Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	ATCC 44394, early decay stage, 0-5 mm	ATCC 44394, middle late decay stage, 15-20 mm	ATCC 44394, late decay stage, 30-35 mm	SB12	MAD698-R, early decay stage, 0-5 mm	MAD698-R, middle late decay stage, 15-20 mm	MAD698-R, late decay stage, 30-35 mm	MAD698-R	Pure culture	week 6, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, untreated wood	week 4, untreated wood	week 3, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 1, untreated wood	week 2, untreated wood	week 5, untreated wood
EED77034	0.04	0.03	0.02	1.0	0.06	0.03	0.02	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03	0.06	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04
EED77185	0.2	0.15	0.21	1.0	0.21	0.15	0.21	0.4	0.04	0.06	0.02	0.02	0.05	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.06	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.05
EED77388	0.12	0.11	0.09	1.0	0.12	0.11	0.09	0.22	0.01	0.05	0.05	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.02	0.06	0.06	0.03	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.07	0.04	0.08
EED77409	0.24	0.22	0.24	1.0	0.25	0.22	0.24	0.52	0.12	0.06	0.09	0.08	0.06	0.08	0.07	0.07	0.08	0.1	0.07	0.09	0.08	0.07	0.06	0.09	0.09	0.12	0.14	0.11	0.07
EED77692	0.04	0.03	0.03	1.0	0.03	0.03	0.03	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED77813	0.5	0.29	0.3	1.0	0.51	0.29	0.3	0.61	0.13	0.11	0.16	0.1	0.16	0.1	0.12	0.11	0.11	0.13	0.1	0.14	0.16	0.19	0.23	0.18	0.19	0.2	0.14	0.08	0.1
EED77844	0.06	0.07	0.05	1.0	0.06	0.07	0.05	0.49	0.05	0.01	0.0	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01
EED77936	0.11	0.02	0.09	1.0	0.11	0.02	0.09	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED78183	0.3	0.18	0.14	1.0	0.32	0.18	0.14	0.44	0.22	0.04	0.04	0.06	0.05	0.07	0.08	0.08	0.08	0.08	0.06	0.07	0.07	0.04	0.04	0.06	0.09	0.09	0.16	0.06	0.09
EED78415	0.09	0.11	0.12	1.0	0.17	0.11	0.12	0.54	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
EED78724	0.12	0.04	0.02	1.0	0.12	0.04	0.02	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED78826	0.06	0.06	0.03	1.0	0.09	0.06	0.03	0.84	0.0	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.03	0.05	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.0	0.07	0.02	0.01
EED79088	0.19	0.1	0.19	1.0	0.22	0.1	0.19	0.28	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79440	0.05	0.09	0.05	1.0	0.05	0.09	0.05	0.15	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
EED79477	0.19	0.11	0.08	1.0	0.17	0.11	0.08	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79550	0.29	0.06	0.05	0.85	0.27	0.06	0.05	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79567	0.05	0.0	0.07	1.0	0.08	0.0	0.07	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79604	0.17	0.15	0.16	1.0	0.14	0.15	0.16	0.82	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79663	0.14	0.07	0.03	1.0	0.12	0.07	0.03	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79823	0.33	0.23	0.19	1.0	0.3	0.23	0.19	0.54	0.41	0.06	0.1	0.13	0.07	0.07	0.09	0.1	0.07	0.14	0.06	0.13	0.08	0.1	0.06	0.13	0.11	0.22	0.15	0.05	0.07
EED79824	0.17	0.09	0.09	1.0	0.19	0.09	0.09	0.42	0.08	0.04	0.03	0.05	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03	0.09	0.06	0.05	0.04	0.07	0.05	0.09	0.02	0.02	0.02
EED79827	0.05	0.01	0.01	1.0	0.06	0.01	0.01	0.26	0.06	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01
EED79943	0.07	0.13	0.06	1.0	0.14	0.13	0.06	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED79946	0.1	0.08	0.07	1.0	0.12	0.08	0.07	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED80109	0.09	0.03	0.02	1.0	0.09	0.03	0.02	0.26	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01
EED80184	0.17	0.23	0.26	1.0	0.19	0.23	0.26	0.46	0.19	0.11	0.12	0.12	0.15	0.16	0.12	0.17	0.13	0.15	0.12	0.17	0.14	0.13	0.11	0.14	0.2	0.17	0.23	0.15	0.18
EED80210	0.01	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
EED80478	0.26	0.17	0.2	1.0	0.26	0.17	0.2	0.31	0.09	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.14	0.13	0.13	0.15	0.14	0.11	0.16	0.15	0.15	0.15	0.15	0.14	0.14	0.13	0.13
EED80518	0.07	0.1	0.07	1.0	0.09	0.1	0.07	0.29	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.07	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.07	0.06	0.03	0.04	0.04	0.04
EED80747	0.02	0.02	0.02	1.0	0.02	0.02	0.02	0.14	0.03	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.01	0.02
EED81039	0.22	0.1	0.15	1.0	0.2	0.1	0.15	0.34	0.06	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.01	0.02	0.0	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02
EED81741	0.54	0.13	0.16	1.0	0.46	0.13	0.16	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED82012	0.13	0.09	0.08	1.0	0.13	0.09	0.08	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED82048	0.07	0.15	0.13	1.0	0.1	0.15	0.13	0.84	0.07	0.03	0.0	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.0	0.05	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01	0.02	0.12	0.07	0.01	0.02
EED82063	0.15	0.04	0.04	1.0	0.17	0.04	0.04	0.75	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.12	0.01	0.01
EED82066	0.06	0.06	0.08	1.0	0.06	0.06	0.08	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED82146	0.17	0.14	0.11	1.0	0.17	0.14	0.11	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED82352	0.04	0.02	0.03	1.0	0.05	0.02	0.03	0.18	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.05	0.04	0.02	0.06	0.01	0.03
EED82456	0.08	0.01	0.0	1.0	0.08	0.01	0.0	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01
EED82591	0.33	0.17	0.11	1.0	0.36	0.17	0.11	0.41	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.21	0.02	0.03
EED82693	0.08	0.02	0.02	1.0	0.13	0.02	0.02	0.25	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0
EED82696	0.06	0.04	0.03	1.0	0.06	0.04	0.03	0.25	0.11	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.01
EED82697	0.05	0.01	0.01	1.0	0.05	0.01	0.01	0.31	0.11	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.08	0.03	0.1	0.19	0.01	0.02
EED82821	0.05	0.06	0.02	1.0	0.04	0.06	0.02	0.28	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
EED82973	0.2	0.14	0.19	1.0	0.22	0.14	0.19	0.61	0.21	0.05	0.03	0.1	0.05	0.06	0.05	0.07	0.03	0.04	0.04	0.05	0.1	0.04	0.08	0.08	0.09	0.07	0.19	0.05	0.07
EED83302	0.02	0.01	0.01	1.0	0.02	0.01	0.01	0.17	0.14	0.04	0.03	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.05	0.05	0.07	0.08	0.07	0.09	0.05	0.06
EED83304	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED83365	0.14	0.13	0.14	1.0	0.14	0.13	0.14	0.54	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.15	0.0	0.0
EED83376	0.51	0.16	0.12	1.0	0.48	0.16	0.12	0.51	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.05	0.01	0.0
EED83488	0.1	0.04	0.04	1.0	0.1	0.04	0.04	0.28	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.0
EED83533	0.02	0.03	0.03	1.0	0.03	0.03	0.03	0.26	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
EED83596	0.27	0.18	0.15	0.92	0.23	0.18	0.15	1.0	0.05	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03	0.06	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.02	0.03
EED83601	0.16	0.04	0.09	1.0	0.14	0.04	0.09	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED83618	0.14	0.1	0.11	1.0	0.15	0.1	0.11	0.81	0.03	0.0	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.05	0.0	0.03	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.0
EED84046	0.05	0.04	0.02	1.0	0.05	0.04	0.02	0.25	0.0	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02
EED84089	0.06	0.04	0.06	1.0	0.05	0.04	0.06	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED84199	0.17	0.13	0.14	1.0	0.2	0.13	0.14	0.34	0.08	0.06	0.03	0.06	0.04	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.08	0.08	0.09	0.04	0.04
EED84240	0.57	0.27	0.23	0.59	0.51	0.27	0.23	1.0	0.07	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.0	0.05	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.02	0.02
EED84255	0.28	0.1	0.05	1.0	0.26	0.1	0.05	0.61	0.19	0.05	0.08	0.09	0.04	0.05	0.05	0.05	0.04	0.09	0.05	0.07	0.05	0.06	0.04	0.07	0.07	0.1	0.21	0.04	0.05
EED84520	0.31	0.22	0.2	1.0	0.31	0.22	0.2	0.68	0.15	0.06	0.07	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.05	0.12	0.05	0.09	0.08	0.08	0.06	0.11	0.09	0.08	0.2	0.07	0.06
EED84611	0.13	0.13	0.06	1.0	0.13	0.13	0.06	0.27	0.02	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.0	0.03	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03
EED84625	0.1	0.02	0.02	1.0	0.11	0.02	0.02	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
EED84646	0.03	0.03	0.02	1.0	0.04	0.03	0.02	0.28	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.02	0.01
EED84654	0.08	0.08	0.05	1.0	0.08	0.08	0.05	0.18	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.0	0.01
EED84661	0.33	0.03	0.05	1.0	0.28	0.03	0.05	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED84767	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED84928	0.04	0.03	0.01	1.0	0.04	0.03	0.01	0.47	0.02	0.03	0.0	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.03	0.01	0.0	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01
EED84988	0.24	0.22	0.23	1.0	0.27	0.22	0.23	0.42	0.25	0.1	0.1	0.1	0.09	0.13	0.12	0.14	0.05	0.1	0.08	0.09	0.08	0.1	0.09	0.12	0.12	0.11	0.17	0.1	0.13
EED85052	0.11	0.09	0.06	1.0	0.13	0.09	0.06	0.17	0.09	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02
EED85276	0.46	0.22	0.24	1.0	0.45	0.22	0.24	0.7	0.51	0.11	0.1	0.09	0.1	0.09	0.1	0.09	0.08	0.07	0.07	0.11	0.11	0.1	0.12	0.12	0.11	0.12	0.13	0.09	0.1
EED85454	0.31	0.16	0.14	1.0	0.28	0.16	0.14	0.4	0.18	0.04	0.08	0.1	0.06	0.09	0.06	0.11	0.06	0.12	0.02	0.08	0.08	0.05	0.05	0.09	0.12	0.08	0.17	0.06	0.06
EED85743	0.15	0.0	0.05	1.0	0.24	0.0	0.05	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EED85772	0.11	0.05	0.03	1.0	0.13	0.05	0.03	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)