Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	ATCC 44394, early decay stage, 0-5 mm	ATCC 44394, middle late decay stage, 15-20 mm	ATCC 44394, late decay stage, 30-35 mm	SB12	MAD698-R, early decay stage, 0-5 mm	MAD698-R, middle late decay stage, 15-20 mm	MAD698-R, late decay stage, 30-35 mm	MAD698-R	Pure culture	week 6, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, untreated wood	week 4, untreated wood	week 3, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 1, untreated wood	week 2, untreated wood	week 5, untreated wood
EED77281	0.5	0.52	0.42	0.15	0.44	0.52	0.42	0.38	0.83	0.55	0.36	0.51	0.47	0.59	0.57	0.67	1.0	0.55	0.46	0.5	0.7	0.48	0.82	0.57	0.74	0.62	0.57	0.74	0.59
EED77292	0.78	0.62	0.64	0.41	0.72	0.62	0.64	0.82	1.0	0.4	0.33	0.37	0.23	0.36	0.27	0.38	0.71	0.51	0.2	0.29	0.25	0.37	0.23	0.36	0.39	0.37	0.62	0.45	0.32
EED77618	0.18	0.08	0.2	0.97	0.15	0.08	0.2	0.2	0.95	0.59	0.51	0.85	0.61	0.51	0.58	0.77	0.89	0.48	0.6	0.93	0.76	1.0	0.96	0.71	0.81	1.0	0.46	0.47	0.57
EED77790	0.36	0.24	0.28	1.0	0.35	0.24	0.28	0.36	0.23	0.11	0.13	0.21	0.11	0.11	0.17	0.19	0.43	0.27	0.19	0.19	0.07	0.15	0.16	0.1	0.1	0.45	0.17	0.37	0.13
EED78016	0.08	0.01	0.01	1.0	0.12	0.01	0.01	0.76	0.22	0.04	0.12	0.49	0.06	0.23	0.09	0.18	0.27	0.32	0.1	0.2	0.15	0.02	0.11	0.17	0.07	0.26	0.26	0.37	0.05
EED78166	0.14	0.11	0.11	1.0	0.16	0.11	0.11	0.22	0.29	0.06	0.07	0.12	0.11	0.12	0.1	0.13	0.27	0.07	0.01	0.1	0.09	0.06	0.05	0.09	0.04	0.13	0.07	0.03	0.04
EED78476	0.7	0.27	0.43	1.0	0.64	0.27	0.43	0.78	0.83	0.17	0.2	0.33	0.19	0.25	0.28	0.31	0.52	0.41	0.13	0.28	0.19	0.11	0.09	0.41	0.21	0.31	0.91	0.28	0.29
EED78486	0.76	0.52	0.47	0.41	0.71	0.52	0.47	1.0	0.12	0.05	0.12	0.13	0.14	0.13	0.12	0.18	0.64	0.17	0.08	0.19	0.1	0.17	0.13	0.23	0.22	0.12	0.26	0.19	0.13
EED79253	0.26	0.24	0.3	1.0	0.27	0.24	0.3	0.39	0.42	0.23	0.14	0.26	0.23	0.2	0.22	0.31	0.32	0.36	0.18	0.16	0.1	0.16	0.19	0.31	0.26	0.39	0.55	0.24	0.19
EED79273	0.31	0.29	0.29	0.52	0.34	0.29	0.29	1.0	0.29	0.26	0.49	0.54	0.4	0.34	0.29	0.35	0.64	0.56	0.34	0.43	0.31	0.46	0.47	0.45	0.78	0.77	0.43	0.33	0.33
EED79368	0.76	0.53	0.56	1.0	0.79	0.53	0.56	0.81	0.64	0.5	0.64	0.6	0.62	0.67	0.74	0.66	0.98	0.84	0.67	0.57	0.66	0.58	0.67	0.67	0.78	0.75	0.72	0.74	0.81
EED79369	0.68	0.94	1.0	0.0	0.72	0.94	1.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.08	0.76	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.0	0.0	0.16	0.0
EED79408	0.56	0.35	0.52	0.63	0.6	0.35	0.52	0.73	0.39	0.25	0.18	0.37	0.21	0.2	0.14	0.2	0.99	0.19	0.1	0.2	0.21	0.06	0.04	0.16	0.05	0.09	1.0	0.22	0.22
EED79624	0.05	0.04	0.04	1.0	0.06	0.04	0.04	0.76	0.31	0.22	0.15	0.24	0.21	0.15	0.17	0.22	0.36	0.29	0.13	0.21	0.22	0.12	0.18	0.17	0.27	0.19	0.24	0.23	0.22
EED79702	0.61	1.0	0.7	0.0	0.61	1.0	0.7	0.37	0.0	0.0	0.08	0.06	0.02	0.09	0.13	0.08	0.52	0.37	0.0	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.21	0.02	0.0	0.07	0.07
EED79787	0.12	0.15	0.19	1.0	0.13	0.15	0.19	0.51	0.21	0.24	0.1	0.25	0.2	0.21	0.27	0.22	0.41	0.35	0.2	0.27	0.21	0.12	0.15	0.18	0.25	0.3	0.18	0.08	0.41
EED79977	0.28	0.18	0.22	0.0	0.27	0.18	0.22	1.0	0.53	0.24	0.18	0.47	0.26	0.2	0.24	0.18	0.72	0.54	0.22	0.44	0.21	0.31	0.53	0.46	0.51	0.59	0.72	0.1	0.23
EED79982	0.48	0.25	0.57	0.1	0.42	0.25	0.57	0.7	0.86	0.31	0.3	0.38	0.31	0.42	0.34	0.62	1.0	0.35	0.24	0.41	0.4	0.34	0.25	0.7	0.49	0.38	0.86	0.43	0.38
EED80006	0.48	0.38	0.42	0.64	0.41	0.38	0.42	0.65	1.0	0.39	0.21	0.3	0.33	0.35	0.37	0.49	0.63	0.3	0.11	0.16	0.52	0.27	0.39	0.21	0.38	0.21	0.45	0.33	0.46
EED80129	0.25	0.05	0.04	0.01	0.35	0.05	0.04	0.44	1.0	0.19	0.22	0.3	0.24	0.24	0.2	0.19	0.4	0.23	0.18	0.28	0.22	0.23	0.18	0.4	0.26	0.25	0.37	0.15	0.14
EED80253	0.19	0.05	0.06	0.0	0.15	0.05	0.06	0.06	0.63	0.3	0.08	0.34	0.18	0.42	0.31	0.19	0.59	0.33	0.31	0.17	0.23	0.24	0.1	0.32	0.56	0.27	1.0	0.24	0.32
EED80563	0.56	0.43	0.57	0.46	0.59	0.43	0.57	1.0	0.11	0.12	0.15	0.09	0.08	0.09	0.11	0.09	0.39	0.04	0.11	0.06	0.2	0.09	0.11	0.17	0.15	0.2	0.13	0.17	0.09
EED80634	0.18	0.22	0.28	0.0	0.17	0.22	0.28	0.18	0.2	0.21	0.37	0.21	0.3	0.18	0.21	0.34	1.0	0.14	0.37	0.25	0.32	0.25	0.22	0.15	0.32	0.2	0.27	0.2	0.17
EED80746	0.26	0.27	0.13	0.97	0.25	0.27	0.13	0.54	0.12	0.08	0.18	0.17	0.14	0.13	0.11	0.26	1.0	0.14	0.17	0.25	0.09	0.15	0.12	0.25	0.14	0.22	0.25	0.15	0.17
EED80757	0.85	0.49	0.4	0.51	0.8	0.49	0.4	0.46	0.54	0.33	0.22	0.3	0.32	0.38	0.25	0.42	1.0	0.88	0.19	0.59	0.11	0.35	0.29	0.68	0.26	0.36	0.36	0.18	0.27
EED80866	0.61	0.35	0.44	0.62	0.65	0.35	0.44	0.26	0.31	0.31	0.42	0.37	0.42	0.56	0.34	0.4	0.55	0.55	0.53	0.46	0.47	0.33	0.41	0.46	0.63	0.36	1.0	0.45	0.6
EED81006	0.18	0.22	0.26	1.0	0.17	0.22	0.26	0.07	0.01	0.03	0.04	0.11	0.04	0.04	0.03	0.02	0.17	0.05	0.02	0.08	0.07	0.05	0.06	0.06	0.04	0.02	0.18	0.02	0.01
EED81061	0.7	0.42	0.37	1.0	0.74	0.42	0.37	0.91	0.58	0.24	0.27	0.26	0.2	0.49	0.32	0.36	0.6	0.35	0.17	0.19	0.39	0.33	0.36	0.37	0.15	0.17	0.41	0.36	0.25
EED81085	0.58	0.53	0.64	0.7	0.6	0.53	0.64	0.97	1.0	0.43	0.5	0.66	0.56	0.54	0.54	0.56	0.96	0.72	0.31	0.62	0.58	0.45	0.41	0.58	0.54	0.59	0.78	0.51	0.58
EED81150	0.61	0.19	0.14	0.07	0.53	0.19	0.14	0.32	1.0	0.17	0.0	0.04	0.0	0.07	0.05	0.02	0.32	0.07	0.11	0.06	0.03	0.02	0.26	0.02	0.12	0.0	0.09	0.11	0.08
EED81162	0.48	0.52	0.49	0.55	0.49	0.52	0.49	0.48	0.82	0.31	0.15	0.46	0.4	0.35	0.32	0.46	0.84	0.43	0.44	0.45	0.7	0.26	0.74	0.66	1.0	0.53	0.85	0.75	0.46
EED81250	0.1	0.17	0.2	1.0	0.14	0.17	0.2	0.99	0.46	0.29	0.2	0.37	0.16	0.2	0.21	0.25	0.9	0.29	0.38	0.44	0.19	0.21	0.25	0.35	0.3	0.51	0.64	0.1	0.36
EED81470	0.43	0.58	0.6	0.09	0.43	0.58	0.6	0.31	1.0	0.36	0.46	0.6	0.39	0.32	0.33	0.43	0.95	0.56	0.19	0.54	0.41	0.43	0.36	0.26	0.39	0.57	0.78	0.42	0.33
EED81728	0.27	0.49	0.41	0.36	0.32	0.49	0.41	0.36	1.0	0.2	0.12	0.32	0.34	0.28	0.24	0.34	0.57	0.52	0.11	0.49	0.15	0.31	0.25	0.26	0.27	0.52	0.28	0.3	0.29
EED81926	0.49	0.5	0.36	0.45	0.52	0.5	0.36	0.67	0.63	0.29	0.33	0.16	0.19	0.44	0.22	0.43	1.0	0.46	0.1	0.42	0.15	0.15	0.17	0.16	0.26	0.14	0.49	0.4	0.37
EED81994	0.06	0.13	0.09	1.0	0.06	0.13	0.09	0.13	0.07	0.07	0.09	0.07	0.05	0.04	0.04	0.07	0.3	0.07	0.06	0.08	0.05	0.16	0.07	0.1	0.08	0.06	0.33	0.03	0.06
EED82035	0.23	0.23	0.22	1.0	0.23	0.23	0.22	0.45	0.15	0.14	0.12	0.16	0.16	0.18	0.13	0.2	0.3	0.25	0.14	0.22	0.19	0.16	0.12	0.19	0.27	0.27	0.29	0.08	0.21
EED82233	0.38	0.27	0.29	1.0	0.36	0.27	0.29	0.39	0.3	0.14	0.18	0.22	0.22	0.2	0.18	0.22	0.87	0.6	0.16	0.26	0.17	0.14	0.19	0.27	0.19	0.23	0.4	0.16	0.3
EED82269	0.46	0.24	0.35	1.0	0.42	0.24	0.35	0.77	0.0	0.07	0.21	0.07	0.02	0.03	0.05	0.13	0.2	0.22	0.18	0.05	0.2	0.06	0.03	0.04	0.2	0.12	0.18	0.01	0.05
EED82281	0.66	0.89	0.68	0.03	0.73	0.89	0.68	1.0	0.01	0.0	0.01	0.12	0.0	0.08	0.0	0.0	0.51	0.15	0.01	0.01	0.02	0.0	0.08	0.01	0.05	0.06	0.03	0.02	0.03
EED82392	0.0	0.06	0.0	0.48	0.02	0.06	0.0	1.0	0.21	0.08	0.14	0.13	0.29	0.13	0.04	0.22	0.21	0.08	0.14	0.14	0.22	0.37	0.74	0.3	0.42	0.0	0.08	0.18	0.09
EED82649	0.24	0.14	0.18	0.03	0.34	0.14	0.18	0.08	1.0	0.13	0.23	0.14	0.18	0.21	0.24	0.15	0.39	0.16	0.21	0.19	0.17	0.16	0.15	0.11	0.23	0.29	0.37	0.17	0.14
EED82655	0.67	0.63	0.64	0.6	0.66	0.63	0.64	0.75	1.0	0.48	0.49	0.63	0.46	0.66	0.58	0.67	0.59	0.47	0.56	0.63	0.6	0.57	0.6	0.62	0.7	0.46	0.62	0.61	0.54
EED83061	0.99	0.65	0.8	0.0	1.0	0.65	0.8	0.7	0.28	0.09	0.08	0.2	0.17	0.1	0.09	0.06	0.42	0.17	0.17	0.16	0.18	0.16	0.13	0.33	0.18	0.37	0.11	0.23	0.11
EED83184	0.52	0.46	0.36	0.73	0.59	0.46	0.36	1.0	0.62	0.18	0.29	0.3	0.16	0.22	0.23	0.29	0.55	0.68	0.31	0.26	0.27	0.15	0.17	0.22	0.27	0.31	0.43	0.14	0.18
EED83380	0.11	0.11	0.25	1.0	0.13	0.11	0.25	0.25	0.1	0.05	0.12	0.35	0.04	0.05	0.05	0.12	0.6	0.08	0.12	0.23	0.12	0.19	0.03	0.33	0.09	0.16	0.05	0.04	0.13
EED83560	0.89	0.87	0.72	0.52	0.94	0.87	0.72	0.71	1.0	0.64	0.4	0.6	0.57	0.72	0.63	0.64	0.9	0.5	0.66	0.68	0.83	0.46	0.84	0.64	0.83	0.66	0.87	0.79	0.73
EED83867	0.26	0.33	0.32	0.0	0.28	0.33	0.32	0.55	0.82	0.9	0.67	0.72	0.8	0.81	0.68	0.67	0.9	0.72	0.7	0.92	0.77	0.69	0.7	0.91	1.0	0.71	0.78	0.62	0.88
EED83889	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.63	0.37	0.6	0.39	0.45	0.48	0.62	0.88	0.36	0.56	0.44	0.58	0.53	0.47	0.34	0.45	0.72	0.39	0.51	0.64
EED84037	0.95	0.7	0.71	0.0	1.0	0.7	0.71	0.75	0.3	0.15	0.19	0.08	0.05	0.06	0.06	0.15	0.34	0.19	0.1	0.07	0.04	0.07	0.19	0.15	0.15	0.12	0.06	0.15	0.04
EED84056	0.14	0.14	0.11	1.0	0.2	0.14	0.11	0.39	0.19	0.04	0.09	0.07	0.04	0.08	0.08	0.21	0.51	0.11	0.05	0.12	0.06	0.01	0.03	0.18	0.06	0.06	0.63	0.24	0.12
EED84144	0.7	0.42	0.37	1.0	0.74	0.42	0.37	0.91	0.58	0.24	0.27	0.26	0.2	0.49	0.32	0.36	0.6	0.35	0.17	0.19	0.39	0.33	0.36	0.37	0.15	0.17	0.41	0.36	0.25
EED84271	0.41	0.22	0.17	1.0	0.51	0.22	0.17	0.55	0.22	0.17	0.22	0.26	0.19	0.21	0.2	0.2	0.43	0.17	0.23	0.18	0.19	0.22	0.19	0.22	0.26	0.17	0.28	0.24	0.2
EED84404	0.7	0.46	0.37	0.98	0.7	0.46	0.37	1.0	0.48	0.4	0.41	0.6	0.43	0.48	0.55	0.48	0.75	0.64	0.34	0.34	0.43	0.5	0.56	0.58	0.51	0.69	0.54	0.44	0.43
EED84428	0.34	0.15	0.17	1.0	0.36	0.15	0.17	0.08	0.51	0.32	0.29	0.42	0.4	0.5	0.37	0.43	0.53	0.42	0.33	0.34	0.33	0.34	0.51	0.36	0.51	0.32	0.69	0.39	0.43
EED84457	0.61	0.62	0.61	0.6	0.6	0.62	0.61	0.89	0.93	0.68	0.75	0.86	0.68	0.79	0.84	0.83	0.86	0.92	0.65	0.77	0.64	0.49	0.66	0.82	0.74	0.72	1.0	0.81	0.81
EED84463	0.57	0.44	0.36	1.0	0.61	0.44	0.36	0.22	0.05	0.15	0.15	0.35	0.26	0.24	0.17	0.27	0.73	0.55	0.1	0.46	0.15	0.37	0.2	0.19	0.16	0.22	0.2	0.25	0.16
EED84601	0.12	0.3	0.48	0.0	0.12	0.3	0.48	0.71	0.59	0.16	0.32	0.42	0.31	0.28	0.14	0.25	0.38	0.44	0.26	0.46	0.4	0.4	0.7	0.46	1.0	0.35	0.45	0.52	0.14
EED84602	0.06	0.18	0.23	0.0	0.07	0.18	0.23	1.0	0.72	0.19	0.37	0.48	0.35	0.31	0.2	0.34	0.35	0.43	0.37	0.48	0.48	0.4	0.97	0.53	0.91	0.52	0.72	0.55	0.14
EED84683	0.95	0.75	0.67	1.0	0.98	0.75	0.67	0.9	0.5	0.52	0.56	0.67	0.6	0.77	0.62	0.65	0.84	0.77	0.63	0.68	0.65	0.56	0.7	0.66	0.91	0.79	0.98	0.57	0.84
EED84689	0.98	0.81	0.75	0.87	1.0	0.81	0.75	0.98	0.79	0.42	0.41	0.45	0.45	0.49	0.35	0.39	0.6	0.63	0.32	0.51	0.41	0.48	0.42	0.45	0.68	0.5	0.39	0.6	0.39
EED84874	0.89	0.79	0.71	0.0	0.89	0.79	0.71	0.55	1.0	0.02	0.08	0.5	0.18	0.15	0.13	0.26	0.44	0.86	0.04	0.41	0.08	0.29	0.0	0.09	0.16	0.09	0.66	0.16	0.1
EED84920	0.12	0.22	0.34	1.0	0.14	0.22	0.34	0.18	0.14	0.21	0.09	0.3	0.24	0.28	0.2	0.28	0.44	0.15	0.2	0.14	0.2	0.07	0.12	0.12	0.16	0.18	0.54	0.28	0.19
EED85402	1.0	0.26	0.27	0.91	0.77	0.26	0.27	0.33	0.14	0.19	0.23	0.21	0.28	0.12	0.16	0.14	0.5	0.1	0.28	0.32	0.39	0.2	0.21	0.23	0.27	0.08	0.13	0.11	0.18
EED85676	0.23	0.33	0.23	1.0	0.24	0.33	0.23	0.65	0.15	0.02	0.04	0.05	0.03	0.1	0.04	0.02	0.23	0.25	0.01	0.04	0.0	0.08	0.0	0.03	0.03	0.07	0.04	0.03	0.04
EED85679	0.34	0.34	0.55	1.0	0.37	0.34	0.55	0.17	0.26	0.22	0.46	0.36	0.3	0.36	0.3	0.34	0.77	0.46	0.31	0.51	0.34	0.31	0.41	0.52	0.49	0.42	0.43	0.38	0.34
EED85835	0.25	0.17	0.09	0.49	0.26	0.17	0.09	0.35	0.95	0.01	0.09	0.11	0.15	0.07	0.07	0.39	1.0	0.08	0.0	0.1	0.11	0.0	0.0	0.24	0.07	0.18	0.0	0.05	0.05
EED85907	0.06	0.04	0.05	1.0	0.08	0.04	0.05	0.79	0.04	0.23	0.09	0.23	0.15	0.11	0.12	0.06	0.36	0.12	0.12	0.15	0.12	0.24	0.13	0.18	0.3	0.13	0.18	0.03	0.16
EED85931	1.0	0.78	0.69	0.9	0.92	0.78	0.69	0.82	0.88	0.32	0.37	0.63	0.37	0.62	0.45	0.65	0.72	0.73	0.33	0.63	0.32	0.46	0.42	0.53	0.39	0.76	0.99	0.47	0.39
EED86043	0.48	0.38	0.42	0.64	0.41	0.38	0.42	0.65	1.0	0.39	0.21	0.3	0.33	0.35	0.37	0.49	0.63	0.3	0.11	0.16	0.52	0.27	0.39	0.21	0.38	0.21	0.45	0.33	0.46
EED86080	0.68	0.49	0.48	0.73	0.72	0.49	0.48	0.85	0.6	0.32	0.43	0.37	0.39	0.5	0.35	0.49	1.0	0.66	0.41	0.4	0.43	0.36	0.39	0.4	0.61	0.54	0.81	0.63	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)