Heatmap: Cluster_79 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
1.0 0.67 0.26 0.23 0.22 0.19 0.28 0.22 0.14 0.22 0.14 0.11 0.29 0.31 0.3 0.42 0.28 0.18 0.22 0.36 0.5 0.3 0.25 0.26 0.82 0.96 0.55 0.17
0.83 0.89 0.51 0.68 0.53 0.45 0.57 0.47 0.42 0.55 0.46 0.42 0.53 0.69 0.63 0.85 0.86 1.0 0.72 0.94 0.79 0.86 0.36 0.88 0.69 0.62 0.69 0.69
0.87 0.71 0.31 0.25 0.12 0.11 0.3 0.31 0.22 0.27 0.24 0.07 0.29 0.32 0.32 0.19 0.11 0.21 0.17 0.15 0.21 0.12 0.23 0.14 0.85 1.0 0.66 0.2
1.0 0.17 0.14 0.02 0.03 0.03 0.12 0.11 0.08 0.06 0.09 0.02 0.04 0.1 0.09 0.03 0.03 0.08 0.03 0.05 0.04 0.05 0.13 0.05 0.34 0.1 0.11 0.02
1.0 0.27 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.36 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.42 0.37 0.1 0.0
1.0 0.84 0.17 0.06 0.08 0.07 0.24 0.16 0.21 0.19 0.26 0.1 0.12 0.17 0.14 0.08 0.1 0.12 0.1 0.11 0.13 0.09 0.15 0.11 0.05 0.06 0.2 0.09
1.0 0.13 0.05 0.06 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.03 0.03 0.04 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.19 0.07 0.01 0.07
1.0 0.09 0.03 0.01 0.02 0.05 0.02 0.05 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.05 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.05 0.02 0.3 0.18 0.06 0.01
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.85 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0
1.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.33 0.02 0.0 0.04 0.02 0.12 0.0 0.05
1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.02 0.0 0.0
1.0 0.28 0.08 0.07 0.03 0.02 0.08 0.04 0.06 0.05 0.07 0.03 0.06 0.09 0.08 0.14 0.11 0.15 0.16 0.15 0.14 0.11 0.04 0.13 0.07 0.12 0.07 0.1
1.0 0.26 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.21 0.23 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.02 0.59 0.01 0.19 0.01
1.0 0.89 0.14 0.05 0.14 0.15 0.06 0.16 0.14 0.09 0.15 0.09 0.03 0.19 0.21 0.12 0.08 0.11 0.09 0.14 0.12 0.12 0.14 0.12 0.44 0.23 0.18 0.03
1.0 0.14 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.33 0.34 0.05 0.01 0.15 0.02 0.13 0.06 0.08 0.01 0.08 0.07 0.09 0.09 0.02
1.0 0.4 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.63 0.54 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.08 0.26 0.02
1.0 0.05 0.01 0.11 0.18 0.83 0.27 0.12 0.04 0.05 0.14 0.1 0.17 0.16 0.07 0.07 0.24 0.07 0.01 0.06 0.04 0.06 0.08 0.03 0.06 0.23 0.14 0.13
1.0 0.41 0.18 0.12 0.1 0.1 0.14 0.11 0.08 0.1 0.07 0.07 0.1 0.13 0.11 0.23 0.14 0.19 0.24 0.2 0.28 0.17 0.13 0.2 0.18 0.08 0.13 0.12
1.0 0.53 0.11 0.16 0.17 0.59 0.14 0.2 0.15 0.13 0.18 0.11 0.16 0.2 0.2 0.16 0.17 0.09 0.11 0.16 0.17 0.17 0.18 0.16 0.26 0.3 0.12 0.2
1.0 0.12 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.05 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 0.06 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.05 0.02
1.0 0.65 0.04 0.04 0.05 0.07 0.05 0.04 0.05 0.05 0.06 0.04 0.06 0.06 0.07 0.03 0.05 0.04 0.03 0.03 0.04 0.03 0.05 0.04 0.12 0.15 0.05 0.04
0.99 1.0 0.24 0.11 0.12 0.11 0.24 0.1 0.13 0.09 0.14 0.1 0.34 0.12 0.12 0.2 0.23 0.13 0.21 0.19 0.18 0.18 0.09 0.24 0.17 0.1 0.2 0.09
1.0 0.51 0.42 0.23 0.14 0.09 0.27 0.19 0.16 0.14 0.18 0.13 0.15 0.25 0.28 0.33 0.3 0.08 0.27 0.31 0.27 0.3 0.25 0.28 0.35 0.26 0.33 0.1
1.0 0.22 0.04 0.07 0.08 0.07 0.06 0.04 0.07 0.05 0.07 0.08 0.07 0.1 0.1 0.06 0.06 0.05 0.03 0.06 0.05 0.06 0.06 0.05 0.3 0.24 0.08 0.07
1.0 0.22 0.41 0.3 0.39 0.27 0.29 0.15 0.2 0.32 0.14 0.39 0.33 0.52 0.4 0.23 0.27 0.1 0.11 0.24 0.25 0.24 0.1 0.18 0.65 0.28 0.49 0.33
1.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.04 0.04 0.01 0.0
1.0 0.52 0.11 0.03 0.0 0.0 0.07 0.26 0.02 0.05 0.0 0.02 0.04 0.04 0.08 0.05 0.0 0.11 0.0 0.06 0.0 0.05 0.03 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0
1.0 0.93 0.17 0.11 0.19 0.18 0.1 0.11 0.27 0.1 0.31 0.19 0.08 0.23 0.23 0.11 0.09 0.07 0.11 0.11 0.11 0.1 0.12 0.12 0.16 0.18 0.24 0.12
1.0 0.67 0.05 0.09 0.13 0.19 0.01 0.04 0.16 0.03 0.17 0.11 0.02 0.05 0.05 0.29 0.21 0.09 0.19 0.23 0.15 0.19 0.03 0.22 0.03 0.17 0.06 0.18
1.0 0.22 0.08 0.05 0.04 0.04 0.04 0.06 0.08 0.08 0.09 0.05 0.05 0.07 0.08 0.06 0.03 0.04 0.05 0.07 0.06 0.07 0.05 0.07 0.08 0.06 0.05 0.04
1.0 0.53 0.3 0.22 0.21 0.18 0.19 0.34 0.24 0.27 0.35 0.19 0.14 0.32 0.31 0.41 0.44 0.2 0.18 0.34 0.39 0.32 0.29 0.29 0.3 0.33 0.52 0.14
1.0 0.2 0.04 0.16 0.08 0.13 0.1 0.03 0.07 0.06 0.07 0.1 0.11 0.16 0.13 0.03 0.04 0.03 0.02 0.04 0.03 0.03 0.01 0.03 0.22 0.32 0.13 0.15
1.0 0.84 0.2 0.15 0.21 0.11 0.15 0.11 0.13 0.1 0.12 0.17 0.16 0.37 0.31 0.12 0.11 0.08 0.06 0.16 0.15 0.11 0.16 0.12 0.53 0.32 0.38 0.08
1.0 0.17 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.48 0.14 0.12 0.01
1.0 0.24 0.21 0.17 0.14 0.2 0.16 0.1 0.1 0.07 0.11 0.12 0.15 0.25 0.19 0.31 0.21 0.1 0.22 0.3 0.33 0.28 0.11 0.3 0.36 0.3 0.23 0.11
1.0 0.25 0.1 0.06 0.05 0.06 0.12 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05 0.13 0.07 0.07 0.11 0.11 0.04 0.07 0.1 0.12 0.1 0.04 0.12 0.15 0.12 0.07 0.07
1.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.04 0.06 0.04 0.0 0.03 0.29 0.18 0.02 0.16 0.05 0.76 0.05 0.05 0.05
1.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.13 0.14 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.52 0.04 0.04 0.0
1.0 0.3 0.08 0.09 0.12 0.14 0.08 0.07 0.04 0.06 0.04 0.06 0.05 0.13 0.12 0.07 0.05 0.04 0.03 0.08 0.06 0.05 0.06 0.06 0.33 0.02 0.3 0.04
1.0 0.73 0.05 0.01 0.02 0.02 0.02 0.16 0.28 0.08 0.32 0.03 0.01 0.12 0.16 0.02 0.02 0.04 0.03 0.05 0.04 0.05 0.06 0.04 0.07 0.06 0.13 0.01
1.0 0.09 0.04 0.02 0.02 0.04 0.03 0.06 0.05 0.1 0.08 0.03 0.02 0.04 0.04 0.08 0.06 0.08 0.07 0.18 0.06 0.08 0.12 0.09 0.07 0.08 0.08 0.07
1.0 0.07 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04 0.02 0.06 0.01 0.0 0.03 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.07 0.01 0.21 0.04 0.04 0.0
1.0 0.62 0.2 0.05 0.07 0.04 0.2 0.05 0.3 0.06 0.31 0.12 0.11 0.26 0.18 0.04 0.06 0.05 0.04 0.05 0.03 0.05 0.13 0.06 0.1 0.1 0.2 0.03
1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.27 0.0 0.0
1.0 0.43 0.23 0.19 0.11 0.12 0.18 0.18 0.3 0.19 0.34 0.09 0.13 0.23 0.24 0.24 0.21 0.6 0.34 0.32 0.33 0.3 0.23 0.27 0.34 0.4 0.25 0.25
1.0 0.25 0.19 0.09 0.24 0.19 0.32 0.09 0.21 0.08 0.22 0.3 0.09 0.13 0.19 0.34 0.33 0.17 0.21 0.32 0.33 0.33 0.4 0.35 0.13 0.07 0.21 0.1
1.0 0.37 0.5 0.15 0.32 0.2 0.3 0.18 0.22 0.18 0.19 0.22 0.16 0.15 0.18 0.48 0.55 0.18 0.16 0.51 0.26 0.56 0.17 0.3 0.18 0.19 0.19 0.11
1.0 0.58 0.12 0.16 0.25 0.34 0.17 0.14 0.13 0.18 0.14 0.18 0.14 0.22 0.23 0.19 0.22 0.09 0.14 0.2 0.17 0.17 0.19 0.13 0.42 0.35 0.27 0.2
1.0 0.8 0.24 0.18 0.23 0.2 0.32 0.1 0.16 0.16 0.14 0.2 0.26 0.26 0.25 0.16 0.18 0.13 0.13 0.2 0.17 0.2 0.1 0.19 0.28 0.26 0.26 0.33
1.0 0.21 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.06 0.0
1.0 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 0.01 0.06 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.12 0.01 0.09 0.02 0.01 0.01
1.0 0.27 0.15 0.1 0.14 0.18 0.41 0.08 0.05 0.12 0.09 0.08 0.25 0.13 0.14 0.13 0.16 0.08 0.09 0.14 0.13 0.13 0.1 0.14 0.26 0.08 0.17 0.07
0.63 1.0 0.31 0.15 0.25 0.29 0.3 0.25 0.25 0.31 0.26 0.22 0.19 0.38 0.34 0.25 0.22 0.14 0.16 0.26 0.27 0.28 0.21 0.24 0.31 0.3 0.49 0.16
1.0 0.16 0.06 0.1 0.04 0.03 0.06 0.17 0.13 0.09 0.1 0.03 0.05 0.12 0.07 0.1 0.04 0.07 0.11 0.09 0.11 0.07 0.04 0.07 0.03 0.02 0.2 0.06
1.0 0.12 0.06 0.01 0.0 0.0 0.02 0.07 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03 0.01 0.0 0.04 0.02 0.03 0.03 0.14 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0
1.0 0.12 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.64 0.25 0.06 0.07 0.1 0.09 0.08 0.08 0.08 0.19 0.07 0.1 0.03 0.1 0.11 0.04 0.06 0.09 0.05 0.07 0.05 0.07 0.08 0.06 1.0 0.09 0.09 0.18
1.0 0.36 0.12 0.07 0.08 0.05 0.08 0.04 0.06 0.04 0.06 0.05 0.07 0.06 0.06 0.11 0.06 0.05 0.07 0.08 0.09 0.07 0.03 0.08 0.08 0.03 0.06 0.03
1.0 0.46 0.13 0.09 0.05 0.05 0.12 0.06 0.05 0.06 0.06 0.04 0.09 0.08 0.08 0.13 0.08 0.06 0.13 0.12 0.14 0.11 0.05 0.12 0.24 0.29 0.09 0.09
1.0 0.06 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.02 0.04 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.03 0.01
1.0 0.66 0.06 0.03 0.08 0.11 0.07 0.07 0.08 0.05 0.11 0.09 0.07 0.13 0.12 0.08 0.08 0.05 0.05 0.08 0.08 0.08 0.07 0.08 0.26 0.12 0.13 0.02
1.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.07 0.1 0.0
1.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.07 0.04 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.03
1.0 0.44 0.14 0.08 0.08 0.08 0.11 0.09 0.12 0.08 0.15 0.11 0.11 0.12 0.1 0.18 0.15 0.16 0.15 0.16 0.17 0.18 0.07 0.16 0.29 0.22 0.12 0.08
1.0 0.1 0.04 0.02 0.04 0.02 0.04 0.06 0.11 0.03 0.08 0.04 0.04 0.05 0.09 0.07 0.04 0.07 0.06 0.09 0.04 0.08 0.08 0.08 0.52 0.02 0.04 0.02
0.93 1.0 0.09 0.08 0.01 0.01 0.11 0.08 0.21 0.02 0.58 0.02 0.02 0.09 0.1 0.06 0.1 0.01 0.03 0.04 0.06 0.05 0.14 0.05 0.08 0.16 0.11 0.07
1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.02 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)