Heatmap: Cluster_92 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.02 0.07 0.74 0.43 0.46 0.26 0.75 0.66 0.65 0.53 0.6 0.22 0.86 0.3 0.2 0.88 0.52 0.64 0.8 0.85 1.0 0.73 0.52 0.75 0.03 0.19 0.44 0.33
0.05 0.03 1.0 0.36 0.96 0.55 0.61 0.31 0.38 0.39 0.42 0.67 0.78 0.06 0.1 0.49 0.42 0.9 0.53 0.51 0.54 0.51 0.38 0.51 0.01 0.09 0.13 0.36
0.06 0.01 0.26 0.35 0.28 0.14 0.2 0.15 0.23 0.1 0.28 0.35 0.15 0.05 0.05 0.46 0.45 0.22 1.0 0.42 0.39 0.42 0.26 0.48 0.02 0.13 0.08 0.26
0.02 0.0 1.0 0.35 0.47 0.17 0.67 0.38 0.27 0.2 0.27 0.21 0.51 0.02 0.03 0.51 0.33 0.39 0.21 0.54 0.45 0.44 0.19 0.46 0.01 0.0 0.16 0.23
0.08 0.18 0.08 0.28 0.24 0.58 0.13 0.88 0.19 1.0 0.11 0.2 0.16 0.11 0.09 0.09 0.17 0.14 0.12 0.09 0.1 0.09 0.06 0.09 0.26 0.08 0.11 0.08
0.04 0.16 0.19 0.3 0.23 0.25 0.35 0.46 0.32 1.0 0.38 0.3 0.25 0.07 0.06 0.17 0.14 0.18 0.09 0.12 0.16 0.15 0.1 0.14 0.1 0.16 0.05 0.29
0.04 0.07 0.82 0.49 0.71 0.39 0.58 0.69 0.33 0.68 0.29 0.25 0.76 0.15 0.13 0.95 0.54 1.0 0.87 0.75 0.87 0.51 0.37 0.61 0.06 0.26 0.36 0.39
0.0 0.01 0.2 0.35 0.13 0.05 0.6 1.0 0.23 0.64 0.24 0.21 0.29 0.02 0.02 0.16 0.14 0.28 0.28 0.25 0.17 0.17 0.23 0.21 0.01 0.02 0.02 0.41
0.02 0.01 0.82 0.5 0.6 1.0 0.57 0.25 0.23 0.26 0.27 0.5 0.4 0.01 0.04 0.81 0.8 0.24 0.75 0.68 0.57 0.68 0.3 0.79 0.01 0.55 0.02 0.51
0.09 0.12 0.37 0.25 0.48 0.49 0.35 0.3 0.09 0.22 0.12 0.16 0.32 0.06 0.06 0.67 1.0 0.33 0.67 0.56 0.4 0.63 0.2 0.6 0.09 0.08 0.15 0.25
0.09 0.32 0.91 0.56 0.66 0.47 0.81 0.32 0.43 0.32 0.4 0.58 0.68 0.37 0.34 0.6 0.51 0.64 0.55 0.66 0.69 0.66 0.55 0.65 0.4 0.41 1.0 0.6
0.19 0.2 0.37 0.47 0.93 0.94 0.35 0.38 0.5 0.35 0.53 1.0 0.33 0.21 0.27 0.47 0.58 0.37 0.85 0.51 0.3 0.54 0.57 0.52 0.21 0.57 0.19 0.71
0.03 0.02 1.0 0.52 0.71 0.62 0.44 0.34 0.21 0.17 0.19 0.35 0.62 0.09 0.1 0.96 0.55 0.39 0.31 0.72 0.74 0.7 0.47 0.65 0.05 0.06 0.27 0.68
0.0 0.0 0.15 0.41 0.03 0.0 0.14 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.01 0.89 0.59 0.09 0.4 0.92 0.49 1.0 0.01 0.83 0.0 0.01 0.0 0.12
0.11 0.18 0.82 0.81 0.82 0.27 0.64 0.62 0.95 0.26 0.77 0.63 0.62 0.31 0.37 0.85 0.58 0.47 0.64 0.96 0.75 1.0 0.94 0.91 0.05 0.39 0.48 0.47
0.15 0.08 0.65 0.44 0.26 0.17 0.73 0.15 0.49 0.79 0.51 0.26 1.0 0.14 0.13 0.2 0.16 0.27 0.24 0.44 0.31 0.36 0.22 0.27 0.04 0.38 0.13 0.65
0.06 0.14 0.44 0.71 0.25 0.25 0.44 0.93 0.91 0.86 0.77 0.33 0.51 0.33 0.31 0.75 0.58 0.49 0.42 0.57 0.78 1.0 0.25 0.82 0.57 0.24 0.26 0.94
0.48 0.66 0.56 0.66 0.89 1.0 0.53 0.93 0.42 0.61 0.42 0.51 0.87 0.45 0.43 0.7 0.62 0.45 0.19 0.49 0.61 0.5 0.58 0.42 0.73 0.21 0.62 0.7
0.0 0.0 0.37 0.5 0.86 0.96 0.27 0.32 0.3 0.35 0.3 1.0 0.49 0.14 0.16 0.62 0.63 0.48 0.31 0.53 0.44 0.57 0.36 0.55 0.01 0.41 0.17 0.69
0.0 0.02 0.5 0.75 1.0 0.95 0.78 0.52 0.45 0.65 0.55 0.82 0.95 0.28 0.21 0.91 0.7 0.74 0.44 0.73 0.7 0.75 0.37 0.72 0.01 0.27 0.27 0.86
0.17 0.04 0.57 0.56 0.78 0.59 0.36 0.83 0.78 0.47 0.84 0.58 0.32 0.18 0.2 0.49 0.37 0.6 1.0 0.53 0.48 0.48 0.67 0.51 0.02 0.16 0.3 0.43
0.04 0.29 0.51 0.61 0.62 0.53 0.68 0.37 0.5 0.56 0.5 0.74 1.0 0.5 0.56 0.39 0.4 0.69 0.17 0.57 0.39 0.39 0.99 0.45 0.29 0.72 0.96 0.75
0.05 0.03 1.0 0.52 0.55 0.38 0.45 0.56 0.3 0.32 0.36 0.5 0.5 0.17 0.23 0.86 0.78 0.84 0.72 0.65 0.7 0.72 0.53 0.93 0.06 0.18 0.26 0.18
0.11 0.15 0.85 0.57 0.67 0.52 0.49 0.59 0.88 0.53 0.9 0.85 0.36 0.28 0.26 0.71 0.59 0.32 1.0 0.77 0.66 0.87 0.38 0.81 0.14 0.17 0.31 0.4
0.25 0.38 0.26 0.43 0.92 1.0 0.29 0.28 0.37 0.35 0.44 0.81 0.32 0.33 0.29 0.21 0.41 0.29 0.36 0.26 0.13 0.27 0.43 0.18 0.48 0.66 0.37 0.54
0.07 0.17 0.24 0.31 0.69 1.0 0.2 0.25 0.2 0.17 0.23 0.76 0.35 0.17 0.2 0.24 0.25 0.25 0.51 0.24 0.15 0.26 0.25 0.25 0.27 0.25 0.18 0.19
0.13 0.01 0.47 0.4 0.43 0.26 0.43 0.07 0.18 0.05 0.25 0.54 0.28 0.03 0.06 0.66 0.72 0.25 1.0 0.5 0.24 0.55 0.18 0.55 0.01 0.24 0.07 0.25
0.41 0.21 0.62 0.45 0.39 0.35 0.52 0.52 0.38 0.4 0.31 0.2 0.55 0.34 0.33 0.66 0.57 0.7 1.0 0.61 0.63 0.58 0.44 0.56 0.07 0.12 0.7 0.58
0.13 0.14 0.82 0.58 0.91 1.0 0.72 0.57 0.56 0.39 0.63 0.82 0.42 0.33 0.32 0.83 0.79 0.37 0.37 0.78 0.69 0.88 0.5 0.89 0.24 0.26 0.28 0.74
0.16 0.56 0.69 0.56 0.89 0.61 0.44 0.4 0.66 0.3 0.55 0.83 0.52 0.29 0.4 0.74 0.7 0.44 1.0 0.76 0.64 0.78 0.6 0.78 0.06 0.35 0.26 0.52
0.05 0.07 0.46 0.46 0.56 0.31 0.34 0.25 0.55 0.18 0.51 0.67 0.35 0.2 0.29 0.36 0.34 0.38 1.0 0.47 0.24 0.5 0.58 0.43 0.07 0.33 0.2 0.49
0.16 0.03 0.82 0.5 0.62 0.3 0.61 0.24 0.23 0.12 0.22 0.59 1.0 0.14 0.15 0.46 0.41 0.41 0.45 0.54 0.61 0.59 0.48 0.62 0.02 0.19 0.16 0.43
0.0 0.0 0.62 0.34 0.2 0.02 0.37 0.09 0.16 0.07 0.17 0.14 0.5 0.04 0.04 0.91 0.42 0.2 0.73 0.83 0.48 0.88 0.2 1.0 0.0 0.0 0.03 0.34
0.03 0.23 0.72 0.78 0.85 0.49 0.77 0.43 0.74 0.3 0.69 0.79 0.68 0.59 0.6 0.81 0.53 0.63 0.83 0.94 0.71 0.78 0.74 0.92 0.43 0.63 0.54 1.0
0.13 0.17 1.0 0.53 0.34 0.35 0.61 0.3 0.16 0.29 0.14 0.19 0.94 0.23 0.19 0.45 0.37 0.16 0.86 0.52 0.56 0.47 0.27 0.4 0.16 0.15 0.68 0.23
0.42 0.0 0.91 0.55 0.15 0.01 0.64 0.3 0.48 0.1 0.4 0.12 0.37 0.0 0.01 0.4 0.28 0.04 0.43 0.66 0.92 0.68 0.24 1.0 0.0 0.0 0.03 0.16
0.01 0.02 0.53 0.5 0.59 0.63 0.49 0.36 0.5 0.19 0.72 1.0 0.3 0.04 0.05 0.46 0.67 0.34 0.39 0.55 0.42 0.73 0.39 0.7 0.03 0.04 0.05 0.34
0.0 0.01 0.45 0.49 0.34 0.3 0.28 0.18 0.18 0.03 0.38 1.0 0.19 0.13 0.1 0.28 0.45 0.15 0.35 0.37 0.25 0.45 0.23 0.47 0.0 0.02 0.04 0.29
0.1 0.0 0.79 0.74 0.43 0.24 0.38 0.51 0.34 0.59 0.48 0.39 0.29 0.07 0.06 0.9 0.68 0.54 1.0 0.78 0.67 0.91 0.3 0.95 0.01 0.02 0.09 0.79
0.08 0.08 0.54 0.62 0.87 0.91 0.52 0.57 0.44 0.39 0.44 0.49 0.7 0.3 0.34 1.0 0.78 0.53 0.82 0.85 0.78 0.64 0.61 0.6 0.1 0.11 0.5 0.59
0.03 0.04 0.24 0.59 0.12 0.04 0.6 0.48 0.81 0.39 0.55 0.11 0.43 0.28 0.27 0.24 0.15 0.21 1.0 0.32 0.26 0.22 0.22 0.29 0.01 0.04 0.3 0.2
0.26 0.13 0.54 0.48 0.59 0.82 0.34 0.24 0.26 0.16 0.26 0.47 0.24 0.17 0.21 0.82 0.89 0.22 1.0 0.63 0.33 0.63 0.3 0.77 0.1 0.14 0.18 0.24
0.02 0.02 1.0 0.73 0.6 0.54 0.58 0.19 0.29 0.12 0.31 0.53 0.5 0.07 0.09 0.58 0.61 0.22 0.85 0.55 0.5 0.55 0.18 0.66 0.01 0.08 0.07 0.43
0.15 0.05 0.33 0.26 0.7 0.26 0.23 0.08 0.11 0.04 0.14 0.61 0.23 0.04 0.05 0.61 1.0 0.27 0.61 0.48 0.54 0.64 0.24 0.86 0.02 0.17 0.06 0.42
0.0 0.0 1.0 0.3 0.5 0.07 0.48 0.07 0.19 0.01 0.08 0.18 0.81 0.0 0.0 0.34 0.19 0.24 1.0 0.53 0.72 0.43 0.09 0.6 0.0 0.0 0.06 0.03
0.15 0.37 0.33 0.4 0.62 1.0 0.31 0.39 0.28 0.31 0.33 0.55 0.34 0.44 0.52 0.42 0.39 0.28 0.5 0.35 0.27 0.37 0.44 0.32 0.23 0.37 0.42 0.31
0.09 0.14 0.77 0.58 0.99 0.64 0.46 0.65 0.71 0.38 0.75 1.0 0.47 0.33 0.37 0.71 0.67 0.43 0.7 0.64 0.58 0.77 0.52 0.71 0.05 0.63 0.38 0.33
0.02 0.09 0.34 0.37 0.56 0.46 0.38 0.43 0.35 0.33 0.37 0.51 0.39 0.19 0.22 0.52 0.35 0.39 1.0 0.43 0.48 0.41 0.34 0.38 0.08 0.22 0.18 0.25
0.46 0.1 0.48 0.5 0.74 0.68 0.34 0.23 0.51 0.15 0.55 0.94 0.32 0.22 0.27 0.56 0.61 0.22 1.0 0.47 0.34 0.5 0.47 0.56 0.03 0.39 0.19 0.39
0.0 0.01 0.56 0.4 0.71 0.44 0.48 0.41 0.28 0.13 0.35 0.87 0.38 0.06 0.1 0.81 0.71 0.69 0.63 0.77 0.84 1.0 0.3 0.91 0.01 0.03 0.09 0.16
0.06 0.21 0.46 0.44 0.64 0.76 0.37 0.51 0.61 0.43 0.61 0.71 0.28 0.15 0.15 0.43 0.32 0.2 1.0 0.47 0.47 0.5 0.24 0.48 0.13 0.12 0.17 0.21
0.23 0.15 0.75 0.57 0.83 0.48 0.48 0.63 0.45 0.51 0.45 0.58 0.68 0.37 0.39 0.72 0.6 1.0 0.65 0.58 0.57 0.47 0.75 0.47 0.13 0.2 0.48 0.61
0.44 0.16 1.0 0.6 0.98 0.75 0.6 0.19 0.28 0.12 0.27 0.79 0.65 0.14 0.15 0.51 0.44 0.65 0.62 0.71 0.75 0.84 0.59 0.86 0.11 0.09 0.26 0.76
0.15 0.08 0.71 0.48 0.84 0.82 0.5 0.59 0.44 0.25 0.55 0.65 0.53 0.17 0.19 0.93 0.82 0.58 0.59 0.81 0.72 0.88 0.54 1.0 0.02 0.32 0.17 0.3
0.5 0.01 0.73 0.58 1.0 0.98 0.71 0.91 0.71 0.54 0.74 0.65 0.57 0.15 0.2 0.53 0.47 0.65 0.2 0.65 0.37 0.64 0.83 0.6 0.02 0.05 0.33 0.61
0.18 0.12 0.37 0.36 0.49 0.42 0.49 0.39 0.33 0.27 0.32 0.4 0.59 0.21 0.2 0.73 0.45 0.87 1.0 0.67 0.73 0.57 0.36 0.57 0.05 0.17 0.3 0.31
0.08 0.17 0.55 0.5 0.8 0.36 0.35 0.18 0.27 0.14 0.26 0.87 0.47 0.16 0.2 0.73 0.77 0.31 0.88 0.71 0.56 0.72 0.25 1.0 0.02 0.07 0.32 0.3
0.15 0.12 0.73 0.49 0.53 0.4 0.56 0.49 0.4 0.36 0.43 0.33 0.79 0.19 0.2 0.76 0.53 1.0 0.66 0.7 0.73 0.59 0.48 0.61 0.15 0.14 0.4 0.38
0.1 0.1 0.9 0.74 0.65 0.47 0.67 0.23 0.48 0.12 0.41 0.6 0.44 0.23 0.28 0.67 0.5 0.26 1.0 0.81 0.72 0.83 0.49 0.79 0.11 0.28 0.2 0.8
0.05 0.36 0.88 0.59 0.73 0.35 0.57 0.67 0.64 0.38 0.68 0.56 0.59 0.53 0.57 0.48 0.43 0.45 1.0 0.59 0.48 0.63 0.71 0.65 0.3 0.16 0.49 0.45
0.03 0.03 0.44 0.65 0.68 0.46 0.46 0.14 0.48 0.17 0.51 1.0 0.31 0.21 0.33 0.63 0.83 0.32 0.9 0.56 0.33 0.62 0.7 0.56 0.03 0.31 0.24 0.61
0.2 0.17 0.69 0.63 0.96 0.73 0.66 0.5 0.65 0.49 0.73 0.91 1.0 0.44 0.43 0.87 0.98 0.43 0.99 0.88 0.88 0.86 0.6 0.82 0.27 0.48 0.54 0.5
0.07 0.01 0.88 0.45 0.8 0.92 0.67 0.32 0.1 0.09 0.08 0.48 0.43 0.02 0.03 0.7 0.64 0.2 0.45 0.74 0.9 0.86 0.22 1.0 0.01 0.02 0.05 0.32
0.05 0.12 0.4 0.41 0.32 0.2 0.53 0.26 0.35 0.48 0.37 0.32 0.41 0.11 0.13 0.42 0.48 0.32 1.0 0.45 0.32 0.48 0.31 0.51 0.05 0.13 0.16 0.61
0.04 0.03 0.36 0.32 0.25 0.15 0.31 0.25 0.21 0.12 0.22 0.12 0.31 0.11 0.12 0.63 0.37 0.39 1.0 0.51 0.74 0.44 0.16 0.54 0.04 0.08 0.19 0.19
0.21 0.26 0.72 0.71 0.64 0.51 0.52 0.33 0.41 0.32 0.44 0.53 0.71 0.14 0.18 0.88 0.64 0.43 0.59 0.85 1.0 0.74 0.59 0.76 0.08 0.16 0.19 0.58
0.03 0.19 1.0 0.94 0.89 0.73 0.33 0.2 0.27 0.17 0.3 0.98 0.36 0.4 0.4 0.96 0.8 0.42 0.94 0.77 0.75 0.95 0.45 0.92 0.15 0.54 0.23 0.81
0.01 0.05 0.65 0.47 0.53 0.4 0.41 0.36 0.45 0.37 0.46 0.6 0.31 0.18 0.17 0.52 0.38 0.32 1.0 0.56 0.58 0.58 0.42 0.63 0.02 0.09 0.2 0.46
0.04 0.13 0.66 0.59 0.75 0.76 0.75 0.66 0.83 0.97 0.86 0.67 0.58 0.41 0.35 0.83 0.65 0.79 1.0 0.8 0.86 0.72 0.51 0.66 0.06 0.17 0.41 0.68
0.02 0.12 0.32 0.47 0.62 0.26 0.2 0.11 0.38 0.14 0.42 0.81 0.2 0.15 0.22 0.5 0.54 0.23 1.0 0.4 0.27 0.44 0.42 0.44 0.03 0.24 0.13 0.43
0.07 0.11 0.59 0.55 0.77 0.83 0.73 0.34 0.38 0.22 0.41 0.73 0.48 0.19 0.22 0.61 0.66 0.32 1.0 0.5 0.44 0.55 0.41 0.58 0.07 0.44 0.21 0.72
0.12 0.21 1.0 0.83 0.7 0.4 0.78 0.34 0.47 0.29 0.49 0.58 0.86 0.22 0.25 0.92 0.78 0.3 0.41 0.92 0.76 0.87 0.37 0.87 0.14 0.33 0.27 0.52
0.48 0.54 0.79 0.55 0.6 0.86 0.63 0.54 0.6 0.52 0.63 0.64 0.43 0.47 0.48 0.65 0.61 0.4 1.0 0.82 0.62 0.78 0.55 0.72 0.36 0.47 0.49 0.56
0.08 0.33 0.4 0.52 0.73 0.5 0.31 0.27 0.45 0.22 0.47 0.57 0.43 0.15 0.2 0.84 0.62 0.53 1.0 0.72 0.63 0.65 0.36 0.67 0.14 0.25 0.2 0.48
0.24 0.21 0.5 0.43 0.61 1.0 0.53 0.38 0.52 0.32 0.41 0.58 0.44 0.18 0.22 0.6 0.68 0.33 0.45 0.6 0.45 0.61 0.44 0.55 0.1 0.14 0.31 0.47
0.1 0.08 0.4 0.59 0.96 1.0 0.44 0.84 0.51 0.52 0.5 0.53 0.49 0.29 0.3 0.79 0.57 0.82 0.61 0.73 0.68 0.53 0.61 0.5 0.12 0.1 0.43 0.48
0.02 0.03 0.44 0.41 0.52 0.43 1.0 0.32 0.45 0.7 0.63 0.84 0.72 0.05 0.08 0.3 0.33 0.4 0.38 0.25 0.14 0.35 0.31 0.35 0.01 0.15 0.12 0.68
0.04 0.06 0.17 0.53 0.16 0.27 0.32 0.42 0.25 0.51 0.21 0.11 0.51 0.11 0.14 0.17 0.33 0.28 0.2 0.18 0.08 0.31 0.62 0.22 0.1 0.01 0.14 1.0
0.14 0.04 0.65 0.43 0.62 0.45 0.51 0.26 0.36 0.24 0.39 0.49 0.4 0.15 0.15 0.71 0.44 0.46 1.0 0.67 0.65 0.6 0.36 0.64 0.03 0.06 0.19 0.37
0.27 0.35 0.51 0.56 0.57 0.36 0.44 0.46 0.35 0.24 0.38 0.29 0.69 0.2 0.23 0.97 0.51 0.47 0.66 0.72 1.0 0.57 0.51 0.58 0.33 0.33 0.48 0.4
0.0 0.02 0.24 0.49 0.07 0.05 0.24 0.71 0.88 1.0 0.38 0.08 0.15 0.32 0.35 0.19 0.14 0.44 0.27 0.44 0.82 0.44 0.34 0.59 0.01 0.01 0.33 0.27
0.0 0.02 0.27 0.52 0.07 0.05 0.27 0.72 0.98 1.0 0.35 0.12 0.18 0.28 0.27 0.23 0.15 0.48 0.39 0.45 0.78 0.46 0.3 0.63 0.02 0.02 0.3 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)