Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.11 0.41 0.59 0.42 0.22 0.38 0.86 0.29 0.22 0.38 0.23 0.17 0.56 0.77 0.65 0.47 0.33 0.25 0.74 0.49 0.7 0.44 0.37 0.44 1.0 0.27 0.96 0.62
0.0 1.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.14 0.0 0.08 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.7 0.0 0.0 0.13 0.0 0.17 0.45
0.34 0.2 0.49 0.4 0.43 0.56 0.68 0.43 0.7 0.54 0.74 0.44 0.46 0.48 0.48 0.45 0.48 1.0 0.26 0.58 0.43 0.56 0.4 0.54 0.3 0.54 0.6 0.51
0.06 0.17 0.31 0.37 0.49 0.56 0.31 0.44 0.41 0.59 0.39 0.54 0.24 0.28 0.32 0.56 0.41 0.37 0.32 0.5 0.56 0.49 0.42 0.48 0.21 0.23 0.22 1.0
0.14 0.36 0.55 0.5 0.63 0.8 0.83 0.64 0.96 0.76 0.92 0.62 0.74 0.66 0.72 0.91 0.89 0.63 0.6 0.96 0.59 1.0 0.78 0.9 0.3 0.59 0.59 1.0
0.24 0.35 0.51 0.39 0.11 0.06 1.0 0.05 0.2 0.19 0.17 0.16 0.38 0.23 0.21 0.28 0.22 0.07 0.19 0.43 0.24 0.26 0.15 0.3 0.17 0.39 0.3 0.52
0.01 0.01 0.34 0.1 0.01 0.01 0.31 0.24 0.1 0.63 0.09 0.04 0.2 0.39 0.26 0.11 0.2 0.07 0.08 0.21 0.17 0.15 0.34 0.12 0.0 0.0 1.0 0.13
0.08 0.14 0.43 0.36 0.33 0.31 0.73 0.16 0.36 0.41 0.32 0.36 0.45 0.13 0.15 0.27 0.2 0.29 0.22 0.4 0.35 0.44 0.35 0.35 0.11 1.0 0.15 0.87
0.07 0.26 0.71 0.49 0.61 0.66 0.95 0.51 0.58 0.56 0.74 0.66 1.0 0.62 0.5 0.63 0.48 0.62 0.32 0.6 0.6 0.63 0.75 0.5 0.17 0.5 0.85 0.55
0.02 0.08 0.32 0.32 0.71 0.46 0.89 0.19 0.2 0.34 0.25 0.51 1.0 0.39 0.37 0.34 0.19 0.46 0.2 0.38 0.24 0.25 0.38 0.24 0.03 0.19 0.38 0.27
0.06 0.17 0.46 0.36 0.57 0.84 1.0 0.41 0.58 0.8 0.76 0.6 0.64 0.33 0.25 0.5 0.84 0.39 0.61 0.9 0.91 0.97 0.44 0.67 0.11 0.31 0.67 0.61
0.29 0.13 0.47 0.26 0.2 0.19 0.72 0.42 0.37 0.53 0.34 0.18 0.42 1.0 0.81 0.26 0.18 0.29 0.15 0.36 0.28 0.31 0.16 0.28 0.42 0.08 0.71 0.14
0.16 0.22 0.8 0.54 0.59 0.84 1.0 0.31 0.7 0.51 0.73 0.62 0.53 0.3 0.32 0.54 0.75 0.45 0.32 0.61 0.49 0.66 0.41 0.57 0.1 1.0 0.46 0.69
0.03 1.0 0.09 0.21 0.15 0.12 0.62 0.08 0.3 0.25 0.16 0.24 0.68 0.17 0.39 0.06 0.09 0.24 0.01 0.09 0.0 0.04 0.23 0.04 0.09 0.27 0.15 0.32
0.22 0.55 0.35 0.39 0.56 0.47 0.49 0.42 0.7 0.41 0.82 0.77 0.4 0.52 0.61 0.89 0.71 0.52 0.41 0.86 1.0 0.82 0.93 0.95 0.51 0.61 0.43 0.52
0.07 0.2 0.49 0.37 0.69 0.76 0.93 0.18 0.28 0.27 0.28 0.52 0.71 0.41 0.46 0.42 0.57 0.44 0.12 0.31 0.19 0.4 0.56 0.25 0.1 0.18 0.46 1.0
0.12 0.02 0.12 0.31 0.26 0.15 0.17 0.5 0.4 1.0 0.51 0.29 0.34 0.09 0.1 0.56 0.61 0.1 0.23 0.49 0.62 0.56 0.1 0.52 0.03 0.01 0.09 0.57
0.3 0.01 0.28 0.21 0.17 0.0 0.54 0.42 0.47 0.35 0.53 0.12 1.0 0.04 0.11 0.22 0.26 0.29 0.35 0.43 0.39 0.16 0.39 0.29 0.03 0.01 0.12 0.34
0.04 0.09 0.42 0.16 0.12 0.18 0.52 0.33 0.23 0.48 0.25 0.09 0.44 0.69 0.6 0.49 0.45 0.37 0.45 0.5 0.6 0.37 0.39 0.41 0.3 0.04 1.0 0.34
0.18 0.37 0.72 0.35 0.55 0.68 0.95 0.29 0.36 0.37 0.38 0.3 0.77 0.3 0.27 0.4 0.35 0.33 0.2 0.45 0.34 0.33 0.32 0.32 0.22 0.32 1.0 0.43
0.09 0.21 0.53 0.39 0.28 0.5 0.69 0.36 0.22 0.63 0.23 0.23 0.75 0.43 0.43 0.35 0.45 0.35 0.21 0.37 0.45 0.41 0.32 0.36 0.71 0.41 1.0 0.64
0.21 0.23 0.34 0.37 0.43 0.54 0.37 0.42 0.45 0.48 0.44 0.32 0.45 1.0 0.83 0.19 0.1 0.28 0.25 0.29 0.21 0.23 0.4 0.19 0.19 0.22 0.78 0.5
0.11 0.05 0.52 0.16 0.17 0.31 0.63 0.14 0.04 0.49 0.03 0.06 0.27 0.85 0.96 0.71 0.72 0.08 0.64 0.61 0.94 0.53 0.29 0.67 0.64 0.26 1.0 0.59
0.15 1.0 0.49 0.6 0.29 0.41 0.81 0.45 0.52 0.57 0.46 0.29 0.57 0.56 0.58 0.7 0.46 0.46 0.43 0.62 0.83 0.5 0.44 0.56 0.64 0.5 0.48 0.94
0.12 0.2 0.47 0.35 0.41 1.0 0.86 0.54 0.3 0.64 0.26 0.29 0.49 0.69 0.78 0.63 0.74 0.42 0.24 0.72 0.53 0.7 0.59 0.62 0.56 0.24 0.61 0.92
0.06 0.06 0.4 0.12 0.13 0.14 0.62 0.14 0.04 0.39 0.05 0.08 0.5 0.21 0.19 0.15 0.2 0.12 0.23 0.22 0.21 0.16 0.14 0.16 0.04 0.01 1.0 0.06
0.49 0.61 0.73 0.66 0.67 0.55 0.87 0.54 0.65 1.0 0.79 0.64 0.79 0.77 0.78 0.73 0.65 1.0 0.63 0.81 0.7 0.71 0.72 0.63 0.24 0.97 0.65 0.71
0.34 0.72 0.64 0.36 0.41 0.63 0.59 0.36 0.63 0.43 0.88 0.51 0.56 1.0 0.89 0.21 0.07 0.47 0.25 0.28 0.27 0.65 0.26 0.33 0.24 0.41 0.76 0.27
0.03 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.5 0.01
0.02 0.03 0.38 0.14 0.16 0.17 0.42 0.45 0.21 0.66 0.23 0.1 0.18 0.48 0.35 0.14 0.2 0.13 0.08 0.28 0.17 0.27 0.42 0.18 0.12 0.01 1.0 0.17
0.03 0.22 0.09 0.32 0.18 0.25 0.22 0.26 0.28 0.22 0.34 0.15 0.29 0.21 0.23 0.78 0.75 0.21 0.15 0.53 0.59 0.57 1.0 0.5 0.11 0.23 0.17 0.09
0.05 0.19 0.53 0.52 0.51 0.73 1.0 0.41 0.69 0.53 0.72 0.64 0.96 0.4 0.38 0.64 0.61 0.41 0.4 0.78 0.72 0.89 0.52 0.85 0.12 0.65 0.39 0.86
0.07 0.27 0.5 0.23 0.09 0.16 0.94 0.43 0.33 0.64 0.31 0.1 0.36 0.72 0.65 0.54 0.62 0.53 1.0 0.82 0.54 0.47 0.55 0.78 0.17 0.55 1.0 0.35
0.01 0.12 0.19 0.22 0.28 0.34 1.0 0.06 0.12 0.14 0.16 0.32 0.31 0.74 0.59 0.47 0.29 0.3 0.49 0.42 0.26 0.39 0.08 0.37 0.14 0.18 0.76 0.37
0.24 0.42 0.18 0.12 0.17 0.12 0.27 0.3 0.75 0.34 0.98 0.12 0.25 0.29 0.34 0.81 0.59 0.25 0.43 0.92 0.89 0.61 1.0 0.55 0.27 0.75 0.3 0.39
0.03 0.06 0.19 0.23 0.24 0.33 0.66 0.25 0.11 0.28 0.09 0.12 0.45 0.22 0.24 0.4 0.43 0.1 0.16 0.3 0.25 0.28 0.54 0.25 0.23 0.14 1.0 0.29
0.04 0.1 0.02 0.12 0.09 0.06 1.0 0.05 0.07 0.09 0.07 0.07 0.05 0.43 0.42 0.1 0.06 0.13 0.09 0.06 0.06 0.05 0.07 0.08 0.16 0.49 0.29 0.28
0.23 0.24 0.18 0.35 0.08 0.11 0.26 0.18 0.21 0.17 0.2 0.11 0.26 0.21 0.26 0.19 0.15 1.0 0.28 0.31 0.37 0.24 0.2 0.23 0.21 0.54 0.17 0.24
0.02 0.05 0.32 0.26 0.19 0.22 0.84 0.29 0.26 0.5 0.16 0.05 0.49 0.44 0.32 0.25 0.3 0.17 0.29 0.3 0.43 0.32 0.15 0.22 0.06 0.01 1.0 0.63
0.48 1.0 0.17 0.1 0.0 0.09 0.2 0.23 0.05 0.14 0.09 0.0 0.13 0.25 0.47 0.0 0.0 0.0 0.41 0.29 0.0 0.06 0.21 0.05 0.0 0.15 0.45 0.0
0.48 0.6 0.76 0.6 0.48 0.57 0.98 0.67 0.82 0.63 0.82 0.47 0.8 0.71 0.76 0.62 0.51 0.68 0.51 0.7 0.6 0.66 1.0 0.62 0.28 0.71 0.78 0.7
0.05 0.05 0.37 0.31 0.32 0.67 0.41 0.26 0.32 0.26 0.29 0.23 0.29 0.95 0.64 0.28 0.23 0.25 0.27 0.38 0.24 0.29 0.28 0.33 0.29 0.09 1.0 0.37
0.04 0.14 0.45 0.33 0.19 0.35 0.8 0.18 0.3 0.39 0.22 0.2 0.38 0.53 0.48 0.18 0.18 0.19 0.11 0.42 0.26 0.28 0.37 0.24 0.16 0.78 1.0 0.72
0.12 0.29 0.16 0.43 0.47 0.34 0.22 0.39 0.61 0.31 0.81 0.6 0.21 0.47 0.5 0.65 0.69 0.38 0.25 0.64 0.51 0.72 1.0 0.67 0.15 0.72 0.36 0.52
0.71 0.45 0.75 0.53 0.48 0.52 0.66 0.6 0.66 0.62 0.65 0.45 0.52 0.63 0.63 0.85 0.69 0.51 0.44 1.0 0.92 0.94 1.0 0.86 0.51 0.5 0.65 0.71
0.09 1.0 0.07 0.16 0.03 0.06 0.2 0.03 0.21 0.03 0.35 0.0 0.12 0.28 0.22 0.0 0.04 0.07 0.33 0.11 0.0 0.07 0.14 0.03 0.11 0.12 0.04 0.09
0.23 0.86 1.0 0.57 0.57 0.61 0.67 0.59 0.75 0.74 0.86 0.64 0.35 0.5 0.47 0.43 0.39 0.76 0.7 0.66 0.56 0.82 0.31 0.74 0.37 0.52 0.49 0.7
0.06 0.15 0.24 0.46 0.14 0.09 0.48 0.22 0.48 0.5 0.5 0.28 0.64 0.14 0.12 0.32 0.09 0.28 0.21 0.38 0.31 0.43 0.12 0.43 0.04 1.0 0.12 0.57
0.05 0.13 0.29 0.66 0.23 0.16 0.4 0.51 0.62 0.62 0.75 0.26 0.47 0.1 0.14 0.44 0.65 0.65 0.18 0.61 0.49 0.53 0.22 0.56 0.11 1.0 0.15 0.31
0.02 0.04 0.63 0.24 0.28 0.27 0.68 0.26 0.55 0.61 0.46 0.19 0.64 0.13 0.09 0.49 0.58 0.53 0.5 0.38 0.49 0.55 0.44 0.49 0.03 0.17 0.24 1.0
0.19 0.33 0.41 0.18 0.15 0.17 0.33 0.42 0.54 0.43 0.91 0.08 0.2 0.2 0.34 0.99 0.71 0.03 0.42 0.95 1.0 0.71 0.94 0.87 0.2 0.69 0.29 0.55
0.37 0.28 0.56 0.39 0.42 0.38 0.63 0.44 0.77 0.38 1.0 0.66 0.47 0.42 0.41 0.54 0.79 0.4 0.32 0.58 0.48 0.58 0.53 0.53 0.2 0.18 0.44 0.51
0.05 0.13 0.58 0.36 0.71 0.51 0.57 0.59 0.58 0.56 0.79 0.64 0.46 0.33 0.42 0.44 0.62 0.47 0.36 0.5 0.45 0.56 1.0 0.53 0.25 0.29 0.31 0.42
0.04 0.09 0.5 0.38 0.2 0.14 0.6 0.66 0.37 0.33 0.48 0.11 1.0 0.15 0.13 0.31 0.36 0.25 0.18 0.42 0.17 0.47 0.37 0.36 0.07 0.13 0.19 0.41
0.25 0.57 0.32 0.5 0.88 0.75 0.49 0.48 0.89 0.6 0.93 1.0 0.47 0.6 0.69 0.76 0.68 0.48 0.38 0.72 0.71 0.68 1.0 0.76 0.21 0.81 0.6 0.6

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)