Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.07 0.18 0.35 0.31 0.3 0.53 0.5 0.31 0.18 0.34 0.21 0.18 0.26 0.33 0.26 0.19 0.15 0.15 0.12 0.22 0.23 0.2 0.22 0.19 1.0 0.15 0.43 0.37
0.18 0.58 0.25 0.05 0.25 0.28 0.41 0.16 0.17 0.35 0.18 0.19 0.63 0.49 0.43 0.1 0.07 0.89 0.05 0.08 0.15 0.08 0.15 0.1 1.0 0.06 0.49 0.04
0.26 0.26 0.11 0.07 0.16 0.41 0.26 0.33 0.16 0.23 0.21 0.07 0.11 0.26 0.24 0.07 0.06 0.66 0.04 0.06 0.05 0.07 0.11 0.05 1.0 0.18 0.25 0.09
0.55 0.33 0.12 0.07 0.19 0.3 0.11 0.32 0.39 0.22 0.45 0.13 0.22 0.24 0.21 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.89 0.07 0.18 0.0
0.22 0.22 0.03 0.32 0.09 0.08 0.09 0.07 0.04 0.1 0.03 0.04 0.05 0.38 0.33 0.13 0.09 0.04 0.06 0.09 0.09 0.08 0.07 0.06 1.0 0.29 0.57 0.56
0.0 0.04 0.23 0.07 0.03 0.01 0.22 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.06 0.02 0.01 0.13 0.07 0.0 0.03 0.11 0.04 0.1 0.08 0.04 0.0 0.0 1.0 0.04
0.13 0.06 0.27 0.28 0.18 0.35 0.3 0.26 0.23 0.26 0.28 0.13 0.21 0.13 0.13 0.23 0.27 0.18 0.15 0.25 0.25 0.25 0.2 0.22 1.0 0.15 0.17 0.22
0.23 0.1 0.0 0.05 0.0 0.01 0.49 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.37 0.22 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.19 0.01 0.01 0.01 1.0 0.0 0.3 0.08
0.07 0.02 0.27 0.09 0.03 0.05 0.84 0.02 0.02 0.19 0.03 0.06 0.11 0.85 1.0 0.09 0.1 0.2 0.22 0.14 0.15 0.1 0.39 0.15 0.48 0.01 0.78 0.34
0.4 0.22 0.45 0.31 0.15 0.04 0.29 0.35 0.36 0.26 0.46 0.03 0.12 0.42 0.5 0.25 0.12 0.09 0.22 0.2 0.15 0.09 0.34 0.14 0.15 0.45 1.0 0.1
0.94 0.21 0.58 0.12 0.54 0.57 0.74 0.79 0.71 1.0 0.66 0.33 0.54 0.41 0.37 0.51 0.3 0.47 0.41 0.58 0.65 0.44 0.49 0.5 0.9 0.72 0.94 0.09
0.52 0.1 0.34 0.13 0.23 0.21 0.57 0.2 0.14 0.34 0.15 0.17 0.6 0.28 0.27 0.21 0.14 0.14 0.08 0.23 0.24 0.21 0.17 0.16 1.0 0.15 0.34 0.17
0.58 0.82 0.62 0.33 0.66 0.98 0.83 0.35 0.48 0.51 0.4 0.69 0.69 0.74 0.69 0.42 0.59 0.56 0.47 0.44 0.4 0.52 0.43 0.53 1.0 0.63 0.67 0.55
0.2 0.22 0.54 0.25 0.18 0.26 0.49 0.16 0.18 0.26 0.17 0.14 0.48 0.38 0.34 0.14 0.16 0.76 0.07 0.18 0.19 0.14 0.42 0.1 1.0 0.51 0.61 0.24
0.11 0.19 0.54 0.07 0.22 0.13 0.31 0.09 0.05 0.06 0.13 0.12 0.07 0.45 0.46 0.44 0.23 0.4 0.19 0.41 0.38 0.44 0.48 0.38 0.86 0.5 1.0 0.06
0.09 0.45 0.08 0.55 0.21 0.55 0.14 0.08 0.13 0.17 0.18 0.21 0.2 0.81 0.66 0.11 0.2 0.55 0.11 0.12 0.08 0.1 0.13 0.08 1.0 0.83 0.9 0.7
0.07 0.16 0.5 0.27 0.27 0.18 0.45 0.14 0.11 0.16 0.1 0.14 0.51 0.34 0.28 0.11 0.12 0.08 0.09 0.14 0.14 0.14 0.17 0.13 0.27 0.07 1.0 0.12
0.1 0.14 0.05 0.21 0.03 0.04 0.36 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.29 0.24 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.05 0.04 0.03 0.03 1.0 0.04 0.91 0.23
0.44 0.77 0.86 0.58 0.6 0.98 1.0 0.63 0.63 0.58 0.77 0.51 0.83 0.54 0.5 0.7 0.68 0.51 0.47 0.84 0.77 0.8 0.5 0.79 0.51 0.52 0.58 0.49
0.41 0.78 0.87 0.66 0.81 0.97 0.92 1.0 0.63 0.97 0.61 0.64 1.0 0.78 0.7 0.77 0.61 0.36 0.3 0.71 0.96 0.71 0.51 0.63 0.91 0.83 0.84 0.75
0.73 0.72 0.44 0.6 0.54 0.6 0.5 0.51 0.46 0.42 0.48 0.38 0.47 0.66 0.61 0.52 0.56 0.34 0.27 0.58 0.55 0.51 0.43 0.49 0.5 0.68 1.0 0.6
0.56 1.0 0.57 0.4 0.53 0.73 0.78 0.44 0.42 0.59 0.44 0.48 0.6 0.49 0.53 0.35 0.42 0.32 0.39 0.41 0.39 0.41 0.58 0.4 0.56 0.49 0.54 0.49
0.08 0.06 0.11 0.11 0.2 0.53 0.27 0.25 0.16 0.17 0.15 0.14 0.13 0.16 0.17 0.09 0.08 1.0 0.07 0.1 0.09 0.11 0.1 0.09 0.79 0.1 0.11 0.17
1.0 0.09 0.2 0.03 0.38 0.31 0.95 0.25 0.55 0.51 0.52 0.38 0.41 0.35 0.28 0.1 0.14 0.38 0.06 0.18 0.33 0.05 0.15 0.23 0.04 0.12 0.69 0.09
0.2 0.24 0.21 0.21 0.07 0.08 0.5 0.26 0.24 1.0 0.06 0.05 0.34 0.31 0.26 0.1 0.11 0.18 0.08 0.12 0.16 0.09 0.09 0.11 0.88 0.42 0.4 0.16
0.04 0.12 0.23 0.16 0.1 0.24 0.39 0.17 0.09 0.4 0.07 0.05 0.39 0.56 0.36 0.09 0.08 0.14 0.06 0.15 0.12 0.09 0.1 0.11 1.0 0.05 0.95 0.15
0.89 0.12 0.33 0.24 0.25 0.3 0.44 0.19 0.26 0.16 0.28 0.34 0.47 0.41 0.36 0.31 0.28 0.32 0.18 0.34 0.24 0.41 0.37 0.39 1.0 0.48 0.25 0.17
0.03 0.17 0.01 0.12 0.02 0.02 0.61 0.12 0.04 0.41 0.01 0.0 0.04 0.62 0.51 0.05 0.03 0.06 0.01 0.07 0.06 0.03 0.09 0.02 1.0 0.02 0.45 0.12
0.2 0.13 0.07 0.09 0.03 0.02 0.34 0.01 0.02 0.07 0.02 0.02 0.19 0.5 0.48 0.04 0.04 0.38 0.04 0.05 0.04 0.03 0.05 0.04 1.0 0.02 0.98 0.08
0.11 0.13 0.21 0.31 0.28 0.2 0.32 0.13 0.18 0.15 0.14 0.22 0.12 0.53 0.45 0.16 0.13 0.18 0.13 0.21 0.17 0.2 0.15 0.17 0.32 0.14 1.0 0.3
0.3 0.85 0.3 0.2 0.24 0.33 0.3 0.39 0.41 0.41 0.43 0.26 0.37 0.34 0.33 0.39 0.29 0.27 0.22 0.42 0.39 0.41 0.28 0.43 1.0 0.29 0.25 0.25
0.99 0.89 0.92 0.68 0.7 0.77 1.0 0.57 0.54 0.7 0.55 0.64 0.93 0.59 0.54 0.62 0.59 0.49 0.48 0.64 0.74 0.69 0.57 0.66 0.47 0.6 0.77 0.7
0.05 0.2 0.22 0.37 0.08 0.1 0.41 0.29 0.11 0.29 0.13 0.05 0.25 0.52 0.65 0.21 0.14 0.06 0.3 0.19 0.27 0.18 0.25 0.16 1.0 0.32 0.64 0.41
0.63 0.81 0.72 0.5 0.68 1.0 0.84 0.63 0.53 0.64 0.58 0.57 0.56 0.69 0.63 0.35 0.44 0.26 0.16 0.45 0.37 0.47 0.48 0.44 0.8 0.69 0.88 0.63
0.26 0.41 0.27 0.41 0.55 0.54 0.33 0.18 0.24 0.2 0.24 0.32 0.51 0.52 0.46 0.25 0.33 1.0 0.55 0.3 0.23 0.3 0.25 0.25 0.45 0.39 0.65 0.48
0.46 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.49 0.0 1.0 0.05
0.88 0.2 0.01 0.05 0.19 0.59 0.07 0.42 0.04 0.15 0.03 0.06 0.1 0.14 0.17 0.04 0.08 0.05 0.11 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 1.0 0.01 0.08 0.04
0.42 0.63 0.17 0.04 0.13 0.16 0.3 0.21 0.2 0.4 0.19 0.15 0.23 0.22 0.2 0.17 0.17 0.33 0.23 0.26 0.26 0.22 0.22 0.25 1.0 0.22 0.19 0.17
0.71 0.75 0.2 0.08 0.21 0.38 0.42 0.23 0.2 0.52 0.21 0.25 0.34 0.26 0.27 0.25 0.26 0.41 0.13 0.26 0.22 0.24 0.25 0.27 1.0 0.23 0.26 0.38
0.34 0.33 0.41 0.08 0.23 0.15 0.23 0.08 0.24 0.1 0.19 0.22 0.11 0.25 0.34 0.3 0.23 0.23 0.09 0.45 0.15 0.31 0.47 0.13 0.22 0.32 1.0 0.18
0.07 0.13 0.02 0.22 0.35 0.63 0.11 0.24 0.09 0.16 0.04 0.06 0.15 0.31 0.34 0.21 0.17 0.96 0.12 0.14 0.1 0.16 0.12 0.12 1.0 0.32 0.96 0.36
0.03 0.26 0.07 0.09 0.21 0.14 0.06 0.08 0.05 0.1 0.04 0.11 0.05 0.19 0.16 0.06 0.06 0.05 0.03 0.06 0.06 0.06 0.04 0.05 0.19 0.06 1.0 0.07
0.17 0.29 0.48 0.12 0.14 0.1 0.99 0.33 0.16 0.68 0.19 0.17 0.23 0.32 0.35 0.18 0.18 0.19 0.12 0.3 0.3 0.23 0.38 0.26 1.0 0.32 0.37 0.16
0.05 0.11 0.06 0.07 0.02 0.01 0.04 0.03 0.01 0.08 0.0 0.01 0.28 0.08 0.06 0.03 0.02 0.03 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.1 0.01 1.0 0.02
0.4 0.04 0.03 0.28 0.13 0.07 0.15 0.11 0.1 0.08 0.13 0.05 0.1 0.27 0.34 0.11 0.09 0.06 0.07 0.14 0.06 0.09 0.11 0.11 0.02 0.71 1.0 0.12
0.17 0.4 0.09 0.41 0.06 0.11 0.34 0.06 0.11 0.12 0.11 0.07 0.1 0.7 0.47 0.09 0.12 0.12 0.11 0.09 0.09 0.1 0.12 0.11 1.0 0.05 0.3 0.37
0.38 0.83 0.41 0.35 0.64 1.0 0.51 0.37 0.41 0.31 0.41 0.66 0.38 0.41 0.43 0.43 0.7 0.51 0.54 0.49 0.33 0.55 0.37 0.43 0.57 0.57 0.45 0.67
0.14 0.3 0.21 0.23 0.22 0.17 0.24 0.12 0.15 0.18 0.15 0.18 0.29 0.28 0.28 0.16 0.16 0.15 0.1 0.16 0.12 0.15 0.14 0.13 0.31 0.51 1.0 0.16
0.5 0.91 0.57 0.68 0.84 0.88 0.86 0.66 0.76 0.83 0.79 0.76 0.68 0.75 0.7 0.57 0.53 0.35 0.33 0.61 0.53 0.61 0.57 0.58 1.0 0.8 0.82 0.75
0.52 0.85 0.76 0.58 0.69 1.0 0.87 0.73 0.68 0.75 0.77 0.6 0.71 0.65 0.63 0.64 0.74 0.7 0.52 0.78 0.63 0.85 0.65 0.77 0.94 0.46 0.6 0.72
0.1 0.15 0.27 0.48 0.05 0.1 0.28 0.07 0.22 0.05 0.27 0.14 0.41 0.8 1.0 0.43 0.14 0.54 0.11 0.35 0.29 0.21 0.75 0.21 0.4 0.45 0.61 0.54
0.36 0.26 0.3 0.26 0.39 0.23 0.2 0.24 0.21 0.24 0.19 0.23 0.33 0.23 0.2 0.31 0.26 0.37 0.36 0.27 0.25 0.26 0.17 0.26 0.34 0.16 1.0 0.17
0.32 0.35 0.17 0.27 0.42 0.57 0.22 0.19 0.21 0.21 0.18 0.33 0.28 0.33 0.28 0.2 0.26 0.74 0.28 0.19 0.12 0.18 0.26 0.14 0.28 0.36 1.0 0.23
0.52 0.77 0.62 0.34 0.5 0.5 0.58 0.35 0.55 0.46 0.65 0.56 0.42 0.54 0.5 0.38 0.44 0.29 0.65 0.49 0.34 0.49 0.4 0.46 1.0 0.42 0.5 0.5
0.78 0.27 0.35 0.07 0.24 0.23 0.26 0.3 0.36 0.21 0.32 0.13 0.14 0.27 0.29 0.12 0.13 0.94 0.39 0.25 0.2 0.25 0.24 0.21 0.8 0.28 1.0 0.11
0.08 0.24 0.0 0.02 0.11 0.83 0.12 0.63 0.01 0.13 0.0 0.01 0.06 0.34 0.26 0.02 0.01 0.75 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.17 0.18 0.0
0.48 0.33 0.16 0.15 0.18 0.21 0.15 0.06 0.06 0.1 0.06 0.09 0.19 0.1 0.14 0.09 0.05 0.14 0.07 0.17 0.07 0.14 0.1 0.11 0.13 0.38 1.0 0.1
0.43 0.45 0.42 0.28 0.37 0.32 0.56 0.34 0.23 0.34 0.26 0.22 0.68 0.56 0.45 0.32 0.31 0.69 0.34 0.34 0.35 0.3 0.44 0.31 1.0 0.47 0.81 0.24
0.12 0.08 0.06 0.19 0.08 0.07 0.32 0.21 0.07 0.87 0.13 0.05 0.11 0.06 0.07 0.09 0.0 0.08 0.07 0.09 0.13 0.04 0.1 0.04 0.1 0.38 1.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.3 0.19 0.14 0.07 0.61 0.07 0.0 0.07 0.17 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.13 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.02 0.2 0.15 0.04 0.04 0.11 0.02 0.05 0.05 0.05 0.05 0.07 0.47 0.0 1.0 0.03
0.0 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.83 0.0
0.08 0.13 0.07 0.05 0.02 0.02 0.05 0.04 0.01 0.11 0.01 0.01 0.21 0.08 0.08 0.02 0.02 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.13 0.01 1.0 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)