Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.1 0.04 0.02 0.01 0.03 0.02 0.36 0.17 1.0 0.18 0.02 0.0 0.11 0.11 0.01 0.02 0.11 0.01 0.01 0.04 0.03 0.01 0.0 0.05 0.01 0.06 0.09
0.0 0.02 0.03 0.01 0.04 0.04 0.16 0.18 0.12 1.0 0.18 0.05 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.58 0.02 0.02 0.01 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02
0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.04 0.01 0.24 0.01 0.01 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.01 0.2 0.0 0.01 0.0 0.05 0.85 0.44 1.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.13 0.0 0.0 0.12 0.01 0.01 0.04 0.01 0.22 0.02 0.01 0.0 0.25 0.0
0.03 0.12 0.26 0.15 0.1 0.08 0.24 0.49 0.25 1.0 0.16 0.07 0.2 0.17 0.17 0.18 0.14 0.15 0.13 0.21 0.28 0.18 0.16 0.2 0.08 0.18 0.18 0.17
0.07 0.06 0.21 0.09 0.04 0.02 0.07 0.26 0.34 1.0 0.3 0.03 0.06 0.02 0.03 0.14 0.05 0.22 0.13 0.25 0.14 0.1 0.08 0.16 0.11 0.05 0.07 0.19
0.07 0.05 0.17 0.02 0.03 0.01 0.04 0.18 0.14 1.0 0.18 0.02 0.1 0.03 0.04 0.25 0.18 0.15 0.2 0.18 0.26 0.21 0.02 0.22 0.06 0.28 0.02 0.03
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.47 0.27 1.0 0.26 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.16 0.01 0.02
0.0 0.0 0.01 0.01 0.17 0.06 0.04 0.02 0.01 1.0 0.05 0.14 0.14 0.01 0.0 0.02 0.02 0.07 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.04 0.02 0.04 0.01 0.01 0.1 0.06 0.2 1.0 0.04 0.03 0.02 0.07 0.05 0.02 0.0 0.08 0.01 0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.12 0.01
0.04 0.07 0.18 0.04 0.04 0.04 0.12 0.79 0.46 1.0 0.49 0.08 0.04 0.14 0.16 0.08 0.05 0.12 0.13 0.12 0.14 0.1 0.17 0.16 0.5 0.99 0.16 0.14
0.03 0.07 0.12 0.02 0.02 0.04 0.13 0.2 0.25 1.0 0.33 0.1 0.17 0.09 0.07 0.0 0.05 0.4 0.0 0.05 0.0 0.05 0.02 0.0 0.37 0.0 0.05 0.06
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.16 0.07 0.0 1.0 0.11 0.18 0.07 0.02 0.07 0.09 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0
0.01 0.01 0.1 0.02 0.04 0.01 0.05 0.42 0.51 1.0 0.12 0.01 0.02 0.13 0.14 0.04 0.03 0.05 0.02 0.12 0.06 0.02 0.05 0.04 0.01 0.06 0.19 0.0
0.0 0.0 0.12 0.07 0.1 0.03 0.04 0.2 0.42 0.7 0.51 0.13 0.08 0.04 0.05 0.1 0.13 1.0 0.12 0.12 0.12 0.1 0.08 0.1 0.01 0.02 0.03 0.07
0.55 0.36 0.34 0.34 0.19 0.18 0.23 0.56 0.46 0.51 0.52 0.23 0.15 0.58 0.54 0.25 0.14 0.11 0.54 0.29 0.34 0.28 0.62 0.26 0.64 1.0 0.48 0.3
0.0 0.0 0.08 0.01 0.03 0.04 0.13 0.22 0.07 1.0 0.24 0.03 0.03 0.01 0.03 0.01 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.15 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.03 0.05 0.08 0.03 0.03 0.02 0.32 0.4 1.0 0.39 0.03 0.07 0.03 0.05 0.09 0.2 0.68 0.15 0.15 0.12 0.13 0.1 0.1 0.06 0.01 0.04 0.18
0.02 0.05 0.08 0.05 0.06 0.06 0.14 0.3 0.33 1.0 0.11 0.06 0.11 0.13 0.11 0.05 0.04 0.05 0.03 0.07 0.06 0.05 0.07 0.05 0.24 0.09 0.15 0.06
0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.04 0.0 0.28 0.06 1.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06
0.03 0.12 0.02 0.04 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.85 0.01 0.0 0.0 0.03 1.0 0.02 0.05 0.03 0.04 0.0 0.04 0.02 0.17 0.0 0.04
0.01 0.0 0.9 0.0 0.01 0.01 0.11 0.53 0.06 1.0 0.02 0.02 0.02 0.16 0.37 0.02 0.1 0.27 0.07 0.06 0.02 0.06 0.43 0.03 0.08 0.0 0.08 0.02
0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.88 0.04 0.01 0.86 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.03 1.0 0.14 0.02 0.07 0.01 0.01 0.04 0.0 0.4 0.0 0.13 0.08 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0
0.02 0.06 0.21 0.1 0.07 0.07 0.56 0.27 0.2 1.0 0.15 0.08 0.37 0.19 0.17 0.03 0.05 0.49 0.04 0.07 0.1 0.07 0.09 0.13 0.17 0.11 0.15 0.04
0.01 0.05 0.14 0.03 0.08 0.09 0.24 0.68 0.29 1.0 0.39 0.07 0.13 0.06 0.07 0.09 0.06 0.12 0.04 0.08 0.09 0.08 0.22 0.08 0.02 0.04 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.24 0.38 0.3 0.09 0.08 0.2 1.0 0.3 0.24 0.21 0.0 0.01 0.01 0.06 0.91 0.15 0.11 0.05 0.07 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.09
0.0 0.01 0.12 0.01 0.03 0.01 0.08 0.07 0.14 1.0 0.19 0.02 0.3 0.01 0.0 0.0 0.01 0.52 0.01 0.06 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 1.0 0.14 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.04 0.03 1.0 0.07 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.59 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.35 0.0 0.13 0.0 0.3 0.0 0.1 0.0
0.0 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.1 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.19 0.01 0.0 0.05 0.03 0.13 0.02 0.05 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.08
0.02 0.05 0.12 0.01 0.16 0.17 0.32 0.06 0.06 1.0 0.1 0.11 0.56 0.02 0.03 0.04 0.03 0.46 0.01 0.08 0.14 0.08 0.03 0.08 0.01 0.02 0.04 0.09
0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.0 1.0 0.0 0.01 0.07 0.03 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 1.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.17 0.07 0.01 0.04 0.04 1.0 0.07 0.29 0.49 0.01 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.18 0.06 0.04 0.01 0.32 0.39 0.32 1.0 0.32 0.06 0.12 0.03 0.03 0.1 0.02 0.33 0.09 0.17 0.13 0.11 0.07 0.19 0.0 0.01 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.03 0.09 0.06 1.0 0.2 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.04 0.04 0.03 0.13 1.0 0.11 0.12 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.03 0.01 0.25 0.19 0.22 0.03 0.02 1.0 0.03 0.07 0.14 0.03 0.02 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.18 0.02 0.0
0.07 0.15 0.29 0.18 0.37 0.28 0.23 0.14 0.07 0.08 0.07 0.08 0.55 0.11 0.11 0.13 0.11 1.0 0.07 0.13 0.13 0.12 0.09 0.1 0.06 0.26 0.28 0.09
0.03 0.04 0.23 0.1 0.17 0.07 0.23 0.32 0.66 0.99 0.73 0.14 0.14 0.12 0.13 0.26 0.19 1.0 0.57 0.52 0.54 0.31 0.22 0.37 0.03 0.1 0.11 0.14
0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 1.0 0.03 0.0 0.07 0.01 0.0 0.03 0.05 0.55 0.04 0.07 0.05 0.06 0.03 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0
0.06 0.0 0.17 0.04 0.07 0.03 0.2 0.17 0.2 0.79 0.56 0.19 0.3 0.14 0.16 0.25 0.36 1.0 0.37 0.45 0.14 0.37 0.17 0.25 0.18 0.08 0.08 0.32
0.02 0.16 0.23 0.13 0.19 0.21 0.36 0.44 0.25 1.0 0.22 0.16 0.33 0.16 0.16 0.22 0.16 0.2 0.13 0.29 0.15 0.19 0.2 0.21 0.12 0.16 0.22 0.1
0.01 0.05 0.35 0.01 0.01 0.01 0.08 0.54 0.25 1.0 0.17 0.04 0.0 0.05 0.05 0.08 0.06 0.03 0.11 0.1 0.09 0.04 0.15 0.1 0.14 0.02 0.06 0.01
0.0 0.02 0.58 0.04 0.02 0.02 0.37 0.91 0.21 1.0 0.18 0.03 0.04 0.11 0.1 0.09 0.07 0.08 0.18 0.16 0.2 0.11 0.36 0.18 0.06 0.01 0.18 0.07
0.0 0.01 0.05 0.04 0.02 0.03 0.02 0.53 0.06 1.0 0.04 0.03 0.01 0.02 0.01 0.14 0.13 0.04 0.06 0.17 0.14 0.15 0.02 0.17 0.01 0.01 0.02 0.1
0.0 0.0 0.48 0.03 0.0 0.01 0.06 0.12 0.3 1.0 0.17 0.0 0.0 0.03 0.04 0.03 0.01 0.01 0.07 0.3 0.02 0.04 0.2 0.05 0.01 0.0 0.26 0.03
0.2 0.18 0.09 0.3 0.24 0.21 0.18 0.16 0.31 0.57 0.36 0.27 0.26 0.12 0.14 0.15 0.17 1.0 0.31 0.17 0.15 0.16 0.18 0.14 0.27 0.27 0.09 0.4
0.21 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.07 0.06 0.07 1.0 0.12 0.04 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.14 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.03 0.08 0.35 0.28 0.02 0.35 0.27 1.0 0.31 0.42 0.03 0.01 0.03 0.05 0.12 0.43 0.07 0.03 0.03 0.05 0.07 0.04 0.0 0.01 0.02 0.15
0.01 0.02 0.11 0.2 0.23 0.19 0.11 0.36 0.41 1.0 0.23 0.22 0.06 0.04 0.07 0.07 0.1 0.86 0.22 0.14 0.06 0.1 0.18 0.1 0.01 0.03 0.05 0.15
0.0 0.03 0.11 0.02 0.07 0.04 0.21 0.25 0.12 1.0 0.14 0.05 0.43 0.22 0.27 0.09 0.06 0.18 0.06 0.13 0.1 0.1 0.1 0.08 0.01 0.02 0.08 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.2 1.0 0.08 0.01 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.0 0.02 0.04 0.06 0.02 0.01 0.11 0.03 1.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.07 0.02 0.03 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.39 0.06 0.01 0.01 0.0 0.05 0.04 0.07 1.0 0.13 0.01 0.06 0.01 0.01 0.03 0.02 0.06 0.03 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01
0.12 0.11 0.1 0.12 0.08 0.07 0.17 1.0 0.06 0.98 0.03 0.08 0.02 0.07 0.06 0.15 0.19 0.27 0.14 0.15 0.16 0.11 0.09 0.12 0.08 0.13 0.1 0.13
0.05 0.33 0.26 0.13 0.05 0.04 0.13 0.37 0.28 0.25 0.31 0.06 0.06 0.19 0.27 0.1 0.06 0.08 0.1 0.14 0.18 0.12 0.6 0.12 0.44 1.0 0.14 0.09
0.02 0.04 0.18 0.06 0.35 0.59 0.07 0.91 0.11 1.0 0.07 0.06 0.06 0.05 0.05 0.07 0.23 0.12 0.18 0.07 0.09 0.08 0.12 0.06 0.03 0.06 0.07 0.05
0.0 0.01 0.13 0.01 0.06 0.03 0.25 0.04 0.03 1.0 0.07 0.1 0.33 0.0 0.0 0.03 0.02 0.47 0.03 0.1 0.05 0.04 0.01 0.07 0.0 0.01 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.1 1.0 0.03 0.0 0.24 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.04 0.02 0.02 0.02 0.43 0.08 1.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.02 0.06 0.13 0.04 0.03 0.03 0.06 0.04 0.11 0.04 0.0 0.01 0.04 0.03
0.01 0.03 0.08 0.15 0.02 0.01 0.06 0.6 0.7 1.0 0.07 0.01 0.02 0.08 0.15 0.04 0.04 0.29 0.03 0.06 0.08 0.05 0.47 0.07 0.14 0.65 0.13 0.18
0.03 0.15 0.37 0.16 0.16 0.23 0.49 0.41 0.2 1.0 0.24 0.17 0.35 0.21 0.19 0.2 0.18 0.47 0.28 0.24 0.25 0.25 0.2 0.24 0.11 0.13 0.18 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.06 0.03 1.0 0.13 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.05 0.23 0.04 0.06 0.09 0.07 0.0 0.0 0.02 0.08
0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.01 0.02 0.05 0.1 1.0 0.3 0.11 0.01 0.01 0.01 0.06 0.04 0.04 0.13 0.49 0.07 0.13 0.14 0.14 0.0 0.0 0.05 0.14
0.04 0.14 0.42 0.12 0.09 0.14 0.52 0.76 0.25 1.0 0.2 0.08 0.21 0.12 0.12 0.07 0.1 0.12 0.16 0.14 0.18 0.1 0.25 0.15 0.07 0.08 0.13 0.17
0.06 0.14 0.32 0.11 0.08 0.14 0.33 0.85 0.25 1.0 0.24 0.06 0.1 0.13 0.11 0.12 0.13 0.12 0.11 0.22 0.22 0.16 0.19 0.2 0.07 0.07 0.1 0.15
0.0 0.01 0.16 0.06 0.17 0.15 0.13 0.31 0.45 1.0 0.15 0.19 0.07 0.04 0.06 0.06 0.06 0.09 0.07 0.11 0.1 0.07 0.22 0.07 0.0 0.01 0.07 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)