Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.19 0.15 0.52 0.31 0.36 0.31 0.58 0.23 0.34 0.38 0.35 0.34 0.47 0.37 0.33 0.39 0.31 1.0 0.61 0.47 0.4 0.37 0.27 0.35 0.28 0.51 0.38 0.46
0.06 0.06 0.08 0.36 0.14 0.1 0.09 0.05 0.08 0.07 0.08 0.16 0.15 0.22 0.19 0.82 0.48 0.21 1.0 0.71 0.72 0.56 0.1 0.56 0.2 0.17 0.19 0.31
0.17 0.51 1.0 0.43 0.43 0.54 0.99 0.56 0.43 0.89 0.44 0.38 0.88 0.45 0.41 0.65 0.41 0.58 0.87 0.8 0.92 0.67 0.33 0.8 0.49 0.45 0.38 0.49
0.11 0.27 0.6 0.46 0.4 0.33 0.72 0.47 0.43 0.54 0.46 0.29 1.0 0.47 0.42 0.57 0.39 0.33 0.72 0.68 0.66 0.47 0.35 0.58 0.24 0.27 0.58 0.24
0.09 0.31 0.59 0.71 0.31 0.2 0.5 0.33 0.28 0.36 0.31 0.19 0.49 0.54 0.49 0.92 0.74 0.28 0.99 0.98 1.0 0.78 0.47 0.79 0.39 0.55 0.54 0.68
0.9 0.44 0.81 0.23 0.14 0.1 0.54 0.22 0.24 0.27 0.27 0.14 0.35 0.43 0.4 0.72 0.46 1.0 0.64 0.65 0.88 0.52 0.35 0.56 0.51 0.67 0.54 0.27
0.01 0.11 0.33 0.28 0.45 0.2 0.19 0.25 0.52 0.36 0.62 0.67 0.24 0.22 0.34 0.39 0.43 0.25 0.35 0.41 0.42 0.48 0.28 0.41 0.62 1.0 0.35 0.2
0.12 0.22 0.73 0.44 0.2 0.09 0.99 0.19 0.63 0.25 0.56 0.2 0.65 0.33 0.37 0.94 0.65 0.31 1.0 0.98 0.96 0.83 0.54 0.88 0.15 0.3 0.41 0.61
0.03 0.15 0.22 0.58 0.14 0.1 0.25 0.08 0.15 0.12 0.16 0.18 0.25 0.14 0.15 0.89 0.47 0.25 1.0 0.69 0.89 0.67 0.15 0.79 0.11 0.41 0.1 0.64
0.08 0.37 0.76 0.43 0.46 0.41 0.92 0.33 0.46 0.38 0.51 0.38 0.85 0.57 0.49 0.86 0.72 0.45 1.0 0.77 0.79 0.74 0.39 0.69 0.38 0.45 0.57 0.68
0.35 0.55 0.7 0.43 0.68 0.47 0.72 0.45 0.71 0.51 0.73 0.79 0.59 0.56 0.55 0.71 0.77 0.91 0.95 0.76 0.63 0.81 0.74 0.75 0.58 1.0 0.6 0.52
0.56 0.24 0.24 0.55 0.16 0.08 0.17 0.13 0.19 0.17 0.2 0.09 0.47 0.33 0.29 0.76 0.53 0.26 0.91 0.79 1.0 0.52 0.2 0.5 0.5 0.21 0.24 0.35
0.39 0.31 0.65 0.59 0.29 0.14 0.31 0.25 0.36 0.32 0.29 0.17 0.58 0.42 0.4 0.68 0.42 0.38 1.0 0.72 0.82 0.52 0.27 0.56 0.51 0.28 0.4 0.31
0.13 0.73 0.85 0.49 0.72 0.54 0.62 0.68 0.66 0.66 0.7 0.57 0.52 0.62 0.58 0.76 0.83 0.94 0.97 1.0 0.86 0.91 0.53 0.83 0.34 0.56 0.74 0.62
0.14 0.25 0.33 0.38 0.32 0.29 0.33 0.24 0.36 0.26 0.45 0.35 0.32 0.45 0.42 0.88 0.49 0.2 0.66 0.78 1.0 0.69 0.39 0.67 0.5 0.62 0.38 0.45
0.44 0.38 0.59 0.48 0.36 0.42 0.78 0.51 0.49 0.49 0.56 0.26 0.55 0.46 0.4 0.99 0.64 0.31 0.8 0.97 1.0 0.79 0.5 0.77 0.21 0.75 0.45 0.67
0.29 0.33 0.97 0.7 0.56 0.49 0.78 0.49 0.78 0.6 1.0 0.56 0.78 0.9 0.88 0.58 0.4 0.43 0.51 0.66 0.55 0.53 0.57 0.61 0.27 0.98 0.88 0.58
0.4 0.56 0.7 0.4 0.51 0.39 0.65 0.34 0.53 0.48 0.54 0.66 0.66 0.86 0.74 0.37 0.35 0.46 0.16 0.4 0.35 0.41 0.43 0.35 0.32 1.0 0.78 0.47
0.17 0.21 0.39 0.29 0.22 0.11 0.38 0.38 0.45 0.35 0.42 0.2 0.32 0.28 0.27 0.54 0.31 0.5 1.0 0.58 0.55 0.46 0.25 0.53 0.15 0.41 0.29 0.25
0.04 0.25 0.85 0.6 0.74 0.4 0.57 0.42 0.74 0.64 0.7 0.65 0.58 0.78 0.71 0.77 0.53 0.55 0.7 0.96 0.81 0.66 0.43 0.73 0.2 1.0 0.91 0.98
0.05 0.09 0.39 0.25 0.22 0.19 0.24 0.2 0.32 0.25 0.39 0.27 0.14 0.45 0.39 0.44 0.28 1.0 0.34 0.4 0.49 0.36 0.27 0.34 0.09 0.46 0.42 0.25
0.07 0.22 0.82 0.31 0.27 0.18 0.49 0.32 0.58 0.3 0.7 0.3 0.29 0.45 0.45 0.37 0.26 1.0 0.39 0.38 0.38 0.33 0.38 0.34 0.13 0.68 0.47 0.37
0.08 0.09 0.59 0.37 0.42 0.31 0.48 0.17 0.34 0.3 0.4 0.47 0.43 0.44 0.44 0.39 0.32 0.51 0.28 0.39 0.34 0.37 0.38 0.38 0.13 1.0 0.44 0.25
0.01 0.05 0.38 0.2 0.21 0.14 0.24 0.1 0.26 0.2 0.25 0.26 0.18 0.27 0.23 0.16 0.14 1.0 0.11 0.19 0.13 0.16 0.15 0.16 0.07 0.47 0.28 0.24
0.34 0.22 0.36 0.3 0.29 0.17 0.26 0.2 0.38 0.4 0.42 0.29 0.43 0.4 0.36 0.36 0.28 1.0 0.62 0.46 0.4 0.31 0.19 0.29 0.11 0.86 0.37 0.26
0.07 0.47 0.75 0.29 0.46 0.24 0.82 0.67 0.59 1.0 0.75 0.66 0.58 0.49 0.53 0.44 0.35 0.61 0.84 0.6 0.59 0.5 0.92 0.51 0.58 0.45 0.97 0.09
0.09 0.33 0.28 0.35 0.26 0.27 0.35 0.35 0.29 0.45 0.37 0.25 0.32 0.57 0.49 0.75 0.55 1.0 0.74 0.71 0.87 0.66 0.28 0.66 0.37 0.71 0.37 0.51
0.46 0.34 0.92 0.5 0.81 0.93 0.89 0.43 0.55 0.49 0.62 0.75 1.0 0.55 0.52 0.79 0.59 0.28 0.74 0.89 0.87 0.8 0.38 0.87 0.86 0.56 0.51 0.23
0.11 0.33 0.57 0.44 0.35 0.33 0.53 0.29 0.44 0.33 0.52 0.44 0.81 0.23 0.26 0.86 0.55 0.43 0.91 0.62 1.0 0.6 0.08 0.59 0.49 0.73 0.21 0.21
0.07 0.18 0.71 0.47 0.7 0.55 0.47 0.31 0.7 0.68 0.73 0.83 0.72 0.84 0.76 0.44 0.4 0.34 0.35 0.62 0.42 0.34 0.25 0.41 0.23 1.0 0.73 0.56
0.08 0.35 0.78 0.31 0.43 0.42 0.62 0.28 0.43 0.42 0.42 0.39 0.54 0.55 0.52 0.54 0.51 0.36 1.0 0.67 0.68 0.59 0.47 0.65 0.27 0.99 0.67 0.27
0.36 0.37 0.63 0.43 0.42 0.39 0.63 0.35 0.39 0.41 0.41 0.36 0.64 0.49 0.45 0.67 0.72 0.3 1.0 0.8 0.68 0.75 0.34 0.68 0.18 0.67 0.53 0.46
0.59 0.6 0.68 0.28 0.62 0.46 0.48 0.57 0.56 0.49 0.58 0.55 0.26 0.38 0.42 0.95 0.57 0.57 0.63 1.0 0.75 0.8 0.39 0.69 0.5 0.98 0.41 0.21
0.41 0.2 0.82 0.25 0.33 0.18 0.24 0.21 0.48 0.31 0.53 0.39 0.12 0.53 0.5 0.53 0.37 0.19 0.29 0.95 0.5 0.56 0.65 0.63 0.05 1.0 0.63 0.29
0.09 0.28 1.0 0.37 0.77 0.61 0.75 0.48 0.56 0.55 0.7 0.83 0.63 0.43 0.45 0.81 0.63 0.46 0.55 0.71 0.74 0.78 0.31 0.74 0.27 0.47 0.45 0.22
0.36 0.48 0.49 0.58 0.37 0.47 0.64 0.3 0.26 0.43 0.25 0.26 0.53 0.45 0.44 0.55 0.46 0.42 0.59 0.6 0.69 0.44 0.43 0.41 0.39 1.0 0.67 0.84
0.04 0.4 0.63 0.51 0.31 0.36 0.67 0.47 0.55 0.71 0.65 0.29 0.57 0.54 0.55 0.85 0.71 0.42 0.84 0.91 1.0 0.76 0.48 0.83 0.29 0.34 0.53 0.64
0.11 0.22 0.5 0.24 0.25 0.24 0.78 0.21 0.28 0.36 0.3 0.26 0.59 0.34 0.32 0.56 0.56 1.0 0.97 0.64 0.68 0.66 0.23 0.66 0.21 0.44 0.28 0.45
0.02 0.15 0.51 0.22 0.18 0.13 0.39 0.07 0.19 0.17 0.15 0.13 0.51 0.35 0.33 0.13 0.11 1.0 0.11 0.14 0.12 0.1 0.27 0.13 0.1 0.32 0.38 0.2
0.36 0.78 1.0 0.83 0.69 0.53 0.73 0.52 0.46 0.62 0.42 0.49 0.65 0.59 0.53 0.94 0.91 0.63 0.72 0.91 0.93 0.88 0.44 0.74 0.39 0.58 0.79 0.85
0.22 0.25 0.85 0.76 0.44 0.49 0.73 0.33 0.48 0.45 0.47 0.36 0.63 0.52 0.51 0.74 0.74 0.26 0.51 1.0 0.85 0.82 0.45 0.74 0.27 0.5 0.58 0.79
0.06 0.21 0.66 0.24 0.26 0.28 0.34 0.26 0.37 0.21 0.43 0.34 0.14 0.77 0.71 0.42 0.25 0.19 0.4 0.42 0.42 0.39 0.65 0.4 0.12 0.6 1.0 0.25
0.03 0.13 0.39 0.37 0.25 0.15 0.36 0.17 0.24 0.19 0.25 0.23 0.35 0.36 0.29 0.44 0.42 1.0 0.42 0.54 0.5 0.46 0.21 0.4 0.12 0.72 0.39 0.34
0.17 0.42 1.0 0.4 0.62 0.61 0.81 0.65 0.71 0.6 0.68 0.55 0.71 0.42 0.42 0.96 0.7 0.51 0.65 0.86 0.82 0.79 0.32 0.82 0.33 0.36 0.42 0.36
0.12 0.25 0.65 0.46 0.56 0.39 0.55 0.36 0.65 0.5 0.72 0.7 0.6 0.66 0.64 0.49 0.46 0.61 0.65 0.98 0.52 0.63 0.55 0.63 0.18 1.0 0.71 0.24
0.13 0.48 0.69 0.5 0.4 0.43 0.48 0.26 0.41 0.32 0.47 0.39 0.45 0.86 0.94 0.68 0.55 0.29 0.76 0.82 0.9 0.82 0.55 0.79 0.35 1.0 0.81 0.63
0.04 0.13 0.64 0.44 0.43 0.29 0.65 0.34 0.27 0.37 0.29 0.26 0.78 0.38 0.4 0.92 0.64 0.55 0.86 0.92 1.0 0.71 0.39 0.67 0.34 0.66 0.41 0.48
0.27 0.43 0.6 0.38 0.42 0.51 0.58 0.5 0.48 0.41 0.56 0.4 0.51 0.56 0.62 0.63 0.51 1.0 0.72 0.84 0.71 0.72 0.5 0.69 0.34 0.73 0.55 0.3
0.0 0.03 0.27 0.19 0.25 0.17 0.17 0.12 0.32 0.25 0.32 0.31 0.16 0.23 0.22 0.28 0.2 1.0 0.23 0.31 0.25 0.26 0.13 0.23 0.03 0.35 0.24 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)