View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | FB cap+lamellae,YMG,strain #326 | FB stipe,YMG,strain #326 | Hyphal knots,control,strain #326 | Mycelium | Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h | Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h | Mycelium,LiCl,strain #326 | Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO | Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO | Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO | Mycelium,control,20C,matA/matB KO | Mycelium,control,28C,8h | Mycelium,control,strain #326 | Stg 1 primordium,YMG,strain #326 | Stg 2 primordium,YMG,strain #326 | Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130 | Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130 | Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO | Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130 | Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130 | Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130 | Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130 | Vegetative mycelium,YMG,strain #326 | Mycelium,control,YMG,37C,strain #130 | YFB cap,YMG,strain #326 | YFB lamellae,YMG,strain #326 | secondary hyphal knots,YMG,strain #326 | strain #130 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0.0 | 0.02 | 0.41 | 0.03 | 0.8 | 0.18 | 0.34 | 0.14 | 0.71 | 0.41 | 0.85 | 1.0 | 0.43 | 0.48 | 0.33 | 0.12 | 0.1 | 0.78 | 0.24 | 0.46 | 0.1 | 0.31 | 0.18 | 0.39 | 0.0 | 0.05 | 0.95 | 0.04 | |
0.0 | 0.12 | 0.12 | 0.04 | 0.3 | 0.12 | 0.16 | 0.07 | 0.37 | 0.27 | 0.54 | 0.46 | 0.24 | 0.61 | 0.39 | 0.08 | 0.06 | 1.0 | 0.28 | 0.21 | 0.07 | 0.15 | 0.07 | 0.19 | 0.02 | 0.07 | 0.74 | 0.05 | |
0.27 | 0.46 | 0.57 | 0.66 | 0.8 | 1.0 | 0.64 | 0.43 | 0.46 | 0.49 | 0.47 | 0.76 | 0.64 | 0.44 | 0.4 | 0.45 | 0.61 | 0.87 | 1.0 | 0.56 | 0.26 | 0.51 | 0.52 | 0.54 | 0.14 | 0.42 | 0.46 | 0.51 | |
0.48 | 0.08 | 0.12 | 0.02 | 0.47 | 0.28 | 0.22 | 0.09 | 0.81 | 0.42 | 1.0 | 0.67 | 0.21 | 0.23 | 0.19 | 0.05 | 0.02 | 0.21 | 0.08 | 0.13 | 0.02 | 0.08 | 0.05 | 0.08 | 0.81 | 0.01 | 0.16 | 0.02 | |
0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.61 | 0.46 | 0.96 | 0.48 | 0.32 | 0.03 | 1.0 | 0.03 | 0.57 | 0.24 | 0.04 | 0.06 | 0.15 | 0.18 | 0.23 | 0.12 | 0.16 | 0.07 | 0.32 | 0.02 | 0.08 | 0.01 | 0.01 | 0.12 | 0.55 | |
0.03 | 0.02 | 0.16 | 0.1 | 0.54 | 0.6 | 0.2 | 0.21 | 0.43 | 1.0 | 0.65 | 0.46 | 0.7 | 0.02 | 0.02 | 0.03 | 0.09 | 0.21 | 0.02 | 0.05 | 0.09 | 0.04 | 0.07 | 0.02 | 0.06 | 0.08 | 0.02 | 0.07 | |
0.0 | 0.0 | 0.07 | 0.08 | 0.16 | 0.02 | 0.18 | 0.07 | 0.76 | 0.74 | 1.0 | 0.49 | 0.37 | 0.11 | 0.07 | 0.13 | 0.13 | 0.22 | 0.11 | 0.33 | 0.08 | 0.2 | 0.07 | 0.21 | 0.0 | 0.04 | 0.47 | 0.11 | |
0.0 | 0.0 | 0.3 | 0.06 | 0.31 | 0.11 | 0.22 | 0.07 | 0.74 | 0.28 | 1.0 | 0.61 | 0.28 | 0.05 | 0.07 | 0.05 | 0.04 | 0.13 | 0.09 | 0.13 | 0.02 | 0.08 | 0.16 | 0.09 | 0.0 | 0.0 | 0.33 | 0.05 | |
0.48 | 0.02 | 0.08 | 1.0 | 0.49 | 0.69 | 0.44 | 0.18 | 0.01 | 0.26 | 0.12 | 0.42 | 0.99 | 0.06 | 0.04 | 0.69 | 0.59 | 0.82 | 0.73 | 0.37 | 0.76 | 0.33 | 0.06 | 0.27 | 0.01 | 0.09 | 0.02 | 0.53 | |
0.05 | 0.77 | 0.28 | 0.4 | 0.39 | 1.0 | 0.23 | 0.24 | 0.41 | 0.73 | 0.55 | 0.18 | 0.54 | 0.23 | 0.43 | 0.04 | 0.27 | 0.24 | 0.04 | 0.13 | 0.34 | 0.23 | 0.15 | 0.31 | 0.68 | 0.52 | 0.19 | 0.31 | |
0.0 | 0.01 | 0.12 | 0.31 | 0.36 | 0.58 | 0.37 | 0.11 | 0.23 | 0.43 | 0.3 | 0.24 | 0.76 | 0.01 | 0.02 | 0.2 | 0.23 | 0.29 | 0.16 | 0.17 | 0.15 | 0.22 | 0.07 | 0.17 | 0.0 | 0.14 | 0.04 | 1.0 | |
0.04 | 0.01 | 0.02 | 0.11 | 0.12 | 0.05 | 0.05 | 0.2 | 0.74 | 0.96 | 1.0 | 0.19 | 0.16 | 0.02 | 0.03 | 0.09 | 0.03 | 0.5 | 0.01 | 0.07 | 0.05 | 0.07 | 0.02 | 0.03 | 0.1 | 0.27 | 0.05 | 0.16 | |
0.02 | 0.07 | 0.18 | 0.04 | 0.04 | 0.07 | 0.39 | 0.21 | 0.42 | 0.08 | 0.53 | 0.04 | 0.54 | 0.21 | 0.2 | 0.56 | 1.0 | 0.68 | 0.93 | 0.31 | 0.31 | 0.43 | 0.08 | 0.81 | 0.01 | 0.04 | 0.1 | 0.06 | |
0.4 | 0.72 | 0.19 | 0.49 | 0.55 | 0.36 | 0.68 | 0.5 | 0.68 | 1.0 | 0.55 | 0.61 | 0.82 | 0.55 | 0.48 | 0.34 | 0.26 | 0.33 | 0.21 | 0.32 | 0.21 | 0.24 | 0.17 | 0.23 | 0.45 | 0.58 | 0.49 | 0.24 | |
0.03 | 0.05 | 0.34 | 0.41 | 0.25 | 0.2 | 0.53 | 0.26 | 0.41 | 1.0 | 0.53 | 0.25 | 0.57 | 0.24 | 0.2 | 0.29 | 0.42 | 0.14 | 0.19 | 0.37 | 0.28 | 0.27 | 0.13 | 0.24 | 0.07 | 0.04 | 0.21 | 0.34 | |
0.0 | 0.06 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.0 | 0.01 | 0.05 | 0.03 | 0.11 | 0.16 | 0.34 | 0.0 | 0.14 | 0.11 | 0.01 | 0.0 | 0.95 | 0.01 | 0.04 | 0.0 | 0.02 | 0.0 | 0.01 | 0.07 | 0.01 | 1.0 | 0.01 | |
0.07 | 0.11 | 0.32 | 0.24 | 0.24 | 0.2 | 0.5 | 0.08 | 0.21 | 0.17 | 0.26 | 0.27 | 1.0 | 0.07 | 0.09 | 0.17 | 0.23 | 0.1 | 0.19 | 0.25 | 0.17 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | 0.24 | 0.23 | 0.13 | 0.11 | |
1.0 | 0.67 | 0.57 | 0.47 | 0.68 | 0.25 | 0.65 | 0.17 | 0.62 | 0.32 | 0.35 | 0.56 | 0.69 | 0.2 | 0.17 | 0.5 | 0.43 | 0.4 | 0.29 | 0.49 | 0.32 | 0.51 | 0.13 | 0.37 | 0.26 | 0.12 | 0.23 | 0.57 | |
0.0 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.01 | 0.27 | 0.02 | 0.65 | 0.43 | 1.0 | 0.08 | 0.35 | 0.01 | 0.0 | 0.03 | 0.01 | 0.31 | 0.03 | 0.07 | 0.01 | 0.04 | 0.0 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | |
0.03 | 0.1 | 0.38 | 0.19 | 0.3 | 0.37 | 0.32 | 0.27 | 0.6 | 0.38 | 1.0 | 0.64 | 0.22 | 0.36 | 0.23 | 0.34 | 0.45 | 0.28 | 0.45 | 0.3 | 0.17 | 0.49 | 0.18 | 0.43 | 0.1 | 0.13 | 0.17 | 0.19 | |
0.0 | 0.0 | 0.25 | 0.29 | 0.24 | 0.17 | 0.42 | 0.37 | 0.52 | 1.0 | 0.83 | 0.3 | 0.76 | 0.01 | 0.02 | 0.48 | 0.54 | 0.35 | 0.28 | 0.3 | 0.79 | 0.51 | 0.05 | 0.44 | 0.0 | 0.0 | 0.01 | 0.11 | |
0.01 | 0.56 | 0.31 | 0.63 | 0.52 | 0.78 | 0.83 | 0.27 | 0.44 | 0.7 | 0.65 | 0.35 | 1.0 | 0.08 | 0.09 | 0.91 | 0.79 | 0.65 | 0.4 | 0.82 | 0.69 | 0.79 | 0.07 | 0.61 | 0.46 | 0.61 | 0.07 | 0.8 | |
0.01 | 0.07 | 0.03 | 0.08 | 0.26 | 1.0 | 0.1 | 0.01 | 0.01 | 0.14 | 0.01 | 0.03 | 0.42 | 0.01 | 0.01 | 0.06 | 0.15 | 0.04 | 0.2 | 0.07 | 0.41 | 0.09 | 0.01 | 0.11 | 0.01 | 0.0 | 0.01 | 0.05 | |
0.17 | 0.54 | 0.1 | 0.28 | 0.48 | 1.0 | 0.4 | 0.17 | 0.16 | 0.56 | 0.16 | 0.16 | 0.9 | 0.09 | 0.11 | 0.52 | 0.39 | 0.55 | 0.04 | 0.13 | 0.24 | 0.3 | 0.08 | 0.07 | 0.22 | 0.27 | 0.2 | 0.42 | |
0.02 | 0.07 | 0.1 | 0.1 | 0.25 | 0.23 | 0.32 | 0.24 | 0.22 | 0.84 | 0.3 | 0.23 | 0.48 | 0.05 | 0.04 | 0.13 | 0.09 | 1.0 | 0.1 | 0.14 | 0.26 | 0.11 | 0.02 | 0.1 | 0.01 | 0.04 | 0.06 | 0.19 | |
0.03 | 0.38 | 0.26 | 0.27 | 0.24 | 0.28 | 0.34 | 0.31 | 0.09 | 0.32 | 0.13 | 0.17 | 0.43 | 0.16 | 0.13 | 0.34 | 1.0 | 0.5 | 0.29 | 0.24 | 0.44 | 0.23 | 0.41 | 0.24 | 0.06 | 0.02 | 0.13 | 0.68 | |
0.0 | 0.0 | 0.07 | 0.29 | 0.02 | 0.04 | 0.51 | 0.07 | 0.63 | 1.0 | 0.52 | 0.03 | 0.62 | 0.05 | 0.05 | 0.06 | 0.04 | 0.25 | 0.08 | 0.07 | 0.09 | 0.07 | 0.02 | 0.08 | 0.05 | 0.01 | 0.02 | 0.1 | |
0.0 | 0.02 | 0.15 | 0.09 | 0.12 | 0.04 | 0.19 | 0.69 | 0.09 | 1.0 | 0.15 | 0.07 | 0.23 | 0.04 | 0.03 | 0.17 | 0.14 | 0.15 | 0.25 | 0.07 | 0.13 | 0.17 | 0.06 | 0.12 | 0.05 | 0.08 | 0.06 | 0.35 | |
0.28 | 0.02 | 0.06 | 0.05 | 0.45 | 0.68 | 0.27 | 0.07 | 0.17 | 0.85 | 0.3 | 0.68 | 0.27 | 0.05 | 0.04 | 0.07 | 0.05 | 1.0 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | 0.07 | 0.03 | 0.07 | 0.11 | 0.06 | 0.04 | 0.06 | |
0.01 | 0.01 | 0.2 | 0.22 | 0.3 | 0.12 | 0.39 | 0.24 | 0.23 | 1.0 | 0.4 | 0.34 | 0.43 | 0.16 | 0.09 | 0.28 | 0.19 | 0.8 | 0.2 | 0.56 | 0.46 | 0.51 | 0.06 | 0.56 | 0.01 | 0.0 | 0.18 | 0.21 | |
0.05 | 0.25 | 1.0 | 0.49 | 0.55 | 0.48 | 0.75 | 0.24 | 0.31 | 0.46 | 0.3 | 0.53 | 0.99 | 0.16 | 0.17 | 0.75 | 0.5 | 0.34 | 0.41 | 0.66 | 0.72 | 0.54 | 0.24 | 0.58 | 0.81 | 0.62 | 0.25 | 0.52 | |
0.01 | 0.03 | 0.42 | 0.18 | 0.7 | 0.61 | 0.52 | 0.18 | 0.52 | 0.91 | 0.59 | 0.92 | 1.0 | 0.03 | 0.01 | 0.1 | 0.08 | 0.45 | 0.05 | 0.11 | 0.06 | 0.13 | 0.1 | 0.05 | 0.26 | 0.25 | 0.02 | 0.16 | |
0.06 | 0.14 | 0.39 | 0.57 | 1.0 | 0.91 | 0.48 | 0.22 | 0.16 | 0.34 | 0.11 | 0.35 | 0.98 | 0.43 | 0.4 | 0.3 | 0.32 | 0.46 | 0.18 | 0.32 | 0.34 | 0.26 | 0.39 | 0.22 | 0.67 | 0.07 | 0.62 | 0.55 | |
0.05 | 0.15 | 0.29 | 0.22 | 0.17 | 0.1 | 0.67 | 0.36 | 0.2 | 0.86 | 0.29 | 0.13 | 0.3 | 0.19 | 0.17 | 0.72 | 0.8 | 0.21 | 0.6 | 0.77 | 1.0 | 0.7 | 0.43 | 0.88 | 0.08 | 0.24 | 0.22 | 0.16 | |
0.08 | 0.18 | 0.61 | 0.22 | 0.21 | 0.21 | 0.88 | 0.55 | 0.19 | 1.0 | 0.25 | 0.26 | 0.31 | 0.23 | 0.21 | 0.46 | 0.51 | 0.7 | 0.35 | 0.51 | 0.71 | 0.63 | 0.44 | 0.71 | 0.12 | 0.3 | 0.33 | 0.21 | |
0.03 | 0.05 | 0.07 | 0.27 | 0.24 | 0.51 | 0.54 | 0.12 | 0.1 | 0.64 | 0.21 | 0.21 | 1.0 | 0.05 | 0.04 | 0.17 | 0.14 | 0.53 | 0.04 | 0.07 | 0.29 | 0.13 | 0.04 | 0.07 | 0.02 | 0.07 | 0.06 | 0.14 | |
0.07 | 0.09 | 0.27 | 0.61 | 0.67 | 0.82 | 0.81 | 0.13 | 0.21 | 0.66 | 0.25 | 0.55 | 0.73 | 0.18 | 0.24 | 0.2 | 0.36 | 0.16 | 0.12 | 0.19 | 0.18 | 0.17 | 0.33 | 0.16 | 0.19 | 0.03 | 0.15 | 1.0 | |
0.12 | 0.15 | 0.06 | 0.28 | 0.25 | 0.46 | 0.52 | 0.41 | 0.44 | 1.0 | 0.44 | 0.28 | 0.24 | 0.43 | 0.35 | 0.0 | 0.64 | 0.86 | 0.22 | 0.38 | 0.49 | 0.36 | 0.11 | 0.0 | 0.05 | 0.25 | 0.73 | 0.16 | |
0.06 | 0.06 | 0.16 | 0.08 | 0.08 | 0.03 | 0.25 | 0.11 | 0.14 | 0.23 | 0.16 | 0.12 | 0.04 | 0.08 | 0.1 | 0.24 | 0.1 | 1.0 | 0.26 | 0.35 | 0.58 | 0.24 | 0.14 | 0.33 | 0.01 | 0.13 | 0.09 | 0.13 | |
0.05 | 0.14 | 0.06 | 0.12 | 0.12 | 0.08 | 0.12 | 0.1 | 0.04 | 0.21 | 0.08 | 0.03 | 1.0 | 0.05 | 0.04 | 0.02 | 0.05 | 0.22 | 0.01 | 0.02 | 0.2 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.09 | 0.05 | 0.05 | |
0.21 | 0.03 | 0.0 | 0.08 | 0.46 | 0.5 | 0.15 | 0.12 | 0.59 | 0.72 | 1.0 | 0.83 | 0.19 | 0.0 | 0.01 | 0.05 | 0.03 | 0.86 | 0.04 | 0.09 | 0.03 | 0.06 | 0.0 | 0.08 | 0.0 | 0.0 | 0.0 | 0.09 | |
0.01 | 0.04 | 0.3 | 0.25 | 1.0 | 0.87 | 0.35 | 0.73 | 0.85 | 0.77 | 0.98 | 0.98 | 0.54 | 0.3 | 0.25 | 0.19 | 0.13 | 0.63 | 0.16 | 0.25 | 0.08 | 0.21 | 0.1 | 0.16 | 0.1 | 0.14 | 0.26 | 0.21 | |
0.03 | 0.28 | 0.21 | 0.17 | 0.9 | 0.53 | 0.15 | 0.46 | 0.69 | 0.83 | 0.96 | 1.0 | 0.4 | 0.15 | 0.29 | 0.13 | 0.15 | 0.77 | 0.05 | 0.19 | 0.09 | 0.17 | 0.12 | 0.21 | 0.14 | 0.5 | 0.09 | 0.16 | |
0.1 | 0.5 | 0.36 | 0.49 | 0.63 | 0.64 | 0.44 | 0.8 | 0.71 | 1.0 | 0.7 | 0.74 | 0.56 | 0.8 | 0.7 | 0.36 | 0.33 | 0.19 | 0.14 | 0.26 | 0.32 | 0.29 | 0.52 | 0.21 | 0.2 | 0.17 | 0.51 | 0.2 | |
0.16 | 0.4 | 0.28 | 0.4 | 0.91 | 0.83 | 0.36 | 0.67 | 0.86 | 0.91 | 1.0 | 0.93 | 0.62 | 0.32 | 0.3 | 0.42 | 0.29 | 0.92 | 0.39 | 0.49 | 0.41 | 0.45 | 0.27 | 0.41 | 0.39 | 0.51 | 0.26 | 0.44 | |
0.02 | 0.2 | 0.18 | 0.16 | 0.4 | 0.22 | 0.25 | 0.18 | 0.81 | 0.56 | 1.0 | 0.55 | 0.59 | 0.69 | 0.55 | 0.21 | 0.14 | 0.38 | 0.18 | 0.3 | 0.13 | 0.16 | 0.06 | 0.32 | 0.12 | 0.34 | 0.73 | 0.23 | |
0.03 | 0.02 | 0.04 | 0.17 | 0.46 | 1.0 | 0.21 | 0.17 | 0.19 | 0.72 | 0.24 | 0.25 | 0.39 | 0.08 | 0.06 | 0.04 | 0.16 | 0.09 | 0.01 | 0.04 | 0.12 | 0.06 | 0.08 | 0.02 | 0.03 | 0.05 | 0.08 | 0.18 | |
0.33 | 0.44 | 0.72 | 0.56 | 0.84 | 0.76 | 0.74 | 0.75 | 0.43 | 0.9 | 0.57 | 0.45 | 0.83 | 0.57 | 0.54 | 0.56 | 0.59 | 1.0 | 0.59 | 0.57 | 0.56 | 0.55 | 0.55 | 0.5 | 0.34 | 0.5 | 0.82 | 0.65 | |
0.02 | 0.08 | 0.13 | 0.12 | 0.1 | 0.04 | 0.19 | 0.06 | 0.36 | 1.0 | 0.72 | 0.38 | 0.38 | 0.05 | 0.05 | 0.1 | 0.07 | 0.21 | 0.04 | 0.12 | 0.09 | 0.11 | 0.04 | 0.1 | 0.08 | 0.04 | 0.05 | 0.09 | |
1.0 | 0.48 | 0.58 | 0.6 | 0.67 | 0.7 | 0.58 | 0.32 | 0.55 | 0.44 | 0.47 | 0.76 | 0.53 | 0.27 | 0.24 | 0.34 | 0.36 | 0.41 | 0.55 | 0.48 | 0.41 | 0.47 | 0.4 | 0.43 | 0.9 | 0.4 | 0.32 | 0.87 | |
0.07 | 0.45 | 0.21 | 0.42 | 0.26 | 0.76 | 0.44 | 0.65 | 0.11 | 0.48 | 0.12 | 0.1 | 0.44 | 0.21 | 0.22 | 0.64 | 0.72 | 0.72 | 0.53 | 0.45 | 1.0 | 0.5 | 0.25 | 0.4 | 0.56 | 0.73 | 0.19 | 0.65 | |
0.02 | 0.01 | 0.32 | 0.17 | 0.62 | 0.35 | 0.5 | 0.4 | 0.47 | 1.0 | 0.71 | 0.79 | 0.38 | 0.07 | 0.11 | 0.23 | 0.09 | 0.56 | 0.18 | 0.3 | 0.28 | 0.19 | 0.73 | 0.23 | 0.01 | 0.03 | 0.11 | 0.18 | |
1.0 | 0.37 | 0.36 | 0.73 | 0.55 | 0.96 | 0.71 | 0.39 | 0.4 | 0.69 | 0.53 | 0.23 | 0.89 | 0.42 | 0.41 | 0.34 | 0.57 | 0.18 | 0.24 | 0.41 | 0.33 | 0.44 | 0.7 | 0.35 | 0.46 | 0.69 | 0.68 | 0.78 | |
0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.09 | 0.6 | 0.16 | 0.05 | 0.18 | 0.39 | 0.16 | 0.65 | 1.0 | 0.06 | 0.05 | 0.09 | 0.03 | 0.01 | 0.91 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.0 | 0.31 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.05 | 0.02 | |
0.19 | 0.71 | 0.25 | 0.41 | 0.31 | 0.93 | 0.45 | 0.25 | 0.19 | 0.78 | 0.2 | 0.09 | 0.7 | 0.28 | 0.3 | 0.28 | 1.0 | 0.51 | 0.59 | 0.35 | 0.94 | 0.44 | 0.23 | 0.31 | 0.23 | 0.31 | 0.27 | 0.58 | |
0.0 | 0.0 | 0.07 | 0.02 | 0.29 | 1.0 | 0.18 | 0.02 | 0.03 | 0.08 | 0.04 | 0.05 | 0.36 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.11 | 0.39 | 0.03 | 0.02 | 0.15 | 0.01 | 0.12 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.02 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)