Heatmap: Cluster_76 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.0 1.0 0.57 0.62 0.53 0.4 0.0 0.04 0.16 0.01 0.36 0.08 0.14 0.08 0.05 0.0 0.33 0.37 0.02 0.0
0.17 0.35 0.27 1.0 0.78 0.39 0.44 0.35 0.24 0.41 0.45 0.27 0.22 0.26 0.24 0.27 0.31 0.46 0.21 0.11
0.0 0.57 0.52 0.92 0.36 0.49 0.0 0.8 0.42 0.62 0.69 0.12 0.29 0.33 0.0 0.0 0.31 1.0 0.01 0.31
0.57 0.83 0.8 0.87 0.61 0.41 0.39 0.41 0.9 0.61 0.58 0.65 0.58 0.71 0.45 0.55 0.63 1.0 0.41 0.96
0.8 0.98 1.0 0.64 0.49 0.66 0.38 0.47 0.71 0.49 0.6 0.28 0.37 0.67 0.13 0.34 0.6 0.73 0.3 0.99
0.0 0.31 0.18 0.34 0.23 0.41 0.05 0.0 0.54 0.25 0.24 0.13 0.29 0.38 0.13 0.77 0.39 1.0 0.37 0.13
0.0 0.23 0.29 0.88 0.58 0.56 0.0 0.35 0.04 0.08 0.37 0.13 0.37 0.52 0.0 0.25 0.22 1.0 0.13 0.05
0.0 0.57 0.35 1.0 0.82 0.57 0.0 0.0 0.42 0.21 0.52 0.15 0.19 0.33 0.0 0.0 0.29 0.68 0.13 0.21
0.07 0.35 0.24 1.0 0.74 0.36 0.02 0.48 0.19 0.18 0.41 0.12 0.26 0.33 0.19 0.23 0.25 0.56 0.13 0.12
0.21 0.84 0.37 1.0 0.76 0.56 0.0 0.17 0.5 0.11 0.65 0.15 0.42 0.95 0.0 0.46 0.44 0.77 0.19 0.65
0.06 0.3 0.23 0.36 0.26 0.21 0.15 0.18 0.3 0.13 0.21 0.38 0.63 0.64 0.32 0.37 0.42 1.0 0.25 0.24
0.3 0.55 0.46 0.65 0.36 0.24 0.52 0.31 0.97 1.0 0.46 0.36 0.52 0.54 0.51 0.5 0.49 0.98 0.29 0.19
0.16 0.24 0.13 1.0 0.69 0.86 0.41 0.91 0.3 0.1 0.38 0.28 0.53 0.49 0.45 0.35 0.42 0.81 0.24 0.22
0.29 0.48 0.34 0.97 0.44 0.26 0.2 0.18 0.15 0.2 0.3 0.31 0.73 0.5 0.83 0.3 0.47 1.0 0.25 0.14
0.06 0.3 0.25 0.91 0.26 0.49 0.3 1.0 0.22 0.18 0.27 0.56 0.33 0.41 0.4 0.27 0.5 0.81 0.35 0.15
0.1 0.47 0.29 0.26 0.05 0.18 0.43 0.1 0.23 0.3 0.19 0.44 0.39 0.44 0.31 0.26 0.46 1.0 0.31 0.1
0.39 0.46 0.25 1.0 0.58 0.75 0.12 0.62 0.17 0.1 0.34 0.26 0.73 0.59 0.51 0.53 0.4 0.66 0.23 0.88
0.22 0.56 0.63 1.0 0.33 0.63 0.0 0.0 0.25 0.27 0.37 0.14 0.34 0.6 0.0 0.43 0.35 0.87 0.3 0.28
0.17 0.52 0.26 0.79 0.27 0.16 0.26 0.16 0.26 0.3 0.24 0.46 0.82 0.61 0.66 0.4 0.53 1.0 0.33 0.25
0.36 0.35 0.28 1.0 0.34 0.33 0.39 0.27 0.2 0.12 0.26 0.4 0.36 0.26 0.5 0.26 0.4 0.5 0.23 0.26
0.06 0.61 0.52 0.97 0.53 0.5 1.0 0.38 0.28 0.32 0.48 0.43 0.47 0.38 0.58 0.24 0.68 0.82 0.39 0.27
0.4 0.49 0.44 1.0 0.34 0.28 0.01 0.34 0.76 0.2 0.27 0.22 0.36 0.64 0.04 0.52 0.28 0.97 0.2 0.17
0.04 0.36 0.17 1.0 0.5 0.54 0.07 0.53 0.07 0.04 0.31 0.29 0.45 0.36 0.26 0.25 0.35 0.52 0.11 0.28
0.12 0.65 0.22 0.54 0.24 0.23 0.19 0.15 0.42 0.27 0.2 0.44 0.66 0.56 0.65 0.41 0.58 1.0 0.28 0.78
0.17 0.39 0.35 0.73 0.39 0.17 1.0 0.06 0.14 0.23 0.34 0.58 0.18 0.17 0.33 0.21 0.4 0.61 0.3 0.23
0.0 0.35 0.1 0.64 0.47 0.15 0.06 0.2 0.06 0.02 0.22 0.32 0.97 1.0 0.67 0.19 0.39 0.99 0.17 0.0
0.0 0.49 0.42 0.71 0.26 0.25 0.03 0.01 0.19 0.14 0.27 0.07 0.21 0.35 0.06 0.0 0.25 0.44 0.02 1.0
0.3 0.43 0.45 0.55 0.46 0.41 0.28 0.5 1.0 0.44 0.48 0.33 0.83 0.55 0.52 0.4 0.65 0.97 0.3 0.64
0.35 0.91 0.67 0.76 0.6 0.48 0.71 0.68 0.42 0.13 0.53 0.2 0.3 0.42 0.24 0.12 0.45 0.57 0.09 1.0
0.05 0.57 0.43 0.53 0.44 0.23 1.0 0.12 0.16 0.06 0.41 0.44 0.72 0.68 0.39 0.24 0.69 0.95 0.09 0.65
0.14 1.0 0.75 0.57 0.4 0.3 0.77 0.18 0.41 0.45 0.48 0.57 0.51 0.44 0.76 0.5 0.85 0.79 0.32 0.87
0.14 0.67 0.24 0.57 0.35 0.2 0.28 0.28 0.73 0.57 0.34 0.4 0.81 1.0 0.21 0.11 0.52 0.81 0.18 0.49
0.18 0.31 0.26 1.0 0.55 0.55 0.09 0.48 0.1 0.06 0.33 0.33 0.42 0.28 0.52 0.23 0.36 0.38 0.15 0.32
0.18 0.5 0.41 0.57 0.31 0.28 0.44 0.3 0.27 0.38 0.31 0.31 0.42 0.46 0.38 0.47 0.49 1.0 0.27 0.2
0.14 0.5 0.3 0.91 0.88 0.64 0.32 0.62 0.89 0.58 0.68 0.36 0.46 0.51 0.45 0.43 0.59 1.0 0.39 0.21
0.35 0.69 0.61 0.47 0.4 0.41 0.47 0.46 0.45 0.79 0.55 0.74 0.52 0.36 0.68 0.24 0.7 1.0 0.4 0.45
0.35 0.48 0.33 1.0 0.38 0.43 0.32 0.46 0.27 0.24 0.32 0.27 0.5 0.51 0.44 0.52 0.42 0.85 0.32 0.34
0.0 0.71 0.77 0.42 0.31 0.45 0.09 0.64 1.0 0.38 0.47 0.05 0.23 0.36 0.02 0.48 0.32 0.63 0.12 0.2
0.0 0.91 0.28 0.79 0.14 0.17 0.0 0.1 0.19 0.36 0.2 0.17 0.43 0.59 0.15 0.48 0.41 0.73 0.15 1.0
0.19 0.33 0.21 1.0 0.36 0.63 0.26 0.5 0.09 0.12 0.24 0.17 0.33 0.37 0.18 0.27 0.25 0.63 0.19 0.11
0.32 0.62 0.41 1.0 0.35 0.52 0.82 0.42 0.53 0.51 0.39 0.4 0.67 0.63 0.58 0.46 0.56 0.86 0.32 0.24
0.22 0.69 0.59 0.46 0.33 0.33 0.32 0.22 0.83 1.0 0.52 0.46 0.51 0.73 0.31 0.44 0.51 0.91 0.38 0.69
0.1 0.45 0.32 1.0 0.57 0.71 0.41 0.58 0.97 0.61 0.63 0.38 0.5 0.51 0.27 0.13 0.51 0.94 0.33 0.09
0.11 0.32 0.1 0.34 0.25 0.18 0.11 0.17 1.0 0.32 0.21 0.31 0.35 0.4 0.29 0.26 0.34 0.51 0.21 0.26
0.27 0.61 0.37 0.67 0.6 0.38 0.24 0.43 1.0 0.4 0.46 0.52 0.8 0.74 0.62 0.5 0.6 0.75 0.33 0.72
0.38 0.77 0.53 0.64 0.4 0.37 1.0 0.29 0.34 0.17 0.34 0.41 0.69 0.58 0.59 0.48 0.66 0.86 0.29 0.63
0.28 0.72 0.59 0.57 0.39 0.34 0.49 0.28 0.4 0.32 0.46 0.41 0.56 0.46 0.61 0.51 0.74 1.0 0.56 0.16
0.0 0.42 0.38 1.0 0.75 0.43 0.01 0.0 0.94 0.46 0.6 0.16 0.37 0.68 0.0 0.0 0.27 0.69 0.01 0.43
0.4 0.59 0.34 0.81 0.51 0.43 0.51 0.48 0.55 0.19 0.41 0.42 0.66 0.61 0.6 0.59 0.67 1.0 0.32 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)