0.04 0.0 0.09 0.51 0.16 0.08 0.08 0.75 0.44 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.38 0.04 0.0
0.0 0.17 0.24 0.73 0.63 0.1 0.03 0.0 0.83 0.28 0.46 0.0 0.13 0.43 0.0 0.06 0.08 1.27 0.15 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.16 0.0 0.09 0.16 0.05 0.12 0.02 0.17 0.0 0.0 0.04 0.62 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.74 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 1.02 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.35 0.23 0.0
0.0 0.09 0.0 0.18 0.0 0.0 0.1 0.37 0.25 0.15 0.05 0.17 0.11 0.24 0.08 0.29 0.05 0.71 0.14 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.48 0.15 0.0 0.1 0.28 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.14 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.08 0.0
0.0 0.03 0.0 0.04 0.02 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.03 0.1 0.12 0.07 0.08 0.0 0.05 0.15 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.18 0.34 0.0 0.05 0.37 0.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.57 0.38 0.0 0.0 0.5 0.0 0.6 0.0 0.88 0.43 0.0
0.0 1.23 0.0 0.09 0.0 0.46 1.29 0.69 2.01 0.28 0.47 1.22 2.33 1.46 1.33 0.43 0.92 2.19 1.35 0.0
0.0 0.0 0.0 0.42 0.18 0.29 0.37 0.0 2.37 0.97 0.45 0.33 2.08 1.89 1.11 0.89 0.17 1.61 0.99 0.0
0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.3 0.0 0.0 0.79 0.47 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.39 0.0 0.03 0.43 0.18 0.42 0.0 0.72 0.0 0.61 0.31 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.13 0.0
0.0 0.42 0.31 0.38 0.1 0.27 0.11 0.26 0.36 0.0 0.29 0.0 0.27 0.82 0.09 0.6 0.1 0.72 0.38 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 1.36 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 2.44 0.36 0.11 0.0 0.59 2.05 0.0 0.11 0.18 1.41 1.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.22 0.05 0.0 0.1 0.1 0.0 0.17 0.04 0.79 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.02 0.01 0.2 0.04 0.45 0.22 0.04 0.29 1.24 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 1.91 0.0 0.02 0.0 0.32 1.06 0.25 0.43 0.0 0.86 0.42 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.21 0.0 0.08 0.06 0.09 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.01 0.04 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.18 0.0 0.69 0.59 0.0 0.15 0.19 0.81 0.37 0.0
0.0 0.07 0.16 0.0 0.02 0.14 0.26 0.21 0.27 0.5 0.13 0.13 0.45 0.22 0.26 0.24 0.07 0.79 0.25 0.0
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.34 0.31 0.0 0.45 0.0 0.0 0.61 0.12 0.0 0.89 0.0 0.3 1.4 0.36 0.0
22.33 57.48 35.13 6.1 3.99 11.31 4.67 1.64 71.9 88.13 30.7 12.98 14.1 22.38 6.55 17.08 36.4 42.88 37.99 17.63
0.0 0.26 0.16 0.0 0.0 0.35 0.56 1.24 1.53 0.28 0.41 0.13 1.07 2.09 0.43 0.0 0.31 1.76 0.97 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.06 0.01 0.0 0.31 0.0 0.04 0.0 0.09 0.52 0.0 0.0 0.06 0.55 0.44 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.13 0.0 0.18 0.0 0.19 0.19 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.17 0.0 0.74 0.0 0.06 0.0 0.18 0.6 0.08 0.25 0.09 0.71 0.43 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.12 0.03 0.0 0.59 0.34 0.26 0.32 0.08 0.78 0.36 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 1.5 0.0 0.04 0.0 0.14 0.36 0.0 0.27 0.09 0.51 0.31 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.79 0.38 0.0
0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.07 0.16 0.0 0.03 0.0 0.22 0.11 0.0
0.0 0.62 0.0 0.13 0.28 0.39 0.21 0.38 2.07 2.25 0.72 0.0 0.56 2.27 0.25 0.33 0.14 1.55 0.85 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.08 0.0 0.42 0.51 0.21 0.58 0.15 0.9 0.0 0.0 0.21 1.11 0.59 0.0
0.0 0.41 0.12 0.34 0.06 0.11 0.04 0.0 1.35 0.28 0.2 0.0 0.32 0.44 0.0 0.28 0.32 0.57 0.32 0.31
0.0 0.66 1.44 0.0 0.03 0.55 2.7 0.62 0.74 0.36 0.31 0.43 0.25 0.38 0.42 0.18 0.26 1.13 0.49 2.12
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.7 0.0 0.0 0.32 0.34 1.14 0.42 0.58 0.12 0.91 0.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.05 0.41 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.74 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.34 0.91 0.0 0.47 0.12 0.67 0.31 0.0
0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.24 0.32 0.22 0.84 0.35 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 1.34 0.0 0.07 0.0 0.24 0.47 0.44 0.67 0.0 1.13 0.41 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.46 0.0 0.05 0.16 0.15 0.91 0.04 0.11 0.05 1.01 0.49 0.0
0.51 0.32 0.0 0.0 0.0 0.18 1.41 0.12 3.37 0.31 0.18 0.61 0.96 1.34 0.77 0.54 0.56 1.27 0.81 0.0
0.44 0.25 0.52 0.23 0.35 1.19 0.68 0.42 0.61 0.61 0.38 0.0 0.31 0.88 0.26 0.06 0.38 0.93 0.53 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.6 0.0 0.03 0.0 0.16 0.16 0.0 0.0 0.1 0.85 0.31 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.95 0.0 0.0 1.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88 0.95 0.0
0.0 0.15 0.16 0.02 0.0 0.07 0.26 0.0 0.38 0.07 0.12 0.13 0.05 0.62 0.04 0.09 0.16 0.74 0.3 0.0
0.0 0.54 0.56 0.08 0.0 0.5 0.56 0.73 1.32 0.0 0.08 0.45 1.18 1.89 0.16 0.47 0.59 1.88 1.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.18 0.27 0.38 0.22 0.06 0.43 0.57 0.0
0.47 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.94 0.14 0.07 0.07 0.28 0.79 0.35 0.05 0.38 2.0 0.79 0.0
0.0 0.33 0.29 0.0 0.0 0.13 0.04 0.0 1.51 0.0 0.64 0.0 0.62 0.43 0.11 0.82 0.32 1.08 0.82 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.79 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.09 0.12 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)