Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.14 0.01 0.04 0.06 0.02 0.03 0.1 0.27 1.0 0.29 0.06 0.01 0.02 0.03 0.05 0.01 0.39 0.03 0.07 0.05 0.05 0.03 0.05 0.02 0.0 0.02 0.07
0.0 0.01 0.35 0.03 0.45 0.38 0.27 0.55 0.52 1.0 0.78 0.46 0.36 0.26 0.23 0.06 0.07 0.2 0.06 0.08 0.08 0.08 0.09 0.07 0.14 0.01 0.19 0.05
0.06 0.04 0.35 0.08 0.25 0.18 0.31 0.31 0.31 1.0 0.6 0.38 0.27 0.14 0.12 0.1 0.04 0.51 0.26 0.21 0.15 0.11 0.47 0.13 0.06 0.21 0.09 0.02
0.04 0.08 0.01 0.02 0.42 0.3 0.07 0.39 0.89 1.0 0.97 0.62 0.11 0.47 0.42 0.03 0.04 0.2 0.04 0.07 0.04 0.05 0.15 0.04 0.07 0.41 0.32 0.1
0.0 0.01 0.12 0.04 0.12 0.03 0.08 0.17 0.39 1.0 0.43 0.16 0.16 0.03 0.03 0.07 0.09 0.22 0.03 0.11 0.1 0.08 0.06 0.08 0.01 0.02 0.02 0.12
0.01 0.04 0.11 0.06 0.05 0.04 0.07 0.14 0.37 1.0 0.37 0.09 0.06 0.15 0.16 0.13 0.1 0.06 0.17 0.3 0.17 0.15 0.01 0.17 0.03 0.05 0.26 0.19
0.0 0.02 0.36 0.21 0.43 0.28 0.27 0.36 0.51 1.0 0.71 0.75 0.31 0.23 0.23 0.17 0.23 0.4 0.34 0.3 0.18 0.23 0.21 0.2 0.03 0.02 0.2 0.19
0.0 0.02 0.04 0.02 0.03 0.01 0.04 0.09 0.33 1.0 0.49 0.07 0.01 0.03 0.01 0.03 0.05 0.06 0.03 0.07 0.04 0.03 0.17 0.06 0.01 0.0 0.04 0.0
0.01 0.01 0.06 0.11 0.14 0.07 0.1 0.16 0.41 1.0 0.8 0.51 0.09 0.13 0.11 0.04 0.09 0.11 0.03 0.04 0.05 0.05 0.27 0.05 0.01 0.0 0.13 0.22
0.0 0.0 0.14 0.03 0.18 0.08 0.15 0.27 0.18 1.0 0.24 0.25 0.17 0.02 0.01 0.07 0.07 0.24 0.05 0.12 0.07 0.07 0.16 0.09 0.0 0.0 0.03 0.03
0.0 0.0 0.36 0.22 0.17 0.15 0.18 0.32 0.39 1.0 0.53 0.15 0.38 0.01 0.02 0.15 0.13 0.11 0.14 0.2 0.17 0.15 0.19 0.17 0.0 0.01 0.03 0.14
0.0 0.03 0.27 0.01 0.21 0.08 0.39 0.31 0.26 1.0 0.27 0.14 0.63 0.02 0.03 0.02 0.02 0.24 0.03 0.06 0.03 0.02 0.14 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.38 0.03 0.28 0.09 0.4 0.22 0.45 1.0 0.48 0.36 0.43 0.02 0.03 0.07 0.08 0.43 0.05 0.12 0.07 0.06 0.22 0.07 0.0 0.0 0.05 0.06
0.0 0.01 0.2 0.03 0.1 0.06 0.23 0.23 0.65 1.0 0.9 0.28 0.19 0.02 0.02 0.13 0.15 0.11 0.18 0.12 0.16 0.15 0.17 0.16 0.0 0.01 0.02 0.09
0.0 0.01 0.28 0.03 0.26 0.13 0.38 0.12 0.28 1.0 0.29 0.36 0.55 0.04 0.04 0.06 0.08 0.39 0.05 0.17 0.07 0.07 0.33 0.07 0.01 0.01 0.12 0.07
0.01 0.01 0.19 0.08 0.12 0.04 0.09 0.21 0.44 1.0 0.52 0.12 0.12 0.05 0.04 0.16 0.22 0.34 0.14 0.27 0.18 0.19 0.23 0.18 0.0 0.01 0.05 0.11
0.0 0.15 0.1 0.08 0.13 0.08 0.14 0.34 0.85 0.53 0.84 0.43 0.24 0.15 0.19 0.22 0.15 0.36 0.17 0.2 0.26 0.32 0.07 0.26 1.0 0.35 0.03 0.07
0.28 0.19 0.48 0.16 0.31 0.15 0.34 0.22 0.57 1.0 0.71 0.38 0.22 0.3 0.28 0.28 0.26 0.27 0.16 0.35 0.36 0.31 0.22 0.3 0.19 0.15 0.31 0.18
0.02 0.02 0.08 0.11 0.08 0.2 0.12 0.16 0.06 1.0 0.05 0.04 0.14 0.05 0.04 0.12 0.12 0.09 0.06 0.09 0.36 0.11 0.06 0.09 0.01 0.13 0.05 0.24
0.02 0.08 0.03 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.3 1.0 0.7 0.01 0.08 0.05 0.04 0.02 0.0 0.05 0.02 0.04 0.04 0.0 0.03 0.0 0.01 0.42 0.04 0.1
0.0 0.01 0.12 0.08 0.15 0.05 0.05 0.12 0.33 1.0 0.52 0.23 0.11 0.01 0.01 0.1 0.12 0.47 0.04 0.14 0.08 0.1 0.03 0.08 0.0 0.01 0.01 0.07
0.01 0.05 0.09 0.02 0.09 0.02 0.1 0.13 0.37 1.0 0.49 0.09 0.26 0.09 0.09 0.06 0.06 0.74 0.04 0.1 0.08 0.07 0.06 0.07 0.07 0.0 0.08 0.03
0.04 0.07 0.43 0.13 0.5 0.3 0.25 0.41 0.9 0.99 1.0 0.71 0.23 0.14 0.14 0.22 0.4 0.23 0.16 0.3 0.23 0.32 0.23 0.29 0.08 0.1 0.14 0.31
0.18 0.07 0.37 0.05 0.53 0.4 0.33 0.58 0.58 1.0 0.84 0.62 0.47 0.3 0.25 0.11 0.11 0.25 0.09 0.15 0.14 0.14 0.12 0.14 0.02 0.05 0.23 0.09
0.01 0.01 0.16 0.0 0.41 0.27 0.14 0.53 0.42 1.0 0.76 0.66 0.24 0.14 0.13 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.09 0.01 0.01 0.01 0.08 0.01
0.02 0.07 0.44 0.07 0.69 0.54 0.32 0.59 0.64 1.0 0.88 0.78 0.46 0.54 0.51 0.21 0.3 0.51 0.31 0.27 0.21 0.27 0.16 0.28 0.1 0.08 0.44 0.15
0.01 0.0 0.02 0.03 0.1 0.03 0.02 0.06 0.27 1.0 0.34 0.12 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.14 0.04 0.08 0.03 0.03 0.02 0.04 0.01 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.18 0.01 0.12 0.03 0.17 0.28 0.24 1.0 0.29 0.21 0.34 0.02 0.02 0.02 0.02 0.14 0.01 0.05 0.02 0.03 0.26 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01
0.02 0.03 0.26 0.04 0.23 0.09 0.27 0.17 0.38 1.0 0.54 0.22 0.23 0.08 0.07 0.1 0.08 0.17 0.04 0.16 0.09 0.12 0.14 0.07 0.06 0.04 0.12 0.04
0.0 0.01 0.45 0.14 0.51 0.17 0.2 0.49 1.0 0.94 0.93 0.76 0.2 0.1 0.11 0.21 0.34 0.43 0.21 0.29 0.21 0.3 0.18 0.27 0.05 0.17 0.11 0.19
0.1 0.12 0.35 0.1 0.42 0.31 0.28 0.21 0.47 1.0 0.68 0.77 0.26 0.2 0.21 0.22 0.28 0.28 0.17 0.36 0.3 0.32 0.35 0.28 0.06 0.09 0.2 0.11
0.02 0.07 0.27 0.35 0.46 0.35 0.21 0.49 0.76 1.0 0.97 0.56 0.28 0.33 0.35 0.31 0.44 0.16 0.17 0.39 0.27 0.33 0.22 0.33 0.11 0.14 0.22 0.3
0.21 0.5 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 1.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.16 0.0 0.33 0.09 0.15 0.12 0.1 0.0 0.0
0.01 0.06 0.12 0.06 0.1 0.17 0.13 0.09 0.45 1.0 0.5 0.17 0.07 0.29 0.18 0.05 0.05 0.14 0.05 0.2 0.04 0.12 0.09 0.09 0.01 0.03 0.12 0.13
0.01 0.02 0.03 0.03 0.41 0.23 0.18 0.03 0.63 1.0 0.75 0.52 0.29 0.22 0.16 0.08 0.11 0.14 0.14 0.08 0.0 0.06 0.08 0.03 0.03 0.04 0.18 0.04
0.02 0.17 0.31 0.27 0.66 0.43 0.29 0.42 0.85 1.0 0.96 0.94 0.46 0.95 0.82 0.17 0.17 0.24 0.1 0.19 0.14 0.16 0.16 0.19 0.64 0.21 0.66 0.15
0.17 0.15 0.94 0.11 0.62 0.37 0.67 0.4 0.83 0.72 0.8 0.85 0.76 1.0 0.97 0.13 0.15 0.48 0.14 0.16 0.14 0.15 0.32 0.13 0.5 0.13 0.68 0.18
0.01 0.03 0.25 0.06 0.38 0.3 0.24 0.48 0.48 1.0 0.54 0.46 0.29 0.31 0.33 0.06 0.09 0.23 0.07 0.09 0.1 0.08 0.17 0.09 0.01 0.08 0.29 0.07
0.01 0.19 0.53 0.12 0.4 0.25 0.24 0.22 0.55 1.0 0.66 0.49 0.28 0.46 0.41 0.09 0.1 0.74 0.07 0.22 0.12 0.17 0.25 0.1 0.11 0.24 0.31 0.13
0.02 0.07 0.13 0.05 0.05 0.0 0.05 0.01 0.21 0.42 0.41 0.11 0.02 0.25 0.28 0.04 0.02 0.03 0.13 0.09 0.02 0.08 1.0 0.09 0.65 0.05 0.18 0.01
0.01 0.01 0.1 0.12 0.05 0.04 0.18 0.22 0.11 1.0 0.21 0.1 0.11 0.03 0.04 0.07 0.08 0.11 0.02 0.05 0.17 0.05 0.24 0.04 0.01 0.02 0.05 0.29
0.01 0.06 0.4 0.18 0.29 0.08 0.42 0.5 0.72 1.0 0.79 0.45 0.2 0.18 0.19 0.17 0.17 0.27 0.15 0.18 0.13 0.16 0.32 0.15 0.08 0.11 0.18 0.13
0.05 0.07 0.27 0.13 0.34 0.14 0.23 0.25 0.38 1.0 0.48 0.55 0.24 0.2 0.2 0.24 0.27 0.24 0.12 0.43 0.27 0.32 0.42 0.26 0.09 0.21 0.18 0.18
0.1 0.09 0.4 0.1 0.34 0.14 0.29 0.33 0.69 1.0 0.7 0.31 0.29 0.16 0.16 0.32 0.4 0.37 0.25 0.48 0.4 0.39 0.25 0.43 0.05 0.33 0.14 0.24
0.08 0.16 0.46 0.15 0.56 0.39 0.35 0.6 0.83 1.0 0.81 0.49 0.31 0.45 0.4 0.26 0.35 0.28 0.12 0.35 0.29 0.32 0.26 0.25 0.14 0.91 0.38 0.23
0.07 0.06 0.29 0.2 0.25 0.19 0.16 0.29 0.48 1.0 0.77 0.43 0.08 0.21 0.22 0.26 0.31 0.3 0.17 0.48 0.31 0.45 0.24 0.32 0.07 0.35 0.19 0.24
0.02 0.09 0.24 0.21 0.18 0.04 0.17 0.17 0.64 1.0 0.93 0.24 0.18 0.23 0.25 0.41 0.34 0.46 0.17 0.32 0.33 0.4 0.27 0.28 0.12 0.08 0.27 0.18
0.01 0.03 0.38 0.31 0.47 0.21 0.33 0.25 0.46 1.0 0.69 0.81 0.29 0.11 0.15 0.18 0.21 0.35 0.29 0.3 0.21 0.27 0.38 0.24 0.03 0.06 0.16 0.24
0.0 0.0 0.13 0.01 0.14 0.06 0.36 0.12 0.2 1.0 0.28 0.18 0.51 0.01 0.01 0.02 0.03 0.21 0.01 0.04 0.02 0.02 0.1 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.01 0.16 0.14 0.18 0.11 0.28 0.26 0.29 1.0 0.34 0.28 0.48 0.0 0.01 0.04 0.02 0.17 0.03 0.05 0.04 0.03 0.05 0.03 0.0 0.0 0.01 0.03
0.02 0.07 0.08 0.02 0.34 0.24 0.27 0.37 0.51 1.0 0.7 0.38 0.35 0.39 0.47 0.03 0.04 0.89 0.06 0.03 0.03 0.04 0.05 0.04 0.01 0.05 0.1 0.03
0.0 0.05 0.14 0.05 0.1 0.03 0.1 0.17 0.52 1.0 0.59 0.12 0.15 0.12 0.15 0.08 0.14 0.1 0.05 0.18 0.11 0.11 0.21 0.12 0.03 0.09 0.11 0.09
0.02 0.14 0.26 0.35 0.68 0.77 0.48 0.41 0.45 0.89 1.0 0.74 0.43 0.19 0.23 0.31 0.31 0.42 0.23 0.3 0.19 0.4 0.67 0.33 0.17 0.15 0.19 0.35
0.02 0.03 0.17 0.03 0.25 0.28 0.38 0.14 0.24 1.0 0.37 0.35 0.21 0.04 0.05 0.04 0.02 0.23 0.03 0.06 0.03 0.04 0.17 0.03 0.04 0.06 0.06 0.04
0.07 0.04 0.17 0.03 0.04 0.05 0.02 0.4 0.28 1.0 0.48 0.1 0.09 0.17 0.28 0.02 0.02 0.0 0.17 0.04 0.08 0.09 0.24 0.04 0.02 0.07 0.21 0.05
0.01 0.05 0.27 0.26 0.25 0.14 0.19 0.36 0.73 1.0 0.76 0.31 0.19 0.28 0.29 0.26 0.31 0.24 0.19 0.36 0.36 0.33 0.26 0.29 0.08 0.17 0.23 0.27
0.0 0.02 0.42 0.2 0.22 0.08 0.24 0.15 0.37 1.0 0.5 0.35 0.19 0.03 0.04 0.23 0.21 0.15 0.18 0.33 0.24 0.21 0.34 0.22 0.02 0.03 0.06 0.11
0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.06 0.26 0.89 1.0 0.15 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.04 0.03 0.01 0.05 0.04 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03
0.0 0.0 0.04 0.02 0.14 0.05 0.03 0.08 0.27 1.0 0.43 0.16 0.21 0.03 0.02 0.01 0.01 0.28 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03
0.0 0.0 0.06 0.2 0.18 0.04 0.04 0.07 0.28 1.0 0.73 0.62 0.03 0.02 0.02 0.07 0.11 0.07 0.06 0.13 0.22 0.21 0.4 0.14 0.0 0.0 0.02 0.07
0.0 0.0 0.13 0.0 0.14 0.02 0.11 0.09 0.32 1.0 0.76 0.37 0.1 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.07 0.0 0.03 0.07 0.07 0.0 0.31 0.45 1.0 0.21 0.2 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.09 0.0 0.04 0.0 0.08 0.03 0.0 0.09 0.06 0.0 0.11
0.01 0.05 0.43 0.04 0.68 0.49 0.32 0.54 0.72 0.97 1.0 0.82 0.44 0.55 0.5 0.17 0.22 0.93 0.26 0.21 0.2 0.24 0.17 0.22 0.04 0.06 0.35 0.09
0.01 0.04 0.12 0.05 0.56 0.48 0.18 0.28 0.59 1.0 0.85 0.96 0.32 0.38 0.28 0.03 0.05 0.17 0.04 0.08 0.02 0.04 0.13 0.05 0.04 0.04 0.49 0.11
0.0 0.09 0.23 0.02 0.11 0.03 0.09 0.15 0.25 1.0 0.31 0.1 0.21 0.02 0.02 0.09 0.06 0.0 0.03 0.03 0.0 0.06 0.04 0.04 0.1 0.18 0.06 0.04
0.02 0.25 0.06 0.06 0.32 0.34 0.13 0.35 0.48 1.0 0.56 0.39 0.23 0.39 0.31 0.08 0.12 0.16 0.07 0.19 0.07 0.15 0.23 0.08 0.09 0.32 0.29 0.17
0.0 0.0 0.01 0.04 0.09 0.03 0.02 0.11 0.29 1.0 0.45 0.1 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.0 0.03 0.04 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.04
0.11 0.7 0.16 0.0 0.37 0.13 0.15 0.22 0.47 1.0 0.79 0.61 0.06 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.83 0.7 0.17 0.0
0.0 0.05 0.1 0.16 0.21 0.03 0.06 0.1 0.29 1.0 0.54 0.46 0.07 0.08 0.13 0.04 0.07 0.13 0.05 0.07 0.05 0.07 0.77 0.06 0.24 0.16 0.07 0.03
0.01 0.02 0.44 0.09 0.59 0.36 0.37 0.28 0.3 1.0 0.27 0.59 0.54 0.06 0.07 0.11 0.06 0.53 0.12 0.32 0.14 0.09 0.41 0.16 0.01 0.23 0.09 0.2
0.02 0.03 0.37 0.07 0.57 0.45 0.59 0.26 0.29 1.0 0.4 0.62 0.81 0.08 0.09 0.21 0.05 0.44 0.04 0.32 0.29 0.12 0.47 0.15 0.03 0.47 0.11 0.03
0.13 0.21 0.3 0.08 0.3 0.25 0.35 0.48 1.0 0.88 0.94 0.75 0.23 0.24 0.2 0.02 0.05 0.46 0.41 0.07 0.14 0.09 0.07 0.07 0.19 0.23 0.14 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)