Heatmap: Cluster_136 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.08 0.1 0.53 0.95 0.45 0.32 0.39 0.46 0.43 0.38 0.42 0.29 0.5 0.3 0.28 0.84 0.54 0.29 0.78 0.84 1.0 0.74 0.29 0.7 0.17 0.12 0.32 0.37
0.34 0.64 0.86 0.8 0.23 0.16 1.0 0.35 0.6 0.55 0.61 0.22 0.75 0.89 0.68 0.52 0.55 0.14 0.41 0.61 0.42 0.6 0.33 0.48 0.39 0.94 0.72 0.69
0.58 1.0 0.55 0.8 0.21 0.18 0.51 0.3 0.37 0.49 0.39 0.26 0.45 0.34 0.38 0.36 0.45 0.21 0.43 0.42 0.36 0.35 0.34 0.34 0.48 0.42 0.49 0.75
1.0 0.5 0.06 0.5 0.01 0.01 0.05 0.04 0.04 0.05 0.03 0.0 0.0 0.07 0.11 0.35 0.46 0.03 0.33 0.34 0.48 0.36 0.06 0.22 0.2 0.12 0.12 0.73
0.51 0.52 0.54 0.95 0.2 0.21 0.57 0.28 0.29 0.28 0.3 0.15 0.6 0.36 0.4 0.63 0.54 0.36 1.0 0.64 0.7 0.56 0.47 0.56 0.32 0.76 0.44 0.66
0.84 0.4 0.6 0.81 0.25 0.34 0.83 0.45 0.53 0.57 0.48 0.18 0.87 0.56 0.51 0.79 0.56 0.34 0.72 0.69 1.0 0.58 0.39 0.67 0.43 0.35 0.6 0.87
0.1 0.23 0.85 0.76 0.39 0.45 0.72 0.1 0.22 0.17 0.2 0.35 1.0 0.24 0.21 0.48 0.56 0.69 0.64 0.46 0.34 0.43 0.16 0.39 0.11 0.6 0.23 0.56
0.76 0.88 0.67 1.0 0.22 0.19 0.76 0.26 0.4 0.36 0.46 0.31 0.31 0.55 0.51 0.45 0.55 0.17 0.83 0.47 0.25 0.43 0.35 0.4 0.39 0.86 0.61 0.59
0.72 0.35 0.47 0.64 0.4 0.39 0.87 0.39 0.46 0.56 0.52 0.31 1.0 0.38 0.36 0.62 0.5 0.45 0.5 0.68 0.67 0.58 0.31 0.59 0.39 0.29 0.5 0.33
0.19 0.82 0.57 0.89 0.37 0.27 0.49 0.6 0.36 0.39 0.31 0.2 0.74 0.59 0.54 0.46 0.27 0.12 0.48 0.38 0.36 0.27 0.45 0.34 0.4 0.8 1.0 0.69
0.28 0.57 0.6 0.89 0.58 0.5 0.46 0.45 0.57 0.49 0.55 0.55 0.85 0.72 0.76 0.66 0.54 0.64 1.0 0.84 0.76 0.68 0.74 0.66 0.46 0.86 0.74 0.84
0.06 0.24 0.21 0.59 0.13 0.1 0.24 0.18 0.21 0.18 0.22 0.11 0.31 0.18 0.19 0.79 0.51 0.2 1.0 0.71 0.9 0.65 0.22 0.7 0.2 0.16 0.13 0.45
0.08 0.2 1.0 0.79 0.37 0.4 0.76 0.13 0.25 0.19 0.25 0.38 0.55 0.3 0.23 0.7 0.6 0.19 0.51 0.61 0.44 0.61 0.2 0.63 0.08 0.24 0.19 0.51
0.07 0.26 1.0 0.65 0.5 0.43 0.64 0.33 0.44 0.41 0.44 0.55 0.8 0.59 0.41 0.68 0.56 0.73 0.96 0.84 0.79 0.77 0.39 0.75 0.3 0.88 0.45 0.48
0.26 0.68 0.74 0.77 0.33 0.27 0.86 0.45 0.74 0.6 0.71 0.27 0.7 0.94 0.86 0.89 0.84 0.42 0.75 1.0 0.97 0.89 0.85 0.89 0.91 0.73 0.92 0.96
0.09 0.32 1.0 0.88 0.55 0.4 0.85 0.43 0.53 0.49 0.56 0.44 0.8 0.71 0.57 0.7 0.68 0.41 0.87 0.86 0.72 0.74 0.68 0.74 0.27 0.72 0.83 0.81
0.27 0.3 1.0 0.5 0.26 0.22 0.77 0.31 0.41 0.31 0.43 0.24 0.75 0.42 0.37 0.51 0.42 0.18 0.41 0.54 0.63 0.54 0.38 0.56 0.23 0.47 0.49 0.39
0.28 0.68 0.9 1.0 0.47 0.38 0.86 0.51 0.52 0.66 0.55 0.27 0.98 0.55 0.54 0.73 0.59 0.87 0.48 0.67 0.69 0.46 0.34 0.5 0.43 0.48 0.66 0.83
0.37 0.67 0.43 0.34 0.03 0.09 0.34 0.29 0.38 0.35 0.44 0.03 0.15 0.47 0.46 0.15 0.08 0.17 0.18 0.28 0.27 0.19 0.23 0.18 0.68 1.0 0.42 0.2
0.85 0.82 0.8 0.42 0.14 0.13 0.84 0.42 0.4 0.37 0.44 0.14 1.0 0.27 0.3 0.14 0.11 0.19 0.45 0.16 0.14 0.08 0.34 0.21 0.31 0.34 0.42 0.3
0.69 0.91 0.88 0.76 0.31 0.27 0.91 0.33 0.46 0.42 0.49 0.39 0.38 0.65 0.68 0.49 0.45 0.16 0.44 0.43 0.3 0.45 0.53 0.41 0.45 1.0 0.61 0.53
0.46 0.9 0.61 0.64 0.39 0.56 0.47 0.37 0.33 0.52 0.4 0.36 0.42 0.69 0.6 0.42 0.57 0.26 0.58 0.62 0.5 0.47 0.39 0.44 1.0 0.68 0.73 0.64
0.4 0.22 0.64 0.39 0.49 0.46 0.5 0.58 0.53 0.4 0.61 0.34 0.45 0.65 0.63 0.86 0.59 0.25 0.4 0.79 1.0 0.67 0.45 0.73 0.68 0.66 0.57 0.22
0.34 0.63 0.72 1.0 0.42 0.3 0.76 0.33 0.42 0.52 0.53 0.59 0.79 0.7 0.71 0.68 0.66 0.49 0.65 0.74 0.71 0.78 0.47 0.81 0.45 0.9 0.61 0.95
0.22 0.46 0.64 0.67 0.7 0.54 0.57 0.49 0.73 0.58 0.75 0.8 0.4 1.0 0.99 0.8 0.59 0.37 0.44 0.78 0.77 0.78 0.5 0.62 0.32 0.71 0.68 0.78
0.08 0.18 1.0 0.61 0.58 0.45 0.86 0.45 0.55 0.47 0.56 0.49 0.83 0.49 0.51 0.7 0.65 0.36 0.65 0.84 0.75 0.74 0.49 0.75 0.44 0.67 0.62 0.5
0.06 0.47 0.93 0.86 0.86 0.6 0.69 0.38 0.52 0.64 0.5 0.78 0.69 1.0 0.85 0.52 0.74 0.39 0.78 0.68 0.53 0.66 0.58 0.61 0.66 0.7 0.88 0.95
0.26 0.36 0.77 0.62 0.29 0.36 0.86 0.65 0.57 0.56 0.57 0.24 0.61 0.77 0.66 0.5 0.32 0.19 0.45 0.51 0.63 0.44 0.52 0.44 1.0 0.37 0.78 0.48
0.08 0.34 0.5 1.0 0.27 0.26 0.62 0.1 0.19 0.16 0.18 0.28 0.73 0.42 0.36 0.59 0.7 0.63 0.57 0.53 0.34 0.48 0.24 0.44 0.16 0.46 0.28 0.77
0.3 0.53 0.64 0.81 0.4 0.49 0.54 0.23 0.27 0.27 0.3 0.42 0.58 0.4 0.39 0.67 0.8 0.3 1.0 0.68 0.53 0.64 0.33 0.73 0.35 0.76 0.31 0.65
0.29 0.14 0.32 1.0 0.42 0.69 0.33 0.5 0.34 0.2 0.34 0.41 0.78 0.31 0.26 0.49 0.39 0.3 0.57 0.33 0.44 0.37 0.14 0.41 0.15 0.23 0.16 0.39
0.04 0.11 0.22 0.95 0.35 0.37 0.34 0.48 0.4 0.57 0.58 0.35 0.41 0.26 0.27 0.84 0.36 0.74 0.79 0.6 1.0 0.62 0.34 0.57 0.21 0.19 0.21 0.75
0.24 0.37 0.58 0.78 0.33 0.43 0.56 0.49 0.38 0.37 0.4 0.36 0.68 0.49 0.5 0.74 0.62 0.22 0.66 0.78 1.0 0.7 0.38 0.66 0.57 0.18 0.55 0.59
0.15 0.19 0.51 0.66 0.59 0.58 0.44 0.42 0.39 0.44 0.38 0.44 0.59 0.55 0.55 0.78 0.58 0.51 1.0 0.69 0.78 0.64 0.51 0.55 0.18 0.81 0.72 0.81
0.23 0.19 0.37 0.88 0.38 0.52 0.67 0.61 0.39 0.46 0.4 0.38 0.47 0.32 0.27 0.64 0.72 1.0 0.55 0.62 0.57 0.61 0.2 0.52 0.14 0.33 0.35 0.5
0.18 0.11 0.69 0.85 0.27 0.24 0.64 0.16 0.52 0.19 0.43 0.33 0.49 0.21 0.24 1.0 0.69 0.24 0.85 0.99 0.74 0.83 0.25 0.92 0.07 0.35 0.3 0.79
0.3 0.64 0.68 0.82 0.4 0.43 0.62 0.3 0.34 0.32 0.31 0.33 0.59 0.67 0.64 0.75 0.64 0.31 0.47 0.82 0.86 0.73 0.51 0.63 0.54 0.69 0.82 1.0
0.15 0.44 0.39 0.9 0.45 0.42 0.5 0.25 0.38 0.39 0.38 0.44 0.66 0.72 0.69 0.8 0.65 0.37 0.56 0.69 0.71 0.63 0.53 0.52 0.32 0.66 0.84 1.0
0.47 0.68 1.0 0.77 0.81 0.91 0.87 0.6 0.54 0.62 0.6 0.68 0.7 0.77 0.7 0.64 0.7 0.48 0.59 0.62 0.59 0.57 0.45 0.65 0.87 0.92 0.87 0.53
0.23 0.55 0.71 1.0 0.37 0.53 0.69 0.35 0.43 0.42 0.45 0.31 0.48 0.47 0.47 0.56 0.41 0.43 0.45 0.46 0.51 0.43 0.27 0.49 0.22 0.47 0.48 0.88
0.31 0.42 0.82 0.71 0.74 1.0 0.75 0.29 0.31 0.38 0.33 0.54 0.65 0.42 0.39 0.73 0.62 0.28 0.39 0.69 0.65 0.61 0.27 0.59 0.37 0.39 0.52 0.66
0.12 0.19 1.0 0.53 0.33 0.33 0.64 0.23 0.29 0.35 0.32 0.3 0.54 0.31 0.29 0.71 0.67 0.23 0.71 0.64 0.65 0.64 0.19 0.64 0.18 0.27 0.26 0.41
0.12 0.09 1.0 0.67 0.49 0.3 0.78 0.22 0.5 0.37 0.63 0.49 0.79 0.35 0.39 0.51 0.65 0.64 0.43 0.68 0.56 0.69 0.58 0.61 0.08 0.73 0.35 0.78
0.88 1.0 0.6 0.58 0.3 0.38 0.56 0.4 0.81 0.49 0.81 0.41 0.34 0.62 0.62 0.29 0.3 0.1 0.39 0.42 0.34 0.38 0.6 0.34 0.53 0.73 0.79 0.39
0.54 0.39 0.6 0.77 0.31 0.23 0.49 0.2 0.4 0.41 0.48 0.32 0.39 0.47 0.43 0.88 0.71 0.35 0.6 0.7 1.0 0.73 0.21 0.71 0.26 0.26 0.35 0.48
0.42 0.29 0.43 0.8 0.65 0.4 0.42 0.35 0.72 0.43 0.69 0.84 0.35 0.59 0.59 1.0 0.9 0.5 0.49 0.76 0.64 0.78 0.64 0.82 0.36 0.41 0.55 0.86
0.58 0.35 0.43 0.8 0.7 0.36 0.63 0.42 0.7 0.56 0.65 0.88 0.52 0.54 0.63 0.9 1.0 0.46 0.51 0.85 0.64 0.75 0.92 0.72 0.4 0.74 0.63 0.79
0.04 0.13 0.69 0.83 0.68 0.5 0.66 0.24 0.66 0.49 0.61 0.84 0.53 0.51 0.47 0.66 0.53 1.0 0.38 0.66 0.65 0.62 0.41 0.55 0.11 0.69 0.51 0.91
0.11 0.36 0.18 0.81 0.45 0.27 0.21 0.24 0.38 0.34 0.4 0.46 0.33 0.41 0.4 0.64 0.72 0.28 0.48 0.68 0.53 0.79 0.39 0.75 0.24 0.45 0.4 1.0
0.22 0.33 0.71 0.81 0.32 0.2 0.79 0.21 0.36 0.34 0.39 0.29 0.7 0.55 0.54 0.79 0.53 0.28 0.7 0.88 0.84 0.72 0.31 0.79 0.25 0.34 0.55 1.0
0.17 0.21 0.28 0.64 0.31 0.27 0.33 0.13 0.24 0.24 0.21 0.31 0.42 0.33 0.32 0.44 0.37 1.0 0.38 0.46 0.42 0.4 0.2 0.31 0.16 0.37 0.33 0.89
0.07 0.22 0.34 0.35 0.18 0.2 0.48 0.43 0.27 0.52 0.29 0.1 0.48 0.25 0.23 0.83 0.55 0.2 0.59 0.62 1.0 0.59 0.18 0.62 0.29 0.3 0.24 0.44
0.18 0.41 1.0 0.49 0.06 0.05 0.79 0.35 0.41 0.36 0.43 0.03 0.58 0.4 0.31 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.05 0.02 0.29 0.06 0.38 0.32 0.47 0.43
0.14 0.3 0.19 0.78 0.06 0.29 0.19 0.31 0.28 0.36 0.17 0.12 0.15 0.49 0.54 0.81 0.92 0.28 0.55 0.8 1.0 0.68 0.4 0.8 0.4 0.25 0.26 0.89
0.18 0.93 1.0 0.74 0.02 0.03 0.62 0.58 0.69 0.41 0.64 0.02 0.39 0.51 0.51 0.02 0.01 0.02 0.07 0.03 0.03 0.02 0.36 0.05 0.34 0.37 0.57 0.44
0.06 0.11 1.0 0.65 0.08 0.14 0.8 0.46 0.48 0.35 0.53 0.09 0.5 0.34 0.31 0.36 0.22 0.31 0.64 0.28 0.25 0.2 0.32 0.34 0.15 0.65 0.42 0.74
0.2 0.35 0.51 0.44 0.29 0.32 0.6 0.53 0.32 0.56 0.37 0.28 0.41 0.44 0.4 0.85 0.5 0.49 0.44 0.68 1.0 0.58 0.46 0.6 0.42 0.53 0.45 0.51
0.08 0.19 1.0 0.53 0.04 0.02 0.84 0.37 0.39 0.44 0.41 0.03 0.74 0.38 0.31 0.03 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.32 0.03 0.2 0.24 0.53 0.35
0.12 0.42 1.0 0.42 0.03 0.01 0.72 0.56 0.55 0.41 0.6 0.02 0.54 0.36 0.33 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.03 0.23 0.02 0.3 0.55 0.46 0.35
0.27 0.29 0.76 0.87 0.26 0.18 0.63 0.38 0.6 0.51 0.59 0.37 0.34 0.59 0.56 0.6 0.54 0.2 0.37 0.65 0.57 0.68 0.41 0.53 0.26 0.43 0.56 1.0
0.02 0.38 1.0 0.38 0.04 0.04 0.59 0.11 0.18 0.1 0.12 0.02 0.59 0.54 0.66 0.0 0.0 0.02 0.2 0.04 0.06 0.01 0.34 0.07 0.18 0.57 0.83 0.31
0.12 0.23 0.19 0.6 0.26 0.28 0.18 0.47 0.53 0.36 0.62 0.26 0.21 0.23 0.29 0.88 0.54 0.25 0.75 0.89 1.0 0.74 0.41 0.7 0.08 0.25 0.22 0.5
0.01 0.02 1.0 0.41 0.45 0.25 0.63 0.16 0.28 0.23 0.36 0.39 0.72 0.22 0.2 0.45 0.39 0.3 0.37 0.53 0.44 0.51 0.24 0.44 0.04 0.41 0.32 0.26
0.0 0.06 1.0 0.3 0.16 0.11 0.46 0.17 0.16 0.36 0.14 0.17 0.56 0.18 0.16 0.67 0.81 0.11 0.77 0.58 0.96 0.46 0.09 0.48 0.04 0.24 0.14 0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)