Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
- -0.78 1.91 -1.93 - - -0.04 1.58 0.64 - - 0.62 - - - 2.49 - - - 2.65 - 1.43 - 0.8 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.73 - - - 2.77 2.38 - - 3.22 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - -
- - - - - - 0.25 - - - - - - - - 3.63 - - 2.01 1.36 2.96 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.79 4.4 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - -
- - 0.76 -2.2 - - - - - - - - - - - 3.76 - - - 0.9 3.3 -0.25 - - - - - -
- -1.02 - -1.29 -0.96 - -1.86 - - 0.74 -0.93 0.99 -0.95 0.07 0.63 0.28 0.36 1.9 - 2.45 - 0.35 - 0.31 - 2.05 -0.6 -
- - - 0.75 1.48 1.52 0.84 - - - 2.51 - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - -
- - - -0.14 - - - - - - - - - - - 2.83 - - - 2.77 - 3.72 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.27 - - - 3.13 - - - -
- - - -0.55 - - - - - - - - - - - 4.77 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - -
- - - -2.66 - - - - - - - - - - -2.5 - - - - -1.44 4.77 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.57 - - - - - - - - - - - - - - - 4.65 - - - - - - - -
-1.64 0.55 -0.29 -0.79 1.29 0.12 1.07 1.08 -1.32 -0.81 - 0.39 0.25 - -1.39 2.25 - -1.56 0.84 1.48 -0.28 -0.03 -3.33 -1.6 -3.03 -3.2 -0.59 -1.24
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.06 3.6 - - 2.92 - - - -
-1.27 1.12 0.31 -3.14 -1.01 0.06 -1.65 0.02 - 0.11 -0.98 -1.0 -1.0 -0.68 -0.14 -0.76 - 1.23 1.13 1.38 1.64 -0.69 1.16 -0.81 - 0.28 - 0.67
- - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - -
- - 2.81 -1.05 - - - - - - - - - - - 1.9 - - - 2.94 2.49 1.8 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - 3.62 - - - - - - -
0.05 1.68 1.1 -0.13 -0.07 -1.97 0.47 -1.11 -2.01 -2.13 -1.23 -1.04 0.6 -1.36 -1.38 -0.0 -0.49 -1.19 -2.71 0.56 -0.1 0.7 -0.03 0.51 0.9 -0.59 1.24 -1.56
- - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - - - - 3.65 2.9 - - - - - -
- 0.54 - -1.07 1.67 - - - 2.68 1.8 - - - - - - - - - - 2.74 2.66 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.51 - 3.33 2.68 - - - 2.54 - - - -
- - - -1.73 1.14 - - - - - - - - - 0.32 2.56 - - - 3.19 3.21 - - - - - - -
3.7 - - -1.01 - - 1.84 - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - - 1.53 - - -
- - - - - - 2.03 - - 2.8 - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - -
- - - -1.69 - - - - - - - - - - - 2.27 - - - 1.12 - 3.17 - - - - - 3.54
- - - - - - 1.28 - - - - - - 2.45 - 3.53 - - - - - - 1.71 - - - 2.4 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.6 - 3.45 - 3.46 - - - -
- - - 0.22 - - 3.13 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.18 - - - -
- - - - - - - - 1.48 1.57 - - - - - - - - - 4.23 - - - 1.78 - - - -
- - - -0.64 - - - - - - - - - - - - - - - 3.44 4.04 - - - - - - -
- - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - 3.55
- - 2.8 - - - - - - - - - 2.5 - 1.82 - - - - - 3.57 - - - - - - -
- - - -0.14 - - - - - - - - - - - 4.33 - - - 2.8 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 - 3.73 - - - - - -
- - 2.37 -1.85 - - - - - - - - - - - 3.47 - - - 3.52 - - - - - - - -
1.09 0.42 - -2.08 - - - 1.44 - - - - - - 0.65 - - 2.69 - 2.91 - - - - 1.35 - 1.81 -
- - - -2.65 - - - - - - - - - - - 2.37 - - - 1.42 4.32 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - -
0.4 0.74 -0.07 -0.35 1.11 -0.55 -0.75 0.12 -0.45 -0.31 -0.99 0.32 -0.68 -0.76 -0.75 0.83 -0.4 -0.02 -0.82 0.62 0.53 0.21 -0.24 0.21 -0.09 -0.44 0.5 -1.6
- -1.29 -1.89 -1.04 -0.6 -2.15 0.6 -0.63 -1.19 -0.11 0.37 -2.28 -0.22 -2.89 -1.03 0.02 -0.93 1.43 0.9 1.54 - -0.9 -0.08 2.0 -2.33 1.71 -0.31 -0.55
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.03 3.38 - - - 3.24 - - - -
0.25 0.8 1.12 0.62 - - 0.42 -2.69 -2.12 -0.79 -2.1 -2.15 - -0.01 -0.17 1.29 -2.51 - -0.57 1.11 0.77 0.77 -0.67 0.7 0.32 1.0 -1.36 0.97
- - - -0.08 - - - 2.6 - - - 2.65 - - - - - 3.88 - - - - - - - - - -
- - - -1.17 - - - - - - - - - - - 3.91 - - 3.65 - - - - - - - - -
- 1.24 - -1.63 2.18 0.55 - 2.05 1.5 - - 1.48 - -0.26 -0.3 - 0.8 1.74 - 0.82 - - 0.09 - - - - -
- - - - - - - - 2.7 - - - - - 0.86 1.93 - - - 3.15 - 2.0 - - 1.59 - - -
- 1.35 - - - - - - - 2.79 - - - - 1.99 - - - - 3.14 - - - - 2.52 - - -
- 2.52 - -1.79 - - - - - - - 2.0 - - 1.41 - 2.41 3.32 - - - - - - - - - -
- 1.57 - 0.14 - - - - - - - 1.52 - - 0.78 - - - - - - 3.9 2.13 - - - - -
- - 1.76 - 2.02 1.52 0.92 0.84 1.49 0.99 - -0.11 1.89 0.12 - - - 1.12 - - - - 0.39 - - - - -
-2.93 -2.12 -2.36 -0.3 - - -3.43 -2.69 0.36 -2.56 -1.64 -2.66 - -2.22 -1.81 1.83 1.42 0.66 1.04 2.18 1.37 0.82 -0.8 0.8 -1.81 -1.35 -2.31 1.01
- - - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - 3.05 - - - - 3.26 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.19 - - - 4.24 - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.8 - - - - 2.04 - 3.05 - - - - - 3.12 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.19 - - - 4.24 - - - - - - - -
- - - 0.57 - - 2.94 - - - - - - - 1.99 - - 3.9 - - - - - - - - - -
- - 1.08 -0.01 -0.6 - 1.11 -1.19 0.35 -0.54 -1.2 -2.31 -0.65 -2.78 - 1.72 -0.0 0.63 2.08 0.19 1.4 0.09 -1.0 0.85 - -1.5 - -0.55
- - - 0.65 - - - - - - - - - - - - - - - 4.72 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.