Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	FB cap+lamellae,YMG,strain #326	FB stipe,YMG,strain #326	Hyphal knots,control,strain #326	Mycelium	Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h	Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h	Mycelium,LiCl,strain #326	Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO	Mycelium,control,20C,matA/matB KO	Mycelium,control,28C,8h	Mycelium,control,strain #326	Stg 1 primordium,YMG,strain #326	Stg 2 primordium,YMG,strain #326	Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130	Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130	Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO	Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130	Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130	Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130	Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130	Vegetative mycelium,YMG,strain #326	Mycelium,control,YMG,37C,strain #130	YFB cap,YMG,strain #326	YFB lamellae,YMG,strain #326	secondary hyphal knots,YMG,strain #326	strain #130
EAU80628	0.01	0.01	0.0	0.06	0.08	1.0	0.0	0.15	0.03	0.09	0.01	0.0	0.0	0.02	0.06	0.03	0.01	0.02	0.1	0.0	0.03	0.0	0.03	0.01	0.09	0.63	0.04	0.03
EAU81059	0.12	0.53	0.12	0.23	0.22	0.81	0.26	0.43	0.2	0.35	0.38	0.12	0.08	0.25	0.24	0.09	0.06	1.0	0.0	0.09	0.15	0.0	0.21	0.09	0.05	0.23	0.31	0.0
EAU81164	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU81215	0.0	0.21	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.27	0.18	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	1.0	0.92	0.0	0.0
EAU81217	0.0	0.13	0.0	0.49	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.21	0.22	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03
EAU81476	0.16	0.63	0.55	0.71	0.61	0.87	1.0	0.25	0.44	0.37	0.36	0.42	0.67	0.34	0.43	0.57	0.7	0.41	0.95	0.62	0.24	0.61	0.36	0.28	0.4	0.58	0.45	0.66
EAU81539	0.02	0.08	0.1	0.15	0.4	1.0	0.22	0.04	0.09	0.09	0.07	0.19	0.13	0.1	0.14	0.26	0.39	0.17	0.12	0.13	0.19	0.11	0.24	0.1	0.04	0.11	0.18	0.23
EAU81541	0.04	0.04	0.01	0.09	0.46	1.0	0.08	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06
EAU81616	0.13	0.12	0.39	0.42	0.68	1.0	0.43	0.32	0.4	0.34	0.39	0.52	0.27	0.39	0.37	0.49	0.45	0.2	0.52	0.42	0.29	0.48	0.4	0.42	0.12	0.17	0.36	0.57
EAU81703	0.01	0.21	0.42	0.35	0.34	0.25	0.6	0.46	0.46	0.74	0.58	0.43	0.28	1.0	0.84	0.31	0.13	0.12	0.24	0.38	0.14	0.2	0.15	0.27	0.09	0.29	0.68	0.31
EAU81742	0.22	0.03	0.23	0.26	0.82	1.0	0.53	0.14	0.14	0.3	0.11	0.08	0.18	0.06	0.08	0.27	0.25	0.14	0.28	0.43	0.3	0.25	0.15	0.4	0.08	0.61	0.08	0.22
EAU81930	0.25	0.8	0.92	1.0	0.4	0.37	0.45	0.46	0.51	0.47	0.61	0.4	0.46	0.77	0.82	0.44	0.21	0.54	0.11	0.52	0.34	0.6	0.76	0.31	0.07	0.21	0.74	0.62
EAU82788	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU83561	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU83677	0.62	0.15	0.02	0.34	0.32	1.0	0.49	0.15	0.02	0.18	0.03	0.04	0.08	0.03	0.03	0.14	0.14	0.07	0.03	0.11	0.02	0.08	0.06	0.07	0.03	0.01	0.03	0.08
EAU83968	0.11	0.29	0.15	0.39	0.61	1.0	0.45	0.23	0.24	0.37	0.29	0.59	0.27	0.35	0.36	0.42	0.48	0.25	0.83	0.33	0.18	0.42	0.75	0.4	0.05	0.11	0.28	0.25
EAU84251	0.06	0.11	0.07	0.25	0.48	1.0	0.23	0.14	0.14	0.17	0.15	0.23	0.14	0.22	0.24	0.35	0.32	0.13	0.14	0.26	0.17	0.28	0.25	0.22	0.06	0.34	0.17	0.5
EAU84628	0.2	0.24	0.12	0.5	0.31	0.72	0.5	0.14	0.2	0.34	0.09	0.17	0.29	0.3	0.31	0.15	0.2	0.27	0.13	0.2	0.12	0.21	0.24	0.19	0.37	0.17	0.4	1.0
EAU84748	0.05	0.09	0.26	0.44	0.48	1.0	0.4	0.26	0.36	0.29	0.3	0.47	0.29	0.19	0.2	0.47	0.45	0.17	0.16	0.44	0.28	0.47	0.3	0.4	0.07	0.3	0.19	0.48
EAU85270	0.19	0.15	0.05	0.43	0.37	0.66	0.15	0.06	0.12	0.05	0.16	0.46	0.15	0.26	0.31	0.19	0.19	0.1	0.09	0.12	0.07	0.2	0.1	0.1	1.0	0.28	0.13	0.52
EAU85758	0.11	0.2	0.3	0.45	0.6	0.53	0.41	0.16	0.2	0.15	0.25	0.63	0.45	0.47	0.51	0.41	0.38	0.79	1.0	0.31	0.37	0.32	0.66	0.4	0.11	0.28	0.34	0.34
EAU86030	0.1	0.05	0.37	1.0	0.76	0.56	0.6	0.19	0.23	0.41	0.28	0.57	0.72	0.31	0.4	0.26	0.34	0.6	0.12	0.38	0.23	0.36	0.86	0.27	0.29	0.12	0.54	0.41
EAU86194	0.11	0.48	0.38	0.58	0.62	0.86	0.68	0.56	0.61	0.62	0.58	0.73	0.56	0.85	0.96	0.5	0.44	0.89	0.89	0.42	0.38	0.46	1.0	0.44	0.32	0.4	0.63	0.55
EAU86321	0.05	0.66	0.52	0.86	0.77	1.0	0.68	0.61	0.78	0.84	0.83	0.71	0.76	0.7	0.67	0.72	0.74	0.64	0.41	0.81	0.9	0.82	0.74	0.8	0.23	0.58	0.51	0.7
EAU86405	0.02	0.03	0.02	0.35	0.27	0.59	0.16	0.05	0.02	0.03	0.03	0.09	0.08	0.02	0.02	1.0	0.79	0.3	0.44	0.52	0.29	0.58	0.09	0.42	0.02	0.02	0.03	0.65
EAU87334	0.24	0.51	0.68	0.72	0.23	0.11	0.29	0.44	0.86	0.63	1.0	0.28	0.22	0.44	0.48	0.1	0.21	0.44	0.42	0.28	0.37	0.27	0.7	0.36	0.23	0.34	0.99	0.12
EAU87339	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU87340	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.07
EAU87341	0.01	0.02	0.68	0.6	0.28	0.29	1.0	0.29	0.51	0.62	0.33	0.36	0.68	0.04	0.06	0.04	0.04	0.23	0.14	0.14	0.0	0.18	0.37	0.09	0.01	0.02	0.13	0.05
EAU87738	0.11	0.31	0.07	0.63	0.45	0.91	0.52	0.29	0.18	0.41	0.18	0.34	0.33	0.44	0.45	0.86	0.65	0.2	0.38	0.6	0.55	0.65	0.34	0.47	0.06	0.13	0.3	1.0
EAU88838	0.22	0.37	0.31	0.51	0.56	1.0	0.59	0.28	0.41	0.34	0.35	0.42	0.29	0.3	0.36	0.32	0.38	0.25	0.14	0.38	0.27	0.39	0.67	0.32	0.69	0.71	0.3	0.73
EAU88894	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.42	0.38	0.0	0.0
EAU89275	0.29	0.08	0.45	0.5	0.74	0.88	0.66	0.72	0.36	0.57	0.35	0.17	0.83	0.15	0.2	0.87	0.53	1.0	0.51	0.57	0.43	0.58	0.53	0.46	0.05	0.21	0.41	0.42
EAU89340	0.02	0.05	0.09	0.21	0.58	1.0	0.15	0.06	0.19	0.25	0.25	0.34	0.21	0.31	0.33	0.26	0.19	0.18	0.16	0.31	0.1	0.24	0.1	0.21	0.02	0.82	0.3	0.34
EAU90063	0.06	0.13	0.11	0.35	0.27	1.0	0.21	0.22	0.07	0.1	0.08	0.19	0.18	0.46	0.41	0.08	0.14	0.69	0.02	0.02	0.01	0.06	0.24	0.02	0.29	0.08	0.56	0.14
EAU91638	0.06	0.01	0.19	0.26	0.38	1.0	0.29	0.07	0.1	0.12	0.12	0.31	0.2	0.08	0.11	0.1	0.18	0.1	0.09	0.16	0.06	0.11	0.19	0.09	0.02	0.22	0.11	0.28
EAU91663	0.21	0.19	0.43	0.51	0.59	1.0	0.52	0.25	0.36	0.27	0.41	0.47	0.49	0.28	0.31	0.37	0.37	0.28	0.39	0.44	0.35	0.43	0.28	0.38	0.19	0.29	0.31	0.51
EAU91836	0.03	0.08	0.04	0.12	0.55	0.92	0.07	1.0	0.09	0.18	0.08	0.12	0.03	0.05	0.04	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.13	0.02	0.05	0.02	0.01	0.88	0.08	0.25
EAU91928	0.15	0.19	0.28	0.23	0.4	0.94	0.18	0.17	0.08	0.13	0.06	0.16	0.2	0.16	0.2	0.37	0.25	0.11	0.06	0.31	0.27	0.25	0.28	0.15	0.12	1.0	0.24	0.11
EAU92211	0.0	0.0	0.1	0.42	0.26	1.0	0.19	0.08	0.03	0.17	0.05	0.22	0.2	0.01	0.02	0.14	0.37	0.0	0.27	0.15	0.09	0.14	0.06	0.15	0.0	0.0	0.0	0.26
EAU92291	0.01	0.02	0.08	1.0	0.15	0.3	0.4	0.15	0.25	0.24	0.08	0.05	0.56	0.04	0.09	0.17	0.17	0.31	0.11	0.1	0.06	0.12	0.24	0.08	0.02	0.03	0.11	0.94
EAU92299	0.08	0.03	0.01	0.29	0.27	1.0	0.33	0.04	0.01	0.06	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.09	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.09	0.03	0.08	0.02	0.02	0.32
EAU92300	0.04	0.1	0.11	0.34	0.48	1.0	0.3	0.18	0.22	0.25	0.18	0.21	0.25	0.07	0.11	0.31	0.34	0.18	0.15	0.3	0.16	0.29	0.17	0.29	0.13	0.41	0.08	0.45
EAU92941	0.36	0.45	0.32	0.53	0.99	0.97	0.64	0.46	0.33	0.35	0.29	0.43	0.47	0.48	0.58	0.75	0.61	0.37	0.18	0.59	0.42	0.63	0.77	0.5	0.32	0.41	1.0	0.72
EFI26580	0.0	0.4	0.09	0.37	0.08	0.37	0.61	0.23	0.14	0.15	0.0	0.0	1.0	0.18	0.25	0.17	0.33	0.18	0.0	0.2	0.0	0.8	0.1	0.0	0.07	0.0	0.09	0.69
EFI26646	0.05	0.2	0.03	0.35	0.31	1.0	0.2	0.07	0.05	0.12	0.05	0.06	0.06	0.11	0.1	0.06	0.06	0.07	0.03	0.05	0.04	0.04	0.12	0.03	0.18	0.18	0.07	0.05
EFI27107	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI27581	0.0	0.29	0.54	0.66	0.0	0.23	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
EFI27595	0.06	0.11	0.41	1.0	0.12	0.07	0.48	0.09	0.58	0.23	0.44	0.21	0.31	0.21	0.28	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.06	0.13	0.3	0.0
EFI27716	0.46	0.24	0.31	0.64	0.75	1.0	0.29	0.48	0.33	0.35	0.37	0.52	0.35	0.31	0.33	0.69	0.51	0.71	0.76	0.57	0.53	0.63	0.42	0.56	0.38	0.71	0.4	0.49
EFI27906	0.18	0.19	0.4	0.6	0.66	1.0	0.5	0.52	0.69	0.54	0.68	0.58	0.41	0.8	0.75	0.74	0.55	0.52	0.44	0.79	0.65	0.65	0.6	0.66	0.26	0.48	0.74	0.82
EFI28130	0.01	0.04	0.15	0.35	0.54	1.0	0.23	0.09	0.16	0.14	0.15	0.42	0.16	0.05	0.08	0.24	0.25	0.1	0.08	0.22	0.15	0.25	0.35	0.22	0.0	0.02	0.08	0.41
EFI28180	0.1	0.19	0.03	0.15	0.02	0.02	0.81	0.02	0.02	0.08	0.02	0.01	0.03	1.0	0.97	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.03	0.66	0.05	0.81	0.07
EFI28471	0.14	0.07	0.16	0.53	0.39	1.0	0.15	0.04	0.01	0.14	0.02	0.06	0.07	0.04	0.08	0.18	0.1	0.01	0.08	0.11	0.07	0.14	0.05	0.09	0.13	0.02	0.07	0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)