Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.24 0.0 0.76 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.19 0.26 0.07 0.03 0.08 0.13 1.0 0.0 0.07 0.22 0.55 0.74 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.01 1.0 0.58 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 1.0 0.11 0.0
1.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.19 0.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.0
0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.67 0.12 0.06 0.01 0.21 0.13 0.01 1.0 0.04 0.04 0.03 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.15 0.0 0.4 0.08 0.29 0.12 0.0
0.0 0.16 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.0 0.53 0.12 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.05 1.0 0.05 0.37 0.41 0.0
0.0 1.0 0.53 0.01 0.07 0.12 0.0 0.42 0.1 0.31 0.23 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.31 0.15 0.05 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.21 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.3 0.0 0.69 0.3 0.05 0.0 0.13 0.07 0.0 0.31 0.2 0.77 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.12 0.2 0.0
0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.48 0.45 0.16 0.44 0.62 0.0 0.19 0.1 1.0 0.79 0.0
0.0 0.0 0.0 0.3 0.44 0.0 0.0 0.06 0.0 0.69 0.92 0.0 0.0 1.0 0.0 0.65 0.66 0.88 0.47 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0
0.08 0.13 0.08 0.18 0.01 0.03 0.0 0.04 0.16 0.04 0.03 0.01 0.12 0.13 0.0 1.0 0.05 0.06 0.06 0.06
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.13 0.38 0.16 0.0
0.0 0.22 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.09 0.11 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.64 0.71 0.0
0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.35 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.14 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.43 0.1 0.0 0.39 0.14 1.0 0.29 0.0
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.35 0.09 0.02 0.0 0.08 0.03 0.0 0.13 0.04 0.38 0.24 1.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.75 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.02 0.13 0.26 0.72 0.4 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.51 0.67 0.15 0.11 0.0 1.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.0 0.0 0.16 0.22 0.43 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 1.0 0.91 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.52 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.41 0.0
0.0 0.29 0.0 0.02 0.01 0.03 0.26 0.0 1.0 0.14 0.09 0.0 0.14 0.19 0.27 0.15 0.17 0.27 0.27 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.0 0.79 0.0 0.05 0.01 0.0
0.0 0.56 0.04 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.09 0.05 0.0 0.05 0.2 0.0 0.01 0.29 0.26 0.0 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 1.0 0.87 0.0
0.0 0.0 0.0 0.71 1.0 0.5 0.42 0.49 0.0 0.0 0.3 0.0 0.88 0.25 0.48 0.0 0.0 0.21 0.13 0.0
0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.06 0.12 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.04 0.01 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.05 0.1 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.18 0.0
0.25 0.14 0.08 0.0 0.0 0.03 0.22 0.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.48 1.0 0.0 0.21 0.27 0.47 0.58 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.0 0.0 0.06 0.17 0.22 0.0
0.0 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.05 0.1 0.29 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.07 0.19 0.0
0.0 0.16 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.0 0.31 0.5 0.25 0.23 0.46 0.0 0.0 0.15 0.02 0.42 0.21 0.38 0.82 0.0 0.58 0.22 1.0 0.88 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.56 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.6 0.15 0.06 0.27 0.09 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.55 0.2 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.24 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.57 0.19 0.03 0.0 0.12 0.31 0.0 0.0 0.03 0.15 0.01 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.52 0.04 0.31 0.09 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.82 0.66 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.13 0.06 0.07 0.13 0.18 0.23 0.16 0.12 0.36 0.95 0.67 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.2 0.08 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.06 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.18 0.0
0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.01 1.0 0.0
0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.2 0.01 0.02 0.0 0.19 0.15 0.0 1.0 0.02 0.03 0.01 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.78 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.56 0.31 0.02 0.0 0.0 0.77 0.47 0.31 1.0 0.0 0.42 0.51 0.37 0.0
0.0 0.27 0.36 0.28 0.27 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.22 0.0 0.31 0.0 0.0 0.31 0.17 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.4 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.17 0.37 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.62 0.0
0.0 0.92 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.26 0.0 0.01 0.0 0.1 0.2 0.0 0.38 0.3 1.0 0.64 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0
0.0 1.0 0.53 0.01 0.07 0.12 0.0 0.42 0.1 0.31 0.23 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.31 0.15 0.05 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.25 0.0 0.04 0.0 0.11 0.06 0.04 0.03 0.08 0.21 0.15 1.0
1.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.03 0.0
0.0 0.65 0.07 0.14 0.14 0.22 0.0 0.5 1.0 0.2 0.13 0.03 0.24 0.54 0.0 0.14 0.16 0.22 0.11 0.08
0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.09 0.0 0.0 0.55 0.65 0.6 0.0 0.41 0.62 0.31 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.03 0.01 0.0 0.02 0.39 0.0 0.0 0.02 0.33 0.46 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.26 0.0 0.0 0.22 0.2 0.36 0.0
0.0 0.07 0.0 0.13 0.07 0.28 0.0 1.0 0.01 0.01 0.05 0.03 0.08 0.06 0.05 0.03 0.11 0.09 0.1 0.0
0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.31 0.05 0.01 0.05 0.05 0.16 0.0 0.21 1.0 0.77 0.46 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.26 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.44 0.41 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.8 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.15 0.03 0.2 0.1 0.03 0.03 1.0 0.36 0.11 0.12 0.0 0.11 0.29 0.05 0.05 0.07 0.22 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.66 0.18 0.07 0.0 0.44 0.56 1.0 0.0 0.28 0.81 0.25 0.0
0.0 0.21 0.06 0.0 0.01 0.02 0.16 0.05 0.39 1.0 0.21 0.09 0.07 0.1 0.11 0.0 0.19 0.18 0.23 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 1.0 0.0 0.03 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.54 0.0 0.47 0.26 0.19 0.1 0.0
0.0 0.84 0.43 0.32 0.0 0.0 0.02 0.0 0.52 0.37 0.12 0.17 0.25 0.97 0.0 0.03 0.12 1.0 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.08 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.36 0.38 0.0 0.0 0.01 0.78 0.34 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.67 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.47 1.0 0.5 0.0 0.3 0.0 0.14 0.13 0.0
0.0 0.06 0.54 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 1.0 0.71 0.16 0.0 0.51 0.0 0.89 0.0 0.09 0.24 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)