Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.09 0.32 0.13 0.13 0.26 0.41 0.19 0.23 0.33 0.24 0.3 0.4 0.16 0.21 0.23 0.84 0.69 0.61 0.61 0.95 0.87 1.0 0.18 0.92 0.51 0.37 0.25 0.23
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 1.0 0.0 0.42 0.59 0.17 0.48 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.21
0.01 0.01 0.02 0.08 0.04 0.05 0.28 0.06 0.08 1.0 0.17 0.02 0.5 0.01 0.01 0.42 0.55 0.05 0.26 0.26 0.47 0.25 0.01 0.26 0.0 0.05 0.01 0.05
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.0 0.68 0.38 0.36 0.66 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.15
0.05 0.24 0.15 0.17 0.04 0.13 0.13 0.03 0.07 0.18 0.11 0.03 0.01 0.07 0.07 0.92 0.8 0.14 0.76 0.91 0.51 1.0 0.07 0.95 0.12 0.15 0.08 0.44
0.25 0.3 0.48 0.22 0.11 0.1 0.39 0.1 0.03 0.05 0.04 0.11 0.4 0.35 0.37 0.63 0.76 1.0 0.33 0.68 0.58 0.68 0.8 0.69 0.14 0.54 0.33 0.31
0.04 0.1 0.38 0.22 0.14 0.08 0.35 0.18 0.28 0.22 0.19 0.11 0.22 0.1 0.15 1.0 0.75 0.44 0.84 0.99 0.81 0.72 0.55 0.8 0.04 0.56 0.13 0.36
0.04 0.19 0.11 0.12 0.0 0.0 0.07 0.09 0.04 0.15 0.09 0.09 0.09 0.05 0.05 0.23 0.11 0.0 0.61 1.0 0.36 0.67 0.17 0.49 0.0 0.0 0.22 0.86
0.25 0.5 0.82 0.31 0.35 0.31 0.62 0.66 0.77 0.87 0.83 0.36 0.49 0.44 0.35 0.89 0.52 0.4 0.59 0.99 1.0 0.89 0.52 1.0 0.6 0.67 0.55 0.51
0.11 1.0 0.66 0.15 0.25 0.33 0.62 0.64 0.63 0.33 0.6 0.23 0.59 0.46 0.61 0.49 0.39 0.49 0.45 0.47 0.51 0.72 0.56 0.72 0.45 0.74 0.34 0.35
0.05 0.75 0.09 0.05 0.05 0.06 0.1 0.12 0.02 0.28 0.04 0.05 0.06 0.05 0.06 0.85 0.95 0.3 0.44 0.49 1.0 0.66 0.09 0.67 0.14 0.26 0.04 0.29
0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 1.0 0.0 0.56 0.62 0.4 0.68 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.37
0.02 0.02 0.14 0.17 0.12 0.23 0.17 0.19 0.31 0.18 0.29 0.16 0.12 0.06 0.06 0.73 0.95 1.0 0.36 0.7 0.45 0.69 0.16 0.57 0.04 0.02 0.07 0.54
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 1.0 0.0 0.25 0.43 0.23 0.44 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.18
0.02 0.01 0.56 0.23 0.2 0.18 0.48 0.25 0.12 0.15 0.2 0.17 0.46 0.05 0.06 0.85 0.74 1.0 0.57 0.8 0.91 0.74 0.33 0.71 0.06 0.05 0.07 0.33
0.04 0.11 0.12 0.19 0.07 0.09 0.23 0.27 0.24 0.24 0.33 0.05 0.21 0.09 0.09 0.93 0.78 0.81 0.92 0.84 0.8 0.93 0.1 1.0 0.09 0.18 0.11 0.26
0.0 0.0 0.03 0.13 0.15 0.04 0.18 0.03 0.01 0.17 0.02 0.2 0.03 0.01 0.01 0.79 1.0 0.2 0.58 0.46 0.49 0.49 0.02 0.51 0.0 0.0 0.02 0.1
0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.7 0.0 0.09 0.41 0.17 0.83 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.27
0.03 0.37 0.45 0.17 0.22 0.33 0.5 0.34 0.15 0.48 0.15 0.12 0.36 0.27 0.24 0.85 0.58 0.38 0.58 0.96 1.0 0.74 0.32 0.83 0.13 0.09 0.43 0.54
0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.66 0.0 0.0 0.12 0.33 0.33 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.1
0.0 0.04 0.12 0.27 0.21 0.17 0.09 0.15 0.33 0.46 0.45 0.41 0.06 0.03 0.04 0.83 0.88 0.49 0.58 0.99 0.77 1.0 0.13 0.89 0.03 0.02 0.05 0.88
0.13 0.94 0.18 0.34 0.2 0.25 0.26 0.21 0.23 0.22 0.24 0.12 0.24 1.0 0.88 0.17 0.1 0.09 0.24 0.15 0.07 0.12 0.14 0.1 0.09 0.09 0.18 0.2
0.2 0.36 0.8 0.25 0.24 0.22 0.5 0.51 0.4 0.27 0.54 0.38 0.43 0.28 0.19 0.66 0.54 0.5 0.82 0.66 0.66 0.87 0.33 1.0 0.09 0.03 0.32 0.22
0.22 0.86 0.63 0.17 0.36 0.43 0.32 0.64 0.59 0.44 0.6 0.31 0.55 0.42 0.44 0.76 0.66 0.5 0.55 1.0 0.57 0.89 0.67 0.84 0.24 0.34 0.57 0.39
0.06 0.41 0.4 0.31 0.47 0.42 0.6 0.28 0.44 0.32 0.5 0.57 0.32 0.4 0.4 0.9 0.52 0.43 0.56 0.9 0.69 1.0 0.47 0.76 0.36 0.33 0.37 0.35
0.05 0.41 0.29 0.24 0.35 0.33 0.43 0.16 0.41 0.27 0.33 0.52 0.49 0.51 0.4 0.84 0.8 0.27 0.52 1.0 0.98 0.8 0.4 0.79 0.06 0.32 0.54 0.39
0.0 0.11 0.34 0.14 0.23 0.16 0.37 0.25 0.38 0.12 0.35 0.21 0.04 0.85 0.74 0.99 0.51 0.19 0.44 0.86 0.4 0.7 1.0 0.6 0.01 0.01 0.31 0.1
0.03 1.0 0.37 0.45 0.45 0.18 0.46 0.45 0.57 0.63 0.66 0.27 0.7 0.58 0.5 0.6 0.34 0.69 0.59 0.65 0.6 0.54 0.3 0.48 0.2 0.41 0.59 0.27
0.11 0.1 0.31 0.25 0.42 0.32 0.28 0.62 0.44 0.28 0.31 0.35 0.15 0.33 0.32 1.0 0.39 0.27 0.4 0.42 0.6 0.43 0.43 0.45 0.45 0.17 0.77 0.15
0.07 0.01 0.76 0.27 0.69 0.43 0.55 0.24 0.22 0.17 0.22 0.45 0.55 0.08 0.1 1.0 0.44 0.89 0.38 0.65 0.69 0.81 0.29 0.77 0.08 0.07 0.14 0.35
0.16 0.67 0.31 0.17 0.16 0.16 0.63 0.22 0.49 0.34 0.52 0.17 0.6 0.54 0.61 0.88 0.89 0.28 0.62 0.89 0.87 1.0 0.38 1.0 0.21 0.1 0.66 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.0 0.61 0.34 0.57 0.34 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.06 0.49 0.14 0.63 0.35 0.28 0.51 0.46 0.34 0.4 0.38 0.42 0.18 0.19 1.0 0.82 0.37 0.57 0.69 0.99 0.77 0.46 0.69 0.03 0.22 0.22 0.17
0.56 0.19 0.36 0.26 0.82 0.4 0.43 1.0 0.59 0.41 0.48 0.83 0.48 0.17 0.16 0.57 0.31 0.81 0.42 0.46 0.49 0.46 0.14 0.63 0.51 0.64 0.74 0.11
0.08 0.61 0.39 0.46 0.35 0.24 0.46 0.26 0.63 0.42 0.56 0.39 0.36 1.0 0.73 0.49 0.36 0.46 0.36 0.65 0.54 0.59 0.37 0.52 0.53 0.48 0.66 0.3
0.18 0.22 0.39 0.21 0.53 0.34 0.33 0.86 0.69 0.61 0.81 0.39 0.23 0.22 0.26 0.9 0.63 0.62 0.58 0.82 1.0 0.87 0.24 0.78 0.36 0.36 0.58 0.23
0.18 0.14 0.44 0.29 0.36 0.58 0.68 0.22 0.14 0.3 0.11 0.2 0.31 0.16 0.17 0.91 1.0 0.45 0.94 0.81 0.6 0.88 0.26 0.6 0.05 0.06 0.4 0.45
0.1 0.28 0.04 0.08 0.01 0.02 0.1 0.05 0.03 0.11 0.05 0.03 0.07 0.4 0.5 0.87 0.73 0.64 0.46 1.0 0.98 0.99 0.09 0.88 0.08 0.11 0.11 0.41
0.02 0.01 0.22 0.18 0.21 0.3 0.23 0.18 0.29 0.55 0.52 0.19 0.26 0.06 0.07 0.68 0.95 0.27 0.78 0.98 0.57 1.0 0.12 0.84 0.04 0.05 0.04 0.74
0.01 0.0 0.09 0.02 0.01 0.0 0.1 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.03 0.03 0.44 0.06 1.0 0.07 0.19 0.7 0.15 0.07 0.09 0.01 0.0 0.03 0.01
0.07 0.07 0.01 0.04 0.02 0.01 0.0 0.04 0.01 0.09 0.11 0.04 0.01 0.08 0.11 1.0 0.37 0.04 0.0 0.06 0.15 0.07 0.02 0.01 0.02 0.35 0.05 0.0
0.65 0.0 0.48 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 1.0 0.0 0.97 0.78 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0
0.61 1.0 0.7 0.12 0.22 0.66 0.88 0.39 0.7 0.49 0.9 0.22 0.42 0.45 0.51 0.35 0.46 0.93 0.29 0.56 0.37 0.72 0.41 0.52 0.43 0.79 0.4 0.67
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.06 0.1 0.18 0.11 1.0 0.0 0.0 0.27 0.11 0.07 0.06 0.0 0.03 0.05 0.0
0.02 0.06 0.43 0.18 0.47 0.56 0.5 0.16 0.25 0.07 0.37 0.59 0.33 0.13 0.17 0.83 1.0 0.6 0.35 0.69 0.49 0.71 0.65 0.67 0.02 0.38 0.12 0.12
0.02 0.03 0.13 0.28 0.16 0.24 0.23 0.28 0.34 0.63 0.34 0.23 0.31 0.04 0.03 0.77 0.68 0.54 0.61 0.96 0.69 0.93 0.03 1.0 0.02 0.02 0.04 0.63
0.02 0.33 0.15 0.21 0.26 0.14 0.2 0.21 0.25 0.22 0.38 0.47 0.3 0.35 0.26 0.53 0.41 1.0 0.53 0.49 0.4 0.48 0.06 0.48 0.14 0.09 0.22 0.22
0.23 0.04 0.07 0.07 0.07 0.12 0.08 0.35 0.34 0.62 0.53 0.14 0.15 0.1 0.11 0.94 0.89 0.17 0.57 1.0 0.9 0.96 0.06 0.75 0.09 0.23 0.08 0.19
0.41 0.57 0.64 0.26 0.2 0.17 0.4 0.28 0.22 0.23 0.27 0.23 0.45 0.25 0.19 0.54 0.62 0.22 0.89 0.64 1.0 0.7 0.24 0.98 0.03 0.07 0.27 0.17
0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.02 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.03 0.09 0.15 0.06 1.0 0.21 0.07 0.19 0.03 0.07 0.06 0.2 0.1 0.0 0.23
0.04 0.05 0.11 0.08 0.27 0.15 0.13 0.04 0.11 0.06 0.09 0.32 0.16 0.25 0.17 1.0 0.44 0.94 0.6 0.54 0.98 0.63 0.08 0.79 0.02 0.13 0.07 0.11
0.3 0.65 0.55 0.02 0.13 0.58 0.03 0.74 0.06 0.5 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.61 1.0 0.04 0.1 0.23 0.78 0.51 0.07 0.15 0.59 0.02 0.02 0.11
0.02 0.2 0.54 0.23 0.5 0.19 0.31 0.26 0.29 0.2 0.32 0.88 0.31 1.0 0.91 0.44 0.49 0.26 0.29 0.37 0.51 0.45 0.21 0.48 0.17 0.11 0.35 0.16
0.02 0.19 0.44 0.33 0.38 0.33 0.45 0.19 0.2 0.23 0.2 0.44 1.0 0.69 0.63 0.47 0.48 0.36 0.32 0.54 0.67 0.6 0.19 0.73 0.1 0.15 0.59 0.18
0.1 0.75 0.62 0.65 0.55 0.39 0.68 0.76 0.63 0.69 0.69 0.36 0.61 1.0 0.96 0.92 0.69 0.52 0.69 0.92 0.78 0.69 0.39 0.67 0.39 0.51 0.69 0.52
0.01 0.27 0.18 0.07 0.1 0.09 0.39 0.29 0.63 0.85 0.82 0.44 0.26 0.32 0.25 0.1 0.08 1.0 0.14 0.36 0.11 0.17 0.14 0.2 0.1 0.02 0.2 0.06
0.22 0.71 1.0 0.34 0.38 0.83 0.25 0.45 0.06 0.19 0.1 0.31 0.13 0.5 0.52 0.34 0.17 0.1 0.36 0.16 0.49 0.36 0.45 0.16 0.2 0.39 0.12 0.09
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.45 0.0 0.89 0.59 0.76 1.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.52
0.01 0.29 0.26 0.26 0.12 0.17 0.34 0.39 0.76 0.71 0.8 0.08 0.29 0.96 0.93 0.93 0.94 0.63 0.4 0.95 0.84 0.8 0.49 0.85 0.14 0.45 0.51 1.0
0.03 0.03 0.49 0.25 0.1 0.04 0.35 0.12 0.16 0.16 0.21 0.07 0.38 0.12 0.11 0.72 0.72 0.06 0.45 0.86 0.89 1.0 0.24 0.9 0.15 0.13 0.05 0.6
0.06 0.05 0.74 0.28 0.23 0.26 0.53 0.37 0.33 0.42 0.42 0.19 0.58 0.21 0.2 0.94 0.89 0.37 0.83 0.99 0.92 0.96 0.37 1.0 0.17 0.17 0.26 0.46
0.02 0.34 0.23 0.22 0.23 0.14 0.15 0.33 0.22 0.26 0.35 0.31 0.21 0.82 0.62 0.95 0.88 0.27 0.57 0.69 0.91 0.8 0.22 1.0 0.08 0.09 0.2 0.4
0.04 0.13 0.39 0.3 0.25 0.16 0.61 0.29 0.36 0.33 0.42 0.2 0.46 0.3 0.37 0.81 0.66 0.58 0.86 1.0 0.79 0.86 0.39 0.84 0.09 0.35 0.38 0.67
0.03 0.06 0.31 0.42 0.22 0.17 0.24 0.18 0.25 0.21 0.28 0.27 0.18 0.18 0.2 0.74 0.83 0.15 0.82 0.97 0.89 1.0 0.14 0.9 0.08 0.17 0.13 0.59
0.02 0.06 0.28 0.14 0.1 0.09 0.23 0.14 0.19 0.14 0.19 0.12 0.2 0.16 0.17 0.86 0.77 0.12 0.48 1.0 0.9 0.91 0.11 0.86 0.1 0.13 0.17 0.59
0.06 0.13 0.53 0.13 0.45 0.36 0.51 0.61 0.61 0.79 0.71 0.53 0.44 0.49 0.47 0.78 0.77 0.47 0.65 1.0 1.0 0.93 0.34 0.97 0.13 0.15 0.39 0.46
0.01 0.01 0.12 0.09 0.06 0.04 0.1 0.12 0.07 0.08 0.09 0.12 0.14 0.03 0.02 0.33 0.27 0.9 0.53 0.42 1.0 0.4 0.05 0.61 0.0 0.02 0.04 0.13
0.0 0.27 0.0 0.21 0.32 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.2 0.37 0.76 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.29 0.39 0.0
0.0 0.02 0.01 0.01 0.05 0.1 0.04 0.0 0.02 0.04 0.01 0.09 0.01 0.08 0.06 0.21 0.07 1.0 0.17 0.13 0.31 0.17 0.08 0.11 0.03 0.03 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.96 0.0 0.56 0.32 0.49 0.38 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.04 0.26 0.1 0.4 0.13 0.86 0.1 0.39 0.21 0.21 0.35 0.17 0.99 0.56 0.55 0.14 1.0 0.24 0.86 0.32 0.7 0.09 0.59 0.02 0.02 0.72 0.08
0.69 1.0 0.77 0.32 0.28 0.44 0.55 0.55 0.67 0.38 0.74 0.26 0.33 0.49 0.5 0.68 0.62 0.58 0.86 0.86 0.95 0.92 0.52 0.84 0.67 0.47 0.6 0.46
0.02 0.26 0.35 0.05 0.08 0.03 0.4 0.03 0.06 0.04 0.08 0.07 0.29 0.33 0.26 0.51 0.34 1.0 0.25 0.38 0.45 0.3 0.25 0.36 0.14 0.33 0.26 0.05
0.11 0.12 0.19 0.04 0.01 0.01 0.4 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.56 0.17 0.19 0.65 0.3 0.37 0.39 0.63 1.0 0.43 0.26 0.44 0.1 0.22 0.37 0.02
0.0 0.14 0.31 0.03 0.01 0.01 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.29 0.28 0.39 0.25 1.0 0.46 0.34 0.8 0.33 0.36 0.25 0.08 0.13 0.27 0.02
0.03 0.02 0.69 0.1 0.14 0.02 0.9 0.08 0.28 0.3 0.42 0.21 0.86 0.69 0.66 0.57 0.81 0.85 0.61 0.51 0.81 0.77 0.85 1.0 0.05 0.36 0.44 0.26
0.09 0.2 0.74 0.22 0.12 0.46 0.69 0.18 0.45 0.48 0.19 0.17 1.0 0.63 0.3 0.53 0.62 0.73 0.08 0.78 0.52 0.92 0.75 0.68 0.3 0.56 0.55 0.59
0.96 0.64 0.46 0.22 0.35 0.3 0.46 0.41 0.51 0.41 0.5 0.3 0.35 0.27 0.3 0.61 0.44 0.42 0.51 0.78 0.6 0.56 0.46 0.58 1.0 0.56 0.39 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)