Heatmap: Cluster_114 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.34 0.32 0.19 0.11 0.09 0.12 0.19 0.24 0.35 0.36 0.33 0.08 0.16 0.14 0.16 0.36 0.54 0.3 0.34 0.68 0.26 0.47 0.21 0.43 1.0 0.21 0.14 0.25
0.22 0.94 0.46 0.29 0.27 0.17 0.5 0.59 0.72 0.53 0.69 0.22 0.72 0.41 0.5 0.76 0.65 0.63 0.67 0.72 0.69 1.0 0.43 0.88 0.88 0.96 0.42 0.16
0.32 0.39 0.25 0.25 0.2 0.2 0.28 0.22 0.35 0.26 0.36 0.27 0.27 0.39 0.43 0.59 0.6 0.42 0.57 0.47 0.57 0.47 0.55 0.49 1.0 0.36 0.25 0.28
0.07 0.4 0.39 0.18 0.19 0.27 0.31 0.34 0.38 0.29 0.51 0.2 0.22 0.36 0.31 0.25 0.21 0.2 0.17 0.34 0.29 0.29 0.44 0.35 1.0 0.17 0.35 0.2
0.74 0.38 0.56 0.37 0.46 0.38 0.52 0.31 0.58 0.38 0.59 0.59 0.45 0.54 0.63 0.55 0.44 0.53 0.3 0.58 0.6 0.58 0.65 0.48 1.0 0.36 0.42 0.54
0.45 0.47 0.73 0.25 0.06 0.03 0.35 0.92 0.74 0.88 0.8 0.09 0.12 0.41 0.46 0.33 0.22 0.2 0.46 0.47 0.56 0.55 0.85 0.51 1.0 0.32 0.68 0.13
0.25 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.03 0.07 0.0
0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.17 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02 0.15 0.01
0.17 0.34 0.1 0.03 0.04 0.06 0.02 0.05 0.1 0.14 0.09 0.03 0.02 0.03 0.12 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 1.0 0.08 0.18 0.0
0.02 0.1 0.06 0.09 0.08 0.12 0.15 0.02 0.02 0.03 0.01 0.07 0.08 0.05 0.03 0.04 0.04 0.03 0.05 0.05 0.03 0.04 0.03 0.04 1.0 0.09 0.03 0.09
0.01 0.05 0.09 0.05 0.11 0.08 0.12 0.06 0.08 0.13 0.08 0.1 0.09 0.13 0.11 0.08 0.07 0.05 0.04 0.08 0.07 0.07 0.05 0.06 1.0 0.29 0.1 0.05
0.03 0.04 0.0 0.01 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.03 0.11 0.12 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.08 0.0
0.2 0.08 0.02 0.02 0.01 0.02 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.24 0.21 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.14 0.15
0.18 0.41 0.4 0.17 0.34 0.27 0.4 0.37 0.33 0.44 0.4 0.25 0.47 0.3 0.22 0.38 0.47 0.26 0.3 0.64 0.58 0.53 0.24 0.51 1.0 0.22 0.39 0.21
0.09 0.09 0.08 0.06 0.07 0.05 0.06 0.02 0.09 0.03 0.13 0.1 0.05 0.06 0.07 0.04 0.06 0.05 0.04 0.07 0.08 0.05 0.09 0.05 1.0 0.11 0.06 0.09
0.59 0.58 0.35 0.26 0.29 0.36 0.34 0.69 0.69 0.44 0.77 0.3 0.31 0.48 0.51 0.27 0.25 0.24 0.18 0.32 0.37 0.31 0.55 0.27 1.0 0.52 0.57 0.28
0.03 0.05 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.09 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.05 0.02 1.0 0.16 0.08 0.04
0.01 0.04 0.12 0.05 0.05 0.03 0.02 0.13 0.07 0.11 0.11 0.06 0.02 0.09 0.1 0.08 0.09 0.03 0.1 0.12 0.17 0.18 0.07 0.22 1.0 0.15 0.11 0.03
0.35 0.09 0.33 0.21 0.29 0.26 0.32 0.39 0.37 0.49 0.42 0.24 0.19 0.52 0.52 0.36 0.26 0.22 0.18 0.42 0.33 0.37 0.42 0.36 1.0 0.29 0.41 0.28
0.27 0.26 0.51 0.23 0.24 0.42 0.5 0.63 0.69 0.57 0.69 0.25 0.35 0.37 0.45 0.77 0.54 0.47 0.61 0.78 0.77 0.82 0.4 0.77 1.0 0.25 0.37 0.33
0.03 0.15 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.25 0.21 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.16 0.02
0.42 0.31 0.03 0.02 0.04 0.08 0.13 0.12 0.07 0.05 0.03 0.02 0.04 0.3 0.38 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 0.01 0.03 0.49 0.03 1.0 0.02 0.16 0.02
0.11 0.08 0.08 0.06 0.06 0.05 0.12 0.08 0.07 0.11 0.08 0.04 0.1 0.2 0.18 0.1 0.09 0.07 0.09 0.11 0.11 0.09 0.08 0.09 1.0 0.07 0.17 0.08
0.05 0.43 0.25 0.18 0.15 0.22 0.27 0.58 0.26 0.53 0.45 0.15 0.21 0.51 0.68 0.5 0.52 0.34 0.39 0.56 0.75 0.35 1.0 0.55 0.24 0.15 0.31 0.38
0.03 0.1 0.1 0.12 0.09 0.06 0.16 0.07 0.05 0.16 0.04 0.06 0.23 0.19 0.15 0.11 0.12 0.16 0.17 0.11 0.1 0.11 0.08 0.1 1.0 0.13 0.16 0.18
0.11 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.0
0.23 0.37 0.3 0.17 0.16 0.1 0.21 0.39 0.38 0.33 0.41 0.08 0.38 0.4 0.38 0.47 0.28 0.35 0.35 0.58 0.44 0.44 0.16 0.48 1.0 0.19 0.42 0.17
0.24 0.2 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.21 0.22 0.01 0.0 0.04 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.1 0.16 0.02
0.42 0.81 0.19 0.25 0.21 0.21 0.24 0.29 0.34 0.24 0.34 0.17 0.14 0.37 0.43 0.33 0.28 0.45 0.32 0.44 0.26 0.45 0.45 0.43 1.0 0.26 0.23 0.3
0.03 0.51 0.34 0.08 0.07 0.06 0.24 1.0 0.53 0.49 0.47 0.08 0.06 0.68 0.71 0.31 0.19 0.22 0.47 0.52 0.96 0.44 0.68 0.55 0.13 0.05 0.34 0.16
0.07 0.12 0.31 0.1 0.12 0.07 0.05 0.27 0.22 0.27 0.33 0.12 0.1 0.19 0.22 0.08 0.1 0.07 0.04 0.26 0.11 0.14 0.45 0.16 1.0 0.53 0.31 0.13
0.04 0.02 0.04 0.02 0.04 0.04 0.06 0.03 0.03 0.06 0.03 0.03 0.05 0.07 0.07 0.04 0.03 0.24 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 1.0 0.17 0.06 0.03
0.09 0.08 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 1.0 0.03 0.01 0.13
0.33 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.02
0.18 0.37 0.37 0.12 0.11 0.1 0.17 0.38 0.45 0.41 0.58 0.11 0.05 0.19 0.25 0.14 0.09 0.33 0.27 0.21 0.22 0.16 0.31 0.21 1.0 0.08 0.22 0.19
0.09 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.04
0.14 0.18 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.16 0.19 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.03 0.11 0.0
0.1 0.26 0.02 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.16 0.23 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.05 0.0
0.2 0.29 0.03 0.04 0.05 0.09 0.03 0.04 0.05 0.03 0.05 0.04 0.02 0.12 0.12 0.03 0.03 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.07 0.03 1.0 0.39 0.1 0.05
0.06 0.15 0.09 0.04 0.0 0.0 0.16 0.0 0.08 0.0 0.22 0.14 0.07 0.28 0.18 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.28 0.06 0.0 1.0 0.06 0.18 0.0
0.28 0.32 0.1 0.04 0.02 0.01 0.07 0.08 0.25 0.07 0.25 0.03 0.03 0.17 0.29 0.06 0.06 0.15 0.17 0.1 0.1 0.11 0.57 0.1 1.0 0.05 0.18 0.03
0.26 0.34 0.27 0.11 0.13 0.17 0.23 0.36 0.42 0.18 0.4 0.09 0.28 0.47 0.43 0.34 0.36 0.51 0.21 0.46 0.18 0.26 0.43 0.2 1.0 0.15 0.45 0.11
0.17 0.34 0.41 0.1 0.15 0.16 0.17 0.73 0.54 0.56 0.42 0.13 0.17 0.4 0.38 0.51 0.45 0.55 0.61 0.65 0.78 0.6 0.93 0.67 1.0 0.05 0.47 0.18
0.13 0.33 0.11 0.13 0.21 0.2 0.12 0.16 0.19 0.13 0.2 0.17 0.11 0.23 0.26 0.15 0.12 0.31 0.15 0.12 0.14 0.11 0.38 0.12 1.0 0.32 0.23 0.17
0.25 0.22 0.25 0.14 0.16 0.17 0.24 0.38 0.36 0.2 0.39 0.1 0.15 0.22 0.21 0.41 0.23 0.25 0.48 0.43 0.51 0.37 0.39 0.38 1.0 0.08 0.23 0.16
0.12 0.44 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.09 0.04 0.0 0.08 0.15 0.15 0.0 0.0 0.1 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.07 0.0 0.0
0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.17 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.1 0.09 0.0
0.05 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.07 0.01 0.0
0.28 0.49 0.12 0.15 0.07 0.08 0.17 0.04 0.08 0.04 0.09 0.09 0.2 0.36 0.42 0.13 0.13 0.1 0.1 0.14 0.15 0.14 0.27 0.15 1.0 0.23 0.28 0.15
0.0 0.07 0.08 0.0 0.21 0.13 0.12 0.04 0.1 0.27 0.22 0.22 0.08 0.3 0.23 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0
0.45 0.31 0.76 0.26 0.26 0.24 0.25 0.71 0.72 0.46 0.75 0.41 0.19 0.39 0.31 0.22 0.19 0.59 0.42 0.76 0.48 0.7 1.0 0.78 0.6 0.2 0.56 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)