Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.01 0.05 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.05 0.44 0.3 0.22 0.0 1.0 0.16 0.68 0.01 0.65 0.0 0.0 0.05 0.3
0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.51 0.0 0.52 0.8 0.64 0.65 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.68
0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.12 0.0 0.39 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 1.0
0.2 0.05 0.0 0.27 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.86 0.76 0.12 0.21 1.0 0.79 0.65 0.0 0.22 0.04 0.0 0.06 0.31
0.01 0.0 0.09 0.38 0.43 0.43 0.2 0.01 0.02 0.02 0.03 0.21 0.19 0.01 0.02 1.0 0.69 0.04 0.34 0.5 0.13 0.46 0.09 0.25 0.02 0.01 0.05 0.24
0.31 0.21 0.19 0.72 0.35 0.29 0.3 0.26 0.37 0.36 0.48 0.37 0.38 0.43 0.41 0.41 0.36 0.4 0.54 0.34 0.31 0.51 0.32 0.43 0.12 0.6 0.54 1.0
0.32 0.39 0.45 0.69 0.56 0.57 0.6 0.43 0.43 0.4 0.46 0.47 0.7 0.5 0.44 1.0 0.76 0.36 0.37 0.86 0.98 0.83 0.48 0.78 0.38 0.58 0.45 0.6
0.0 0.01 0.03 0.48 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.06 0.06 0.03 0.04 0.0 0.0 0.91 0.56 0.03 0.51 1.0 0.63 1.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.99
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.0 0.48 0.57 0.28 0.35 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.41
0.07 0.11 0.14 0.58 0.14 0.2 0.26 0.22 0.23 0.22 0.25 0.14 0.2 0.22 0.18 0.78 0.72 0.81 0.61 0.93 0.91 0.73 0.14 0.76 0.06 0.14 0.24 1.0
0.02 0.09 0.23 0.3 0.11 0.19 0.11 0.1 0.16 0.18 0.09 0.14 0.19 0.14 0.11 1.0 0.85 0.25 0.63 0.85 0.74 0.88 0.1 0.83 0.04 0.22 0.17 0.65
0.12 0.19 0.45 0.58 0.18 0.09 0.26 0.28 0.35 0.2 0.36 0.12 0.4 0.19 0.21 0.48 0.34 1.0 0.27 0.49 0.51 0.43 0.27 0.37 0.16 0.32 0.19 0.23
0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.54 0.0 0.11 0.45 0.47 0.36 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 1.0
0.01 0.01 0.27 0.59 0.01 0.01 0.08 0.05 0.27 0.14 0.24 0.05 0.09 0.05 0.06 0.84 0.71 0.64 0.79 1.0 0.62 0.8 0.07 0.71 0.04 0.27 0.1 0.54
0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0 0.58 0.99 0.68 0.77 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.36
0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.69 0.0 0.86 0.94 0.91 0.92 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 1.0
0.15 0.08 0.54 0.99 0.21 0.22 0.38 0.28 0.37 0.35 0.18 0.17 0.15 0.12 0.12 0.42 0.42 0.42 0.23 1.0 0.95 0.83 0.64 0.48 0.06 0.19 0.15 0.91
0.18 0.06 0.02 0.51 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.15 0.12 0.1 0.26 0.19 0.17 0.24 0.01 0.2 0.04 0.03 0.1 1.0
0.84 0.25 0.07 1.0 0.02 0.02 0.09 0.07 0.08 0.15 0.07 0.02 0.12 0.2 0.19 0.21 0.14 0.13 0.54 0.3 0.29 0.41 0.06 0.41 0.18 0.13 0.15 0.8
0.0 0.0 0.11 1.0 0.08 0.01 0.13 0.08 0.06 0.04 0.04 0.04 0.31 0.02 0.01 0.71 0.55 0.78 0.3 0.84 0.64 0.71 0.16 0.68 0.0 0.05 0.1 0.83
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.28 0.0 1.0 0.44 0.27 0.5 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.38
0.21 0.1 0.22 0.38 0.06 0.12 0.07 0.82 0.22 0.43 0.21 0.07 0.06 0.11 0.13 0.64 0.5 0.32 0.42 0.63 1.0 0.65 0.19 0.67 0.12 0.12 0.09 0.48
0.86 0.03 0.33 0.76 0.17 0.2 0.21 0.12 0.1 0.08 0.13 0.12 0.21 0.12 0.12 0.79 0.58 0.62 0.86 0.73 0.72 0.75 0.19 0.8 0.01 0.09 0.13 1.0
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.81 0.0 0.55 0.82 0.85 0.93 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.47
0.03 0.05 0.35 0.47 0.28 0.31 0.25 0.53 0.45 0.83 0.53 0.23 0.33 0.23 0.21 1.0 0.72 0.57 0.41 0.92 0.73 0.82 0.28 0.67 0.03 0.08 0.27 0.82
0.03 0.01 0.3 0.45 0.08 0.05 1.0 0.09 0.15 0.1 0.15 0.08 0.31 0.08 0.08 0.36 0.36 0.23 0.27 0.46 0.52 0.45 0.11 0.41 0.02 0.26 0.13 0.69
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.62 0.0 0.78 1.0 0.94 0.91 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.6
0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.63 0.0 0.58 0.93 0.83 0.77 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.44 0.0 0.74 0.8 0.94 0.7 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.0 0.0 0.04 0.2 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.66 0.38 0.0 0.36 1.0 0.62 0.75 0.01 0.74 0.01 0.01 0.01 0.57
0.07 0.31 0.04 0.2 0.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.0 0.06 0.0 0.03 0.19 0.18 0.51 0.0 0.07 0.51 1.0 0.74 0.46 0.0 0.54 0.13 0.02 0.03 0.36
0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.3 0.0 0.54 0.99 1.0 0.93 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.8
0.0 0.0 0.02 0.17 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.56 0.39 0.04 0.47 1.0 0.76 0.79 0.0 0.73 0.01 0.02 0.01 0.63
0.04 0.1 0.01 0.26 0.01 0.02 0.07 0.06 0.11 0.03 0.15 0.07 0.05 0.09 0.11 0.22 0.07 0.04 0.26 0.49 0.42 0.18 0.04 0.3 0.01 0.01 0.04 1.0
0.06 0.12 0.24 0.37 0.2 0.12 0.2 0.31 0.28 0.32 0.31 0.24 0.18 0.14 0.19 0.59 0.36 1.0 0.13 0.97 0.9 0.8 0.34 0.68 0.03 0.03 0.13 0.8
0.05 0.09 0.09 0.4 0.18 0.19 0.17 0.16 0.2 0.31 0.2 0.22 0.29 0.25 0.24 0.74 0.78 0.28 0.45 1.0 0.82 0.96 0.2 0.91 0.27 0.18 0.17 0.81
0.15 0.01 0.1 0.58 0.08 0.01 0.1 0.8 0.32 0.28 0.39 0.12 0.03 0.02 0.03 1.0 0.47 0.14 0.26 0.65 0.76 0.68 0.11 0.57 0.0 0.12 0.01 0.24
0.05 0.05 0.22 0.41 0.15 0.13 0.16 0.24 0.23 0.26 0.36 0.18 0.12 0.38 0.29 0.27 0.14 0.19 0.25 0.5 0.3 0.32 0.13 0.3 0.19 0.34 0.49 1.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.44 0.02 0.83 0.89 0.93 0.84 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.56
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.25 0.0 0.17 0.2 0.4 0.22 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.68 0.92 0.1 1.0 0.75 0.39 0.9 0.03 0.75 0.0 0.0 0.0 0.85
0.02 0.01 0.03 0.14 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.07 0.07 0.62 0.47 0.08 0.39 1.0 0.72 0.88 0.04 0.74 0.01 0.01 0.17 0.56
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.79 0.0 0.88 0.65 0.0 1.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.43
0.02 0.07 0.2 0.39 0.27 0.17 0.2 0.16 0.25 0.22 0.28 0.34 0.3 0.18 0.17 0.9 0.57 0.35 0.7 0.87 1.0 0.76 0.16 0.71 0.07 0.29 0.21 0.96
0.0 0.01 0.04 0.2 0.02 0.01 0.04 0.03 0.04 0.01 0.06 0.03 0.01 0.1 0.06 0.72 0.56 0.05 0.63 1.0 0.56 0.79 0.05 0.84 0.01 0.03 0.07 0.41
0.0 0.0 0.01 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.41 0.0 0.53 1.0 0.81 0.85 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.47
0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.24 0.0 0.57 0.5 0.0 1.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.32 0.0 0.13 1.0 0.24 0.56 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.95
0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.5 0.0 0.34 1.0 0.62 0.75 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.67
0.0 0.03 0.14 0.21 0.05 0.05 0.09 0.23 0.27 0.22 0.29 0.05 0.11 0.19 0.09 0.39 0.29 0.64 0.37 1.0 0.34 0.82 0.1 0.59 0.06 0.08 0.16 0.64
0.04 0.27 0.13 0.25 0.43 1.0 0.14 0.58 0.14 0.48 0.23 0.15 0.03 0.29 0.31 0.15 0.17 0.33 0.42 0.64 0.32 0.58 0.12 0.61 0.2 0.31 0.24 0.23
0.04 0.14 0.62 0.58 0.55 0.38 0.51 0.61 0.64 0.76 0.86 0.54 0.35 0.7 0.61 0.37 0.25 0.38 0.29 0.63 0.45 0.4 0.29 0.39 0.31 0.88 0.84 1.0
0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.29 0.0 0.23 1.0 0.67 0.74 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.17
0.04 0.48 0.53 0.41 0.11 0.06 0.1 0.09 0.09 0.08 0.09 0.04 0.18 1.0 0.78 0.6 0.45 0.38 0.64 0.85 0.68 0.76 0.1 0.65 0.25 0.19 0.84 0.55
0.06 0.1 0.02 0.32 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.22 0.22 0.4 0.42 0.28 0.21 0.54 0.37 0.39 0.11 0.36 0.06 0.3 0.26 1.0
0.03 0.11 0.21 0.52 0.52 0.39 0.11 0.11 0.23 0.25 0.2 0.74 0.15 0.15 0.14 0.38 0.51 0.27 0.27 0.66 0.35 0.45 0.12 0.4 0.05 0.18 0.14 1.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.0 0.16 0.61 0.71 0.48 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.43 0.0 0.45 0.31 0.64 0.49 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 1.0
0.11 0.53 0.44 1.0 0.57 0.55 0.45 0.35 0.4 0.42 0.45 0.57 0.65 0.32 0.33 0.52 0.47 0.5 0.39 0.47 0.33 0.53 0.41 0.55 0.16 0.27 0.27 0.76
0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.65 0.0 0.1 0.17 0.18 0.11 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.4 0.0 0.34 0.54 0.54 0.49 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 1.0
0.45 0.53 0.59 0.69 0.75 1.0 0.64 0.35 0.42 0.36 0.49 0.62 0.83 0.44 0.42 0.56 0.55 0.42 0.25 0.54 0.53 0.52 0.44 0.55 0.25 0.57 0.47 0.48
0.25 0.34 0.71 0.75 0.54 0.42 0.78 0.38 0.33 0.3 0.38 0.44 0.84 0.34 0.36 1.0 0.76 0.34 0.85 0.86 0.84 0.81 0.51 0.78 0.29 0.69 0.23 0.69
0.01 0.07 0.0 0.29 0.07 0.13 0.03 0.18 0.11 0.26 0.18 0.12 0.05 0.06 0.06 0.52 0.64 0.28 0.14 0.91 0.36 1.0 0.07 0.98 0.0 0.1 0.02 0.47
0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.22 0.0 0.18 0.25 0.14 0.19 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 1.0
0.05 0.08 0.12 0.23 0.05 0.1 0.1 0.12 0.16 0.1 0.2 0.05 0.14 0.07 0.08 0.7 0.55 0.04 0.83 1.0 0.83 0.95 0.17 0.94 0.1 0.09 0.12 0.69
0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.57 0.0 0.48 0.96 0.33 0.33 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 1.0
0.07 0.54 0.28 0.42 0.28 0.36 0.22 0.24 0.26 0.22 0.26 0.33 0.31 0.6 0.51 0.89 0.58 1.0 0.51 0.63 0.99 0.73 0.28 0.66 0.27 0.59 0.4 0.57
0.02 0.06 0.05 0.16 0.05 0.07 0.02 0.05 0.08 0.05 0.07 0.08 0.04 0.05 0.06 0.52 0.41 0.0 0.68 1.0 0.74 0.78 0.05 0.87 0.08 0.03 0.07 0.48
0.01 0.0 0.0 0.21 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.72 0.73 0.0 0.74 0.7 0.67 1.0 0.0 0.91 0.0 0.01 0.0 0.41
0.05 0.26 0.08 0.61 0.18 0.2 0.23 0.17 0.24 0.21 0.26 0.22 0.19 0.1 0.08 0.94 0.8 0.42 0.51 0.87 0.69 0.82 0.1 0.91 0.26 0.11 0.19 1.0
0.0 0.01 0.04 0.4 0.04 0.01 0.11 0.04 0.01 0.11 0.09 0.07 0.1 0.0 0.02 0.57 0.56 0.14 1.0 0.53 0.55 0.81 0.05 0.49 0.03 0.0 0.0 0.86
0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.38 0.0 0.62 0.76 1.0 0.72 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.3
0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.46 0.0 0.22 0.64 0.24 0.54 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)