Heatmap: Cluster_22 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
1.0 0.31 0.04 0.18 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.04 0.17 0.15 0.09 0.03 0.05 0.1 0.06 0.1 0.08 0.05 0.07 0.08 0.55 0.22 0.07
1.0 0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.05 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.06 0.03 0.03 0.01 0.04 0.06 0.32 0.04 0.01
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.99 0.0 0.0
1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0 0.0
1.0 0.03 0.03 0.06 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.07 0.01 0.02 0.02 0.02 0.04 0.03 0.02 0.07 0.05 0.07 0.03 0.02 0.04 0.07 0.04 0.03 0.05
1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.38 0.0 0.01
1.0 0.08 0.17 0.14 0.02 0.01 0.03 0.06 0.1 0.08 0.1 0.04 0.03 0.22 0.26 0.02 0.43 0.02 0.06 0.03 0.03 0.03 0.09 0.03 0.1 0.14 0.11 0.04
0.25 0.09 0.33 0.04 0.14 0.07 0.11 0.04 0.17 0.09 0.17 0.19 0.09 0.13 0.12 0.0 0.01 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 1.0 0.12 0.0
0.58 0.29 0.55 0.66 0.41 0.33 0.48 0.33 0.17 0.35 0.17 0.25 0.91 0.3 0.31 0.74 0.52 0.27 0.4 0.54 0.66 0.47 0.44 0.48 0.17 0.76 1.0 0.43
1.0 0.05 0.27 0.34 0.28 0.71 0.27 0.16 0.08 0.08 0.06 0.12 0.25 0.03 0.05 0.34 0.18 0.38 0.22 0.18 0.17 0.23 0.15 0.12 0.17 0.09 0.04 0.52
1.0 0.02 0.02 0.08 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.05 0.02 0.02 0.08 0.03 0.07 0.09 0.05 0.04
1.0 0.18 0.1 0.09 0.11 0.13 0.15 0.16 0.17 0.16 0.25 0.08 0.08 0.09 0.13 0.19 0.17 0.11 0.23 0.21 0.21 0.34 0.16 0.18 0.06 0.8 0.03 0.27
0.59 0.95 0.1 0.06 0.16 0.25 0.16 0.15 0.06 0.15 0.08 0.14 0.08 0.2 0.14 0.2 0.11 0.3 1.0 0.16 0.21 0.31 0.1 0.33 0.74 0.34 0.25 0.07
1.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 0.02 0.0 0.0
1.0 0.02 0.18 0.12 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.05 0.13 0.1 0.15 0.13 0.07 0.19 0.5 0.02 0.03
0.44 0.01 0.1 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.1 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02 0.03 1.0 0.01 0.01
0.7 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.01 0.0
1.0 0.36 0.47 0.26 0.33 0.34 0.5 0.35 0.26 0.23 0.31 0.28 0.18 0.4 0.43 0.57 0.55 0.3 0.37 0.64 0.57 0.65 0.54 0.57 0.42 0.73 0.35 0.25
0.56 0.18 0.11 0.11 0.08 0.16 0.2 0.1 0.11 0.1 0.14 0.07 0.15 0.16 0.15 0.18 0.22 0.2 0.11 0.24 0.23 0.2 0.13 0.16 0.05 1.0 0.1 0.22
0.63 0.1 0.35 0.29 0.27 0.34 0.42 0.23 0.49 0.26 0.68 0.48 0.25 0.15 0.19 0.64 0.65 0.38 0.34 0.64 0.59 0.71 0.47 0.76 0.17 1.0 0.16 0.46
1.0 0.26 0.42 0.27 0.35 0.31 0.4 0.32 0.37 0.44 0.39 0.42 0.28 0.36 0.3 0.42 0.4 0.26 0.26 0.8 0.37 0.46 0.44 0.57 0.65 0.97 0.34 0.33
0.11 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.15 1.0 0.02 0.01
1.0 0.05 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.16 0.02 0.04
1.0 0.1 0.23 0.21 0.34 0.3 0.33 0.38 0.41 0.26 0.39 0.28 0.26 0.27 0.24 0.43 0.37 0.22 0.22 0.41 0.27 0.37 0.24 0.4 0.1 0.15 0.32 0.15
0.58 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.17 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.48 0.08 0.01
0.39 0.04 0.14 0.04 0.07 0.05 0.13 0.08 0.18 0.09 0.24 0.09 0.09 0.05 0.06 0.13 0.11 1.0 0.23 0.18 0.2 0.14 0.14 0.17 0.05 0.04 0.08 0.06
1.0 0.02 0.11 0.03 0.04 0.06 0.15 0.04 0.03 0.04 0.06 0.05 0.14 0.07 0.06 0.0 0.0 0.08 0.01 0.01 0.06 0.03 0.02 0.02 0.04 0.69 0.09 0.03
1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.18 0.01 0.01
0.1 0.3 0.54 0.33 0.44 0.6 0.64 1.0 0.7 0.73 0.98 0.39 0.7 0.46 0.4 0.48 0.72 0.72 0.34 0.5 0.39 0.37 0.62 0.41 0.11 0.72 0.28 0.27
0.55 0.04 0.07 0.05 0.05 0.09 0.04 0.03 0.06 0.05 0.09 0.03 0.06 0.05 0.04 0.03 0.07 0.03 0.01 0.05 0.03 0.05 0.03 0.08 0.05 1.0 0.06 0.1
1.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.01
0.72 0.08 0.34 0.29 0.29 0.22 0.35 0.41 0.56 0.13 0.72 0.37 0.19 0.39 0.45 0.41 0.65 0.29 0.26 0.39 0.31 0.44 0.83 0.48 0.1 1.0 0.23 0.18
1.0 0.08 0.11 0.12 0.09 0.08 0.11 0.04 0.07 0.04 0.07 0.1 0.07 0.14 0.12 0.21 0.12 0.08 0.13 0.14 0.08 0.13 0.18 0.14 0.12 0.99 0.47 0.22
1.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.14 0.0 0.0
0.11 0.09 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.22 0.51 0.04 0.0 0.32 0.05 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.25 0.02 0.0
1.0 0.2 0.37 0.25 0.37 0.21 0.43 0.06 0.27 0.26 0.27 0.31 0.4 0.17 0.24 0.18 0.21 0.86 0.13 0.3 0.27 0.28 0.21 0.33 0.43 0.39 0.11 0.31
0.31 0.34 0.28 0.34 0.44 0.33 0.37 0.35 0.19 0.21 0.17 0.11 0.67 0.37 0.36 0.57 0.34 0.53 0.16 0.39 0.39 0.24 0.24 0.19 0.18 1.0 0.41 0.16
1.0 0.12 0.09 0.03 0.02 0.01 0.06 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.02 0.04 0.04 0.07 0.05 0.08 0.04 0.06 0.09 0.05 0.07 0.05 0.19 0.59 0.14 0.07
1.0 0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.05 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.06 0.04 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.4 0.01 0.02
1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.0 0.0
0.6 0.27 0.06 0.05 0.08 0.09 0.11 0.04 0.04 0.02 0.04 0.08 0.08 0.3 0.33 0.03 0.05 0.03 0.02 0.04 0.04 0.06 0.1 0.04 0.31 1.0 0.09 0.07
1.0 0.03 0.04 0.11 0.04 0.11 0.06 0.1 0.03 0.03 0.05 0.02 0.01 0.03 0.03 0.04 0.07 0.05 0.03 0.1 0.05 0.08 0.02 0.12 0.05 0.42 0.06 0.05
1.0 0.08 0.18 0.06 0.14 0.26 0.21 0.09 0.02 0.04 0.06 0.08 0.21 0.07 0.1 0.14 0.09 0.09 0.13 0.11 0.13 0.08 0.24 0.1 0.32 0.47 0.06 0.05
1.0 0.06 0.42 0.2 0.14 0.09 0.22 0.09 0.09 0.11 0.09 0.12 0.26 0.11 0.09 0.32 0.23 0.16 0.22 0.52 0.33 0.32 0.3 0.37 0.04 0.32 0.22 0.21
0.61 0.03 0.07 0.1 0.14 0.08 0.13 0.05 0.11 0.04 0.13 0.22 0.21 0.06 0.05 0.04 0.06 0.09 0.04 0.05 0.03 0.06 0.18 0.06 0.17 1.0 0.09 0.17
0.18 0.1 0.47 0.18 0.07 0.07 0.18 0.15 0.1 0.1 0.1 0.05 0.19 0.57 0.59 0.12 0.09 0.4 0.28 0.34 0.23 0.26 0.19 0.22 0.15 1.0 0.81 0.13
1.0 0.24 0.69 0.32 0.29 0.27 0.66 0.26 0.37 0.41 0.41 0.28 0.54 0.32 0.24 0.47 0.25 0.56 0.55 0.59 0.58 0.55 0.3 0.62 0.08 0.32 0.26 0.43
1.0 0.04 0.05 0.03 0.05 0.05 0.06 0.03 0.06 0.04 0.07 0.05 0.05 0.05 0.05 0.04 0.06 0.07 0.09 0.06 0.03 0.05 0.03 0.04 0.03 0.07 0.06 0.04
1.0 0.01 0.07 0.05 0.03 0.01 0.05 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.02 0.03 0.03 0.04 0.09 0.02 0.05 0.04 0.05 0.04 0.06 0.03 0.05 0.01 0.02
1.0 0.13 0.08 0.07 0.03 0.06 0.04 0.29 0.14 0.18 0.18 0.03 0.02 0.12 0.12 0.2 0.25 0.19 0.29 0.34 0.27 0.3 0.12 0.22 0.12 0.27 0.1 0.11
0.03 0.16 0.08 0.08 0.29 0.27 0.05 0.38 0.23 0.24 0.32 0.31 0.07 0.29 0.29 0.17 0.14 0.21 0.14 0.13 0.16 0.18 0.04 0.16 0.4 1.0 0.09 0.07
1.0 0.05 0.19 0.19 0.17 0.09 0.23 0.07 0.12 0.11 0.11 0.17 0.2 0.18 0.18 0.18 0.14 0.21 0.17 0.2 0.17 0.19 0.15 0.13 0.25 0.74 0.18 0.2
1.0 0.01 0.05 0.25 0.03 0.01 0.04 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.09 0.03 0.03 0.2 0.08 0.14 0.22 0.3 0.21 0.13 0.2 0.14 0.01 0.22 0.11 0.1
0.28 0.15 0.18 0.13 0.01 0.01 0.12 0.07 0.09 0.1 0.09 0.01 0.05 0.1 0.1 0.11 0.06 0.05 0.23 0.16 0.18 0.13 0.08 0.16 1.0 0.17 0.08 0.14
0.76 0.9 0.36 0.41 0.71 0.85 0.42 0.43 0.56 0.44 0.59 0.8 0.49 0.48 0.48 0.62 0.62 0.79 0.37 0.63 0.59 0.65 0.62 0.6 0.55 1.0 0.49 0.56
0.27 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.04 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 1.0 0.05 0.02
0.06 0.03 0.43 0.63 1.0 0.9 0.62 0.72 0.61 0.49 0.66 0.77 0.49 0.17 0.19 0.7 0.55 0.5 0.18 0.9 0.49 0.77 0.47 0.53 0.07 0.62 0.29 0.41
1.0 0.22 0.08 0.07 0.06 0.09 0.24 0.06 0.02 0.13 0.04 0.04 0.21 0.39 0.29 0.15 0.14 0.15 0.08 0.12 0.18 0.11 0.11 0.12 0.64 0.2 0.33 0.1
0.22 0.18 0.16 0.47 0.44 0.31 0.19 0.13 0.15 0.14 0.17 0.48 0.19 0.13 0.12 0.3 0.38 0.2 0.11 0.29 0.23 0.4 0.23 0.24 0.28 0.36 0.09 1.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.22 0.01 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)