Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.06 0.15 1.0 0.41 0.47 0.6 0.7 0.28 0.52 0.35 0.54 0.56 0.37 0.34 0.35 0.49 0.38 0.28 0.38 0.59 0.45 0.58 0.39 0.53 0.12 0.38 0.31 0.32
0.05 0.52 0.77 0.73 0.72 0.61 0.75 0.3 0.64 0.58 0.84 0.9 0.53 0.6 0.58 0.95 0.77 0.5 0.9 0.96 0.89 0.89 0.48 1.0 0.5 0.98 0.66 0.95
0.1 0.14 0.83 0.48 0.5 0.39 0.53 0.18 0.41 0.34 0.4 0.48 0.4 0.66 0.63 0.53 0.49 0.79 0.81 0.68 0.52 0.61 0.41 0.51 0.12 1.0 0.83 0.8
0.13 0.34 1.0 0.52 0.53 0.62 0.83 0.44 0.49 0.56 0.53 0.56 0.64 0.74 0.66 0.7 0.53 0.32 0.84 0.82 0.79 0.67 0.45 0.67 0.49 0.5 0.94 0.52
0.12 0.32 0.87 0.56 0.63 0.59 1.0 0.32 0.57 0.54 0.59 0.66 0.64 0.66 0.58 0.75 0.6 0.59 0.53 0.85 0.75 0.77 0.42 0.72 0.29 0.43 0.82 0.66
0.05 0.55 0.67 0.72 0.9 0.68 0.71 0.41 0.79 0.68 0.89 1.0 0.71 0.66 0.63 0.8 0.76 0.72 0.95 0.85 0.74 0.91 0.42 0.8 0.25 0.5 0.59 0.79
0.25 0.21 0.77 0.51 0.56 0.65 0.73 0.16 0.55 0.41 0.53 0.92 0.72 0.66 0.6 0.27 0.61 0.47 0.19 0.55 0.34 0.53 0.34 0.37 0.56 1.0 0.71 0.6
0.21 0.4 1.0 0.65 0.57 0.4 0.94 0.23 0.45 0.38 0.46 0.53 0.74 0.49 0.47 0.76 0.77 0.71 0.42 0.91 0.77 0.9 0.32 0.74 0.39 0.63 0.44 0.86
0.1 0.38 0.83 0.57 0.5 0.39 0.76 0.32 0.58 0.42 0.62 0.57 0.6 0.57 0.63 1.0 0.76 0.81 0.97 0.83 0.84 0.83 0.49 0.74 0.19 0.53 0.56 0.84
0.14 0.5 0.96 0.73 0.77 0.47 0.75 0.41 0.64 0.81 0.75 0.79 0.77 0.67 0.66 0.8 0.85 0.49 0.39 1.0 0.88 0.95 0.56 0.82 0.4 0.77 0.6 0.88
0.1 0.38 0.93 0.55 0.86 0.65 0.82 0.24 0.62 0.48 0.57 1.0 0.77 0.79 0.68 0.5 0.65 0.39 0.37 0.66 0.4 0.62 0.42 0.45 0.24 0.83 0.76 0.72
0.07 0.13 1.0 0.43 0.51 0.34 0.73 0.22 0.54 0.46 0.52 0.65 0.52 0.59 0.52 0.39 0.4 0.28 0.34 0.48 0.38 0.48 0.27 0.44 0.14 0.43 0.56 0.48
0.0 0.47 1.0 0.48 0.57 0.73 0.85 0.71 0.38 0.4 0.36 0.67 0.69 0.48 0.51 0.54 0.6 0.4 0.88 0.63 0.67 0.6 0.52 0.6 0.3 0.55 0.46 0.57
0.06 0.35 0.82 0.6 0.8 0.58 0.93 0.38 0.67 0.57 0.65 1.0 0.88 0.78 0.7 0.54 0.65 0.4 0.32 0.68 0.45 0.67 0.44 0.54 0.25 0.44 0.69 0.76
0.14 0.24 0.9 0.65 0.73 0.48 0.75 0.22 0.67 0.59 0.7 1.0 0.69 0.78 0.69 0.8 0.69 0.74 0.8 0.9 0.76 0.72 0.39 0.66 0.18 0.65 0.68 0.95
0.07 0.2 0.66 0.46 0.45 0.75 0.97 0.4 0.28 0.36 0.34 0.36 0.49 0.39 0.38 1.0 0.81 0.42 0.63 0.93 0.9 0.92 0.45 0.91 0.23 0.51 0.48 0.75
0.08 0.32 0.76 0.7 0.79 0.68 0.71 0.55 0.79 0.74 0.84 1.0 0.64 0.64 0.6 0.78 0.9 0.56 0.94 0.89 0.76 0.83 0.56 0.74 0.28 0.37 0.68 0.98
0.04 0.19 0.56 0.26 0.74 0.88 0.28 0.31 0.38 0.3 0.34 0.86 0.38 0.45 0.6 0.62 0.69 0.7 0.33 0.67 0.43 0.64 0.62 0.47 0.21 1.0 0.37 0.66
0.03 0.2 0.6 0.74 0.51 0.3 0.51 0.18 0.44 0.25 0.48 0.6 0.53 0.45 0.44 0.85 0.92 0.3 0.48 0.82 0.81 0.95 0.55 0.81 0.22 0.66 0.38 1.0
0.19 0.37 1.0 0.6 0.62 0.69 0.88 0.49 0.6 0.54 0.65 0.69 0.53 0.67 0.61 0.69 0.71 0.55 0.48 0.82 0.67 0.84 0.52 0.75 0.35 0.6 0.76 0.69
0.02 0.1 0.76 0.52 0.48 0.7 0.52 0.45 0.52 0.42 0.62 0.45 0.37 0.53 0.46 0.6 0.5 0.38 1.0 0.71 0.62 0.66 0.42 0.61 0.16 0.2 0.53 0.56
0.04 0.08 0.56 0.39 0.46 0.48 0.39 0.26 0.49 0.72 0.42 0.51 0.55 0.37 0.36 0.32 0.32 0.47 0.51 0.55 0.37 0.31 0.45 0.39 0.22 1.0 0.32 0.7
0.07 0.37 0.86 0.68 0.69 0.43 0.91 0.23 0.54 0.37 0.59 0.71 0.59 0.53 0.51 0.87 0.61 0.35 0.54 0.89 0.7 0.77 0.35 0.72 0.22 0.63 0.52 1.0
0.09 0.3 0.6 0.73 0.7 0.6 0.58 0.44 0.67 0.59 0.8 0.82 0.42 0.61 0.53 0.87 0.65 0.37 0.52 1.0 0.95 0.83 0.54 0.89 0.14 0.61 0.57 0.85
0.02 0.14 0.67 0.58 0.41 0.17 0.49 0.22 0.6 0.27 0.49 0.45 0.47 0.45 0.4 0.78 0.59 0.2 0.36 0.8 0.75 0.82 0.57 1.0 0.06 0.85 0.41 0.91
0.05 0.17 1.0 0.38 0.51 0.33 0.78 0.29 0.65 0.5 0.68 0.67 0.48 0.56 0.48 0.47 0.41 0.29 0.38 0.5 0.46 0.46 0.36 0.47 0.12 0.3 0.56 0.41
0.05 0.14 0.6 0.51 0.44 0.51 0.67 0.18 0.57 0.25 0.59 0.52 0.32 0.3 0.32 1.0 0.86 0.24 0.71 0.93 0.82 0.87 0.36 0.91 0.09 0.2 0.3 0.69
0.02 0.09 1.0 0.49 0.5 0.42 0.65 0.27 0.45 0.31 0.46 0.58 0.5 0.31 0.32 0.49 0.45 0.29 0.59 0.62 0.51 0.59 0.45 0.55 0.14 0.58 0.41 0.5
0.22 0.42 0.71 0.61 0.59 0.44 0.68 0.33 0.8 0.52 0.77 0.8 0.51 0.57 0.63 1.0 0.78 0.55 0.67 1.0 0.93 0.9 0.72 0.83 0.24 0.73 0.58 0.93
0.13 0.29 0.67 0.63 0.75 0.61 0.56 0.46 0.6 0.47 0.74 0.8 0.46 0.52 0.6 0.78 0.65 0.46 0.71 0.8 0.74 0.81 0.58 0.78 0.25 1.0 0.44 0.61
0.06 0.07 0.4 0.28 0.47 0.88 0.27 0.18 0.34 0.53 0.34 0.29 0.17 0.26 0.33 0.86 0.69 0.35 0.4 0.81 0.67 0.7 0.33 0.9 0.09 1.0 0.3 0.45
0.19 0.72 0.84 0.59 0.53 0.55 0.53 0.29 0.62 0.34 0.77 0.79 0.33 0.47 0.51 1.0 0.7 0.51 0.7 0.9 0.84 0.93 0.39 0.89 0.61 0.93 0.37 0.47
0.15 0.34 1.0 0.49 0.4 0.42 0.9 0.44 0.55 0.44 0.58 0.4 0.63 0.49 0.43 0.52 0.58 0.29 0.42 0.62 0.55 0.64 0.42 0.63 0.27 0.44 0.61 0.53
0.1 0.15 1.0 0.68 0.48 0.49 0.89 0.33 0.49 0.48 0.5 0.48 0.65 0.47 0.44 0.72 0.81 0.48 0.66 0.89 0.8 0.92 0.39 0.78 0.16 0.39 0.46 0.67
0.05 0.34 0.95 0.69 0.77 0.68 0.88 0.41 0.86 0.65 0.85 1.0 0.67 0.83 0.74 0.66 0.58 0.91 0.69 0.85 0.71 0.74 0.5 0.66 0.32 0.49 0.84 0.85
0.33 0.63 0.7 0.59 0.65 0.78 0.92 0.53 0.46 0.56 0.49 0.56 0.63 0.65 0.61 0.93 0.72 0.57 1.0 0.91 0.95 0.81 0.53 0.78 0.76 0.96 0.67 0.86
0.14 0.63 0.54 0.28 0.19 0.4 0.48 0.45 0.47 0.42 0.55 0.13 0.33 0.25 0.28 0.74 0.72 0.47 0.36 1.0 0.7 0.98 0.48 0.78 0.14 0.43 0.23 0.63
0.08 0.37 0.7 0.7 0.73 0.52 0.66 0.38 1.0 0.68 1.0 0.96 0.87 0.85 0.82 0.8 0.82 0.71 0.89 0.82 0.89 0.85 0.46 0.85 0.13 0.66 0.8 0.99
0.57 0.42 0.52 0.54 0.4 0.39 0.69 0.39 0.51 0.45 0.56 0.5 0.57 0.48 0.46 1.0 0.69 0.22 0.64 0.86 0.97 0.82 0.42 0.81 0.32 0.57 0.46 0.61
0.14 0.11 1.0 0.36 0.39 0.41 0.61 0.19 0.53 0.24 0.52 0.56 0.41 0.24 0.25 0.49 0.47 0.27 0.38 0.64 0.59 0.69 0.32 0.59 0.06 0.47 0.31 0.44
0.02 0.21 0.66 0.53 0.59 0.45 0.67 0.22 0.64 0.45 0.64 0.75 0.56 0.59 0.59 0.65 0.57 1.0 0.96 0.68 0.66 0.65 0.48 0.69 0.2 0.52 0.49 0.74
0.15 0.23 1.0 0.58 0.6 0.44 0.95 0.28 0.52 0.43 0.53 0.65 0.65 0.58 0.5 0.6 0.5 0.55 0.62 0.78 0.57 0.73 0.3 0.67 0.36 0.5 0.61 0.67
0.01 0.12 0.62 0.46 0.43 0.31 0.37 0.35 0.74 0.48 0.84 0.57 0.39 0.62 0.58 0.77 0.56 0.4 1.0 0.83 0.89 0.7 0.43 0.83 0.1 0.65 0.49 0.47
0.34 0.27 0.71 0.55 0.52 0.39 0.77 0.37 0.52 0.42 0.52 0.49 0.77 0.63 0.64 1.0 0.84 0.67 0.9 0.91 0.77 0.85 0.78 0.89 0.5 0.65 0.61 0.79
0.15 0.24 0.91 0.62 0.75 0.48 0.91 0.28 0.74 0.54 0.73 0.85 1.0 0.83 0.79 0.61 0.66 0.47 0.37 0.88 0.69 0.69 0.53 0.62 0.24 0.74 0.87 0.76
0.06 0.48 0.93 0.5 0.63 0.62 0.82 0.46 0.7 0.42 0.74 0.81 0.58 0.86 0.84 0.74 0.61 0.5 0.92 0.94 0.78 1.0 0.6 0.88 0.2 0.3 0.68 0.72
0.04 0.29 1.0 0.58 0.64 0.44 0.81 0.37 0.86 0.49 0.86 0.79 0.46 0.95 0.93 0.82 0.7 0.5 0.8 0.87 0.72 0.82 0.43 0.9 0.25 0.51 0.84 0.8
0.09 0.41 0.6 0.62 0.49 0.65 0.62 0.35 0.4 0.44 0.44 0.47 0.54 0.54 0.5 0.57 0.66 0.4 1.0 0.75 0.68 0.77 0.38 0.65 0.49 0.76 0.47 0.98
0.05 0.06 1.0 0.7 0.59 0.41 0.7 0.27 0.73 0.39 0.72 0.79 0.51 0.5 0.5 0.89 0.83 0.43 0.64 0.96 0.67 0.89 0.47 0.88 0.13 0.64 0.47 0.87
0.11 0.39 0.79 0.66 0.77 0.62 1.0 0.37 0.7 0.6 0.76 0.9 0.81 0.72 0.66 0.83 0.74 0.44 0.67 0.83 0.73 0.75 0.47 0.78 0.4 0.59 0.66 0.77
0.14 0.21 0.8 0.47 0.45 0.64 0.82 0.53 0.39 0.38 0.49 0.53 0.35 0.41 0.43 0.73 0.86 0.29 0.82 1.0 0.76 0.95 0.63 0.9 0.26 0.77 0.43 0.78
0.38 0.49 1.0 0.65 0.87 0.96 0.91 0.64 0.77 0.73 0.78 0.89 0.65 0.8 0.75 0.66 0.58 0.39 0.33 0.77 0.65 0.68 0.67 0.68 0.47 0.47 1.0 0.67
0.11 0.31 0.51 0.55 0.64 0.38 0.61 0.21 0.49 0.39 0.47 0.81 0.7 0.7 0.66 0.37 0.46 0.29 0.24 0.45 0.37 0.51 0.37 0.39 0.3 1.0 0.61 0.87
0.05 0.26 1.0 0.51 0.75 0.72 0.88 0.4 0.6 0.66 0.66 0.86 0.76 0.62 0.53 0.47 0.4 0.39 0.4 0.56 0.49 0.54 0.4 0.5 0.16 0.45 0.61 0.52
0.13 0.18 0.97 0.66 0.58 0.43 0.78 0.27 0.56 0.51 0.56 0.66 0.62 0.6 0.56 0.65 0.65 0.34 0.39 0.79 0.63 0.75 0.33 0.67 0.18 0.57 0.54 1.0
0.04 0.19 0.66 0.64 0.61 0.34 0.61 0.25 0.71 0.56 0.71 0.68 0.5 0.54 0.51 0.73 0.56 0.56 1.0 0.73 0.65 0.66 0.33 0.64 0.09 0.47 0.51 0.84
0.04 0.13 1.0 0.38 0.23 0.25 0.58 0.3 0.49 0.32 0.5 0.33 0.45 0.47 0.4 0.55 0.56 0.41 0.34 0.47 0.6 0.43 0.75 0.5 0.2 0.37 0.64 0.33
0.18 0.31 0.82 0.66 0.46 0.51 0.79 0.29 0.48 0.36 0.52 0.48 0.72 0.64 0.61 0.72 0.8 0.78 1.0 0.77 0.72 0.78 0.54 0.74 0.27 0.98 0.66 0.81
0.05 0.22 1.0 0.69 0.63 0.49 0.87 0.27 0.56 0.58 0.61 0.74 0.89 0.83 0.7 0.55 0.51 0.36 0.36 0.67 0.6 0.6 0.47 0.5 0.28 0.76 0.64 0.74
0.14 0.32 1.0 0.58 0.53 0.36 0.63 0.44 0.72 0.33 0.69 0.53 0.42 0.4 0.58 0.5 0.34 0.41 0.45 0.65 0.6 0.73 0.42 0.68 0.14 0.65 0.53 0.54
0.06 0.19 1.0 0.54 0.38 0.43 0.67 0.27 0.44 0.38 0.51 0.4 0.62 0.54 0.53 0.66 0.6 0.33 0.57 0.84 0.85 0.76 0.39 0.75 0.3 0.63 0.44 0.7
0.3 0.17 1.0 0.4 0.37 0.28 0.85 0.25 0.85 0.37 0.59 0.6 0.5 0.44 0.47 0.45 0.42 0.29 0.34 0.54 0.36 0.53 0.44 0.38 0.2 0.38 0.49 0.47
0.14 0.54 0.7 0.63 0.79 0.74 0.65 0.42 0.92 0.63 0.87 1.0 0.62 0.75 0.7 0.62 0.68 0.46 0.44 0.69 0.57 0.69 0.46 0.6 0.87 0.9 0.66 0.99
0.06 0.12 0.92 0.72 0.58 0.52 0.76 0.39 0.67 0.55 0.65 0.54 0.68 0.78 0.78 0.77 0.67 0.61 0.95 1.0 0.88 0.91 0.52 0.84 0.24 0.67 0.81 0.88
0.15 0.27 0.49 0.6 0.58 0.48 0.51 0.23 0.62 0.28 0.57 1.0 0.43 0.49 0.6 0.74 0.63 0.46 0.6 0.81 0.72 0.77 0.69 0.75 0.24 0.81 0.39 0.9
0.06 0.45 0.76 0.68 0.92 0.76 0.93 0.33 0.67 0.55 0.82 1.0 0.71 0.58 0.54 0.94 0.79 0.5 0.87 0.9 0.82 0.79 0.52 0.92 0.39 0.88 0.73 0.86
0.16 0.4 1.0 0.56 0.67 0.74 0.81 0.56 0.59 0.53 0.65 0.62 0.75 0.78 0.7 0.7 0.61 0.63 0.98 0.86 0.72 0.84 0.52 0.83 0.35 0.51 0.81 0.6
0.11 0.25 1.0 0.54 0.7 0.52 0.69 0.37 0.66 0.53 0.71 0.78 0.6 0.54 0.57 0.81 0.7 0.38 0.55 0.89 0.67 0.77 0.48 0.71 0.22 0.49 0.6 0.71
0.06 0.24 1.0 0.59 0.81 0.68 0.95 0.35 0.7 0.57 0.71 0.95 0.7 0.6 0.57 0.71 0.66 0.52 0.7 0.87 0.66 0.75 0.49 0.66 0.22 0.5 0.66 0.78

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)