Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.11 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.19 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.21 0.51 1.0 0.29 0.16 0.54 0.13 0.41 0.38 0.26 0.25 0.34 0.13 0.25 0.33 0.2 0.24 0.03 0.18 0.08 0.17 0.78 0.21 0.11 0.64 0.14 0.08
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.57 0.12 0.45 0.38 0.33 0.39 0.06 0.12 0.14 0.11 0.48 0.28 0.25 0.22 0.13 0.22 0.28 0.11 0.24 0.2 0.17 0.07 0.17 0.62 0.3 0.25 1.0
0.0 0.47 0.39 0.26 0.22 0.57 0.53 0.41 0.75 0.7 0.81 0.55 0.23 0.12 0.21 0.3 0.37 0.25 0.4 0.15 0.36 0.58 0.39 0.35 0.04 0.14 0.28 1.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.33 0.0 0.07 1.0 0.13 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.75
0.19 0.12 0.44 1.0 0.39 0.34 0.89 0.22 0.24 0.86 0.18 0.22 0.39 0.42 0.56 0.3 0.17 0.16 0.34 0.46 0.47 0.3 0.3 0.37 0.11 0.22 0.46 0.2
0.02 0.1 0.1 1.0 0.06 0.02 0.17 0.01 0.05 0.04 0.04 0.02 0.1 0.07 0.05 0.0 0.03 0.03 0.03 0.03 0.06 0.01 0.11 0.03 0.04 0.1 0.09 0.04
0.14 0.0 0.33 0.86 0.39 1.0 0.1 0.87 0.04 0.06 0.08 0.08 0.04 0.07 0.26 0.5 0.17 0.98 0.04 0.35 0.2 0.28 0.59 0.07 0.77 0.0 0.08 0.22
0.09 0.38 0.09 0.17 0.1 0.08 0.07 0.13 0.18 0.23 0.15 0.17 0.2 0.04 0.05 0.1 0.06 1.0 0.09 0.13 0.12 0.14 0.07 0.11 0.06 0.03 0.02 0.31
0.04 0.02 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.92 0.24 0.0 0.21 1.0 0.61 0.3 0.0 0.3 0.05 0.0 0.0 0.16
0.02 0.01 0.34 0.35 0.07 0.01 0.04 0.42 0.05 1.0 0.09 0.03 0.06 0.07 0.07 0.48 0.27 0.08 0.36 0.42 0.57 0.66 0.57 0.49 0.01 0.04 0.06 0.22
0.04 0.02 0.19 0.39 0.05 0.06 0.48 0.03 0.04 0.24 0.08 0.05 1.0 0.06 0.07 0.18 0.1 0.16 0.18 0.23 0.95 0.17 0.05 0.21 0.13 0.11 0.1 0.41
0.01 0.06 0.5 0.5 0.48 0.32 0.43 0.6 0.26 0.69 0.32 0.44 0.44 0.28 0.21 0.69 0.65 0.26 1.0 0.54 0.85 0.74 0.77 0.6 0.09 0.43 0.18 0.32
0.16 0.18 0.0 0.18 0.1 0.09 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.11 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.19 0.06 0.08 0.02 0.05 0.0 0.05 0.3 1.0 0.08 0.38
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.05 0.02 0.66 0.6 0.62 0.23 0.06 0.12 0.22 0.12 0.76 0.31 0.06 0.06 0.13 0.16 0.86 0.32 0.26 0.11 0.2 0.01 0.21 0.01 0.11 0.12 1.0
0.14 0.51 0.22 0.5 0.22 0.29 0.31 0.13 0.19 0.22 0.18 0.16 0.44 0.32 0.3 0.18 0.32 0.9 0.23 0.26 0.25 0.27 0.1 0.23 0.63 0.91 0.25 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.57 0.12 0.58 0.66 1.0 0.34 0.13 0.2 0.19 0.21 0.73 0.4 0.26 0.23 0.13 0.22 0.27 0.12 0.2 0.19 0.18 0.06 0.16 0.82 0.34 0.23 0.92
0.19 0.26 0.8 0.94 0.26 0.32 0.65 0.36 0.78 0.16 0.5 0.35 0.81 0.36 0.33 0.17 0.43 0.49 0.36 0.41 0.49 0.61 1.0 0.5 0.1 0.46 0.35 0.33
0.34 0.18 0.51 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.42 0.0 0.0 0.28 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.62 0.0 0.76 0.0 0.53 0.0
0.08 0.05 0.81 0.48 0.26 0.32 0.42 0.26 0.58 0.55 0.51 0.31 0.22 0.14 0.18 0.39 0.29 0.48 0.41 0.57 0.43 0.39 0.37 0.5 0.05 1.0 0.55 0.12
0.06 0.12 0.45 0.89 0.24 0.06 0.1 0.02 0.03 0.03 0.02 0.19 0.18 0.25 0.2 0.02 0.02 0.04 0.1 0.04 0.04 0.05 0.06 0.03 0.13 0.28 1.0 0.0
0.18 0.16 0.23 0.56 0.31 0.32 0.28 0.13 0.19 0.2 0.2 0.38 0.35 0.19 0.19 0.37 0.32 0.28 0.42 0.33 0.45 0.3 0.28 0.28 0.12 1.0 0.19 0.64
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.36 0.9 0.44 0.66 0.61 0.59 0.59 0.41 0.57 0.42 0.55 0.6 0.56 0.52 0.56 0.61 0.53 1.0 0.72 0.62 0.54 0.56 0.55 0.57 0.69 0.88 0.53 0.57
0.1 0.42 0.14 0.38 0.26 0.29 0.29 0.09 0.13 0.13 0.13 0.31 0.37 0.26 0.21 0.09 0.13 0.08 0.07 0.14 0.13 0.14 0.06 0.12 1.0 0.37 0.24 0.52
1.0 0.55 0.44 0.53 0.55 0.53 0.67 0.17 0.33 0.4 0.25 0.63 0.69 0.46 0.39 0.25 0.34 0.26 0.16 0.35 0.29 0.34 0.18 0.28 0.68 0.31 0.49 0.98
0.01 0.0 0.58 0.18 0.22 0.01 1.0 0.04 0.32 0.11 0.24 0.48 0.33 0.0 0.0 0.07 0.01 0.12 0.1 0.05 0.1 0.24 0.06 0.16 0.0 0.0 0.01 0.42
0.02 0.16 0.16 0.88 0.37 0.24 0.27 0.25 0.16 1.0 0.26 0.27 0.32 0.07 0.07 0.46 0.24 0.06 0.15 0.31 0.67 0.39 0.06 0.26 0.08 0.07 0.07 0.58
0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.79 0.0 0.64 0.0 0.0 0.06 0.22 0.53 0.45 0.52 0.0 0.0 0.2 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.19 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.02 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.7 0.0 0.5 0.91 0.88 0.55 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 1.0
0.13 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.38 1.0
0.45 0.84 0.13 0.43 0.57 0.44 0.54 0.11 0.27 0.21 0.24 0.79 0.57 0.37 0.33 0.14 0.18 0.44 0.14 0.21 0.15 0.18 0.1 0.16 0.63 1.0 0.42 0.74
0.18 0.43 0.08 0.3 0.1 0.09 0.11 0.03 0.03 0.02 0.03 0.1 0.03 0.46 0.42 0.13 0.12 0.17 0.1 0.15 0.15 0.11 0.14 0.11 1.0 0.14 0.73 0.17
0.07 0.12 0.03 0.83 0.72 0.57 0.27 0.02 0.03 0.15 0.03 0.65 0.1 0.16 0.15 0.08 0.06 0.63 0.15 0.21 0.07 0.11 0.01 0.13 0.2 0.12 0.34 1.0
0.09 0.63 0.33 0.52 0.53 1.0 0.66 0.73 0.25 0.31 0.25 0.42 0.6 0.5 0.41 0.24 0.3 0.17 0.11 0.29 0.24 0.25 0.08 0.22 0.92 0.25 0.49 0.98
0.35 1.0 0.12 0.52 0.22 0.28 0.32 0.07 0.09 0.1 0.08 0.16 0.44 0.29 0.24 0.08 0.12 0.13 0.1 0.14 0.12 0.12 0.06 0.11 0.83 0.32 0.32 0.47
0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.36 0.99 0.3 0.44 0.25 0.47 0.49 0.53 0.74 0.77 1.0 0.25 0.35 0.42 0.47 0.68 0.63 0.52 0.53 0.69 0.79 0.83 0.44 0.68 0.6 0.55 0.39 0.52
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.16 0.18 0.47 0.68 1.0 0.37 0.3 0.41 0.32 0.57 0.83 0.45 0.18 0.18 0.22 0.27 0.18 0.24 0.24 0.22 0.21 0.28 0.22 0.08 0.45 0.21 0.48
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.01 0.03 0.39 0.03 0.07 0.13 0.05 0.06 0.4 0.16 0.03 0.27 0.0 0.01 0.05 0.05 0.06 0.02 0.03 0.25 0.03 0.04 0.03 0.05 0.19 0.01 0.63
0.0 0.0 0.73 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.46 0.0 0.94
0.31 0.71 0.16 0.69 0.55 0.54 0.38 0.18 0.27 0.28 0.3 0.7 0.41 0.28 0.26 0.42 0.38 1.0 0.41 0.51 0.3 0.52 0.17 0.52 0.18 0.49 0.33 0.72
0.76 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.25 0.0 0.28 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.18 0.24 0.41 0.35 0.32 0.41 0.25 0.19 0.57 0.17 0.42 0.26 0.27 0.16 0.18 0.11 0.48 0.18 0.1 0.1 0.21 0.06 0.19 0.06 0.68 0.27 1.0
0.01 0.07 0.3 1.0 0.32 0.3 0.29 0.23 0.36 0.19 0.52 0.22 0.23 0.21 0.21 0.23 0.29 0.28 0.56 0.42 0.41 0.41 0.44 0.23 0.07 0.41 0.23 0.43
0.08 0.05 0.81 0.48 0.26 0.32 0.42 0.26 0.58 0.55 0.51 0.31 0.22 0.14 0.18 0.39 0.29 0.48 0.41 0.57 0.43 0.39 0.37 0.5 0.05 1.0 0.55 0.12
0.07 0.09 0.11 0.33 0.05 0.0 0.1 0.22 0.13 0.1 0.18 0.0 0.04 0.17 0.15 0.22 0.22 0.11 0.19 0.23 1.0 0.11 0.17 0.55 0.24 0.29 0.21 0.14
0.09 0.07 0.77 0.98 0.8 1.0 0.71 0.32 0.46 0.67 0.14 0.45 0.94 0.55 0.25 0.03 0.58 0.21 0.19 0.54 0.98 0.78 0.45 0.2 0.05 0.16 0.59 0.63
0.08 0.15 0.3 0.78 0.36 1.0 0.43 0.47 0.29 0.63 0.32 0.31 0.3 0.26 0.19 0.21 0.29 0.08 0.07 0.36 0.46 0.16 0.26 0.29 0.08 0.2 0.26 0.44
0.23 0.15 0.49 0.28 0.06 0.06 0.1 0.46 0.34 0.55 0.12 0.0 0.0 0.04 0.16 0.07 0.13 0.0 0.25 0.43 0.23 0.28 0.29 0.28 0.0 1.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)