Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.11 0.16 0.36 0.28 0.23 0.2 0.26 0.19 0.14 0.18 0.13 0.13 0.37 0.14 0.13 0.3 0.29 1.0 0.17 0.3 0.36 0.27 0.18 0.27 0.05 0.15 0.22 0.23
0.49 0.17 0.18 0.36 0.26 1.0 0.17 0.29 0.22 0.27 0.25 0.23 0.15 0.23 0.2 0.1 0.13 0.66 0.09 0.14 0.11 0.13 0.13 0.1 0.17 0.41 0.18 0.37
0.24 0.35 0.37 0.59 0.9 0.88 0.38 0.28 0.31 0.35 0.34 0.69 0.76 0.38 0.38 0.27 0.29 1.0 0.35 0.41 0.29 0.35 0.47 0.26 0.14 0.58 0.63 0.6
0.1 0.34 0.2 0.4 0.32 0.25 0.2 0.23 0.17 0.23 0.18 0.16 0.37 0.1 0.1 0.41 0.26 1.0 0.33 0.35 0.4 0.29 0.15 0.25 0.18 0.32 0.27 0.28
0.03 0.01 0.14 0.14 0.24 0.2 0.19 0.21 0.05 0.08 0.03 0.04 0.41 0.09 0.14 0.18 0.24 1.0 0.15 0.17 0.19 0.17 0.13 0.18 0.11 0.01 0.4 0.07
0.05 0.16 0.27 0.24 0.37 0.33 0.23 0.32 0.2 0.24 0.23 0.2 0.45 0.14 0.15 0.22 0.19 1.0 0.27 0.23 0.24 0.22 0.19 0.23 0.09 0.09 0.28 0.12
0.14 0.18 0.36 0.23 0.58 0.65 0.24 0.38 0.27 0.27 0.26 0.38 0.38 0.05 0.06 0.36 0.3 1.0 0.34 0.44 0.38 0.38 0.34 0.4 0.03 0.1 0.11 0.1
0.07 0.0 0.08 0.19 0.24 0.13 0.01 0.0 0.09 0.02 0.3 0.42 0.11 0.04 0.03 0.11 0.0 1.0 0.09 0.24 0.0 0.21 0.13 0.18 0.0 0.02 0.1 0.0
0.1 0.14 0.38 0.57 0.32 0.19 0.31 0.11 0.17 0.11 0.13 0.25 0.49 0.29 0.26 0.35 0.29 1.0 0.13 0.32 0.31 0.27 0.3 0.19 0.1 0.13 0.38 0.44
0.09 0.07 0.32 0.38 0.43 0.22 0.35 0.19 0.27 0.19 0.28 0.44 0.44 0.14 0.19 0.43 0.53 1.0 0.79 0.33 0.24 0.37 0.45 0.41 0.01 0.16 0.23 0.44
0.06 0.08 0.32 0.22 0.2 0.11 0.31 0.11 0.17 0.11 0.16 0.12 0.3 0.08 0.09 0.3 0.25 1.0 0.18 0.29 0.28 0.27 0.16 0.26 0.03 0.1 0.18 0.23
0.55 0.74 0.13 0.7 0.75 1.0 0.31 0.34 0.51 0.5 0.54 0.9 0.44 0.47 0.44 0.52 0.81 0.18 0.27 0.59 0.43 0.64 0.29 0.58 0.35 0.73 0.35 0.81
0.02 0.15 0.31 0.43 0.51 0.45 0.24 0.17 0.23 0.18 0.26 0.46 0.36 0.21 0.21 0.46 0.33 1.0 0.13 0.37 0.34 0.32 0.14 0.33 0.07 0.22 0.31 0.31
0.11 0.19 0.08 0.19 0.06 0.05 0.07 0.26 0.06 0.15 0.09 0.02 0.15 0.19 0.2 0.22 0.09 1.0 0.05 0.16 0.1 0.13 0.09 0.1 0.21 0.24 0.32 0.06
0.14 0.08 0.28 0.26 0.21 0.21 0.07 0.16 0.11 0.11 0.13 0.15 0.08 0.17 0.2 0.24 0.2 1.0 0.21 0.38 0.24 0.26 0.38 0.24 0.03 0.12 0.32 0.22
0.16 0.22 0.29 0.41 0.25 0.24 0.33 0.21 0.2 0.24 0.19 0.22 0.31 0.25 0.26 0.29 0.36 1.0 0.61 0.36 0.24 0.33 0.32 0.3 0.33 0.36 0.3 0.38
0.05 0.08 0.44 0.43 0.39 0.55 0.54 0.37 0.24 0.25 0.34 0.31 0.44 0.09 0.14 0.43 0.32 1.0 0.56 0.45 0.42 0.41 0.42 0.37 0.09 0.08 0.17 0.36
0.07 0.17 0.3 0.5 0.25 0.19 0.22 0.17 0.22 0.19 0.2 0.25 0.32 0.34 0.3 0.29 0.24 1.0 0.18 0.33 0.37 0.28 0.33 0.28 0.13 0.24 0.33 0.34
0.14 0.02 0.33 0.19 0.33 0.13 0.34 0.14 0.13 0.15 0.11 0.3 0.39 0.03 0.03 0.17 0.15 1.0 0.36 0.17 0.17 0.17 0.17 0.18 0.01 0.11 0.06 0.15
0.08 0.04 0.22 0.31 0.3 0.23 0.16 0.22 0.09 0.18 0.06 0.1 0.26 0.07 0.11 0.23 0.14 1.0 0.07 0.2 0.2 0.16 0.18 0.14 0.14 0.13 0.36 0.19
0.09 0.03 0.21 0.28 0.43 0.33 0.23 0.26 0.28 0.2 0.31 0.34 0.32 0.11 0.13 0.56 0.38 1.0 0.27 0.43 0.38 0.39 0.26 0.4 0.05 0.18 0.18 0.19
0.74 0.64 0.62 0.59 1.0 0.37 0.54 0.44 0.33 0.25 0.32 0.78 0.83 0.27 0.35 0.66 0.73 0.75 0.47 0.53 0.37 0.54 0.48 0.62 0.32 0.29 0.46 0.4
0.09 0.2 0.57 0.51 0.47 0.41 0.55 0.32 0.25 0.38 0.25 0.32 0.77 0.38 0.33 0.51 0.57 1.0 0.58 0.5 0.43 0.47 0.3 0.42 0.28 0.18 0.47 0.4
0.02 0.05 0.14 0.07 0.19 0.17 0.19 0.16 0.07 0.12 0.04 0.06 0.11 0.07 0.07 0.22 0.09 1.0 0.14 0.19 0.22 0.18 0.05 0.17 0.22 0.02 0.26 0.04
0.01 0.09 0.1 0.32 0.22 0.04 0.13 0.03 0.09 0.04 0.11 0.26 0.13 0.07 0.07 0.3 0.21 1.0 0.69 0.29 0.26 0.34 0.1 0.35 0.04 0.18 0.06 0.14
0.31 0.52 0.24 0.52 0.46 0.51 0.26 0.37 0.29 0.29 0.36 0.3 0.44 0.3 0.27 0.28 0.25 1.0 0.35 0.23 0.22 0.2 0.37 0.18 0.19 0.44 0.31 0.23
0.08 0.03 0.28 0.36 0.35 0.36 0.2 0.16 0.11 0.13 0.1 0.22 0.23 0.06 0.07 0.43 0.38 1.0 0.33 0.44 0.39 0.45 0.16 0.39 0.06 0.08 0.12 0.4
0.21 0.55 0.25 0.45 0.35 0.3 0.22 0.4 0.46 0.39 0.53 0.28 0.32 0.09 0.13 0.47 0.53 1.0 0.34 0.41 0.47 0.43 0.38 0.4 0.1 0.08 0.18 0.29
0.21 0.2 0.47 0.28 0.32 0.21 0.51 0.2 0.21 0.18 0.22 0.21 0.37 0.19 0.2 0.39 0.33 1.0 0.19 0.37 0.39 0.37 0.26 0.37 0.18 0.3 0.2 0.21
0.4 0.04 0.16 0.29 0.16 0.21 0.14 0.12 0.17 0.09 0.17 0.21 0.07 0.09 0.09 0.25 0.3 1.0 0.31 0.27 0.19 0.3 0.1 0.27 0.07 0.05 0.12 0.35
0.01 0.02 0.38 0.12 0.2 0.09 0.24 0.19 0.16 0.1 0.16 0.12 0.2 0.04 0.05 0.2 0.16 1.0 0.15 0.26 0.21 0.21 0.17 0.23 0.02 0.05 0.07 0.11
0.14 0.25 0.48 0.35 0.57 0.34 0.41 0.32 0.27 0.28 0.2 0.34 0.41 0.19 0.19 0.53 0.32 1.0 0.21 0.4 0.4 0.36 0.31 0.39 0.21 0.26 0.43 0.17
0.15 0.23 0.18 0.37 0.56 1.0 0.3 0.11 0.09 0.09 0.08 0.33 0.21 0.23 0.23 0.12 0.13 0.92 0.09 0.12 0.07 0.11 0.14 0.08 0.11 0.24 0.23 0.38
0.02 0.02 0.39 0.26 0.07 0.05 0.11 0.29 0.14 0.05 0.16 0.08 0.14 0.04 0.06 0.08 0.11 1.0 0.19 0.17 0.13 0.18 0.44 0.21 0.01 0.01 0.07 0.13
0.47 0.51 0.41 0.46 0.58 0.64 0.38 0.24 0.23 0.23 0.24 0.42 0.65 0.19 0.2 0.45 0.42 1.0 0.39 0.36 0.29 0.32 0.18 0.28 0.16 0.28 0.35 0.29
0.02 0.04 0.31 0.15 0.23 1.0 0.35 0.28 0.14 0.52 0.18 0.14 0.82 0.05 0.07 0.15 0.06 0.52 0.35 0.33 0.24 0.21 0.15 0.23 0.09 0.13 0.06 0.19
0.07 0.17 0.19 0.25 0.43 0.12 0.14 0.12 0.15 0.11 0.15 0.26 0.5 0.06 0.08 0.37 0.37 1.0 0.35 0.32 0.27 0.27 0.12 0.4 0.06 0.18 0.14 0.21
0.04 0.12 0.01 0.34 0.3 0.1 0.03 0.09 0.12 0.07 0.1 0.19 0.15 0.05 0.06 0.53 0.48 1.0 0.76 0.39 0.33 0.38 0.05 0.49 0.03 0.08 0.07 0.55
0.05 0.15 0.18 0.17 0.13 0.07 0.15 0.16 0.13 0.13 0.12 0.05 0.21 0.1 0.1 0.28 0.19 1.0 0.17 0.24 0.23 0.19 0.13 0.18 0.12 0.09 0.2 0.12
0.02 0.04 0.09 0.29 0.15 0.16 0.09 0.17 0.1 0.14 0.1 0.12 0.12 0.06 0.06 0.15 0.11 1.0 0.06 0.13 0.1 0.13 0.07 0.12 0.02 0.02 0.06 0.4
0.06 0.0 0.13 0.19 0.32 0.78 0.07 0.15 0.05 0.06 0.05 0.23 0.09 0.05 0.05 0.02 0.02 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.05 0.02 0.03 0.05 0.05 0.06
0.07 0.11 0.27 0.31 0.29 0.22 0.19 0.22 0.14 0.22 0.17 0.19 0.28 0.13 0.13 0.27 0.22 1.0 0.15 0.26 0.29 0.25 0.13 0.26 0.15 0.2 0.21 0.21
0.38 0.02 0.41 0.23 0.74 0.36 0.15 0.04 0.18 0.02 0.08 0.37 0.21 0.02 0.04 0.02 0.02 1.0 0.02 0.08 0.06 0.09 0.29 0.06 0.02 0.19 0.11 0.03
0.05 0.09 0.16 0.19 0.71 0.78 0.61 0.46 0.15 0.52 0.2 0.54 0.49 0.23 0.21 0.23 0.28 1.0 0.16 0.06 0.15 0.14 0.34 0.21 0.04 0.06 0.21 0.47
0.0 0.0 0.09 0.07 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.21 0.15 1.0 0.2 0.33 0.19 0.22 0.05 0.18 0.0 0.0 0.01 0.09
0.22 0.11 0.22 0.18 0.4 0.33 0.19 0.5 0.15 0.21 0.11 0.09 0.3 0.09 0.11 0.32 0.21 1.0 0.59 0.31 0.38 0.25 0.11 0.29 0.14 0.14 0.53 0.08
0.14 0.01 0.19 0.27 0.52 0.67 0.19 0.45 0.08 0.35 0.07 0.23 0.14 0.02 0.05 0.21 0.13 0.84 0.03 0.13 0.06 0.16 0.14 0.1 0.02 0.09 0.1 1.0
0.23 0.18 0.24 0.2 0.21 0.2 0.26 0.36 0.28 0.19 0.33 0.18 0.26 0.21 0.21 0.24 0.25 1.0 0.12 0.31 0.29 0.28 0.23 0.27 0.26 0.2 0.29 0.2
0.26 0.36 0.4 0.58 0.64 0.91 0.47 0.54 0.29 0.62 0.33 0.44 0.48 0.3 0.29 0.2 0.29 1.0 0.08 0.25 0.15 0.23 0.23 0.21 0.27 0.29 0.69 0.61
0.41 0.16 0.23 0.34 0.51 0.45 0.11 0.19 0.1 0.09 0.11 0.24 0.36 0.07 0.1 0.35 0.22 1.0 0.11 0.22 0.26 0.2 0.13 0.15 0.16 0.15 0.17 0.11
0.04 0.04 0.34 0.28 0.3 0.2 0.26 0.21 0.23 0.19 0.25 0.21 0.33 0.07 0.08 0.35 0.22 1.0 0.29 0.33 0.39 0.29 0.21 0.31 0.02 0.05 0.12 0.18
0.02 0.09 0.25 0.17 0.2 0.1 0.18 0.13 0.14 0.17 0.17 0.12 0.21 0.11 0.12 0.21 0.16 1.0 0.08 0.22 0.18 0.2 0.14 0.19 0.06 0.15 0.14 0.24
0.3 0.18 0.12 0.25 0.24 0.37 0.44 0.13 0.16 0.29 0.15 0.3 0.32 0.19 0.23 0.35 0.36 1.0 0.39 0.29 0.26 0.33 0.25 0.31 0.7 0.11 0.14 0.47
0.11 0.16 0.18 0.28 0.47 1.0 0.44 0.17 0.14 0.22 0.15 0.35 0.56 0.26 0.24 0.16 0.25 0.97 0.06 0.13 0.07 0.16 0.26 0.11 0.33 0.25 0.26 0.43
0.07 0.08 0.33 0.21 0.32 0.16 0.18 0.35 0.24 0.27 0.26 0.17 0.17 0.13 0.14 0.33 0.23 1.0 0.12 0.29 0.34 0.25 0.21 0.26 0.1 0.14 0.27 0.15
0.88 0.37 0.48 0.43 0.27 0.26 0.21 0.19 0.3 0.15 0.29 0.13 0.26 0.14 0.14 0.45 0.32 0.82 1.0 0.72 0.67 0.67 0.26 0.61 0.38 0.06 0.18 0.33
0.01 0.14 0.04 0.08 0.08 0.04 0.08 0.02 0.05 0.05 0.06 0.05 0.04 0.05 0.05 0.08 0.09 1.0 0.22 0.11 0.11 0.11 0.06 0.12 0.04 0.03 0.06 0.11
0.07 0.1 0.44 0.37 0.48 0.21 0.31 0.22 0.32 0.23 0.33 0.27 0.5 0.2 0.23 0.59 0.41 1.0 0.32 0.53 0.53 0.46 0.28 0.5 0.08 0.23 0.43 0.46
0.15 0.35 0.28 0.54 0.24 0.37 0.27 0.19 0.08 0.25 0.07 0.15 0.41 0.22 0.26 0.17 0.2 0.86 0.08 0.19 0.16 0.17 0.21 0.16 0.14 0.1 1.0 0.38
0.05 0.2 0.25 0.37 0.5 0.56 0.22 0.16 0.16 0.2 0.15 0.22 0.42 0.19 0.18 0.16 0.19 1.0 0.11 0.19 0.15 0.16 0.2 0.13 0.19 0.16 0.4 0.35
0.17 0.23 0.31 0.32 0.06 0.05 0.13 0.23 0.28 0.21 0.37 0.05 0.11 0.13 0.14 0.34 0.21 1.0 0.22 0.41 0.49 0.32 0.2 0.34 0.17 0.15 0.18 0.16
0.03 0.09 0.06 0.2 0.3 0.58 0.08 0.11 0.12 0.11 0.12 0.27 0.13 0.1 0.09 0.12 0.18 1.0 0.12 0.1 0.05 0.14 0.13 0.11 0.06 0.17 0.11 0.19
0.11 0.2 0.49 0.41 0.7 0.45 0.32 0.4 0.39 0.44 0.34 0.44 0.61 0.41 0.42 0.49 0.46 1.0 0.35 0.48 0.43 0.4 0.43 0.37 0.31 0.29 0.62 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)