Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.01 0.21 0.08 0.82 1.0 0.74 0.0 0.7 0.01 0.03 0.37 0.24 0.76 0.77 0.23 0.56 0.21 0.37 0.27 0.12
0.56 0.74 0.72 0.92 0.74 0.62 0.53 0.61 0.91 0.73 0.8 1.0 0.59 0.61 0.77 0.59 0.93 0.71 0.63 0.7
0.29 0.66 0.45 0.33 0.12 0.1 0.46 0.08 1.0 0.54 0.31 0.67 0.42 0.45 0.39 0.36 0.39 0.53 0.28 0.19
0.04 0.57 0.1 0.75 0.59 0.49 0.03 0.52 0.24 0.09 0.33 0.23 0.89 0.57 0.69 0.3 0.52 0.44 0.27 1.0
0.22 0.44 0.49 0.35 0.27 0.37 1.0 0.51 0.75 0.43 0.39 0.65 0.4 0.44 0.43 0.44 0.54 0.66 0.57 0.31
0.09 0.23 0.15 0.17 0.21 0.14 0.06 0.17 1.0 0.34 0.25 0.37 0.67 0.34 0.44 0.23 0.32 0.32 0.21 0.4
0.3 0.59 0.43 0.25 0.23 0.21 0.41 0.26 0.64 0.21 0.29 0.5 0.47 0.47 0.49 0.5 0.47 0.4 0.28 1.0
0.04 0.08 0.07 0.07 0.1 0.06 0.05 0.05 1.0 0.28 0.12 0.07 0.5 0.27 0.08 0.17 0.06 0.12 0.05 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.61 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.22 0.06 0.11 0.03 0.04 0.01 0.02 0.04 0.02 0.03 0.28 1.0 0.82 0.16 0.49 0.17 0.31 0.23 0.12
0.0 0.06 0.02 0.04 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.24 1.0 0.5 0.23 0.54 0.1 0.31 0.2 0.06
0.5 0.76 0.52 0.58 0.48 0.37 0.59 0.39 0.56 0.41 0.54 1.0 0.89 0.89 0.85 0.79 0.83 0.8 0.51 0.67
0.47 0.6 0.54 0.4 0.47 0.6 0.49 0.55 1.0 0.59 0.67 0.57 0.6 0.65 0.56 0.59 0.68 0.55 0.52 0.62
0.32 1.0 0.55 0.92 0.72 0.47 0.49 0.59 0.41 0.25 0.55 0.6 0.86 0.99 0.67 0.74 0.73 0.63 0.47 0.45
0.13 0.42 0.29 0.47 0.46 0.25 0.36 0.29 1.0 0.36 0.33 0.56 0.79 0.73 0.6 0.42 0.37 0.4 0.3 0.4
0.1 0.16 0.12 0.33 0.19 0.17 0.11 0.08 1.0 0.13 0.17 0.22 0.83 0.67 0.5 0.17 0.2 0.32 0.12 0.14
0.32 0.6 0.45 0.32 0.28 0.2 0.59 0.19 0.56 0.28 0.4 0.98 1.0 0.87 0.83 0.61 0.54 0.7 0.41 0.72
0.03 0.11 0.04 0.32 0.34 0.3 0.02 0.33 0.06 0.01 0.16 0.36 1.0 0.6 0.21 0.54 0.21 0.31 0.18 0.08
0.4 0.55 0.5 0.54 0.47 0.36 1.0 0.36 0.36 0.18 0.48 0.72 0.77 0.67 0.42 0.67 0.54 0.48 0.38 0.83
0.42 0.66 0.48 0.53 0.34 0.24 0.91 0.32 0.78 0.49 0.4 0.82 1.0 1.0 0.76 0.97 0.6 0.78 0.49 0.42
0.11 0.48 0.37 0.32 0.34 0.16 0.17 0.18 0.62 0.19 0.39 0.55 0.97 0.87 0.89 0.25 0.49 0.59 0.38 1.0
0.4 0.57 0.52 0.35 0.35 0.23 0.55 0.16 0.16 0.13 0.36 1.0 0.58 0.63 0.45 0.71 0.49 0.59 0.39 0.55
0.24 0.32 0.24 0.57 0.41 0.35 0.3 0.27 0.38 0.14 0.36 0.49 1.0 0.66 0.46 0.54 0.41 0.5 0.31 0.36
0.14 0.15 0.08 0.05 0.03 0.04 0.06 0.04 0.67 0.05 0.06 0.32 1.0 0.67 0.29 0.61 0.19 0.26 0.15 0.19
0.79 0.92 0.72 0.89 0.68 0.43 0.73 0.4 0.59 0.39 0.67 0.91 1.0 0.87 0.82 0.8 0.96 0.77 0.51 0.9
0.0 0.2 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.02 0.01 0.01 0.34 1.0 0.79 0.44 0.47 0.28 0.44 0.31 0.0
0.03 0.25 0.11 0.0 0.0 0.05 0.6 0.0 0.01 0.0 0.03 0.39 1.0 0.48 0.5 0.27 0.44 0.3 0.27 0.25
0.5 0.63 0.41 0.58 0.68 0.58 0.15 0.41 1.0 0.09 0.47 0.56 0.87 0.58 0.88 0.43 0.68 0.54 0.37 0.74
0.7 0.57 0.47 0.48 0.5 0.37 0.38 0.36 0.51 0.25 0.58 0.67 0.57 0.45 0.64 0.54 0.56 0.49 0.31 1.0
0.28 0.79 0.73 0.75 0.41 0.39 1.0 0.28 0.41 0.29 0.47 0.63 0.7 0.79 0.5 0.7 0.52 0.77 0.44 0.67
0.4 0.78 0.62 0.2 0.22 0.16 0.7 0.13 0.51 0.44 0.37 1.0 0.86 0.82 0.76 0.75 0.76 0.79 0.5 0.61
0.05 0.27 0.17 0.28 0.22 0.25 0.18 0.3 0.32 0.11 0.2 0.5 1.0 0.97 0.27 0.76 0.29 0.44 0.23 0.36
0.18 0.59 0.33 0.36 0.15 0.15 0.49 0.06 1.0 0.35 0.27 0.58 0.54 0.59 0.64 0.35 0.5 0.56 0.29 0.47
0.02 0.21 0.11 0.3 0.27 0.17 0.07 0.16 1.0 0.42 0.25 0.26 0.37 0.35 0.35 0.23 0.22 0.21 0.14 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0
0.05 0.14 0.04 0.78 0.95 0.71 0.08 0.92 0.12 0.02 0.34 0.32 1.0 0.53 0.33 0.47 0.25 0.32 0.22 0.13
0.16 0.06 0.21 0.66 1.0 0.66 0.0 0.0 0.02 0.05 0.48 0.01 0.06 0.15 0.0 0.0 0.07 0.12 0.03 0.1
0.41 0.95 0.65 0.77 0.65 0.66 0.52 0.62 0.24 0.75 0.78 0.63 0.86 0.76 0.83 0.54 1.0 0.89 0.81 0.62
0.76 0.92 0.79 0.65 0.51 0.44 0.96 0.43 0.36 0.19 0.56 0.66 0.89 0.78 0.64 0.74 0.89 0.74 0.51 1.0
0.01 0.17 0.06 0.01 0.0 0.02 0.05 0.0 0.19 0.03 0.02 0.47 1.0 0.52 0.27 0.44 0.21 0.24 0.24 0.36
0.14 0.46 0.23 1.0 0.59 0.42 0.13 0.41 0.33 0.2 0.4 0.59 0.64 0.61 0.59 0.4 0.46 0.44 0.31 0.55
0.82 0.65 0.73 0.65 0.57 0.39 0.52 0.42 0.69 0.5 0.51 0.58 0.64 0.62 0.73 0.48 0.72 0.57 0.43 1.0
0.0 0.02 0.0 1.0 0.9 0.64 0.0 0.0 0.0 0.02 0.33 0.02 0.42 0.14 0.0 0.02 0.06 0.1 0.0 0.0
0.42 0.55 0.35 0.89 0.65 0.74 0.6 0.83 0.33 0.15 0.47 0.4 0.94 1.0 0.49 0.82 0.62 0.62 0.39 0.34
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.5 1.0 0.34 0.07 0.59 0.03 0.22 0.15 0.0
0.04 0.12 0.02 0.27 0.1 0.15 0.01 0.1 1.0 0.15 0.08 0.15 0.43 0.33 0.16 0.18 0.14 0.17 0.11 0.12
0.17 0.79 0.43 0.97 1.0 0.64 0.19 0.8 0.96 0.81 0.71 0.64 0.85 0.9 0.63 0.72 0.61 0.64 0.55 0.69
0.0 0.04 0.02 1.0 0.64 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.07 0.17 0.0 0.0 0.08 0.1 0.01 0.0
0.12 0.04 0.04 0.12 0.5 0.26 0.02 0.96 0.3 0.04 0.24 0.12 0.37 1.0 0.07 0.11 0.1 0.63 0.2 0.0
0.41 0.56 0.33 1.0 0.62 0.37 0.42 0.39 0.81 0.53 0.46 0.64 0.85 0.85 0.68 0.66 0.5 0.62 0.49 0.58
0.56 0.74 0.72 0.92 0.74 0.62 0.53 0.61 0.91 0.73 0.8 1.0 0.59 0.61 0.77 0.59 0.93 0.71 0.63 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.16 0.3 0.14 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.02 0.06 0.02 1.0
0.41 0.59 0.48 0.48 0.47 0.34 0.35 0.39 0.67 0.41 0.58 1.0 0.73 0.65 0.6 0.79 0.67 0.67 0.47 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.01 0.0 0.1 0.2 0.0 0.0 0.03 0.06 0.02 1.0
0.47 0.7 0.48 0.41 0.41 0.31 0.24 0.36 0.66 0.19 0.46 0.55 0.58 0.46 0.63 0.5 0.77 0.64 0.43 1.0
0.33 0.43 0.33 0.54 0.48 0.42 0.78 0.44 0.46 0.14 0.38 0.65 1.0 0.8 0.55 0.63 0.47 0.56 0.39 0.95
0.44 1.0 0.72 0.7 0.38 0.56 0.65 0.39 0.72 0.34 0.38 0.35 0.69 0.61 0.64 0.54 0.65 0.53 0.45 0.61
0.0 0.03 0.61 0.48 0.6 0.0 0.46 0.16 0.96 0.0 0.58 0.66 0.49 0.4 0.83 0.12 0.28 0.61 0.19 1.0
0.26 0.56 0.42 0.52 0.33 0.19 0.52 0.21 1.0 0.43 0.36 0.48 0.69 0.77 0.59 0.65 0.46 0.6 0.41 0.55
0.31 0.53 0.33 0.25 0.26 0.19 0.72 0.2 0.19 0.12 0.26 1.0 0.62 0.4 0.73 0.66 0.6 0.5 0.37 0.41
0.34 0.6 0.45 0.42 0.37 0.3 0.32 0.25 1.0 0.35 0.43 0.52 0.85 0.82 0.65 0.47 0.6 0.46 0.42 0.94
0.69 0.88 0.5 0.73 0.75 0.29 0.6 0.3 0.81 0.2 0.61 0.84 1.0 0.95 0.76 0.78 0.99 0.76 0.65 0.81
0.35 0.44 0.51 0.34 0.21 0.2 0.64 0.18 0.14 0.11 0.24 0.49 1.0 0.65 0.32 0.53 0.39 0.42 0.27 0.51
0.56 0.83 0.53 0.55 0.44 0.34 0.83 0.32 0.31 0.3 0.46 0.87 0.81 0.75 0.86 0.6 0.84 0.75 0.56 1.0
0.25 0.64 0.37 1.0 0.55 0.48 0.4 0.4 0.39 0.19 0.46 0.54 0.97 0.83 0.56 0.62 0.61 0.62 0.47 0.34
0.47 0.81 0.64 0.41 0.37 0.3 0.84 0.31 0.42 0.18 0.51 1.0 0.9 0.72 0.79 0.72 0.84 0.68 0.36 0.86
0.02 0.05 0.01 1.0 0.74 0.45 0.0 0.54 0.0 0.01 0.27 0.01 0.4 0.44 0.04 0.2 0.07 0.15 0.1 0.01
0.13 0.19 0.14 0.11 0.08 0.08 0.09 0.09 1.0 0.36 0.18 0.2 0.38 0.29 0.31 0.19 0.17 0.2 0.09 0.54
0.15 1.0 0.47 0.34 0.23 0.25 0.21 0.2 0.63 0.22 0.3 0.48 0.7 0.72 0.53 0.54 0.59 0.46 0.31 0.67
0.0 0.29 0.0 0.17 0.0 0.32 0.36 0.55 0.0 0.0 0.03 0.0 0.12 0.01 0.0 0.04 0.09 1.0 0.03 0.0
0.29 0.73 0.55 0.26 0.32 0.28 0.38 0.21 0.64 0.45 0.4 1.0 0.88 0.75 0.75 0.74 0.78 0.75 0.57 0.53
0.06 0.09 0.08 0.08 0.09 0.07 0.14 0.07 1.0 0.32 0.13 0.1 0.74 0.25 0.16 0.22 0.09 0.13 0.07 0.13
0.09 0.12 0.05 0.03 0.06 0.06 0.08 0.04 0.05 0.01 0.06 0.2 1.0 0.34 0.22 0.5 0.09 0.19 0.09 0.28
0.21 0.31 0.19 1.0 0.87 0.35 0.04 0.52 0.86 0.36 0.58 0.25 0.69 0.63 0.27 0.35 0.29 0.33 0.17 0.65
0.03 0.08 0.01 0.66 0.37 0.36 0.01 0.44 0.08 0.01 0.24 0.29 1.0 0.39 0.47 0.36 0.16 0.27 0.14 0.1
0.38 0.79 0.53 0.75 0.62 0.43 0.28 0.69 0.55 0.23 0.53 1.0 0.86 0.67 0.82 0.66 0.77 0.66 0.49 0.71
0.11 0.25 0.19 0.87 0.7 0.49 0.27 0.48 1.0 0.36 0.46 0.26 0.68 0.6 0.21 0.45 0.27 0.3 0.2 0.26
0.05 0.09 0.04 0.21 0.21 0.15 0.01 0.22 0.4 0.12 0.12 0.77 0.98 1.0 0.24 0.95 0.12 0.42 0.2 0.07
0.27 0.66 0.59 0.72 0.37 0.3 0.7 0.29 0.15 0.08 0.3 0.55 1.0 0.94 0.52 0.54 0.57 0.54 0.35 0.65
0.07 0.59 0.34 1.0 0.64 0.5 0.21 0.56 0.59 0.62 0.48 0.59 0.83 0.72 0.68 0.53 0.54 0.56 0.44 0.91
0.84 0.55 0.61 0.43 0.33 0.32 0.4 0.26 0.59 0.33 0.4 0.54 0.48 0.4 0.56 0.37 0.53 0.49 0.36 1.0
0.07 0.1 0.04 0.07 0.1 0.07 0.01 0.07 0.14 0.01 0.06 0.2 1.0 0.28 0.17 0.3 0.12 0.14 0.09 0.17
0.56 0.74 0.49 0.64 0.57 0.5 1.0 0.47 0.42 0.13 0.4 0.64 0.78 0.58 0.72 0.5 0.84 0.7 0.53 0.93
0.35 0.93 0.59 0.73 0.45 0.43 0.34 0.3 0.71 0.36 0.46 0.75 1.0 0.94 0.91 0.78 0.79 0.67 0.47 0.94
0.55 0.91 0.75 0.36 0.32 0.53 0.38 0.46 0.69 0.37 0.48 0.91 0.79 0.83 0.7 0.71 0.83 0.68 0.54 1.0
0.24 0.4 0.37 1.0 0.61 0.81 0.32 0.88 0.26 0.32 0.5 0.46 0.67 0.7 0.49 0.37 0.45 0.54 0.38 0.39
0.1 0.53 0.29 0.53 0.61 0.44 0.49 0.33 0.61 0.21 0.32 0.33 0.57 0.49 0.52 0.27 0.57 0.49 0.31 1.0
0.16 1.0 0.34 0.73 0.67 0.43 0.47 0.44 0.48 0.22 0.47 0.38 0.79 0.75 0.75 0.65 0.93 0.6 0.38 0.4
0.49 0.55 0.46 0.41 0.42 0.35 0.71 0.36 0.66 0.19 0.39 0.65 1.0 0.77 0.77 0.62 0.57 0.59 0.46 0.9
0.85 0.63 0.78 0.67 0.44 0.37 1.0 0.37 0.42 0.58 0.6 0.68 0.7 0.63 0.69 0.54 0.48 0.61 0.44 0.96
0.12 0.68 0.52 0.64 0.37 0.35 1.0 0.3 0.49 0.24 0.39 0.34 0.68 0.65 0.55 0.38 0.68 0.65 0.5 0.76
0.02 0.04 0.01 0.14 0.17 0.1 0.01 0.12 0.12 0.07 0.1 0.61 0.93 0.6 0.14 1.0 0.07 0.31 0.17 0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)