Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.01 0.04 0.33 0.12 0.09 0.12 0.58 0.12 0.11 0.65 0.09 0.07 0.44 0.36 0.23 0.21 0.18 1.0 0.28 0.32 0.35 0.19 0.12 0.2 0.04 0.02 0.57 0.65
0.01 0.01 0.79 0.13 0.28 0.33 1.0 0.11 0.25 0.88 0.27 0.27 0.46 0.13 0.2 0.36 0.29 0.51 0.21 0.3 0.25 0.27 0.33 0.32 0.02 0.01 0.49 0.28
0.01 0.01 0.59 0.08 0.22 0.41 1.0 0.37 0.17 0.62 0.18 0.06 0.15 0.39 0.32 0.37 0.43 0.07 0.18 0.36 0.33 0.4 0.23 0.42 0.04 0.03 0.36 0.22
0.0 0.0 0.44 0.2 0.09 0.06 0.81 0.4 0.09 1.0 0.13 0.13 0.47 0.03 0.03 0.16 0.18 0.16 0.22 0.24 0.28 0.27 0.34 0.25 0.0 0.01 0.05 0.12
0.04 0.08 0.51 0.15 0.11 0.06 0.62 0.05 0.19 0.14 0.05 0.1 0.2 0.02 0.02 0.6 0.38 0.51 0.54 0.88 0.8 0.83 0.12 1.0 0.04 0.04 0.05 0.06
0.01 0.04 0.75 0.16 0.11 0.11 0.72 0.36 0.14 0.74 0.17 0.1 0.56 0.25 0.2 0.4 0.65 1.0 0.31 0.5 0.68 0.42 0.75 0.49 0.02 0.03 0.3 0.31
0.05 0.19 0.23 0.13 0.16 0.2 1.0 0.24 0.4 0.26 0.4 0.21 0.3 0.19 0.18 0.15 0.22 0.46 0.46 0.29 0.16 0.26 0.39 0.26 0.15 0.09 0.18 0.15
0.0 0.0 0.33 0.05 0.55 0.33 0.71 0.08 0.2 0.16 0.17 1.0 0.32 0.04 0.02 0.17 0.25 0.15 0.1 0.26 0.13 0.21 0.48 0.15 0.0 0.0 0.09 0.01
0.01 0.03 0.34 0.08 0.33 0.16 0.7 0.24 0.7 1.0 0.15 0.35 0.11 0.08 0.06 0.05 0.04 0.09 0.09 0.29 0.07 0.08 0.37 0.07 0.04 0.06 0.16 0.04
0.01 0.01 0.54 0.11 0.14 0.26 0.41 0.88 0.18 0.76 0.18 0.08 0.46 0.04 0.04 0.45 0.45 0.44 0.5 0.36 1.0 0.43 0.15 0.43 0.03 0.02 0.05 0.07
0.07 0.22 0.59 0.17 0.26 0.33 0.89 0.41 0.29 1.0 0.26 0.26 0.48 0.2 0.25 0.29 0.18 0.45 0.18 0.37 0.4 0.25 0.52 0.29 0.23 0.62 0.21 0.19
0.0 0.05 0.36 0.11 0.17 0.25 0.23 0.32 0.26 0.33 0.24 0.16 0.19 0.08 0.08 0.06 0.06 1.0 0.12 0.06 0.12 0.07 0.34 0.09 0.02 0.18 0.14 0.03
0.02 0.03 0.57 0.11 0.2 0.43 0.99 0.07 0.11 0.39 0.09 0.13 0.46 0.01 0.02 0.33 0.25 0.17 0.48 0.64 1.0 0.65 0.15 0.97 0.05 0.02 0.05 0.18
0.0 0.01 0.74 0.1 0.02 0.01 0.83 0.04 0.11 0.16 0.05 0.03 0.1 0.01 0.01 0.44 0.21 0.08 0.44 0.81 0.84 0.81 0.18 1.0 0.02 0.0 0.04 0.07
0.0 0.01 0.63 0.08 0.07 0.05 0.89 0.12 0.16 1.0 0.16 0.1 0.12 0.04 0.05 0.44 0.31 0.13 0.21 0.92 0.33 0.53 0.28 0.39 0.01 0.01 0.11 0.15
0.03 0.17 0.39 0.21 0.2 0.26 0.6 0.29 0.17 0.51 0.17 0.14 0.41 0.44 0.34 0.17 0.15 1.0 0.24 0.25 0.24 0.2 0.32 0.2 0.12 0.1 0.49 0.22
0.01 0.08 0.27 0.15 0.03 0.07 1.0 0.04 0.01 0.52 0.01 0.02 0.32 0.06 0.07 0.05 0.05 0.91 0.07 0.05 0.05 0.04 0.04 0.04 0.51 0.02 0.11 0.08
0.04 0.2 0.37 0.23 0.23 0.25 1.0 0.18 0.25 0.55 0.27 0.27 0.51 0.09 0.11 0.5 0.48 0.83 0.77 0.56 0.51 0.43 0.38 0.62 0.1 0.05 0.15 0.49
0.01 0.01 0.33 0.07 0.15 0.29 0.34 0.48 0.09 0.62 0.12 0.07 0.18 0.0 0.01 0.41 0.43 0.32 1.0 0.32 0.41 0.36 0.03 0.34 0.0 0.0 0.01 0.15
0.13 0.07 0.64 0.35 0.36 0.5 0.75 0.6 0.26 0.85 0.31 0.25 1.0 0.65 0.57 0.67 0.66 0.64 0.45 0.67 1.0 0.63 0.57 0.69 0.34 0.91 0.44 0.44
0.01 0.17 0.37 0.19 0.3 0.3 0.51 0.26 0.15 0.45 0.13 0.27 0.27 0.32 0.3 0.1 0.13 0.62 0.07 0.2 0.06 0.13 0.28 0.15 0.09 0.13 1.0 0.14
0.02 0.17 0.48 0.25 0.23 0.36 0.9 0.59 0.27 1.0 0.26 0.13 0.38 0.34 0.36 0.19 0.22 0.21 0.1 0.37 0.23 0.26 0.3 0.25 0.1 0.11 0.63 0.31
0.0 0.0 0.88 0.05 0.03 0.08 0.57 0.53 0.03 1.0 0.04 0.01 0.43 0.02 0.01 0.26 0.4 0.1 0.87 0.25 0.6 0.45 0.09 0.29 0.0 0.02 0.02 0.12
0.0 0.03 0.26 0.17 0.04 0.02 0.41 1.0 0.59 0.61 0.51 0.03 0.08 0.08 0.13 0.12 0.08 0.09 0.13 0.28 0.28 0.16 0.59 0.19 0.0 0.02 0.11 0.15
0.01 0.02 0.54 0.37 0.13 0.13 1.0 0.5 0.14 0.96 0.16 0.1 0.41 0.29 0.25 0.19 0.24 0.11 0.1 0.17 0.26 0.19 0.35 0.19 0.08 0.03 0.93 0.28
0.11 0.04 0.46 0.17 0.31 0.47 0.83 0.32 0.41 0.45 0.46 0.44 0.35 0.07 0.08 0.65 0.75 0.79 1.0 0.74 0.98 0.8 0.29 0.77 0.04 0.05 0.07 0.31
0.0 0.02 0.28 0.16 0.18 0.33 0.94 1.0 0.37 0.92 0.18 0.08 0.17 0.05 0.05 0.18 0.14 0.47 0.36 0.15 0.21 0.19 0.48 0.17 0.01 0.07 0.05 0.28
0.04 0.06 0.59 0.25 0.17 0.22 1.0 0.48 0.2 0.73 0.2 0.17 0.58 0.21 0.21 0.12 0.15 0.14 0.17 0.2 0.16 0.19 0.61 0.18 0.05 0.34 0.53 0.26
0.02 0.17 0.69 0.47 0.36 0.38 0.88 0.35 0.42 0.61 0.47 0.32 1.0 0.35 0.34 0.6 0.63 0.37 0.49 0.79 0.63 0.67 0.43 0.7 0.11 0.09 0.58 0.51
0.0 0.03 0.87 0.17 0.29 0.27 1.0 0.39 0.35 0.73 0.37 0.31 0.97 0.15 0.14 0.49 0.74 0.4 0.28 0.64 0.53 0.6 0.4 0.42 0.01 0.02 0.24 0.3
0.0 0.01 0.07 0.14 0.07 0.07 0.72 0.08 0.07 1.0 0.09 0.03 0.23 0.07 0.07 0.32 0.19 0.11 0.21 0.11 0.14 0.13 0.04 0.11 0.21 0.01 0.17 0.26
0.02 0.03 0.05 0.07 0.01 0.01 0.09 0.15 0.17 1.0 0.29 0.0 0.09 0.01 0.03 0.01 0.04 0.2 0.06 0.06 0.05 0.04 0.05 0.07 0.22 0.0 0.01 0.08
0.03 0.09 0.65 0.26 0.28 0.21 0.98 0.36 0.25 0.66 0.24 0.26 1.0 0.2 0.23 0.74 0.59 0.38 0.39 0.78 0.72 0.61 0.37 0.7 0.02 0.21 0.34 0.49
0.05 0.13 0.41 0.15 0.27 0.6 0.85 0.49 0.22 0.71 0.29 0.2 0.3 0.22 0.23 0.21 0.23 1.0 0.15 0.23 0.23 0.27 0.21 0.24 0.07 0.19 0.23 0.36
0.14 0.12 0.27 0.11 0.07 0.19 0.17 0.62 0.21 1.0 0.24 0.01 0.25 0.05 0.05 0.34 0.19 0.2 0.14 0.62 0.35 0.36 0.22 0.42 0.04 0.06 0.15 0.03
0.18 0.46 0.29 0.31 0.17 0.1 0.68 0.25 0.1 0.28 0.08 0.07 0.31 0.22 0.32 0.15 0.05 0.13 0.06 0.21 0.16 0.09 0.35 0.1 0.25 0.05 1.0 0.23
0.01 0.04 0.49 0.08 0.28 0.14 1.0 0.37 0.44 0.83 0.51 0.2 0.44 0.3 0.34 0.07 0.12 0.94 0.19 0.08 0.23 0.09 0.27 0.09 0.07 0.07 0.32 0.09
0.04 0.08 0.75 0.24 0.19 0.29 1.0 0.31 0.21 0.62 0.22 0.16 0.55 0.3 0.32 0.09 0.19 0.18 0.06 0.21 0.13 0.19 0.43 0.16 0.05 0.03 0.74 0.2
0.35 0.03 0.71 0.18 0.3 0.41 1.0 0.4 0.26 0.81 0.25 0.21 0.78 0.14 0.13 0.6 0.4 0.73 0.43 0.59 0.57 0.46 0.4 0.48 0.07 0.1 0.37 0.88
0.05 1.0 0.13 0.19 0.02 0.01 0.36 0.04 0.02 0.47 0.03 0.02 0.04 0.03 0.03 0.1 0.09 0.09 0.03 0.2 0.09 0.07 0.11 0.14 0.17 0.02 0.07 0.31
0.01 0.06 0.31 0.13 0.14 0.19 1.0 0.18 0.1 0.39 0.14 0.1 0.5 0.16 0.14 0.16 0.16 0.32 0.18 0.31 0.24 0.19 0.12 0.22 0.04 0.07 0.37 0.11
0.03 0.12 0.34 0.2 0.27 0.26 0.39 0.25 0.24 0.41 0.28 0.33 0.44 0.4 0.42 0.21 0.26 1.0 0.14 0.3 0.26 0.3 0.32 0.28 0.09 0.15 0.38 0.35
0.01 0.01 0.15 0.05 0.0 0.02 0.51 0.13 0.03 1.0 0.05 0.01 0.09 0.06 0.06 0.04 0.04 0.02 0.01 0.02 0.08 0.02 0.12 0.03 0.04 0.01 0.06 0.08
0.01 0.03 0.42 0.11 0.17 0.44 1.0 0.29 0.16 0.58 0.08 0.09 0.16 0.32 0.35 0.4 0.2 0.29 0.37 0.47 0.27 0.27 0.24 0.26 0.0 0.0 0.39 0.14
0.02 0.03 0.69 0.12 0.05 0.08 0.53 0.7 0.34 1.0 0.25 0.04 0.43 0.17 0.13 0.1 0.08 0.24 0.17 0.21 0.27 0.14 0.25 0.16 0.12 0.26 0.38 0.07
0.01 0.03 1.0 0.21 0.15 0.28 0.82 0.12 0.23 0.47 0.35 0.08 0.34 0.23 0.22 0.22 0.38 0.09 0.14 0.2 0.32 0.23 0.58 0.18 0.03 0.03 0.31 0.19
0.0 0.02 0.43 0.3 0.13 0.21 0.39 0.77 0.51 0.68 0.42 0.08 0.37 0.16 0.2 0.86 0.62 0.94 0.6 0.85 1.0 0.91 0.7 0.93 0.02 0.06 0.16 0.4
0.01 0.05 0.3 0.04 0.01 0.01 1.0 0.06 0.01 0.73 0.02 0.02 0.4 0.02 0.04 0.08 0.0 0.37 0.08 0.04 0.16 0.1 0.12 0.08 0.01 0.01 0.09 0.05
0.0 0.03 0.49 0.11 0.3 0.29 0.75 0.36 0.32 0.57 0.39 0.31 0.52 0.14 0.15 0.18 0.17 1.0 0.2 0.28 0.31 0.2 0.53 0.2 0.03 0.08 0.27 0.13
0.02 0.02 0.39 0.12 0.01 0.01 0.9 0.09 0.01 1.0 0.01 0.01 0.6 0.03 0.02 0.02 0.03 0.24 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.08 0.12 0.02
0.11 0.08 0.42 0.17 0.09 0.06 1.0 0.42 0.28 0.61 0.33 0.08 0.31 0.13 0.16 0.28 0.21 0.12 0.18 0.47 0.5 0.31 0.27 0.32 0.02 0.14 0.17 0.32
0.06 0.02 0.7 0.09 0.18 0.49 1.0 0.46 0.02 0.5 0.09 0.0 0.01 0.32 0.44 0.17 0.2 0.11 0.68 0.3 0.3 0.24 0.6 0.38 0.85 0.04 0.67 0.14
0.0 0.0 0.57 0.09 0.12 0.42 1.0 0.2 0.16 0.54 0.15 0.11 0.48 0.03 0.03 0.32 0.35 0.63 0.4 0.49 0.31 0.38 0.17 0.46 0.0 0.0 0.08 0.62
0.01 0.01 0.55 0.13 0.22 0.43 0.86 0.84 0.12 1.0 0.19 0.11 0.49 0.01 0.01 0.47 0.64 0.44 0.92 0.53 0.45 0.54 0.1 0.59 0.0 0.01 0.03 0.18
0.12 0.09 0.5 0.12 0.07 0.35 0.29 0.56 0.23 1.0 0.32 0.03 0.3 0.06 0.06 0.7 0.47 0.49 0.52 0.85 0.43 0.54 0.26 0.67 0.04 0.1 0.31 0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)