Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.22 0.04 0.01 1.0 0.16 0.1 0.07 0.02 0.02 0.22 0.01 0.12 0.23 0.01 0.02 0.25 0.14 0.24 0.38 0.27 0.12 0.21 0.01 0.31 0.04 0.69 0.02 0.57
0.48 1.0 0.28 0.98 0.3 0.28 0.45 0.32 0.36 0.4 0.52 0.24 0.45 0.36 0.38 0.46 0.59 0.51 0.9 0.43 0.46 0.44 0.39 0.4 0.32 0.29 0.73 0.91
0.41 1.0 0.1 0.33 0.09 0.16 0.1 0.17 0.1 0.22 0.1 0.06 0.19 0.13 0.11 0.09 0.1 0.06 0.05 0.12 0.09 0.1 0.11 0.09 0.22 0.05 0.15 0.24
1.0 0.08 0.42 0.63 0.01 0.01 0.06 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.31 0.06 0.05 0.06 0.18 0.14 0.08 0.76 0.27 0.79 0.56 0.16 0.76 0.65 0.15 0.04
0.54 0.05 0.18 0.43 0.91 1.0 0.27 0.13 0.16 0.19 0.19 0.89 0.19 0.09 0.12 0.17 0.14 0.11 0.13 0.19 0.24 0.21 0.16 0.21 0.07 0.26 0.09 0.39
1.0 0.29 0.02 0.36 0.14 0.66 0.01 0.06 0.04 0.02 0.06 0.15 0.06 0.07 0.07 0.03 0.01 0.01 0.02 0.1 0.03 0.04 0.06 0.04 0.05 0.23 0.12 0.1
0.26 0.15 0.71 0.59 0.46 0.19 0.42 0.25 0.16 0.19 0.16 0.14 0.92 0.15 0.13 0.75 0.4 0.44 0.55 0.79 0.9 0.58 0.23 0.61 0.14 1.0 0.46 0.14
0.1 0.22 0.3 0.8 0.17 0.11 1.0 0.21 0.05 0.51 0.05 0.16 0.33 0.18 0.11 0.21 0.11 0.27 0.2 0.17 0.18 0.13 0.06 0.16 0.72 0.48 0.25 0.77
0.23 0.98 0.68 1.0 0.19 0.06 0.26 0.76 0.65 0.4 0.81 0.14 0.19 0.27 0.3 0.74 0.35 0.98 0.99 0.79 0.83 0.56 0.78 0.68 0.13 0.15 0.38 0.87
1.0 0.06 0.32 0.34 0.25 0.16 0.16 0.26 0.14 0.36 0.11 0.15 0.26 0.07 0.09 0.25 0.24 0.22 0.81 0.34 0.26 0.31 0.28 0.29 0.09 0.12 0.14 0.24
0.23 0.22 0.62 0.89 0.51 0.47 0.87 0.34 0.32 0.2 0.42 0.36 0.89 0.27 0.28 0.53 0.49 0.47 0.46 0.47 0.66 0.47 1.0 0.48 0.35 0.71 0.44 0.41
0.59 0.73 0.37 0.42 0.92 1.0 0.31 0.29 0.21 0.31 0.24 0.6 0.3 0.27 0.32 0.32 0.38 0.24 0.39 0.32 0.31 0.28 0.27 0.25 0.33 0.34 0.46 0.36
0.83 1.0 0.13 0.36 0.15 0.13 0.16 0.07 0.14 0.1 0.1 0.17 0.19 0.19 0.17 0.05 0.11 0.03 0.02 0.06 0.02 0.05 0.15 0.04 0.15 0.54 0.3 0.27
1.0 1.0 0.29 0.55 0.55 0.78 0.18 0.07 0.08 0.08 0.1 0.36 0.2 0.1 0.14 0.21 0.25 0.13 0.17 0.24 0.18 0.18 0.36 0.19 0.34 0.97 0.27 0.32
0.32 0.82 0.06 0.21 0.05 0.03 0.23 0.31 0.22 1.0 0.03 0.02 0.19 0.03 0.05 0.03 0.04 0.1 0.06 0.05 0.07 0.04 0.03 0.03 0.11 0.1 0.08 0.15
0.2 0.16 0.48 0.97 0.42 0.32 0.57 0.26 0.24 0.33 0.28 0.34 0.8 0.31 0.28 0.9 0.57 0.24 0.5 0.7 0.85 0.61 0.49 0.72 0.11 1.0 0.42 0.64
0.71 0.36 0.6 0.62 0.55 0.38 0.48 0.49 0.62 0.4 0.68 0.45 0.74 0.41 0.43 0.5 0.4 0.58 0.63 0.48 0.47 0.46 0.32 0.4 1.0 0.53 0.38 0.38
0.33 0.47 0.43 0.59 0.31 0.68 0.69 0.62 0.17 0.29 0.14 0.15 0.22 0.3 0.27 0.23 0.21 0.06 0.11 0.28 0.28 0.26 0.12 0.24 1.0 0.59 0.43 0.62
0.12 0.04 0.7 0.71 0.79 0.48 0.52 0.79 0.93 0.54 1.0 0.51 0.62 0.18 0.18 0.74 0.79 0.61 0.8 0.9 0.72 0.9 0.31 0.77 0.06 0.8 0.25 0.6
1.0 0.06 0.21 0.23 0.23 0.22 0.22 0.26 0.07 0.11 0.04 0.17 0.16 0.11 0.13 0.21 0.17 0.19 0.45 0.21 0.32 0.18 0.27 0.19 0.17 0.27 0.16 0.43
1.0 0.74 0.26 0.41 0.4 0.62 0.15 0.34 0.17 0.25 0.2 0.29 0.2 0.14 0.19 0.26 0.39 0.12 0.15 0.3 0.29 0.28 0.41 0.3 0.08 0.29 0.43 0.32
0.16 0.31 0.75 0.65 0.38 0.17 0.69 0.63 0.71 1.0 0.79 0.27 0.71 0.5 0.48 0.74 0.4 0.4 0.35 0.78 0.85 0.65 0.4 0.65 0.36 0.95 0.41 0.39
0.54 0.76 0.23 0.32 0.29 1.0 0.22 0.14 0.16 0.29 0.15 0.23 0.28 0.36 0.26 0.15 0.16 0.21 0.09 0.14 0.19 0.15 0.11 0.15 0.05 0.05 0.35 0.32
0.54 0.23 0.36 0.74 0.41 0.77 0.55 1.0 0.71 0.72 0.68 0.45 0.43 0.58 0.64 0.86 0.95 0.47 0.49 0.94 0.7 0.79 0.87 0.73 0.3 0.48 0.66 0.71
1.0 0.29 0.69 0.63 0.69 0.55 0.61 0.82 0.46 0.52 0.6 0.55 0.62 0.21 0.25 0.68 0.64 0.46 0.61 0.71 0.65 0.71 0.48 0.61 0.07 0.25 0.34 0.36
0.13 0.09 0.18 0.41 0.28 0.27 0.2 0.08 0.15 0.07 0.2 0.29 0.26 0.13 0.13 0.45 0.37 0.09 0.18 0.31 0.28 0.3 0.2 0.29 0.24 1.0 0.13 0.31
0.65 0.02 0.56 0.84 0.38 0.62 0.46 0.28 0.14 0.19 0.1 0.09 0.34 0.03 0.04 0.76 0.45 0.25 0.36 0.82 0.63 0.64 0.54 0.6 0.03 1.0 0.07 0.97
0.3 0.3 0.51 0.86 0.93 0.74 0.61 0.33 0.32 0.36 0.22 0.76 1.0 0.38 0.35 0.58 0.59 0.43 0.23 0.43 0.32 0.43 0.34 0.35 0.22 0.63 0.68 0.66
1.0 0.34 0.42 0.49 0.72 0.56 0.34 0.33 0.25 0.23 0.25 0.38 0.57 0.05 0.09 0.3 0.29 0.29 0.6 0.33 0.2 0.28 0.28 0.31 0.41 0.28 0.21 0.32
0.15 0.26 0.62 0.64 0.61 0.37 0.51 0.41 0.32 0.24 0.34 0.31 0.37 0.36 0.3 0.46 0.29 0.3 0.13 0.49 0.4 0.41 0.38 0.37 0.11 1.0 0.47 0.34
0.22 0.36 0.89 1.0 0.89 0.86 0.82 0.74 0.63 0.69 0.66 0.72 0.88 0.58 0.51 0.72 0.56 0.34 0.33 0.7 0.77 0.66 0.4 0.61 0.6 0.94 0.6 0.79
0.4 0.16 0.58 0.82 0.59 0.84 0.4 1.0 0.76 0.7 0.83 0.57 0.36 0.38 0.42 0.79 0.72 0.34 0.4 0.78 0.42 0.72 0.53 0.56 0.5 0.87 0.62 0.48
0.19 0.1 0.39 0.64 0.46 1.0 0.58 0.3 0.27 0.24 0.3 0.31 0.37 0.24 0.22 0.26 0.29 0.49 0.44 0.44 0.28 0.41 0.29 0.35 0.21 0.2 0.3 0.65
0.76 0.29 0.41 0.42 0.28 0.17 0.17 0.22 0.19 0.21 0.22 0.15 0.3 0.27 0.28 0.28 0.2 0.18 0.25 0.35 0.3 0.27 0.25 0.23 0.33 1.0 0.4 0.17
1.0 0.36 0.25 0.61 0.72 0.81 0.28 0.11 0.11 0.19 0.11 0.37 0.5 0.17 0.19 0.31 0.18 0.29 0.27 0.34 0.25 0.29 0.34 0.28 0.37 0.57 0.26 0.38
0.31 1.0 0.27 0.32 0.62 0.47 0.17 0.18 0.24 0.21 0.21 0.59 0.18 0.11 0.12 0.26 0.25 0.23 0.21 0.25 0.18 0.35 0.12 0.33 0.12 0.07 0.19 0.19
0.1 0.13 0.24 0.41 0.19 0.48 0.31 0.66 0.46 1.0 0.37 0.17 0.26 0.33 0.33 0.6 0.55 0.29 0.35 0.71 0.65 0.52 0.51 0.45 0.07 0.3 0.37 0.41
0.13 0.08 0.49 0.36 0.75 1.0 0.83 0.27 0.22 0.32 0.25 0.63 0.75 0.2 0.18 0.32 0.35 0.18 0.24 0.3 0.13 0.29 0.36 0.33 0.1 0.15 0.28 0.19
1.0 0.59 0.2 0.27 0.31 0.79 0.12 0.28 0.11 0.06 0.1 0.08 0.11 0.18 0.2 0.23 0.13 0.08 0.14 0.18 0.15 0.13 0.1 0.1 0.2 0.2 0.49 0.05
0.05 0.11 0.15 0.56 0.21 0.41 0.17 0.19 0.15 0.21 0.18 0.21 0.15 0.4 0.38 0.29 0.23 0.13 0.12 0.24 0.23 0.21 0.32 0.19 0.11 0.51 0.26 1.0
0.29 0.35 0.46 0.79 0.77 0.73 0.68 0.45 0.34 0.23 0.34 0.54 0.82 0.26 0.22 0.24 0.19 0.19 0.15 0.26 0.17 0.23 0.12 0.22 0.68 1.0 0.31 0.71
0.24 0.51 0.82 0.85 0.91 1.0 0.7 0.37 0.4 0.46 0.41 0.77 0.81 0.46 0.43 0.67 0.66 0.37 0.53 0.73 0.59 0.66 0.37 0.65 0.43 0.84 0.54 0.76
0.28 0.37 0.17 0.36 0.17 0.17 0.15 0.35 0.08 0.2 0.09 0.07 0.32 0.27 0.26 0.18 0.13 0.12 0.04 0.18 0.22 0.14 0.18 0.13 0.27 1.0 0.25 0.18
0.25 0.62 0.48 0.9 0.45 0.22 0.48 0.62 0.73 0.5 0.52 0.29 0.85 0.39 0.39 0.44 0.42 0.26 0.45 0.44 0.41 0.42 0.7 0.38 0.45 0.37 0.45 1.0
0.53 0.01 0.22 1.0 0.16 0.1 0.13 0.05 0.12 0.01 0.08 0.05 0.14 0.03 0.04 0.09 0.21 0.05 0.08 0.25 0.17 0.22 0.2 0.21 0.04 0.21 0.23 0.31
1.0 0.89 0.28 0.44 0.19 0.38 0.36 0.2 0.21 0.15 0.19 0.09 0.18 0.3 0.28 0.24 0.24 0.08 0.2 0.29 0.24 0.21 0.13 0.18 0.49 0.07 0.78 0.29
0.42 0.27 0.5 0.37 0.2 0.03 0.23 0.26 0.41 0.15 0.4 0.11 0.11 0.26 0.33 1.0 0.47 0.32 0.42 0.7 0.98 0.69 0.82 0.69 0.12 0.23 0.43 0.04
0.1 1.0 0.02 0.34 0.43 0.67 0.12 0.46 0.14 0.54 0.17 0.18 0.1 0.03 0.02 0.09 0.08 0.04 0.01 0.04 0.1 0.05 0.03 0.03 0.01 0.0 0.03 0.23
0.14 0.04 0.32 0.98 0.79 0.85 0.36 0.73 0.74 0.77 0.76 0.65 0.3 0.31 0.3 1.0 0.66 0.64 0.54 0.85 0.82 0.82 0.4 0.8 0.52 0.66 0.37 0.96
0.02 0.05 0.37 0.48 0.51 1.0 0.45 0.12 0.26 0.23 0.23 0.48 0.4 0.17 0.17 0.19 0.25 0.19 0.22 0.22 0.15 0.2 0.2 0.21 0.04 0.39 0.14 0.37
0.11 0.04 0.06 0.84 0.23 1.0 0.44 0.09 0.04 0.06 0.04 0.1 0.13 0.21 0.17 0.1 0.14 0.1 0.02 0.06 0.08 0.08 0.12 0.05 0.05 0.79 0.47 0.62
1.0 0.06 0.3 0.39 0.72 0.8 0.43 0.75 0.41 0.34 0.51 0.66 0.46 0.08 0.11 0.75 0.57 0.34 0.3 0.47 0.36 0.49 0.26 0.43 0.03 0.22 0.12 0.58
0.72 0.76 0.51 0.59 0.58 0.38 0.49 0.25 0.2 0.3 0.17 0.36 0.72 0.43 0.44 0.33 0.35 0.34 0.26 0.39 0.32 0.36 0.52 0.35 0.51 1.0 0.76 0.67
1.0 0.21 0.4 0.69 0.37 0.32 0.37 0.22 0.37 0.2 0.37 0.35 0.45 0.32 0.4 0.43 0.41 0.26 0.33 0.49 0.38 0.47 0.66 0.44 0.11 0.28 0.36 0.68
0.97 0.2 1.0 0.42 0.69 0.49 0.6 0.12 0.17 0.07 0.19 0.61 0.77 0.2 0.23 0.65 0.55 0.37 0.3 0.66 0.35 0.79 0.3 0.73 0.12 0.53 0.19 0.27
1.0 0.3 0.63 0.53 0.58 0.59 0.37 0.45 0.39 0.34 0.41 0.34 0.44 0.27 0.25 0.52 0.52 0.27 0.23 0.58 0.57 0.55 0.35 0.43 0.45 0.49 0.37 0.28
0.46 0.4 0.47 0.98 0.71 0.97 0.7 0.63 0.47 0.33 0.46 0.63 0.71 0.62 0.64 0.69 0.47 0.6 0.42 0.64 0.59 0.53 1.0 0.65 0.62 0.7 0.64 0.71
1.0 0.01 0.15 0.33 0.06 0.05 0.03 0.04 0.01 0.07 0.01 0.06 0.01 0.0 0.0 0.04 0.04 0.23 0.03 0.07 0.05 0.08 0.03 0.07 0.0 0.04 0.0 0.23
0.32 0.32 0.45 0.85 0.83 0.75 0.39 0.77 0.26 0.6 0.22 0.44 0.52 0.35 0.32 0.53 0.36 0.46 0.25 0.47 0.38 0.38 0.44 0.37 0.69 0.64 1.0 0.6
0.47 0.13 0.13 0.25 0.09 0.14 0.09 0.22 0.06 0.26 0.03 0.03 0.12 0.05 0.05 0.08 0.06 0.08 0.05 0.08 0.11 0.08 0.08 0.07 0.28 1.0 0.18 0.53
0.09 0.01 0.03 0.37 0.36 0.15 0.49 0.03 0.0 0.08 0.0 0.19 0.27 0.28 0.09 0.03 0.01 0.12 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.2 1.0 0.06
0.1 0.14 0.42 0.49 0.44 0.92 0.53 0.34 0.54 0.39 0.35 0.44 0.46 0.38 0.4 0.39 0.4 0.18 0.21 0.45 0.35 0.41 0.39 0.36 0.11 0.69 0.38 1.0
1.0 0.11 0.59 0.73 0.62 0.49 0.72 0.55 0.43 0.31 0.42 0.58 0.59 0.18 0.2 0.75 0.59 0.26 0.87 0.67 0.71 0.69 0.51 0.68 0.07 0.64 0.31 0.86
1.0 0.0 0.22 0.45 0.25 0.26 0.21 0.27 0.2 0.09 0.22 0.22 0.14 0.01 0.01 0.17 0.12 0.08 0.23 0.2 0.13 0.19 0.19 0.17 0.01 0.09 0.01 0.4
0.17 0.07 0.65 0.64 0.49 0.22 0.46 0.42 0.35 0.35 0.38 0.22 0.83 0.14 0.18 1.0 0.62 0.34 0.35 0.82 0.86 0.72 0.39 0.72 0.04 0.23 0.14 0.48
0.1 0.68 0.54 0.79 0.36 0.45 0.43 0.3 0.13 0.14 0.13 0.22 0.83 0.2 0.2 0.53 0.51 0.21 0.77 0.49 0.46 0.43 0.37 0.49 0.25 1.0 0.28 0.32
0.68 0.58 0.48 1.0 0.76 0.77 0.63 0.3 0.5 0.35 0.6 0.75 0.63 0.41 0.5 0.38 0.46 0.41 0.26 0.48 0.45 0.5 0.6 0.53 0.31 0.8 0.46 0.51
1.0 0.6 0.7 0.63 0.64 0.25 0.79 0.39 0.4 0.46 0.37 0.62 0.93 0.37 0.47 0.64 0.8 0.41 0.26 0.61 0.38 0.64 0.68 0.62 0.48 0.85 0.61 0.54
1.0 0.21 0.12 0.38 0.37 0.33 0.16 0.1 0.05 0.07 0.02 0.04 0.33 0.06 0.09 0.13 0.09 0.61 0.15 0.13 0.11 0.13 0.24 0.1 0.09 0.2 0.61 0.14
0.09 0.01 0.72 0.59 0.45 0.43 0.37 0.42 0.53 0.72 0.37 0.37 0.67 0.11 0.08 0.23 0.28 0.31 0.22 0.57 0.5 0.47 0.51 0.41 0.05 0.46 0.25 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)