Heatmap: Cluster_129 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	A1163,mycelia	A1163,mycelia,1% Ethanol min	ATCC 46645,mycelia	Af293,mycelia,30-48C	Af293,mycelia	Af293,mycelia,methylprednisolone	A1160,mycelia,pyrG+	Af293,mycelia,NORMOXIA	Af293,mycelia,HYPOXIA	mycelia,hrmA KO,NORMOXIA	mycelia,hrmA KO,HYPOXIA	mycelia,hrmA OE,NORMOXIA	mycelia,hrmA OE,HYPOXIA	EVOL20,mycelia,NORMOXIA	EVOL20,mycelia,HYPOXIA	dnm1 mgm1tetOn,mycelia,invitro	AfS35,mycelia,invitro,WT	mycelia,MAT1-1	Af293,mycelia,MAT1-2	mycelia,MAT1-2	Af293,hyphae	Z5,hyphae	hyphae,100 % oxygen saturation	hyphae,5 % oxygen saturation	A1163,hyphae,Added Neutrophils	Af293,hyphae,No Doxycycline	Af293,hyphae,Doxycycline	A1163,fungal_cells,WT	CEA17,fungal_cells,akuB KO	CEA17,fungal_cells,siamycin,akuB KO	A1163,fungal_cells,akuB KO	A1163,fungal_cells,akuB, mpkA KO	A1163,fungal_cells,akuB,sakB KO	Afs35,conidia	Af293,conidia	CEA17,conidia,Malt agar	CEA17,conidia,3% glu, 1%YE	A1160,conidia	spores,wetA KO	Af293,spores	Af293,YPD medium,28C	Af293,SEB	Af293,fructose	CEA17,FGSC:A1160 culture collection	CEA17,CAS	A1163,sorbitol,schA KO	A1163,sorbitol	CEA17,WT,Fe starv 2h	CEA17,WT,Fe starv 1h	CEA17,WT,Fe starv 0h	PpzA KO,Fe starv 2h	PpzA KO,Fe starv 1h	PpzA KO,Fe starv 0h	Af293,asexual stage	Af293	Af293,invivo	Af293,WT	Af293,37C	Af293,SS	Af293,OS	A1163,invivo	Af293,choC KO	A1163	AfS35	Af293,atrR KO	Af293,SS,atrR KO	CZB01	CEA17,SrbA KO	CEA17,SrbB KO	CEA17	A1160	A1160,A1160 Itra KO	A1163,30C,WT	A1163,37C,WT	A1163,WT	AfIR974	A1160C,WT	A1160C	AfS35,WT	MYA3627	MYA3627,ResCtrl	MYA3626,SusCtrl	MYA3626,SusItz4_	MYA3626,SusTbz8_	MYA3626,SusTbz1_	ATCC46645	ATCC46645,GliT KO	TSD62.1,37C	TSD62.1,30C	TSD1.15,30C	TSD1.15,37C	TSD1.15	TTDS4.1	29.9 Itra KO	AMM,mpkA KO	AMM,WT	crzA KO	zipD KO	sakA KO	mpkC and sakA KO	atfA KO	HapB	HapB,HapB Itra KO
EAL85883	0.35	0.78	0.19	0.18	0.31	0.3	0.35	0.51	0.07	0.55	0.05	0.44	0.01	0.48	0.04	0.15	0.36	0.11	0.16	0.15	0.46	0.63	0.44	1.0	0.52	0.67	0.76	0.52	0.67	0.55	0.47	0.33	0.77	0.37	0.24	0.05	0.18	0.1	0.37	0.02	0.19	0.56	0.3	0.38	0.31	0.29	0.2	0.37	0.81	0.32	0.3	0.85	0.32	0.14	0.38	0.4	0.28	0.06	0.3	0.33	0.54	0.62	0.05	0.1	0.35	0.34	0.64	0.26	0.4	0.53	0.45	0.72	0.15	0.23	0.2	0.42	0.24	0.25	0.2	0.13	0.21	0.17	0.15	0.16	0.19	0.17	0.24	0.24	0.3	0.08	0.1	0.13	0.26	0.79	0.38	0.09	0.37	0.21	0.2	0.34	0.39	0.33	0.44
EAL88915	0.59	0.03	0.18	0.08	0.97	0.92	0.37	0.45	0.09	0.51	0.08	0.46	0.02	0.48	0.06	0.0	0.26	0.04	0.1	0.1	0.28	0.5	0.4	0.7	0.63	0.61	0.73	0.47	0.53	0.47	0.38	0.38	1.0	0.04	0.13	0.04	0.08	0.05	0.15	0.01	0.05	0.28	0.06	0.23	0.25	0.21	0.12	0.45	0.64	0.34	0.41	0.74	0.33	0.21	0.32	0.31	0.21	0.02	0.2	0.23	0.38	0.24	0.02	0.09	0.27	0.23	0.62	0.11	0.11	0.49	0.45	0.62	0.14	0.17	0.14	0.2	0.21	0.22	0.16	0.16	0.19	0.14	0.14	0.14	0.17	0.12	0.18	0.16	0.16	0.09	0.12	0.12	0.21	0.54	0.56	0.05	0.32	0.12	0.22	0.32	0.34	0.26	0.39
EAL88916	0.53	0.03	0.15	0.09	0.74	0.67	0.47	0.54	0.08	0.65	0.06	0.52	0.01	0.57	0.04	0.0	0.32	0.03	0.08	0.08	0.3	0.33	0.58	0.91	0.8	0.72	0.83	0.5	0.53	0.49	0.4	0.37	1.0	0.01	0.09	0.01	0.1	0.02	0.14	0.0	0.02	0.33	0.06	0.29	0.24	0.18	0.11	0.58	0.8	0.3	0.51	0.88	0.33	0.32	0.41	0.41	0.27	0.01	0.22	0.24	0.45	0.24	0.01	0.11	0.34	0.3	0.61	0.11	0.12	0.5	0.5	0.74	0.18	0.23	0.21	0.34	0.3	0.33	0.19	0.2	0.26	0.17	0.15	0.15	0.19	0.1	0.21	0.26	0.24	0.1	0.11	0.2	0.28	0.63	0.44	0.04	0.4	0.16	0.23	0.29	0.46	0.29	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)