Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
1.0 0.07 0.31 0.0 0.0 0.02 0.18 0.02 0.04 0.01 0.42 0.13 0.03 0.04 0.06 0.02 0.11 0.09 0.07 0.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0
0.0 0.07 0.03 0.15 0.07 0.1 0.25 0.03 0.13 0.48 1.0 0.04 0.11 0.14 0.02 0.02 0.02 0.16 0.19 0.07
0.04 0.58 0.57 0.01 0.0 0.02 0.06 0.01 0.86 0.48 0.94 0.07 0.34 0.24 0.01 0.12 0.13 0.23 0.15 1.0
0.03 0.04 0.0 0.02 0.02 0.09 0.07 0.01 0.0 0.72 1.0 0.04 0.07 0.06 0.07 0.03 0.09 0.29 0.21 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.69 1.0 0.07 0.01 0.04 0.01 0.02 0.0 0.1 0.05 0.0
0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.42 1.0 0.08 0.04 0.1 0.01 0.02 0.02 0.14 0.05 0.0
0.7 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.06 1.0 0.36 0.05 0.05 0.06 0.06 0.03 0.05 0.15 0.1 0.0
0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 1.0 0.42 0.19 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0
0.0 0.07 0.0 0.04 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.85 0.5 0.01 0.06 0.07 0.0 0.0 0.21 0.08 0.0
1.0 0.12 0.69 0.0 0.0 0.05 0.56 0.1 0.07 0.32 0.83 0.52 0.13 0.13 0.02 0.03 0.07 0.24 0.15 0.46
0.0 0.3 0.3 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.64 0.75 1.0 0.05 0.27 0.26 0.0 0.1 0.09 0.26 0.13 0.05
0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.07 1.0 0.04 0.02 0.05 0.01 0.06 0.02 0.09 0.06 0.02
0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.14 0.05 0.0 0.0 1.0 0.98 0.54 0.21 0.13 0.38 0.02 0.42 0.27 0.44
0.44 0.08 0.24 0.0 0.03 0.01 0.28 0.02 1.0 0.1 0.22 0.15 0.12 0.12 0.12 0.07 0.12 0.1 0.09 0.37
0.02 0.07 0.04 0.0 0.0 0.02 0.07 0.01 1.0 0.06 0.33 0.12 0.15 0.2 0.22 0.12 0.07 0.08 0.13 0.14
0.05 0.12 0.35 0.0 0.0 0.02 0.26 0.03 0.02 0.42 1.0 0.19 0.05 0.07 0.06 0.07 0.06 0.25 0.12 0.19
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 1.0 0.02 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.09 0.06 0.02
0.0 0.05 0.08 0.01 0.02 0.01 0.27 0.02 1.0 0.33 0.82 0.02 0.06 0.06 0.04 0.01 0.04 0.09 0.09 0.01
1.0 0.4 0.78 0.02 0.01 0.05 0.19 0.02 0.28 0.02 0.17 0.24 0.08 0.09 0.31 0.16 0.31 0.18 0.27 0.72
0.0 0.1 0.04 0.16 0.17 0.3 0.05 0.35 0.07 0.51 1.0 0.19 0.04 0.14 0.05 0.06 0.12 0.18 0.2 0.11
0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.09 1.0 0.04 0.18 0.18 0.1 0.12 0.06 0.13 0.08 0.11
0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.54 1.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.12 0.1 0.05
0.97 0.08 0.16 0.0 0.0 0.04 0.59 0.07 0.09 0.04 0.46 0.61 0.21 0.17 0.12 0.23 0.1 0.2 0.18 1.0
1.0 0.19 0.45 0.02 0.01 0.03 0.09 0.02 0.2 0.02 0.21 0.29 0.15 0.18 0.26 0.16 0.19 0.16 0.21 0.81
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 1.0 0.09 0.03 0.05 0.0 0.09 0.0 0.1 0.04 0.02
0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.12 0.09 1.0 0.13 0.05 0.09 0.02 0.13 0.02 0.1 0.08 0.04
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.03 0.69 1.0 0.07 0.03 0.1 0.01 0.08 0.0 0.1 0.03 0.01
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.04 1.0 0.86 0.06 0.01 0.05 0.02 0.01 0.0 0.08 0.04 0.01
0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.08 0.39 1.0 0.12 0.08 0.1 0.01 0.04 0.03 0.14 0.12 0.01
1.0 0.26 0.53 0.02 0.01 0.05 0.12 0.04 0.12 0.0 0.24 0.3 0.15 0.18 0.18 0.18 0.25 0.18 0.13 0.8
0.37 0.32 0.64 0.18 0.46 0.21 0.95 0.73 0.35 0.11 0.64 0.63 0.19 0.19 0.33 0.12 0.31 0.32 0.32 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.07 1.0 0.02 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.08 0.07 0.01
0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.01 0.06 1.0 0.41 0.24 0.17 0.03 0.27 0.01 0.29 0.29 0.0
0.03 0.61 0.17 0.01 0.02 0.03 0.63 0.06 0.91 0.3 0.7 0.49 1.0 0.61 0.68 0.43 0.45 0.41 0.32 0.66
0.11 0.44 0.33 0.08 0.05 0.08 0.66 0.07 0.34 0.52 1.0 0.36 0.16 0.32 0.15 0.1 0.44 0.31 0.25 0.33
0.0 0.05 0.06 0.08 0.04 0.02 0.09 0.01 0.26 1.0 0.67 0.12 0.05 0.12 0.05 0.03 0.06 0.14 0.06 0.14
0.03 0.2 0.06 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.16 0.67 1.0 0.21 0.46 0.71 0.13 0.09 0.12 0.3 0.06 0.37
0.02 0.05 0.08 0.06 0.02 0.08 0.22 0.03 0.19 0.32 1.0 0.05 0.12 0.13 0.1 0.03 0.06 0.13 0.18 0.12
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.15 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0
0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.05 0.05 0.33 0.04 1.0 0.59 0.15 0.01 0.04 0.02 0.02 0.0 0.12 0.06 0.0
0.0 0.06 0.03 0.0 0.01 0.02 0.13 0.01 0.03 0.27 1.0 0.28 0.23 0.27 0.07 0.06 0.05 0.44 0.1 0.29
0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.02 0.04 0.01 0.06 0.53 1.0 0.12 0.08 0.13 0.02 0.02 0.04 0.19 0.07 0.16
0.24 0.4 0.43 0.19 0.19 0.14 0.0 0.03 0.21 0.2 1.0 0.13 0.21 0.42 0.0 0.15 0.2 0.25 0.11 0.74
0.0 0.17 0.06 0.06 0.04 0.05 0.16 0.02 0.35 1.0 0.72 0.16 0.16 0.19 0.34 0.06 0.18 0.2 0.19 0.15
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.07 1.0 0.2 0.02 0.05 0.01 0.01 0.0 0.11 0.14 0.02
0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.03 0.23 0.02 0.1 0.04 1.0 0.02 0.04 0.03 0.06 0.02 0.03 0.06 0.09 0.1
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.05 0.04 0.09 1.0 0.74 0.31 0.32 0.11 0.19 0.02 0.38 0.19 0.65
0.0 0.45 0.1 0.93 0.81 0.41 0.07 0.19 0.25 0.22 1.0 0.6 0.59 0.48 0.42 0.28 0.57 0.44 0.31 0.81
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.04 0.25 1.0 0.18 0.03 0.07 0.01 0.01 0.0 0.13 0.21 0.04
0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.06 0.26 1.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.06 0.03 0.0
0.0 0.07 0.03 0.03 0.02 0.04 0.17 0.03 0.21 0.35 1.0 0.29 0.13 0.11 0.06 0.04 0.07 0.21 0.17 0.11
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.04 1.0 0.4 0.07 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.06 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 0.1 1.0 0.28 0.19 0.03 0.06 0.02 0.0 0.03 0.08 0.04 0.34
0.02 0.03 0.01 0.0 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.07 1.0 0.08 0.05 0.08 0.03 0.09 0.03 0.09 0.07 0.04
0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.74 1.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.08 0.04 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.19 0.01 0.54 0.18 1.0 0.09 0.09 0.19 0.03 0.07 0.01 0.16 0.16 0.0
0.0 0.18 0.1 0.01 0.01 0.02 0.22 0.0 1.0 0.28 0.54 0.12 0.36 0.44 0.17 0.11 0.13 0.19 0.09 0.21
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.04 1.0 0.04 0.07 0.08 0.02 0.02 0.01 0.07 0.1 0.01
1.0 0.2 0.41 0.16 0.05 0.1 0.37 0.07 0.21 0.04 0.34 0.22 0.17 0.18 0.19 0.14 0.2 0.14 0.12 0.72
0.37 0.04 0.07 0.0 0.01 0.01 0.17 0.09 0.03 0.06 0.33 0.4 0.17 0.16 0.03 0.05 0.02 0.17 0.16 1.0
0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.01 0.01 0.19 1.0 0.1 0.01 0.07 0.02 0.02 0.02 0.15 0.19 0.03
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03 0.08 0.0 0.16 1.0 0.43 0.23 0.27 0.19 0.51 0.01 0.09 0.23 0.13 0.0
0.2 0.14 0.15 0.13 0.05 0.03 0.18 0.07 0.58 0.38 1.0 0.32 0.16 0.17 0.07 0.05 0.06 0.27 0.13 0.39
0.03 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.26 0.54 0.06 0.05 0.1 0.05 0.03 0.02 0.06 0.06 0.08
0.0 0.04 0.11 0.0 0.0 0.03 0.12 0.01 0.11 0.71 1.0 0.3 0.02 0.06 0.04 0.01 0.02 0.16 0.1 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0
0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.21 0.02 1.0 0.34 0.09 0.21 0.04 0.09 0.0 0.23 0.18 0.24
0.14 0.05 0.19 0.02 0.37 0.63 0.59 0.81 0.15 0.56 1.0 0.97 0.13 0.12 0.13 0.14 0.05 0.38 0.31 0.37
0.06 0.12 0.13 0.02 0.01 0.01 0.29 0.01 0.66 1.0 0.41 0.05 0.02 0.05 0.07 0.04 0.07 0.09 0.06 0.1
0.04 0.05 0.03 0.1 0.03 0.05 0.19 0.04 0.01 0.15 1.0 0.12 0.12 0.16 0.16 0.1 0.07 0.23 0.18 0.03
0.16 0.07 0.28 0.0 0.0 0.04 0.09 0.04 0.06 1.0 0.84 0.53 0.18 0.22 0.01 0.05 0.05 0.3 0.15 0.41
0.15 0.08 0.01 0.16 0.25 0.39 0.18 0.37 0.02 1.0 0.85 0.65 0.09 0.15 0.06 0.1 0.15 0.29 0.29 0.25
0.1 0.2 0.22 0.01 0.03 0.1 0.52 0.09 0.65 0.68 1.0 0.38 0.14 0.16 0.2 0.09 0.16 0.31 0.27 0.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 1.0 0.56 0.04 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.02
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.76 1.0 0.02 0.01 0.06 0.01 0.01 0.0 0.08 0.06 0.01
0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.02 0.14 1.0 0.17 0.08 0.12 0.05 0.03 0.05 0.23 0.12 0.13
1.0 0.18 0.87 0.0 0.0 0.09 0.61 0.09 0.06 0.22 0.54 0.14 0.03 0.06 0.09 0.03 0.15 0.18 0.15 0.82
0.0 0.01 0.0 0.02 0.04 0.04 0.02 0.06 0.03 0.29 1.0 0.04 0.02 0.0 0.03 0.02 0.01 0.1 0.1 0.0
0.01 0.07 0.04 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.11 0.28 1.0 0.15 0.12 0.16 0.14 0.06 0.09 0.18 0.14 0.07
0.07 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.08 0.45 1.0 0.09 0.05 0.08 0.1 0.04 0.04 0.12 0.12 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.26 1.0 0.02 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.13 0.08 0.0
0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.22 1.0 0.11 0.08 0.12 0.0 0.1 0.01 0.14 0.11 0.09
0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.33 0.06 0.09 0.01 0.14 0.01 0.23 0.15 0.0
0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.02 0.12 1.0 0.25 0.09 0.13 0.02 0.1 0.01 0.2 0.19 0.02
0.67 0.51 0.62 0.01 0.01 0.14 0.88 0.07 0.07 0.14 0.44 0.42 0.23 0.43 0.16 0.3 0.28 0.36 0.24 1.0
0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.06 0.04 0.03 0.2 1.0 0.07 0.07 0.1 0.05 0.07 0.04 0.17 0.17 0.2
0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 0.05 0.01 0.06 1.0 0.08 0.03 0.05 0.02 0.08 0.05 0.09 0.09 0.05
0.36 0.2 0.45 0.02 0.1 0.08 0.6 0.05 0.88 0.2 0.43 0.2 0.12 0.15 0.15 0.07 0.12 0.11 0.11 1.0
0.3 0.05 0.04 0.02 0.0 0.01 0.25 0.05 0.02 0.06 1.0 0.31 0.28 0.17 0.04 0.13 0.03 0.23 0.21 0.16
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.13 1.0 0.03 0.01 0.05 0.01 0.02 0.02 0.15 0.07 0.0
1.0 0.1 0.53 0.0 0.0 0.07 0.11 0.04 0.88 0.78 0.83 0.73 0.22 0.14 0.06 0.05 0.15 0.27 0.12 0.22
1.0 0.06 0.3 0.0 0.01 0.01 0.48 0.08 0.01 0.02 0.33 0.19 0.09 0.05 0.03 0.01 0.07 0.14 0.08 0.71
0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.04 1.0 0.08 0.01 0.04 0.01 0.02 0.01 0.09 0.12 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)