Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.28 0.97 0.62 0.43 0.19 0.28 0.86 0.14 0.41 0.4 0.28 1.0 0.6 0.67 0.73 0.59 0.8 0.68 0.54 0.82
0.37 0.65 0.69 0.24 0.12 0.19 0.75 0.17 0.24 0.41 0.31 0.37 0.21 0.25 0.5 0.21 0.61 0.5 0.35 1.0
0.29 0.47 0.6 0.04 0.01 0.06 1.0 0.02 0.54 0.56 0.33 0.64 0.15 0.18 0.38 0.26 0.41 0.41 0.27 0.66
0.54 0.65 0.67 0.34 0.25 0.2 0.67 0.14 0.64 0.8 0.55 0.34 0.41 0.4 0.65 0.35 0.56 0.47 0.34 1.0
0.52 0.85 1.0 0.54 0.25 0.36 0.94 0.34 0.82 0.86 0.52 0.66 0.49 0.63 0.45 0.7 0.66 0.75 0.48 0.4
0.21 0.77 0.89 0.39 0.29 0.35 1.0 0.18 0.54 0.49 0.42 0.45 0.36 0.43 0.45 0.39 0.58 0.56 0.43 0.34
0.39 0.44 0.28 0.03 0.01 0.03 1.0 0.03 0.04 0.08 0.15 0.43 0.1 0.24 0.4 0.25 0.55 0.48 0.43 0.49
0.4 0.44 0.44 0.09 0.05 0.08 1.0 0.07 0.1 0.6 0.45 0.57 0.16 0.32 0.68 0.44 0.54 0.47 0.47 0.79
0.17 0.53 0.49 0.31 0.26 0.31 1.0 0.29 0.08 0.24 0.29 0.38 0.34 0.3 0.32 0.3 0.5 0.43 0.44 0.3
0.17 0.89 0.61 0.06 0.02 0.09 1.0 0.03 0.21 0.24 0.2 0.5 0.2 0.24 0.66 0.24 0.71 0.47 0.41 0.9
0.69 0.79 1.0 0.19 0.11 0.19 0.5 0.18 0.5 0.38 0.35 0.43 0.2 0.27 0.26 0.29 0.55 0.41 0.35 0.62
0.42 1.0 0.6 0.39 0.53 0.24 0.57 0.16 0.28 0.36 0.38 0.74 0.51 0.46 0.72 0.45 0.86 0.67 0.44 0.43
0.62 1.0 0.97 0.78 0.36 0.43 0.99 0.18 0.54 0.55 0.52 0.85 0.63 0.69 0.68 0.65 0.84 0.78 0.62 0.87
0.35 0.95 0.78 0.76 0.61 0.37 0.86 0.31 0.85 0.7 0.61 0.82 0.49 0.53 0.58 0.51 0.77 0.63 0.44 1.0
0.43 0.78 0.87 0.46 0.32 0.26 1.0 0.25 0.35 0.2 0.42 0.71 0.53 0.54 0.47 0.57 0.64 0.58 0.42 0.83
0.49 0.98 0.86 0.46 0.44 0.46 0.57 0.48 0.82 0.76 0.76 0.61 0.43 0.45 0.65 0.49 1.0 0.67 0.5 0.93
0.76 0.89 0.92 0.26 0.15 0.16 1.0 0.11 0.24 0.15 0.36 0.53 0.38 0.32 0.7 0.54 0.81 0.49 0.39 0.88
0.69 0.98 0.93 0.4 0.38 0.68 1.0 0.67 0.78 0.59 0.71 0.78 0.63 0.56 0.88 0.59 0.87 0.69 0.62 0.76
0.48 0.76 1.0 0.24 0.17 0.19 0.74 0.11 0.61 1.0 0.51 0.58 0.33 0.46 0.47 0.36 0.62 0.56 0.45 0.86
0.52 0.84 0.92 0.45 0.38 0.29 0.78 0.26 0.66 1.0 0.7 0.89 0.51 0.63 0.66 0.5 0.75 0.66 0.47 0.61
0.11 0.57 0.42 0.42 0.21 0.19 0.52 0.25 0.47 0.28 0.28 1.0 0.61 0.54 0.85 0.31 0.88 0.74 0.37 0.09
0.67 0.83 1.0 0.68 0.34 0.55 0.78 0.5 0.2 0.22 0.57 0.59 0.52 0.6 0.52 0.64 0.8 0.7 0.65 0.54
0.04 0.85 0.65 0.1 0.04 0.12 1.0 0.05 0.06 0.11 0.15 0.5 0.13 0.24 0.36 0.3 0.73 0.6 0.51 0.23
0.28 0.48 0.41 0.38 0.25 0.25 1.0 0.0 0.53 0.6 0.46 0.91 0.58 0.63 0.81 0.35 0.8 0.84 0.5 0.43
0.65 0.75 1.0 0.81 0.36 0.31 0.67 0.17 0.1 0.23 0.4 0.31 0.19 0.19 0.54 0.23 0.59 0.4 0.36 0.63
0.37 0.82 0.78 0.59 0.44 0.27 1.0 0.19 0.28 0.3 0.44 0.59 0.41 0.39 0.55 0.41 0.68 0.61 0.39 0.71
0.43 0.91 0.82 0.6 0.43 0.37 1.0 0.38 0.61 0.64 0.67 0.79 0.56 0.7 0.85 0.64 0.97 0.77 0.6 0.82
0.17 0.56 0.56 0.1 0.12 0.12 0.64 0.13 0.65 1.0 0.49 0.42 0.21 0.29 0.31 0.35 0.56 0.42 0.33 0.27
0.24 1.0 0.83 0.14 0.05 0.11 0.67 0.11 0.51 0.43 0.3 0.62 0.48 0.62 0.73 0.6 0.86 0.58 0.43 0.79
0.45 0.85 0.85 0.67 0.38 0.37 1.0 0.37 0.9 0.6 0.47 0.5 0.57 0.59 0.8 0.5 0.71 0.69 0.57 0.51
0.24 0.78 0.66 0.51 0.4 0.17 1.0 0.18 0.51 0.5 0.59 0.46 0.48 0.55 0.59 0.38 0.72 0.52 0.41 0.76
0.26 0.7 0.74 1.0 0.8 0.7 0.85 0.54 0.16 0.17 0.51 0.57 0.43 0.5 0.5 0.5 0.59 0.63 0.42 0.72
0.96 0.65 0.68 0.11 0.03 0.13 0.55 0.07 0.84 1.0 0.4 0.55 0.21 0.27 0.52 0.32 0.6 0.53 0.44 0.69
0.11 0.6 0.49 0.14 0.13 0.2 1.0 0.12 0.04 0.03 0.18 0.28 0.17 0.16 0.3 0.14 0.43 0.31 0.18 0.88
0.32 0.47 0.47 0.27 0.27 0.24 0.37 0.21 0.44 0.31 0.32 0.45 0.27 0.28 0.36 0.27 0.42 0.36 0.29 1.0
0.68 0.88 0.92 0.21 0.19 0.2 1.0 0.18 0.64 0.97 0.61 0.95 0.79 0.76 0.94 0.81 0.74 0.92 0.6 0.77
0.46 0.85 0.69 0.92 0.73 0.44 0.95 0.36 1.0 0.87 0.73 0.89 0.65 0.73 0.8 0.88 0.87 0.9 0.6 0.81
0.16 0.62 0.44 0.01 0.0 0.07 1.0 0.01 0.07 0.11 0.08 0.77 0.41 0.43 0.53 0.36 0.41 0.51 0.39 0.57
0.51 1.0 0.94 0.63 0.44 0.38 0.81 0.31 0.12 0.27 0.61 0.75 0.29 0.38 0.84 0.45 0.8 0.65 0.57 0.8
0.71 0.88 0.97 0.31 0.24 0.27 1.0 0.2 0.45 0.7 0.5 0.84 0.4 0.4 0.58 0.47 0.86 0.79 0.57 0.69
0.41 0.93 0.85 0.92 0.5 0.48 0.87 0.38 0.13 0.19 0.49 0.71 0.54 0.52 0.74 0.49 0.92 0.73 0.59 1.0
0.52 0.87 0.97 0.66 0.45 0.37 0.83 0.35 0.56 0.49 0.56 0.44 0.41 0.44 0.61 0.44 0.72 0.52 0.45 1.0
0.2 0.69 0.81 0.07 0.02 0.18 0.7 0.07 0.3 1.0 0.43 0.31 0.14 0.23 0.24 0.24 0.55 0.4 0.34 0.44
0.6 0.93 1.0 0.57 0.53 0.43 0.65 0.3 0.16 0.5 0.67 0.61 0.26 0.33 0.54 0.34 0.64 0.65 0.42 0.5
0.52 0.78 1.0 0.1 0.07 0.11 0.91 0.05 0.34 0.76 0.44 0.54 0.36 0.37 0.9 0.36 0.9 0.64 0.47 0.44
0.41 1.0 0.86 0.37 0.24 0.27 0.89 0.23 0.4 0.64 0.46 0.72 0.4 0.5 0.52 0.39 0.85 0.68 0.56 0.5
0.54 0.82 0.97 0.46 0.36 0.32 0.76 0.28 1.0 0.81 0.56 0.65 0.57 0.64 0.68 0.65 0.79 0.66 0.58 0.65
0.31 1.0 0.58 0.42 0.26 0.23 0.73 0.16 0.26 0.16 0.29 0.63 0.45 0.5 0.54 0.49 0.9 0.58 0.51 0.43
0.21 0.64 0.64 0.32 0.18 0.25 1.0 0.21 0.68 0.73 0.41 0.59 0.6 0.58 0.55 0.29 0.55 0.48 0.33 0.59
0.56 0.93 0.84 0.75 0.49 0.39 1.0 0.42 0.72 0.65 0.63 0.97 0.79 0.86 0.71 0.76 0.8 0.93 0.72 0.65
0.61 0.82 1.0 0.21 0.22 0.25 0.6 0.2 0.38 0.33 0.5 0.5 0.3 0.34 0.7 0.37 0.78 0.59 0.51 0.81
0.91 0.87 0.97 0.36 0.32 0.36 1.0 0.34 0.14 0.24 0.52 0.7 0.41 0.35 0.75 0.48 0.91 0.75 0.57 0.67
0.3 0.63 0.58 0.18 0.15 0.17 0.73 0.12 1.0 0.79 0.46 0.56 0.31 0.33 0.38 0.3 0.55 0.41 0.28 0.65
0.26 0.64 0.64 0.23 0.14 0.33 0.46 0.31 0.15 0.24 0.22 0.31 0.11 0.15 0.18 0.21 0.59 0.37 0.38 1.0
0.35 0.89 0.38 0.21 0.2 0.19 0.28 0.11 0.09 0.08 0.27 0.35 0.41 0.33 0.46 0.34 0.84 0.38 0.24 1.0
0.34 0.58 0.53 0.39 0.37 0.2 0.61 0.17 0.63 0.63 0.49 0.41 0.43 0.46 0.57 0.34 0.54 0.46 0.36 1.0
0.53 0.88 0.86 0.46 0.31 0.33 1.0 0.26 0.71 0.51 0.49 0.71 0.46 0.55 0.56 0.49 0.7 0.61 0.5 0.9
0.12 0.53 0.57 0.25 0.18 0.14 1.0 0.16 0.15 0.17 0.22 0.61 0.41 0.43 0.49 0.33 0.36 0.49 0.28 0.67
0.33 0.49 0.53 0.38 0.24 0.24 0.63 0.22 0.31 0.43 0.39 0.3 0.35 0.31 0.44 0.26 0.41 0.31 0.27 1.0
0.19 0.87 0.7 0.26 0.18 0.14 0.95 0.21 0.75 1.0 0.53 0.53 0.36 0.49 0.68 0.44 0.59 0.45 0.34 0.68
0.46 0.53 0.55 0.27 0.26 0.17 0.47 0.16 0.18 0.22 0.38 0.4 0.21 0.23 0.47 0.29 0.43 0.37 0.28 1.0
0.62 0.92 0.85 0.62 0.33 0.33 0.84 0.19 1.0 0.81 0.48 0.96 0.71 0.73 0.78 0.56 0.72 0.64 0.53 0.67
0.34 0.56 0.54 0.17 0.17 0.12 0.56 0.1 0.29 0.89 0.49 0.61 0.39 0.38 0.58 0.28 0.49 0.38 0.29 1.0
0.45 1.0 0.89 0.81 0.51 0.47 0.83 0.46 0.35 0.28 0.53 0.6 0.51 0.57 0.56 0.57 0.9 0.64 0.56 0.78
0.64 0.9 0.65 0.57 0.35 0.4 0.64 0.36 0.11 0.14 0.34 0.62 0.4 0.43 0.58 0.49 1.0 0.67 0.6 0.48
0.54 0.81 0.54 0.27 0.14 0.12 0.95 0.07 0.58 0.31 0.26 0.48 0.62 0.61 1.0 0.44 0.68 0.45 0.3 0.88
0.41 0.69 0.52 0.3 0.29 0.19 0.56 0.15 0.18 0.21 0.33 0.24 0.22 0.28 0.46 0.37 0.49 0.35 0.29 1.0
0.46 0.73 0.69 0.51 0.35 0.32 1.0 0.21 0.76 0.78 0.49 0.5 0.61 0.65 0.58 0.51 0.62 0.58 0.45 0.61
0.38 0.84 1.0 0.35 0.31 0.26 0.76 0.26 0.93 0.66 0.56 0.92 0.65 0.59 0.87 0.58 0.82 0.7 0.49 0.76
0.28 0.83 0.85 0.38 0.23 0.28 1.0 0.25 0.79 0.74 0.48 0.48 0.59 0.7 0.44 0.49 0.55 0.54 0.44 0.54
0.26 1.0 0.98 0.55 0.38 0.45 0.78 0.46 0.44 0.57 0.59 0.68 0.52 0.71 0.32 0.56 0.73 0.74 0.56 0.62
0.19 1.0 0.53 0.45 0.22 0.29 0.95 0.17 0.09 0.04 0.2 0.73 0.66 0.73 0.86 0.49 0.68 0.72 0.43 0.76
0.57 0.96 0.82 0.12 0.07 0.12 0.96 0.08 0.34 0.45 0.42 0.69 0.43 0.46 0.73 0.46 0.65 0.54 0.48 1.0
0.42 0.59 0.4 0.2 0.07 0.05 0.49 0.02 1.0 0.53 0.27 0.51 0.21 0.26 0.67 0.32 0.53 0.52 0.37 0.34
0.24 0.62 0.51 0.19 0.08 0.12 1.0 0.05 0.34 0.17 0.2 0.38 0.44 0.51 0.5 0.28 0.45 0.42 0.27 0.59
0.13 0.8 0.4 0.39 0.25 0.19 1.0 0.3 0.24 0.19 0.31 0.65 0.49 0.39 0.83 0.43 0.87 0.57 0.43 0.64
0.61 0.99 0.66 0.77 0.66 0.75 0.78 0.67 0.65 0.53 0.62 0.77 0.44 0.52 0.77 0.6 1.0 0.71 0.62 0.68
0.49 0.53 0.6 0.14 0.13 0.14 0.83 0.11 0.72 1.0 0.45 0.6 0.32 0.38 0.48 0.34 0.54 0.57 0.4 0.7
0.6 1.0 0.66 0.29 0.21 0.26 0.57 0.15 0.24 0.35 0.34 0.36 0.28 0.33 0.48 0.3 0.76 0.61 0.51 0.36
0.24 0.79 0.71 0.54 0.25 0.14 1.0 0.14 0.91 0.65 0.42 0.78 0.56 0.76 0.56 0.57 0.78 0.68 0.47 0.65
0.19 1.0 0.96 0.35 0.23 0.29 0.79 0.27 0.24 0.32 0.45 0.69 0.44 0.58 0.53 0.39 0.86 0.65 0.53 0.35
0.93 0.52 0.86 0.42 0.14 0.27 1.0 0.13 0.36 0.38 0.3 0.39 0.34 0.36 0.39 0.31 0.42 0.4 0.33 0.57
0.07 0.8 0.65 0.08 0.02 0.07 1.0 0.0 0.18 0.05 0.1 0.67 0.29 0.51 0.71 0.44 0.53 0.47 0.36 0.76
0.25 1.0 0.76 0.13 0.11 0.2 0.43 0.15 0.42 0.18 0.23 0.44 0.27 0.35 0.63 0.36 0.74 0.5 0.4 0.7
0.4 0.61 0.79 0.58 0.45 0.35 1.0 0.24 0.56 0.77 0.56 0.46 0.38 0.43 0.34 0.35 0.5 0.5 0.36 0.5
0.21 0.91 0.46 0.28 0.38 0.31 0.58 0.28 0.42 0.4 0.52 0.62 0.39 0.43 0.58 0.48 1.0 0.79 0.62 0.42
0.51 0.91 1.0 0.36 0.36 0.25 0.92 0.19 0.33 0.39 0.5 0.85 0.51 0.58 0.6 0.59 0.76 0.77 0.56 0.82
0.3 0.68 0.55 0.44 0.15 0.2 0.59 0.15 0.16 0.3 0.3 0.31 0.23 0.32 0.57 0.25 0.51 0.36 0.33 1.0
0.17 0.47 0.43 0.14 0.2 0.16 0.75 0.22 0.45 1.0 0.5 0.57 0.19 0.26 0.33 0.38 0.49 0.44 0.34 0.44
0.31 0.39 0.42 0.13 0.09 0.11 0.43 0.1 0.39 1.0 0.4 0.39 0.14 0.16 0.4 0.21 0.42 0.34 0.27 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)