1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_125 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.19 0.26 0.44 0.44 0.73 0.34 0.71 0.27 0.76 0.27 0.76 1.0 0.38 0.34 0.35 0.65 0.65 0.41 0.49 0.69 0.47 0.68 0.35 0.82 0.16 0.46 0.33 0.66
0.04 0.14 0.21 0.45 0.18 0.3 0.66 0.22 0.92 0.58 1.0 0.37 0.29 0.15 0.16 0.44 0.35 0.34 0.39 0.61 0.53 0.32 0.36 0.52 0.04 0.16 0.28 0.9
0.11 0.6 0.74 0.5 0.48 0.46 0.85 0.4 0.58 0.54 0.62 0.42 0.77 0.68 0.73 0.88 0.97 0.32 0.39 1.0 0.92 0.79 0.39 0.88 0.34 0.53 0.58 0.61
0.32 0.43 0.62 0.41 0.58 0.87 0.59 0.7 0.43 1.0 0.54 0.57 0.7 0.27 0.22 0.74 0.89 0.57 0.4 0.61 0.79 0.67 0.48 0.59 0.2 0.4 0.3 0.52
0.0 0.0 0.26 0.02 0.08 0.01 0.27 0.1 0.43 0.04 0.52 0.19 0.15 0.04 0.03 0.83 0.93 0.15 0.42 1.0 0.55 0.7 0.86 0.93 0.0 0.0 0.1 0.01
0.03 0.24 0.47 0.4 0.42 0.47 0.45 0.6 1.0 0.7 1.0 0.51 0.22 0.19 0.27 0.63 0.68 0.44 0.4 0.92 0.68 0.81 0.65 0.8 0.05 0.16 0.21 0.77
0.53 0.32 0.58 0.44 0.53 0.38 0.6 0.49 0.58 1.0 0.72 0.55 0.54 0.37 0.35 0.59 0.48 0.36 0.51 0.64 0.5 0.48 0.3 0.48 0.24 0.23 0.37 0.31
0.41 0.42 0.43 0.48 0.33 0.4 0.74 0.55 0.69 0.51 0.91 0.44 0.52 0.44 0.42 0.66 0.59 0.54 0.67 0.82 0.67 0.88 0.25 1.0 0.13 0.38 0.3 0.62
0.04 0.12 0.8 0.3 0.61 0.2 0.83 0.2 0.46 1.0 0.7 0.97 0.33 0.16 0.17 0.32 0.39 0.21 0.37 0.46 0.46 0.49 0.57 0.49 0.23 0.11 0.22 0.13
0.09 0.32 0.72 0.45 0.62 0.39 0.78 0.4 0.68 0.37 0.58 0.64 0.5 0.69 0.64 0.97 0.74 0.68 0.94 0.96 0.99 1.0 0.46 1.0 0.21 0.15 0.85 0.53
0.29 0.5 1.0 0.6 0.61 0.37 0.86 0.43 0.67 0.43 0.77 0.64 0.67 0.45 0.49 0.66 0.83 0.47 0.59 0.81 0.58 0.83 0.56 0.85 0.05 0.13 0.38 0.74
0.25 0.29 0.64 0.66 0.79 0.62 0.76 0.53 0.9 0.61 1.0 0.83 0.78 0.52 0.54 0.8 0.83 0.47 0.55 0.79 0.62 0.79 0.59 0.81 0.15 0.44 0.5 0.68
0.05 0.27 0.91 0.45 0.62 0.54 0.66 0.54 1.0 0.84 0.9 0.85 0.4 0.46 0.43 0.67 0.66 0.35 0.86 0.63 0.74 0.62 0.41 0.6 0.37 0.36 0.49 0.4
0.03 0.13 0.94 0.44 0.52 0.42 0.89 0.46 0.39 0.85 0.56 0.7 0.42 0.26 0.31 0.79 0.66 0.35 0.59 1.0 0.79 0.84 0.67 0.85 0.14 0.16 0.4 0.27
0.15 0.12 0.25 0.34 0.65 1.0 0.52 0.43 0.59 0.76 0.7 0.61 0.34 0.25 0.3 0.56 0.96 0.29 0.31 0.53 0.53 0.62 0.62 0.59 0.07 0.25 0.31 0.71
0.04 0.05 0.43 0.27 0.22 0.25 0.47 0.4 0.27 0.24 0.54 0.46 0.18 0.14 0.15 0.44 0.64 0.27 1.0 0.77 0.63 0.85 0.45 0.81 0.05 0.09 0.25 0.22
0.6 0.5 0.63 0.53 0.53 0.5 0.75 0.37 0.79 0.46 0.73 0.8 0.41 0.71 0.73 0.67 0.72 0.3 1.0 0.68 0.45 0.79 0.64 0.73 0.56 0.52 0.44 0.82
0.15 0.3 0.94 0.54 0.76 0.75 0.9 0.45 0.73 0.63 0.75 1.0 0.75 0.55 0.5 0.85 0.71 0.48 0.97 0.86 0.88 0.9 0.65 0.87 0.22 0.35 0.54 0.79
0.16 0.4 0.7 0.46 0.61 0.58 0.65 0.57 0.66 0.5 0.7 0.72 0.59 0.48 0.46 0.98 0.7 0.41 0.5 0.8 1.0 0.75 0.63 0.86 0.38 0.29 0.4 0.43
0.28 0.46 0.57 0.54 0.6 0.41 0.62 0.45 0.95 0.44 1.0 0.75 0.39 0.48 0.5 0.63 0.59 0.36 0.68 0.69 0.59 0.68 0.8 0.64 0.22 0.27 0.53 0.66
0.14 0.15 0.56 0.31 0.19 0.23 0.45 0.57 1.0 0.57 0.94 0.23 0.27 0.34 0.35 0.51 0.32 0.44 0.52 0.74 0.62 0.57 0.44 0.62 0.08 0.19 0.38 0.26
0.2 0.57 0.52 0.68 0.67 0.55 0.62 0.62 0.97 0.68 1.0 0.89 0.54 0.47 0.48 0.83 0.68 0.56 0.61 0.72 0.82 0.72 0.51 0.78 0.38 0.45 0.41 0.71
0.1 0.22 0.86 0.56 0.57 0.61 1.0 0.37 0.51 0.6 0.53 0.63 0.79 0.44 0.43 0.68 0.62 0.43 0.81 0.71 0.76 0.77 0.41 0.7 0.12 0.3 0.53 0.74
0.06 0.27 0.6 0.57 0.55 0.55 0.62 0.75 0.8 0.68 0.75 0.84 0.7 0.48 0.55 0.7 0.62 0.91 0.81 1.0 0.72 0.99 0.74 0.9 0.24 0.34 0.44 0.7
0.23 0.42 0.8 0.58 0.76 0.6 0.77 0.49 0.91 0.57 1.0 0.93 0.56 0.56 0.58 0.89 0.76 0.58 0.67 0.91 0.79 0.9 0.64 0.94 0.18 0.34 0.65 0.69
0.14 0.1 0.61 0.46 0.82 0.92 0.6 0.96 0.74 1.0 0.83 0.69 0.45 0.39 0.42 0.99 0.79 0.46 0.58 0.88 1.0 0.95 0.55 0.93 0.11 0.36 0.41 0.68
0.05 0.22 0.74 0.47 0.59 0.59 1.0 0.52 0.74 0.69 0.87 0.67 0.62 0.38 0.39 0.75 0.64 0.3 0.61 0.72 0.75 0.73 0.42 0.73 0.14 0.37 0.43 0.47
0.04 0.03 0.96 0.25 0.48 0.4 0.5 0.38 0.54 0.55 0.55 0.59 0.32 0.22 0.23 0.84 1.0 0.17 0.52 0.83 0.85 0.76 0.86 0.83 0.1 0.01 0.25 0.19
0.27 0.15 0.83 0.5 0.45 0.55 1.0 0.48 0.63 0.43 0.66 0.54 0.54 0.28 0.33 0.54 0.49 0.43 0.45 0.61 0.53 0.66 0.45 0.54 0.1 0.43 0.35 0.49
0.01 0.11 0.26 0.34 0.29 0.16 0.21 0.44 0.58 1.0 0.77 0.34 0.32 0.4 0.36 0.32 0.39 0.13 0.18 0.39 0.29 0.32 0.13 0.28 0.31 0.09 0.29 0.21
0.12 0.35 0.64 0.48 0.66 0.59 0.71 0.54 0.81 1.0 0.85 0.79 0.69 0.43 0.42 0.89 0.92 0.48 0.62 0.93 0.79 0.92 0.44 0.9 0.25 0.42 0.4 0.57
0.03 0.15 0.49 0.42 0.44 0.3 0.55 0.49 0.91 0.52 1.0 0.6 0.34 0.41 0.42 0.87 0.63 0.33 0.59 0.83 0.77 0.75 0.35 0.83 0.07 0.24 0.34 0.51
0.14 0.31 0.95 0.56 0.69 0.5 1.0 0.33 0.72 0.5 0.78 0.61 0.7 0.4 0.41 0.69 0.65 0.64 0.74 0.75 0.58 0.77 0.49 0.71 0.32 0.61 0.52 0.77
0.13 0.39 0.73 0.54 0.68 0.55 1.0 0.43 0.62 0.61 0.66 0.77 0.7 0.48 0.48 0.77 0.69 0.46 0.4 0.69 0.64 0.7 0.46 0.67 0.22 0.46 0.42 0.57
0.09 0.46 0.67 0.54 0.44 0.41 0.74 0.4 0.58 0.75 0.7 0.45 0.42 0.34 0.33 0.99 0.94 0.33 0.64 0.81 0.86 0.84 0.48 0.92 0.12 0.21 0.3 1.0
0.18 0.33 0.65 0.54 0.64 0.53 1.0 0.36 0.67 0.5 0.62 0.73 0.71 0.37 0.4 0.67 0.55 0.31 0.3 0.73 0.57 0.63 0.39 0.65 0.24 0.45 0.35 0.74
0.08 0.25 0.73 0.52 0.49 0.25 0.5 0.57 0.7 1.0 0.94 0.52 0.44 0.6 0.58 0.93 0.69 0.29 0.76 0.95 0.82 0.77 0.42 0.79 0.31 0.49 0.52 0.29
0.01 0.03 0.37 0.2 0.33 0.2 0.64 0.2 0.61 1.0 0.86 0.34 0.42 0.23 0.25 0.4 0.37 0.35 0.47 0.44 0.5 0.42 0.38 0.38 0.02 0.03 0.16 0.24
0.53 0.34 0.78 0.36 0.38 0.39 0.48 0.34 0.94 0.35 0.75 0.42 0.38 0.31 0.31 0.77 0.94 0.31 0.71 1.0 0.81 0.96 0.38 0.95 0.19 0.41 0.32 0.4
0.06 0.35 0.65 0.43 0.48 0.39 0.48 0.54 1.0 0.49 0.95 0.51 0.23 0.28 0.27 0.52 0.38 0.71 0.43 0.61 0.42 0.57 0.32 0.67 0.05 0.25 0.33 0.53
0.27 0.25 0.66 0.57 0.72 0.45 0.71 0.42 0.82 0.49 1.0 0.88 0.62 0.38 0.4 0.89 0.85 0.31 0.39 0.84 0.75 0.79 0.53 0.86 0.15 0.25 0.36 0.53
0.06 0.03 0.6 0.31 0.8 0.6 0.23 0.49 0.88 0.84 0.86 0.8 0.11 0.36 0.33 0.95 1.0 0.47 0.64 0.84 0.96 0.73 0.55 0.68 0.17 0.08 0.47 0.2
0.28 0.61 0.57 0.47 0.63 0.53 0.67 0.57 0.97 0.55 1.0 0.8 0.47 0.58 0.62 0.7 0.69 0.43 0.93 0.87 0.67 0.85 0.76 0.86 0.3 0.27 0.45 0.57
0.02 0.11 0.89 0.38 0.52 0.4 0.62 0.62 0.67 0.93 0.85 0.78 0.3 0.35 0.39 0.61 0.56 0.22 0.58 1.0 0.57 0.7 0.88 0.77 0.14 0.16 0.57 0.33
0.1 0.13 0.34 0.25 0.25 0.12 0.41 0.31 0.88 0.42 1.0 0.47 0.24 0.23 0.27 0.68 0.48 0.26 0.44 0.7 0.79 0.69 0.4 0.77 0.15 0.08 0.23 0.4
0.01 0.02 0.35 0.08 0.31 0.06 0.45 0.09 0.27 1.0 0.54 0.45 0.2 0.06 0.05 0.35 0.31 0.32 0.26 0.92 0.36 0.34 0.45 0.39 0.08 0.03 0.1 0.08
0.01 0.01 0.39 0.22 0.2 0.15 0.62 0.36 1.0 0.61 0.85 0.35 0.24 0.15 0.14 0.45 0.28 0.29 0.36 0.61 0.4 0.55 0.33 0.47 0.0 0.16 0.3 0.37
0.27 0.59 0.62 0.62 0.8 0.52 1.0 0.44 0.94 0.59 0.87 0.71 0.61 0.64 0.66 0.83 0.77 0.68 0.62 0.76 0.63 0.79 0.59 0.75 0.23 0.4 0.63 0.97

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)