Heatmap: Cluster_64 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.02 0.41 0.03 0.8 0.18 0.34 0.14 0.71 0.41 0.85 1.0 0.43 0.48 0.33 0.12 0.1 0.78 0.24 0.46 0.1 0.31 0.18 0.39 0.0 0.05 0.95 0.04
0.0 0.12 0.12 0.04 0.3 0.12 0.16 0.07 0.37 0.27 0.54 0.46 0.24 0.61 0.39 0.08 0.06 1.0 0.28 0.21 0.07 0.15 0.07 0.19 0.02 0.07 0.74 0.05
0.27 0.46 0.57 0.66 0.8 1.0 0.64 0.43 0.46 0.49 0.47 0.76 0.64 0.44 0.4 0.45 0.61 0.87 1.0 0.56 0.26 0.51 0.52 0.54 0.14 0.42 0.46 0.51
0.48 0.08 0.12 0.02 0.47 0.28 0.22 0.09 0.81 0.42 1.0 0.67 0.21 0.23 0.19 0.05 0.02 0.21 0.08 0.13 0.02 0.08 0.05 0.08 0.81 0.01 0.16 0.02
0.01 0.01 0.04 0.61 0.46 0.96 0.48 0.32 0.03 1.0 0.03 0.57 0.24 0.04 0.06 0.15 0.18 0.23 0.12 0.16 0.07 0.32 0.02 0.08 0.01 0.01 0.12 0.55
0.03 0.02 0.16 0.1 0.54 0.6 0.2 0.21 0.43 1.0 0.65 0.46 0.7 0.02 0.02 0.03 0.09 0.21 0.02 0.05 0.09 0.04 0.07 0.02 0.06 0.08 0.02 0.07
0.0 0.0 0.07 0.08 0.16 0.02 0.18 0.07 0.76 0.74 1.0 0.49 0.37 0.11 0.07 0.13 0.13 0.22 0.11 0.33 0.08 0.2 0.07 0.21 0.0 0.04 0.47 0.11
0.0 0.0 0.3 0.06 0.31 0.11 0.22 0.07 0.74 0.28 1.0 0.61 0.28 0.05 0.07 0.05 0.04 0.13 0.09 0.13 0.02 0.08 0.16 0.09 0.0 0.0 0.33 0.05
0.48 0.02 0.08 1.0 0.49 0.69 0.44 0.18 0.01 0.26 0.12 0.42 0.99 0.06 0.04 0.69 0.59 0.82 0.73 0.37 0.76 0.33 0.06 0.27 0.01 0.09 0.02 0.53
0.05 0.77 0.28 0.4 0.39 1.0 0.23 0.24 0.41 0.73 0.55 0.18 0.54 0.23 0.43 0.04 0.27 0.24 0.04 0.13 0.34 0.23 0.15 0.31 0.68 0.52 0.19 0.31
0.0 0.01 0.12 0.31 0.36 0.58 0.37 0.11 0.23 0.43 0.3 0.24 0.76 0.01 0.02 0.2 0.23 0.29 0.16 0.17 0.15 0.22 0.07 0.17 0.0 0.14 0.04 1.0
0.04 0.01 0.02 0.11 0.12 0.05 0.05 0.2 0.74 0.96 1.0 0.19 0.16 0.02 0.03 0.09 0.03 0.5 0.01 0.07 0.05 0.07 0.02 0.03 0.1 0.27 0.05 0.16
0.02 0.07 0.18 0.04 0.04 0.07 0.39 0.21 0.42 0.08 0.53 0.04 0.54 0.21 0.2 0.56 1.0 0.68 0.93 0.31 0.31 0.43 0.08 0.81 0.01 0.04 0.1 0.06
0.4 0.72 0.19 0.49 0.55 0.36 0.68 0.5 0.68 1.0 0.55 0.61 0.82 0.55 0.48 0.34 0.26 0.33 0.21 0.32 0.21 0.24 0.17 0.23 0.45 0.58 0.49 0.24
0.03 0.05 0.34 0.41 0.25 0.2 0.53 0.26 0.41 1.0 0.53 0.25 0.57 0.24 0.2 0.29 0.42 0.14 0.19 0.37 0.28 0.27 0.13 0.24 0.07 0.04 0.21 0.34
0.0 0.06 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.05 0.03 0.11 0.16 0.34 0.0 0.14 0.11 0.01 0.0 0.95 0.01 0.04 0.0 0.02 0.0 0.01 0.07 0.01 1.0 0.01
0.07 0.11 0.32 0.24 0.24 0.2 0.5 0.08 0.21 0.17 0.26 0.27 1.0 0.07 0.09 0.17 0.23 0.1 0.19 0.25 0.17 0.14 0.14 0.14 0.24 0.23 0.13 0.11
1.0 0.67 0.57 0.47 0.68 0.25 0.65 0.17 0.62 0.32 0.35 0.56 0.69 0.2 0.17 0.5 0.43 0.4 0.29 0.49 0.32 0.51 0.13 0.37 0.26 0.12 0.23 0.57
0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 0.27 0.02 0.65 0.43 1.0 0.08 0.35 0.01 0.0 0.03 0.01 0.31 0.03 0.07 0.01 0.04 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02
0.03 0.1 0.38 0.19 0.3 0.37 0.32 0.27 0.6 0.38 1.0 0.64 0.22 0.36 0.23 0.34 0.45 0.28 0.45 0.3 0.17 0.49 0.18 0.43 0.1 0.13 0.17 0.19
0.0 0.0 0.25 0.29 0.24 0.17 0.42 0.37 0.52 1.0 0.83 0.3 0.76 0.01 0.02 0.48 0.54 0.35 0.28 0.3 0.79 0.51 0.05 0.44 0.0 0.0 0.01 0.11
0.01 0.56 0.31 0.63 0.52 0.78 0.83 0.27 0.44 0.7 0.65 0.35 1.0 0.08 0.09 0.91 0.79 0.65 0.4 0.82 0.69 0.79 0.07 0.61 0.46 0.61 0.07 0.8
0.01 0.07 0.03 0.08 0.26 1.0 0.1 0.01 0.01 0.14 0.01 0.03 0.42 0.01 0.01 0.06 0.15 0.04 0.2 0.07 0.41 0.09 0.01 0.11 0.01 0.0 0.01 0.05
0.17 0.54 0.1 0.28 0.48 1.0 0.4 0.17 0.16 0.56 0.16 0.16 0.9 0.09 0.11 0.52 0.39 0.55 0.04 0.13 0.24 0.3 0.08 0.07 0.22 0.27 0.2 0.42
0.02 0.07 0.1 0.1 0.25 0.23 0.32 0.24 0.22 0.84 0.3 0.23 0.48 0.05 0.04 0.13 0.09 1.0 0.1 0.14 0.26 0.11 0.02 0.1 0.01 0.04 0.06 0.19
0.03 0.38 0.26 0.27 0.24 0.28 0.34 0.31 0.09 0.32 0.13 0.17 0.43 0.16 0.13 0.34 1.0 0.5 0.29 0.24 0.44 0.23 0.41 0.24 0.06 0.02 0.13 0.68
0.0 0.0 0.07 0.29 0.02 0.04 0.51 0.07 0.63 1.0 0.52 0.03 0.62 0.05 0.05 0.06 0.04 0.25 0.08 0.07 0.09 0.07 0.02 0.08 0.05 0.01 0.02 0.1
0.0 0.02 0.15 0.09 0.12 0.04 0.19 0.69 0.09 1.0 0.15 0.07 0.23 0.04 0.03 0.17 0.14 0.15 0.25 0.07 0.13 0.17 0.06 0.12 0.05 0.08 0.06 0.35
0.28 0.02 0.06 0.05 0.45 0.68 0.27 0.07 0.17 0.85 0.3 0.68 0.27 0.05 0.04 0.07 0.05 1.0 0.03 0.06 0.03 0.07 0.03 0.07 0.11 0.06 0.04 0.06
0.01 0.01 0.2 0.22 0.3 0.12 0.39 0.24 0.23 1.0 0.4 0.34 0.43 0.16 0.09 0.28 0.19 0.8 0.2 0.56 0.46 0.51 0.06 0.56 0.01 0.0 0.18 0.21
0.05 0.25 1.0 0.49 0.55 0.48 0.75 0.24 0.31 0.46 0.3 0.53 0.99 0.16 0.17 0.75 0.5 0.34 0.41 0.66 0.72 0.54 0.24 0.58 0.81 0.62 0.25 0.52
0.01 0.03 0.42 0.18 0.7 0.61 0.52 0.18 0.52 0.91 0.59 0.92 1.0 0.03 0.01 0.1 0.08 0.45 0.05 0.11 0.06 0.13 0.1 0.05 0.26 0.25 0.02 0.16
0.06 0.14 0.39 0.57 1.0 0.91 0.48 0.22 0.16 0.34 0.11 0.35 0.98 0.43 0.4 0.3 0.32 0.46 0.18 0.32 0.34 0.26 0.39 0.22 0.67 0.07 0.62 0.55
0.05 0.15 0.29 0.22 0.17 0.1 0.67 0.36 0.2 0.86 0.29 0.13 0.3 0.19 0.17 0.72 0.8 0.21 0.6 0.77 1.0 0.7 0.43 0.88 0.08 0.24 0.22 0.16
0.08 0.18 0.61 0.22 0.21 0.21 0.88 0.55 0.19 1.0 0.25 0.26 0.31 0.23 0.21 0.46 0.51 0.7 0.35 0.51 0.71 0.63 0.44 0.71 0.12 0.3 0.33 0.21
0.03 0.05 0.07 0.27 0.24 0.51 0.54 0.12 0.1 0.64 0.21 0.21 1.0 0.05 0.04 0.17 0.14 0.53 0.04 0.07 0.29 0.13 0.04 0.07 0.02 0.07 0.06 0.14
0.07 0.09 0.27 0.61 0.67 0.82 0.81 0.13 0.21 0.66 0.25 0.55 0.73 0.18 0.24 0.2 0.36 0.16 0.12 0.19 0.18 0.17 0.33 0.16 0.19 0.03 0.15 1.0
0.12 0.15 0.06 0.28 0.25 0.46 0.52 0.41 0.44 1.0 0.44 0.28 0.24 0.43 0.35 0.0 0.64 0.86 0.22 0.38 0.49 0.36 0.11 0.0 0.05 0.25 0.73 0.16
0.06 0.06 0.16 0.08 0.08 0.03 0.25 0.11 0.14 0.23 0.16 0.12 0.04 0.08 0.1 0.24 0.1 1.0 0.26 0.35 0.58 0.24 0.14 0.33 0.01 0.13 0.09 0.13
0.05 0.14 0.06 0.12 0.12 0.08 0.12 0.1 0.04 0.21 0.08 0.03 1.0 0.05 0.04 0.02 0.05 0.22 0.01 0.02 0.2 0.02 0.02 0.01 0.02 0.09 0.05 0.05
0.21 0.03 0.0 0.08 0.46 0.5 0.15 0.12 0.59 0.72 1.0 0.83 0.19 0.0 0.01 0.05 0.03 0.86 0.04 0.09 0.03 0.06 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.09
0.01 0.04 0.3 0.25 1.0 0.87 0.35 0.73 0.85 0.77 0.98 0.98 0.54 0.3 0.25 0.19 0.13 0.63 0.16 0.25 0.08 0.21 0.1 0.16 0.1 0.14 0.26 0.21
0.03 0.28 0.21 0.17 0.9 0.53 0.15 0.46 0.69 0.83 0.96 1.0 0.4 0.15 0.29 0.13 0.15 0.77 0.05 0.19 0.09 0.17 0.12 0.21 0.14 0.5 0.09 0.16
0.1 0.5 0.36 0.49 0.63 0.64 0.44 0.8 0.71 1.0 0.7 0.74 0.56 0.8 0.7 0.36 0.33 0.19 0.14 0.26 0.32 0.29 0.52 0.21 0.2 0.17 0.51 0.2
0.16 0.4 0.28 0.4 0.91 0.83 0.36 0.67 0.86 0.91 1.0 0.93 0.62 0.32 0.3 0.42 0.29 0.92 0.39 0.49 0.41 0.45 0.27 0.41 0.39 0.51 0.26 0.44
0.02 0.2 0.18 0.16 0.4 0.22 0.25 0.18 0.81 0.56 1.0 0.55 0.59 0.69 0.55 0.21 0.14 0.38 0.18 0.3 0.13 0.16 0.06 0.32 0.12 0.34 0.73 0.23
0.03 0.02 0.04 0.17 0.46 1.0 0.21 0.17 0.19 0.72 0.24 0.25 0.39 0.08 0.06 0.04 0.16 0.09 0.01 0.04 0.12 0.06 0.08 0.02 0.03 0.05 0.08 0.18
0.33 0.44 0.72 0.56 0.84 0.76 0.74 0.75 0.43 0.9 0.57 0.45 0.83 0.57 0.54 0.56 0.59 1.0 0.59 0.57 0.56 0.55 0.55 0.5 0.34 0.5 0.82 0.65
0.02 0.08 0.13 0.12 0.1 0.04 0.19 0.06 0.36 1.0 0.72 0.38 0.38 0.05 0.05 0.1 0.07 0.21 0.04 0.12 0.09 0.11 0.04 0.1 0.08 0.04 0.05 0.09
1.0 0.48 0.58 0.6 0.67 0.7 0.58 0.32 0.55 0.44 0.47 0.76 0.53 0.27 0.24 0.34 0.36 0.41 0.55 0.48 0.41 0.47 0.4 0.43 0.9 0.4 0.32 0.87
0.07 0.45 0.21 0.42 0.26 0.76 0.44 0.65 0.11 0.48 0.12 0.1 0.44 0.21 0.22 0.64 0.72 0.72 0.53 0.45 1.0 0.5 0.25 0.4 0.56 0.73 0.19 0.65
0.02 0.01 0.32 0.17 0.62 0.35 0.5 0.4 0.47 1.0 0.71 0.79 0.38 0.07 0.11 0.23 0.09 0.56 0.18 0.3 0.28 0.19 0.73 0.23 0.01 0.03 0.11 0.18
1.0 0.37 0.36 0.73 0.55 0.96 0.71 0.39 0.4 0.69 0.53 0.23 0.89 0.42 0.41 0.34 0.57 0.18 0.24 0.41 0.33 0.44 0.7 0.35 0.46 0.69 0.68 0.78
0.01 0.04 0.05 0.09 0.6 0.16 0.05 0.18 0.39 0.16 0.65 1.0 0.06 0.05 0.09 0.03 0.01 0.91 0.01 0.01 0.01 0.0 0.31 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02
0.19 0.71 0.25 0.41 0.31 0.93 0.45 0.25 0.19 0.78 0.2 0.09 0.7 0.28 0.3 0.28 1.0 0.51 0.59 0.35 0.94 0.44 0.23 0.31 0.23 0.31 0.27 0.58
0.0 0.0 0.07 0.02 0.29 1.0 0.18 0.02 0.03 0.08 0.04 0.05 0.36 0.03 0.01 0.01 0.11 0.39 0.03 0.02 0.15 0.01 0.12 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)