1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.17 0.28 0.95 0.39 0.1 0.1 0.05 0.33 0.27 0.24 0.41 0.17 0.06 0.38 0.3 2.32 0.96 0.28 1.45 9.49 1.23 1.92 3.13 3.4 0.01 0.2 2.44 2.73
0.0 0.0 0.24 0.44 0.0 0.0 0.11 0.0 0.39 0.0 0.1 0.0 0.0 0.12 0.03 0.75 0.51 0.0 0.53 5.34 0.59 1.01 0.18 0.91 0.0 0.0 0.23 0.46
0.47 0.86 2.65 1.81 1.73 3.36 1.66 1.01 1.19 0.84 0.97 1.22 0.68 8.9 4.98 2.8 1.58 0.65 1.71 13.77 3.82 3.17 3.69 4.54 2.02 0.49 11.48 4.24
0.04 0.07 0.23 0.04 0.02 0.0 0.03 0.31 0.09 0.12 0.15 0.02 0.11 0.18 0.2 0.59 0.5 0.09 0.66 1.37 0.63 0.61 0.03 1.0 0.05 0.04 0.22 0.18
0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.16 0.11 0.21 0.0 0.0 2.24 0.73 0.55 0.21 0.31 0.0 0.0 0.11 0.0
0.0 0.06 0.31 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.38 0.79 1.24 0.0 0.57 4.51 1.3 1.9 1.32 2.77 0.12 0.0 0.31 1.22
0.96 0.62 8.75 1.78 0.76 0.73 2.72 1.2 0.81 2.02 1.08 0.57 2.68 2.4 2.57 10.32 10.58 1.41 9.57 37.65 7.57 12.93 8.29 13.34 0.99 1.34 6.11 6.9
0.78 15.35 7.68 15.08 0.64 0.86 1.09 1.81 2.78 3.53 2.9 0.61 1.35 0.98 1.44 18.2 14.53 0.83 8.55 59.62 19.57 16.01 4.3 17.83 0.43 1.6 4.22 17.45
0.0 0.09 0.26 0.21 0.03 0.0 0.1 0.15 0.28 0.46 0.43 0.03 0.09 0.1 0.11 0.66 0.29 0.16 0.97 1.85 0.44 0.42 0.18 0.49 0.0 0.4 0.45 0.69
0.06 0.17 2.54 0.68 0.14 0.28 0.14 0.24 0.27 0.33 0.42 0.19 0.32 1.4 0.78 3.43 1.63 0.48 2.85 11.79 1.31 3.5 5.35 4.77 0.43 0.83 3.16 3.34
0.07 0.0 0.16 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.37 0.17 0.05 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.27
1.25 2.84 6.09 1.77 0.36 0.39 1.97 2.45 4.26 2.64 5.19 0.49 1.78 1.89 1.99 15.89 10.85 2.11 11.49 36.52 13.95 13.84 3.29 14.32 1.2 0.6 2.55 5.42
0.01 0.13 0.57 0.33 0.01 0.0 0.03 0.04 0.04 0.03 0.1 0.0 0.05 0.1 0.06 2.14 1.45 0.0 1.87 9.61 1.91 2.43 0.1 2.4 0.04 0.06 0.15 0.61
0.25 0.69 10.87 8.39 1.7 1.59 1.52 4.75 6.85 3.85 8.16 2.35 1.9 1.91 1.7 22.87 18.13 3.1 20.48 86.49 21.64 30.17 2.29 34.47 0.54 6.76 3.81 18.43
0.87 0.61 3.75 1.9 1.03 0.64 3.38 0.59 1.14 0.96 0.99 0.92 2.6 1.54 1.26 3.79 2.55 1.43 5.42 11.99 3.01 4.68 2.63 5.44 0.51 1.06 3.4 3.68
2.88 2.14 3.21 3.17 2.13 3.37 2.56 1.25 1.1 0.85 2.15 2.16 1.75 4.81 4.53 9.19 5.02 1.36 5.87 18.12 6.1 6.58 8.45 8.73 1.43 6.16 8.46 8.26
0.13 0.61 2.46 0.94 0.16 0.21 0.41 0.27 0.46 0.27 0.56 0.18 0.14 0.77 0.7 4.53 2.17 0.12 7.84 13.15 3.14 3.97 2.98 5.54 0.35 2.72 2.0 2.42
0.28 0.0 0.0 0.24 0.0 0.35 0.17 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.41 0.0 1.49 5.04 2.69 1.24 0.72 0.38 0.0 0.0 0.81 3.22
0.14 0.05 0.51 0.25 0.04 0.21 0.12 0.22 0.29 1.15 0.21 0.0 0.0 0.12 0.26 0.85 0.85 0.32 0.46 3.56 0.83 1.07 0.91 1.29 0.07 0.0 0.99 0.39
0.13 0.19 4.01 4.06 0.99 0.39 0.46 1.16 1.98 2.99 2.2 0.72 1.12 2.83 3.75 13.61 4.77 1.6 20.43 36.25 9.52 10.59 16.44 12.48 0.19 7.45 8.78 18.38
0.25 1.25 0.15 0.16 0.12 0.12 0.24 0.05 0.04 0.04 0.06 0.03 0.06 0.27 0.37 0.29 0.3 0.1 0.28 1.68 0.72 0.46 0.17 0.5 0.55 0.54 0.34 0.36
0.51 0.29 2.01 1.32 0.1 0.0 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.61 0.29 3.66 1.5 0.0 2.69 23.43 3.3 5.07 7.86 6.61 0.31 0.0 3.78 7.84
1.57 2.5 5.27 3.78 1.31 2.44 5.21 1.1 2.04 1.88 2.1 1.47 3.43 6.89 4.06 5.44 4.47 2.35 4.34 10.85 5.39 5.32 6.06 5.28 1.92 2.31 5.01 5.57
0.13 0.67 2.47 0.81 0.25 0.28 0.56 2.16 1.6 2.71 0.82 0.55 0.14 2.4 2.29 2.62 1.1 0.48 1.62 11.33 1.9 2.94 7.34 3.74 0.25 1.01 7.78 4.19
0.51 9.63 6.13 2.09 2.6 2.35 2.85 2.67 3.98 2.35 3.61 1.78 2.09 6.3 6.04 10.27 6.3 2.57 6.23 33.89 11.74 10.65 19.29 11.03 1.78 3.48 16.45 14.52
18.71 4.05 11.4 7.7 0.94 1.14 1.2 0.67 1.3 0.75 1.32 0.72 2.11 3.07 2.28 23.26 5.81 0.57 18.06 82.8 27.14 19.81 45.26 28.04 4.65 1.77 32.06 27.2
2.33 11.44 2.6 1.85 0.73 1.79 1.21 0.74 1.49 0.7 1.47 0.28 0.33 0.63 0.48 9.11 7.66 0.34 8.28 44.05 10.86 11.75 1.16 14.89 0.58 1.93 1.37 3.86
0.58 29.97 3.27 2.31 0.8 0.61 0.6 1.46 2.36 1.28 2.34 0.81 0.59 1.44 1.25 3.47 0.99 0.47 2.49 35.58 2.38 3.05 1.11 3.53 0.54 0.89 17.39 5.01
0.0 0.0 0.34 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.13 0.16 0.2 0.41 0.0 0.42 0.64 0.12 0.08 0.14 0.03 0.0 0.0 0.38 0.1
0.26 0.31 1.41 0.93 0.68 0.31 0.76 0.43 0.78 1.1 0.85 0.46 0.59 0.37 0.35 4.08 3.07 2.08 7.11 9.64 3.0 2.89 0.53 4.56 0.18 1.62 0.75 1.26
1.24 0.14 38.68 13.7 2.43 0.48 0.27 6.68 1.38 3.94 3.87 0.29 0.15 3.35 1.91 23.65 4.68 0.0 34.91 305.43 19.22 18.92 4.72 23.62 0.56 0.0 61.6 30.19
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.49 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.22 1.39 0.73 0.31 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.48
0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.32 0.34 0.0 0.24 0.97 0.0 0.27 0.0 0.46 0.0 0.03 0.0 0.23
1.21 3.7 7.05 8.2 9.5 6.65 4.38 9.73 14.77 5.98 14.12 12.66 4.38 5.8 5.48 7.51 8.08 13.3 5.87 54.65 6.87 9.07 5.89 11.06 7.79 3.52 12.98 11.2
2.44 22.69 12.01 25.85 3.91 2.08 1.04 8.74 7.51 4.62 4.75 3.31 1.0 4.18 3.23 18.21 4.29 2.07 3.48 168.63 7.52 8.36 6.29 10.73 0.78 1.08 69.64 55.29
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.32 2.01 2.15 0.0 0.0 0.16 0.0 0.18 0.0 0.09 0.09 0.0 2.97 2.17 12.99 13.02 0.0 26.93 35.24 10.59 8.44 11.11 10.53 0.49 1.01 6.81 17.11
0.0 0.03 0.11 0.07 0.0 0.0 0.04 0.11 0.04 0.06 0.11 0.04 0.04 0.05 0.05 0.34 0.22 0.0 0.12 0.82 0.22 0.18 0.04 0.17 0.1 0.22 0.07 0.06
0.44 0.34 1.2 0.74 0.14 0.05 0.27 0.15 0.74 0.42 0.39 0.09 0.1 1.43 0.89 4.66 3.51 0.11 5.42 10.73 2.17 3.06 3.8 4.58 0.44 0.08 2.73 1.24
1.18 1.38 0.12 0.43 0.04 0.22 0.02 0.14 0.08 0.02 0.06 0.0 0.0 0.4 0.23 1.64 1.36 0.04 2.29 8.46 1.56 1.68 0.1 2.89 0.87 1.48 0.75 1.28
0.54 0.0 0.71 0.45 0.1 0.24 0.42 0.17 0.08 0.92 0.23 0.16 0.38 0.32 0.24 1.9 0.88 0.86 1.14 5.33 1.87 1.35 2.79 1.97 0.0 0.71 1.43 2.62
0.01 0.01 0.04 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.02 0.3 0.28 0.0 0.35 1.82 0.45 0.33 0.16 0.32 0.0 0.01 0.15 0.15
0.03 0.14 0.84 0.22 0.04 0.03 0.31 0.05 0.12 0.43 0.1 0.06 1.21 0.13 0.13 0.74 0.18 0.08 0.51 2.1 0.41 0.55 1.06 0.85 0.03 0.16 0.58 0.93
0.41 2.4 5.01 4.1 1.16 0.69 2.56 2.12 3.4 1.87 4.21 1.1 1.53 2.87 3.23 10.72 5.63 5.93 17.94 24.88 12.14 12.54 17.38 13.24 2.01 2.32 11.2 8.5
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83
0.79 2.62 3.76 3.15 1.37 1.14 3.33 0.91 1.1 2.21 1.45 1.22 4.52 2.16 1.41 8.41 4.7 2.58 7.43 24.11 6.27 6.62 3.83 8.06 0.34 3.76 5.06 6.85

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)