Heatmap: Cluster_27 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
7D,39C
7D,25C
7D,37C
7D,32C
7D
5D
7D,39C,NA
7D,32C,NA
7D,37C,NA
7D,NA
7D,25C,NA
-0.19 1.12 -0.22 0.24 -3.59 1.98 -3.16 -6.53 -1.54 0.07 -1.46
-0.37 0.74 0.69 -0.47 -4.46 2.61 - - - -4.4 -
0.0 0.97 1.2 -0.69 -6.01 2.34 -9.01 -7.58 - -5.24 -
-0.71 0.46 -0.07 -1.11 -4.07 2.91 -7.23 - -8.59 - -6.92
0.42 1.59 1.66 0.29 -5.6 1.17 - - - - -
-0.3 0.89 0.1 -0.89 -3.64 2.73 - - - - -
-0.29 0.74 0.54 -0.89 -4.33 2.69 - - - - -
0.0 1.26 0.09 0.01 -0.56 1.79 -1.73 -1.7 -2.08 -1.4 -2.66
1.06 1.69 1.71 0.95 -7.93 -1.06 - - - - -
0.04 0.75 0.24 -0.35 -0.97 1.6 -0.79 -1.32 -0.27 -1.39 -0.76
0.01 0.96 0.33 0.16 -1.25 2.05 -1.55 -1.52 -2.08 -4.5 -2.74
0.03 1.14 0.16 -0.66 -1.78 2.18 -1.73 -1.91 -1.26 -4.55 -2.42
0.15 1.12 0.67 0.1 -1.79 1.13 -1.24 -1.38 -0.35 -0.54 -1.7
0.01 0.78 0.64 -0.27 -1.89 2.33 -2.91 -2.61 -3.0 -4.9 -2.84
0.54 1.24 0.68 0.02 -4.3 1.97 -1.68 -4.24 -3.41 -4.11 -3.64
0.27 1.45 0.66 -0.27 -3.46 2.13 -4.4 -4.74 -4.57 -5.71 -4.9
0.11 1.03 0.03 -0.36 -1.42 2.3 -2.31 -2.32 -2.2 -3.83 -3.25
0.24 0.72 0.66 0.16 -1.0 1.75 -0.88 -1.58 -1.66 -5.4 -1.35
-0.29 0.94 0.15 -0.84 -3.22 2.69 -6.81 -6.99 - -5.7 -
0.12 1.47 0.1 -0.39 -3.68 2.28 -3.35 -8.04 -3.39 -2.95 -4.1
-0.04 0.56 -0.01 -0.01 -0.09 1.62 -0.94 -1.0 -0.67 -1.67 -0.75
-0.08 1.36 0.18 -0.41 -2.19 2.13 -1.65 -2.23 -2.34 -3.07 -2.51
-0.59 0.9 0.14 -1.0 -3.9 2.75 -4.72 -5.53 -8.99 - -5.07
-0.08 0.29 0.12 0.23 -0.33 1.19 -0.36 -0.56 -0.84 -0.88 -0.08
-0.15 0.8 0.31 -0.34 -1.41 2.49 -2.7 -5.11 -4.63 -6.04 -3.49
0.06 1.25 0.63 -0.71 -3.41 2.39 -5.27 -8.29 -5.81 -5.23 -6.12
-0.12 0.93 0.87 -0.38 -5.22 2.33 - -6.17 -1.55 -3.9 -3.43
-0.0 1.23 0.49 -0.64 -3.28 2.37 -5.38 -4.94 -3.17 -3.92 -3.52
-0.29 1.1 0.27 -0.82 -2.23 2.43 -3.24 -2.23 -2.03 -4.79 -4.31
-0.91 0.62 -0.28 -0.68 -2.9 2.87 -4.74 - - - -
-1.01 0.38 -0.29 -0.6 -3.81 2.92 - - - -3.88 -
0.4 1.13 0.8 0.14 -4.07 2.1 -4.36 -4.86 -4.71 -4.12 -2.87
-0.17 0.86 0.05 -0.68 -2.47 2.49 -3.46 -6.45 -3.22 -0.84 -4.19
0.07 0.44 0.48 0.39 -0.12 1.21 -0.35 -0.49 -1.21 -1.55 -1.37
0.19 1.04 0.45 0.12 -1.49 1.45 -1.91 -2.3 -0.76 -1.16 -0.4
0.13 0.98 0.28 -0.31 -0.98 2.17 -2.29 -2.05 -1.17 -5.17 -
0.8 1.78 1.05 0.59 -5.77 1.15 -6.7 - -8.11 - -
0.22 1.37 0.99 0.35 -4.66 1.97 -8.58 -9.31 -7.09 -8.61 -
0.01 0.79 0.25 -1.05 -4.54 2.68 -6.0 -7.72 -4.42 -4.34 -4.69
0.22 0.98 0.34 -0.48 -4.47 2.54 -5.96 -8.0 -9.29 - -7.69
-0.44 1.12 0.36 -0.79 -2.23 2.38 -2.93 -2.39 -1.09 -7.52 -
0.04 0.85 0.2 -0.01 -1.06 1.99 -1.08 -1.3 -1.64 -2.68 -2.14
-0.06 1.34 0.19 -0.45 -2.58 2.34 -3.9 -7.22 -6.67 -2.12 -3.42
-1.17 0.18 0.51 -1.17 -2.97 2.73 -5.57 -5.32 -1.99 -0.98 -
-0.23 0.85 0.08 -0.01 -0.98 2.14 -2.05 -4.29 -2.54 -1.37 -0.88
0.18 1.57 0.53 -0.26 -4.13 2.09 -2.61 -6.03 -4.36 -4.51 -4.34
-0.46 1.04 -0.04 -0.15 -1.52 2.1 -4.35 -1.78 -2.18 -5.58 0.18
-0.09 0.65 -0.13 -0.93 -0.98 1.89 -0.81 -0.71 -0.77 -0.54 -1.39
-0.66 0.89 0.38 -1.07 -3.15 2.71 -4.52 -8.72 -6.56 -8.1 -7.7
-0.87 0.76 -0.16 -0.94 -2.64 2.81 -4.73 -5.32 -4.51 -5.16 -6.44
-0.23 1.19 0.28 -0.7 -4.37 2.55 -4.83 -5.62 -5.88 -6.81 -4.84
0.1 1.15 0.8 -0.72 -3.83 2.35 -4.79 -4.65 -4.02 -3.95 -
0.0 0.5 0.31 -0.53 -1.33 2.49 -2.02 -2.96 -3.85 -3.21 -3.94
-0.31 1.48 -0.01 -0.01 -3.82 2.39 -7.25 -7.35 -6.7 - -3.51
0.04 0.8 0.39 -0.41 -4.73 2.59 -5.91 - -5.24 -4.32 -
0.19 1.05 1.0 0.01 -2.25 1.9 -3.77 -1.17 -1.59 - -
0.02 0.84 0.9 -0.45 -3.64 2.46 -7.91 -7.3 -7.22 - -
0.5 1.71 1.13 0.74 -0.15 -0.84 -2.26 - -3.3 - -0.56
0.23 1.67 0.77 -0.18 -3.75 1.99 -8.45 -9.57 -13.98 -10.43 -12.37
0.12 1.11 1.27 -0.45 -4.56 2.17 -6.0 -5.11 -5.26 - -
0.66 1.4 1.1 0.1 -2.67 1.65 -2.87 -5.52 -4.35 -4.8 -5.0
0.59 1.8 1.94 0.62 -4.88 -0.99 -5.99 -5.23 -4.55 -5.3 -
-0.44 1.15 0.44 -0.29 -2.61 2.51 - - - - -
-0.12 1.23 0.96 -0.17 -3.78 2.27 - - - - -
0.42 1.05 1.29 0.36 -3.8 1.91 -6.67 -4.76 - - -
0.23 0.83 0.69 0.02 -0.62 1.62 -1.62 -1.82 -1.64 -0.99 -1.92
-0.57 0.95 0.01 -0.31 -1.3 2.56 -3.88 -4.41 -2.79 - -
0.38 0.95 0.08 0.08 -2.22 2.13 -2.16 -1.33 -3.81 -4.86 -1.65
-0.15 1.21 0.23 -0.03 -3.85 2.46 -6.44 -5.11 - - -4.79
-0.57 0.74 0.1 -0.66 -1.62 2.67 -4.56 -6.04 -3.53 -4.19 -3.61
-0.13 1.26 0.42 -0.35 -4.67 2.46 - - - - -
0.13 1.39 0.68 0.21 -5.09 2.13 -7.77 - - -5.16 -3.7
0.17 1.32 0.44 -0.21 -3.57 2.13 -5.42 -4.7 -2.01 -4.43 -1.48
0.21 1.1 0.26 -0.38 -1.36 2.01 -1.85 -2.21 -1.12 -3.16 -1.96
0.09 1.12 0.01 -0.42 -1.5 2.17 -2.13 -2.67 -1.53 -2.53 -1.91
0.11 1.23 0.6 -0.32 -3.55 2.26 -2.29 -5.18 -5.23 -5.45 -3.53
0.13 0.66 -0.05 -0.38 -0.74 2.0 -0.67 -1.31 -1.1 -2.3 -1.74
0.01 0.8 0.41 -0.84 -3.85 2.65 -7.06 -8.56 - -6.71 -
0.85 1.88 0.62 0.13 -3.2 1.07 -3.48 -4.42 -2.89 -2.03 -2.59
0.29 1.28 0.52 -0.19 -2.34 2.02 -1.65 -4.41 -2.12 -3.37 -3.67
-0.22 1.21 0.85 -0.77 -4.13 2.42 -9.69 -10.56 -7.09 - -
-0.28 0.75 0.07 -0.55 -1.46 1.9 -1.44 -2.41 -1.4 0.54 -1.81
0.06 1.15 0.39 0.0 -3.18 2.35 -5.27 -5.51 -5.2 -4.23 -3.63
0.22 1.23 0.85 -0.32 -4.45 2.23 -3.07 -8.18 -5.54 - -
-0.7 0.46 -0.48 -1.01 -3.68 2.91 -3.16 -6.56 -4.95 - -3.79
0.09 0.54 0.18 0.09 -0.19 1.26 -0.58 -0.73 -0.52 -1.22 -0.72
-0.41 0.25 0.54 -0.77 -2.19 2.53 -2.26 -3.21 -2.29 -2.5 -1.59
0.04 1.31 0.57 -0.09 -2.47 2.2 -4.06 -3.25 -4.24 -4.44 -4.88
0.01 1.07 0.47 0.11 -1.63 2.11 -2.48 -2.46 -2.16 -3.05 -3.44
-0.16 1.05 0.17 -0.03 -1.17 2.09 -1.94 -1.28 -1.88 -4.37 -2.0
0.06 1.07 0.19 -0.4 -2.18 2.08 -1.35 -2.33 -1.7 -1.14 -2.78
0.59 1.27 0.53 0.02 -1.25 1.65 -2.44 -1.91 -1.55 -3.89 -2.26
0.22 0.85 0.55 -0.1 -2.27 2.2 -3.01 -3.17 -1.6 -3.65 -2.41
-0.5 1.23 0.29 -0.23 -4.4 2.54 -10.35 -10.44 -8.1 -7.74 -
-0.16 1.28 0.62 -0.14 -4.35 2.37 -6.79 - -7.6 -7.11 -
-0.3 1.09 0.75 -0.26 -2.65 2.33 -4.59 -3.68 -2.49 -5.53 -5.4
-0.55 1.13 0.54 -0.29 -1.4 2.42 -3.55 -6.53 -7.81 -6.27 -7.19
0.44 1.24 0.81 0.04 -2.75 1.61 -0.04 -2.95 -3.23 -4.89 -4.55
-0.44 0.69 -0.39 -0.95 -1.23 2.55 -1.47 -2.9 -1.7 -3.1 -2.7
0.64 1.35 1.39 0.29 -1.64 -0.49 -2.35 -5.97 -2.28 -0.19 -0.49
-0.51 1.56 0.14 -0.33 -3.5 2.4 - - - -3.64 -
0.03 1.14 0.98 -0.6 -4.91 2.35 - - -9.01 - -
-0.42 1.07 0.59 -0.75 -1.57 2.41 -5.27 -6.04 -2.74 -3.77 -2.89
-0.61 0.99 -0.33 -0.41 -2.49 2.65 -3.06 -4.99 -4.47 -3.18 -5.11
0.16 1.32 0.47 -0.69 -4.31 2.39 -6.66 -5.38 -4.79 -8.71 -4.65
0.12 1.24 0.87 0.76 -1.54 0.81 -3.4 -4.38 -3.91 -3.55 0.71
-0.46 0.81 0.42 -1.24 -3.57 2.68 -3.28 -6.65 -5.85 -3.29 -4.78
0.04 0.69 0.52 -0.02 -1.94 2.37 -1.9 -3.45 -4.15 -4.28 -4.24
0.35 0.92 1.09 0.38 -2.44 1.9 -3.28 -2.08 -3.35 - -4.4
-0.04 0.72 0.26 -0.11 -1.21 2.11 -1.01 -1.13 -1.69 -4.03 -2.63
-0.24 0.97 0.06 -0.44 -1.91 2.12 -0.62 -1.31 -1.46 -5.66 -1.46
0.48 1.48 0.88 -0.03 -4.6 1.91 - - - - -2.33
-0.16 1.15 0.76 -0.28 -3.18 2.28 -4.09 -6.21 -3.97 -4.26 -2.23
0.06 1.25 0.92 -0.74 -5.27 2.3 -5.37 -8.33 -5.67 -4.4 -4.43
0.27 0.58 0.46 0.18 0.1 1.32 -1.03 -1.83 -1.93 -1.23 -0.41
0.22 1.62 1.19 0.47 -1.86 0.49 -4.02 -5.28 -0.28 -1.87 -2.11
-0.54 0.93 -0.27 -0.19 -1.79 2.6 -5.02 -8.95 -3.43 -2.07 -6.16
-0.56 0.84 -0.25 -0.64 -3.13 2.77 -5.17 -7.35 -4.63 -4.82 -5.65
-0.07 1.03 0.41 -0.06 -3.62 2.47 - -3.72 - - -
0.1 1.01 0.7 -0.33 -2.19 2.21 -1.94 -5.23 -3.11 -2.73 -3.61
-0.06 0.9 0.35 -0.64 -4.3 2.57 -2.58 -5.66 -4.67 - -5.43
0.4 1.21 0.95 -0.5 -2.41 2.17 -4.53 - - - -
-0.26 0.85 0.37 -0.51 -3.47 2.65 - - - - -
-0.32 0.99 0.1 -0.62 -3.97 2.66 -4.64 -5.08 -6.07 -4.82 -
0.21 0.97 0.08 -0.18 -0.45 1.55 -1.16 -1.0 -0.68 -1.92 -1.13
0.29 0.84 0.44 -0.7 -4.11 2.54 -3.37 -6.33 -5.39 - -5.78
0.33 1.19 0.41 0.01 -1.2 1.98 -1.05 -3.0 -3.94 -3.43 -
-0.02 1.01 0.46 -0.22 -1.43 2.23 -3.09 -2.53 -2.82 -3.5 -2.45
-0.53 1.09 -0.19 -0.65 -4.16 2.72 -6.9 -9.01 -7.2 - -6.25
-0.1 0.94 0.78 -0.63 -2.36 2.4 -5.13 -4.71 -3.75 -7.31 -2.59
0.21 0.83 0.83 -0.34 -3.0 2.41 -5.0 -5.85 -6.54 -7.04 -
-0.58 1.03 0.34 -0.74 -3.33 2.62 -6.52 -8.1 -2.58 - -
-0.06 1.21 0.25 -0.44 -1.51 2.4 -3.35 -7.28 -4.63 -4.87 -
-0.61 1.08 0.52 -0.44 -1.82 2.37 -2.78 -4.86 -2.31 -4.23 -2.54
-0.03 0.99 0.42 -0.38 -1.18 2.11 -1.72 -1.88 -1.79 -2.45 -2.84
0.12 1.04 0.38 -0.13 -1.45 1.62 -1.12 -0.71 -0.94 -2.81 -1.11
0.43 1.32 0.73 0.28 -2.18 1.49 -0.17 -4.22 -3.2 -4.05 -2.92
0.36 1.51 0.52 -0.09 -6.48 2.16 -10.4 -10.7 - - -
0.4 1.4 0.58 -0.34 -4.64 2.03 -1.94 -7.06 -3.58 -3.56 -2.4
-0.43 1.13 0.18 -0.29 -2.43 2.48 -2.98 -3.11 -3.88 -5.9 -5.78
0.11 1.08 0.58 -0.5 -1.92 2.22 -2.51 -3.16 -3.0 -3.88 -2.32
0.33 1.54 0.62 -0.38 -2.16 2.01 -2.6 -5.44 -4.77 -5.35 -4.91
-0.07 0.94 0.16 -1.01 -3.6 2.61 -3.8 -4.6 -3.65 -4.0 -3.49
-0.48 1.12 -0.33 -0.77 -3.72 2.67 -5.06 -5.66 -3.76 -3.47 -3.64
-0.34 0.94 -0.19 -0.86 -2.66 2.71 -4.35 -4.91 -5.57 -4.57 -6.05
0.26 1.41 1.07 1.0 -2.74 0.97 -2.92 -2.57 -2.8 -2.28 -1.76
0.5 1.5 0.3 0.03 -2.95 1.9 -3.76 -3.68 -2.36 -5.72 -1.79
0.18 1.52 0.48 0.14 -2.9 2.01 -3.49 -5.38 -3.79 -3.14 -4.91
-0.51 0.52 0.2 -1.01 -2.9 2.57 -4.55 -5.1 -1.15 -3.65 -0.88
0.13 1.17 0.03 -0.33 -1.6 2.14 -1.91 -2.53 -2.27 -2.51 -1.8
0.26 1.49 0.98 -0.03 -4.78 1.99 -6.91 -10.08 - -6.34 -6.0
1.1 1.71 1.71 0.73 -6.14 -0.86 - - -3.41 - -
-0.06 0.73 -0.09 -0.77 -0.94 1.67 -1.42 -1.42 -0.48 0.41 -1.48
0.07 0.59 -0.01 0.06 -0.26 1.73 -0.93 -0.69 -1.08 -1.17 -2.33
-0.39 1.01 0.14 -0.71 -3.91 2.67 -5.38 -6.49 -6.57 -6.39 -6.07
0.18 0.98 0.73 0.22 -0.68 1.27 -0.47 -1.98 -2.49 -1.13 -1.24
0.26 1.38 0.47 -0.41 -5.31 2.33 -9.01 -8.24 -7.29 -9.21 -9.46
0.05 1.08 0.83 0.31 -4.24 2.25 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.